- •1. Энзимология и биологическое окисление
- •Введение
- •Формулы аминокислот
- •Таблица 1
- •Витамины: жирорастворимые
- •Коферменты:
- •Изоферменты ЛДГ, КФК:
- •В виде последовательности реакций
- •В виде цикла
- •Схема субстратов БО
- •Биологическое окисление-2
- •Схема образования АФК. Реакции, катализируемые каталазой, СОД, глутатионпероксидазой; реакции Фентона, Хабера-Вайса
- •Биохимия углеводов
- •Метаболизм гликогена: Синтез гликогена
- •Мобилизация гликогена
- •Аденилатциклазный путь регуляции метаболизма
- •Инозитол-3-фосфатный путь регуляции
- •Превращения фруктозы и галактозы
- •Углеводы-2
- •Метаболизм этанола
- •Гликолиз
- •Обмен глюкозо-6-фосфата
- •Углеводы-3
- •ПВК дегидрогеназный комплекс
- •Глюконеогенез
- •Синтез основных классов ГАГ
- •Схема TIGAR
- •Цикл Кори, цикл Фелига
- •Биохимия липидов
- •Липиды-1
- •Синтез триглицеридов и фосфолипидов
- •Синтез эйкозаноидов
- •Катаболизм триацилгицеролов (ТАГ), глицерола. Энергетический баланс
- •Метаболизм (синтез и утилизация) кетоновых тел:
- •Липиды-3
- •Биосинтез ЖК
- •Ненасыщенные
- •Синтез холестерола
- •Биохимия белков и нуклеиновых кислот
- •Белки-1
- •Эндогенный пул аминокислот, его образование и утилизация
- •Схема Мейстера
- •Гниение белков, обезвреживание продуктов гниения:
- •Переваривание белков
- •Белки-2:
- •Вступление АК в ЦТК
- •Цикл синтеза мочевины:
- •Метаболизм SAM и креатина
- •Цикл Мейстера и цикл Робертса (ГАМК-шунт)
- •Интеграция обмена белков, липидов, углеводов
- •Белки-4
- •Репликационная вилка (По Березову и Коровкину, 1998)
- •Синтез пиримидинов:
- •Распад пиримидинов:
- •Схема биосинтеза белка (прокариотическая клетка)
- •Биохимия гормонов и витаминов
- •Гормоны-1
- •Обмен Ca/P
- •Метаболизм витамина D
- •Принципы организации НЭС
- •Гормоны-2
- •Формулы гормонов
- •Синтез серотонина
- •Синтез тиреоидных гормонов
- •Биохимия органов и систем
- •Кровь-1
- •Основные биохимические константы
- •Кровь-2
- •Синтез гема
- •Распад гема
- •Транспорт железа
- •Почки
- •Ацидо- и аммониогенез
- •Печень
- •Детоксикация ксенобиотиков
- •Мышечная ткань
- •Электромеханическое сопряжение
- •Синтез ансерина и карнозина
- •Гипокинетический синдром
- •Нервная и соединительная ткань
- •Строение десмозина
- •Гидроксилирование пролина и лизина
- •Механизм электрогенеза
- •Синтез ацетилхолина
Интеграция обмена белков, липидов, углеводов |
||
Липиды |
|
Углеводы |
Жирные кислоты |
Глицерин |
Глюкоза |
Ацетоацетил-Коа |
Ацетил-Коа |
Пируват |
HOH |
ЦТК |
|
CO2 |
|
|
Кетогенные |
|
Гликогенные |
АМК |
Аминокислоты |
АМК |
|
Белки |
|
|
Белки-4 |
|
Репликационная вилка (По Березову и Коровкину, 1998) |
5' |
3' |
|
|
|
|
Комплекс белков |
|
ДНК-гираза |
Праймасома |
dnaA и dnaB |
|
|
|
|
|
ДНК-хеликаза- |
|
|
|
гер-белок |
|
|
|
ДНК-связывающие |
Праймаза |
|
|
белки |
|
Фрагменты Оказаки |
|
|
5' |
||
3' |
|
|
|
|
|
|
|
3' |
|
|
5' |
Праймер |
|
|
|
5' |
|
|
3' |
|
|
|
|
Ведущая цепь |
ДНК-полимераза III |
Удаление |
Отстающая |
|
|||
|
|
праймера |
цепь |
|
|
|
|
|
|
|
ДНК-лигаза |
ДНК-полимераза I - катализирует отщепление затравочного |
ДНК-полимераза I |
||
|
|
||
олигорибонуклеотидного праймера и заполнение образующихся |
|
|
|
после этого пробелов дезоксирибонуклеотидами. |
|
|
|
ДНК-полимераза III - катализирует стадию элонгации репликации ДНК. |
|
|
|
ДНК-лигаза - выполняет функцию соединения двух цепей ДНК. |
|
|
|
ДНК-хеликаза (гер-белок) - выполняет фунцкию раскручивания двойной спирали ДНК. |
|
||
Праймаза - катализирует синтез короткого олигорибонуклеотида (праймера) с которого начинается синтез ДНК. |
|||
ДНК-гираза - учавствует в сверхспирализации, обеспечивая как репликацию, так и транкскрипцию ДНК. |
|||
|
47 |
|
|
Синтез пуринов Схема синтеза пуринового кольца
CO2 воздуха
гли аспартат
|
CH2 |
|
NH |
|
|
HN |
6 |
5 C |
7 |
|
|
1 |
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
2 |
4 |
|
8 CH |
|
HC |
C |
9 |
|
||
3 |
|
|
|||
|
N |
|
|||
|
N |
|
|
N5,N10-метенил- |
|
|
|
|
|
||
N10-формил- |
|
|
|
|
ТГФК |
ТГФК |
Амидная группа |
|
|||
|
|
||||
|
|
глн |
|
|
48
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H2N CH |
COOH |
|
|
|
|
HN |
N |
|
|
CH2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
COOH |
|
|
|
HOH |
N |
N |
|
|
|
Асп |
ИМФ-дегидро |
|
|
|
|
||||
O |
|
|
|
|
||||
геназа (1) |
|
НАД+ |
H2C O P |
OH |
|
|
|
|
|
|
OH |
ГТФ |
|
|
|
||
|
|
|
|
|
Аденило- |
|||
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
Инозиновая кислота |
Mg2+ |
|
сукцинат- |
||
|
|
|
(ИМФ) |
|
|
синтетаза (6) |
||
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
НАДН • H+ |
|
ГДФ + Pi |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
COOH |
|
|
|
|
O |
|
|
|
CH |
CH2 |
COOH |
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
N |
|
|
NH |
|
|
|
HN |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HN |
N |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
N |
N |
|
|
|
|
|
|
|
H |
O |
|
|
|
|
|
|
|
H2C O P |
OH |
|
N |
N |
|
|
|
|
|
|
O |
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
OH |
|
|
|
|
H2C O P |
OH |
|
|
Ксантиловая к-та |
Аденилоянтарная к-та |
|||||
|
|
OH |
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
АТФ |
|
Mg2+ |
|
|
|
|
|
|
ГМФ- |
|
Глн |
|
Аденилосукцинат |
|
|
|
|
|
|
лиаза (4) |
COOH |
|
||||
синтетаза(6) |
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
||
АДФ |
|
Глу |
|
|
|
CH |
CH |
COOH |
|
|
|
|
NH2 |
|
Фумарат |
||
+ Pi |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HN |
N |
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HN |
|
N |
|
|
N |
N |
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
H2C O P OH |
|
|
H2N |
|
|
|
|
|
|
OH |
|
N |
N |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
H2C O P OH |
|
|
|
|
|
|
|
|
OH |
|
|
|
|
|
|
|
ГМФ |
|
|
|
|
АМФ |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ГМФ + АТФ |
ГДФ + АДФ |
|
|
|
||
|
|
ГДФ + АТФ |
ГТФ + АДФ |
|
|
|
||
|
|
|
|
49 |
|
|
|
|
Синтез пиримидинов:
CO2 |
|
NH2 |
|
|
Аспартаткарбамоил- |
|
|
|
|
C O |
|
HOOC |
|
HOOC |
|
||
Карбомоилфосфатсинтетаза (6) |
|
трансфераза (2) |
|
|
||||
|
|
H |
|
|||||
|
Mg2+ |
O |
+ |
CH2 |
|
|
|
|
Глн |
|
|
N H |
CH2 |
||||
|
HO P |
OH |
|
|
|
|
||
|
CH COOH |
|
H2C |
CH COOH |
||||
2 АТФ |
2 АДФ + Pi |
O |
|
|
||||
|
H2N |
|
|
N |
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
H |
|
ОМФдекарбоксилаза
(4)
CO2
ФФн
O
HN CH
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O C |
|
|
C |
|
|
|
COOH |
||||||||
|
|
|
|
|
|||||||||||
|
|
N |
|||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|||
|
|
|
OH2C |
|
O |
|
P |
|
OH |
||||||
|
|
|
|
|
|
||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
OH |
||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Оротидин-5-фосфат |
|||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
(ОМФ) |
||||||
|
|
O |
|||||||||||||
HN |
|
|
|
CH |
|||||||||||
|
|
|
|||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O C |
|
|
|
CH |
|
|
|||||||||
|
|
|
|
||||||||||||
|
|
N |
|||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|||||
|
|
|
|
OH2C |
|
O |
|
P |
|
OH |
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
OH |
Карбамоилфосфат |
Аспартат |
|
N-карбамоиласпартат |
||||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
Дегидро- |
|
||
|
|
|
|
оротаза |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HOH |
|
ФРПФ |
|
|
|
|
|
|
Оротат- |
|
O |
|
|
|
O |
|
фосфорибозил- |
|
|
Дегидрооротат |
|
|
|
|
трансфераза (2) |
HN |
CH |
HN |
|
CH2 |
||
дегидрогеназа (1) |
|
||||||
|
|
||||||
|
O C |
C |
COOH |
|
O C |
|
CH COOH |
|
|
N |
|
|
|
N |
|
|
|
H |
НАДН + Н+ |
НАД+ |
|
H |
|
|
Оротовая |
|
|
Дигидрооротовая |
|||
|
|
кислота |
|
|
|||
|
|
|
|
|
кислота |
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
НАДФ+ |
|
|
|
|
|
O |
ТГФК |
НАДФН + H+ |
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HN |
CH |
N5,N10-CH2-ТГФК |
ДГФК |
HN |
|
C CH3 |
|
|
|
|
|
|
||
... |
O C |
CH |
Тимидилатсинтаза (2) |
O C |
N |
CH |
|
|
|
N |
|
|
|
|
O |
|
|
|
O |
|
|
|
H2C O P OH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H2C O P OH |
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
OH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
OH |
|
|
|
|
|
|
|
Дезоксирибо-уридин- |
Тимидин-5-фосфат (ТМФ) |
|
Уридин-5-фосфат (УМФ) |
|||||
|
|||||
5-фосфат (дУМФ) |
|
||||
|
|
|
|
||
|
|
|
50 |
|
Белки-5 Распад пуринов
|
NH2 |
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
|
|
HN |
|
N |
N |
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
Аденозин |
N |
N |
|
|
H2N |
N |
N |
|
|
|
Гуанозин |
|
|
||
|
|
|
|
|
|
Рибоза |
|
|
|
Рибоза |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HOH |
|
|
|
H3PO4 |
|
|
|
|
|
Аденозин- |
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
Нуклеозид- |
|
|
|
дезаминаза (3) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
фосфорилаза (2) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NH3 |
|
|
|
рибозо-1- |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
фосфат |
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
O |
|
HN |
|
N |
|
|
HN |
|
N |
|
|
|
|
|
|
||
инозин |
N |
N |
|
|
H2N |
N |
N |
|
|
|
|
|
|
|
H |
|
|
Рибоза |
|
Гуанин |
|
|
|
H3PO4 |
|
|
|
|
HOH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Нуклеозид- |
|
|
|
|
Гуанин- |
|
|
|
|
|
|
дезаминаза (3) |
|
|
|
фосфорилаза (2) |
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
рибозо-1- |
|
|
|
|
NH3 |
|
|
фосфат |
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
HOH + O2 |
H2O2 |
O |
|
||
|
|
|
|||||
|
|
N |
|
|
HN |
|
N |
HN |
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
Ксантин- |
|
O |
N |
N |
|
|
оксидаза (1) |
|||||
|
N |
|
H |
||||
|
|
H |
|||||
гипоксантин |
|
H |
|
|
|
|
Ксантин
HOH + O2
Ксантиноксидаза (1)
H2O2
O
H
HN
N
O
O N N H H
Мочевая
кислота
51