3. Принципы классификации микробов.

Систематика - распределение микроорганизмов в соответствии с их происхождением и биологическим сходством.

Классификация - распределение (объединение) организмов в соответствии с их общими свойствами (сходными генотипическими и фенотипическими признаками) по различным таксонам.

Таксономия - наука о методах и принципах распределения (классификации) организмов в соответствии с их иерархией.

Вид – это эволюционно сложившаяся совокупность особей, имеющая единый генотип, который в стандартных условиях проявляется сходными морфологическими, физиологическими, биохимическими и другими признаками.

Чистая культура – совокупность однородных микроорганизмов, выделенных на питательной среде, характеризующаяся сходными морфологическими, культуральными, биохимическими и антигенными свойствами.

Штамм – чистая культура микроорганизмов, выделенных из определенного источника и отличающихся от представителей вида из других местообитаний.

Клон – совокупность потомков, выращенных из единственной микробной клетки.

Колония - видимая изолированная структура при размножении бактерий на плотных питательных средах, может развиваться из одной или нескольких родительских клеток.

Микроорганизмы представлены доклеточными формами (вирусы — царство Vira) и клеточными формами (бактерии, архебактерии, грибы и простейшие). Различают 3 домена (или «империи»): «Bacteria», «Archaea» и «Eukarya»:

1)домен «Bacteria» — прокариоты, представленные настоящими бактериями (эубактериями);

2)домен «Archaea» — прокариоты, представленные архебактериями;

3)домен «Eukarya» — эукариоты, клетки которых имеют ядро с ядерной оболочкой и ядрышком, а цитоплазма состоит из высокоорганизованных органелл — митохондрий, аппарата Гольджи и др. Домен «Eukarya» включает: царство Fungi (грибы); царство животных Animalia (включает прстейшие – подцарство Protozoa); царство растений Plante. Домены включают царства, типы, классы, порядки, семейства, роды, виды.

Прокариоты отличаются от эукариот:

• Отсутствие истинного дифференцированного ядра (ядерной мембраны).

• Отсутствие развитой эндоплазматической сети, аппарата Гольджи.

• Отсутствие митохондрий, хлоропластов, лизосом.

• В бактериальной клетке много рибосом.

• Коэффициент седиментации прокариотов -70s, эукариотов - 80s.

• Неспособность к эндоцитозу (захвату частиц пищи).

• Клеточное деление не связано с циклическими изменениями строения клетки.

• Значительно меньшие размеры (как правило).

• У бактерий могут быть жгутики.

• В клеточной стенке бактерий содержится особый пептидогликан – муреин.

4. Классификация и таксономия бактерий.

Свойства для определения вида бактерий

1) морфологические (форма и структура бактериальной клетки);

2) тинкториальные (способность окрашиваться различными красителями);

3) культуральные (характер роста на питательных средах);

4) биохимические (способность утилизировать различные субстраты);

5) антигенные (наличие определённого набора антигенов).

Внутривидовая идентификация

1. серовары (по антигенной структуре);

2. резистентовары (по чувствительности к химическим веществам, в том числе к антибиотикам);

3. фаговары (по чувствительности к бактериофагам)

4. Ферментовары (по способности утилизировать различные субстраты);

5. Биовары (по совокупности нескольких признаков).

Раньше бактерии различали по толщине стенки: толстостенные, тонкостенные, без стенки. В настоящее время основу классификации составляет степень генетического родства, основанная на изучении строения генома рибосомных РНК (рРНК), определении процентного содержания в геноме гуанинцитозиновых пар (ГЦ-пары), построении рестрикционной карты генома, изучении степени гибридизации.

Домен Bacteria включает 23 типа, из которых медицинское значение имеют нижеизложенные.

Большинство грамотрицательных бактерий объединены в тип Proteobacteria (по имени греческого бога Proteus, способного принимать различные облики). Тип Proteobacteria подразделен на 5 классов:

• класс Alphaproteobacteria (роды Rickettsia, Orientia, Erlichia, Bartonella, Brucella);

• класс Betaproteobacteria (роды Вordetellа, Burholderia, Neisseria, Spirillum);

• класс Gammaproteobacteria (представителисемейства Enterobacteriaceae, роды Francisella, Legionella, Coxiella, Pseudomonas, Vibrio);

• класс Deltaproteobacteria (род Bilophila);

• класс Epsilonproteobacteria (роды Campilobacter, Helicobacter).

Грамотрицательные бактерии входят также в следующие типы:

• тип Chlamydiae (роды Chlamydia, Chlamydophila),

• тип Spirochaetes (роды Spirocheta, Borrelia, Treponema, Leptospira);

• тип Bacteroides (роды Bacteroides, Prevotella, Porphyromonas).

Грамположительные бактерии входят в следующие типы:

• тип Firmicutes включает класс Clostridium (роды Clostridium, Peptococcus), класс Bacilli (Listeria, Staphylococcus, Lactobacillus, Streptococcus) и класс Mollicutes (роды Mycoplasma, Ureaplasma), которые являются бактериями, не имеющими клеточную стенку;

• тип Actinobacteria (роды Actinomyces, Micrococcus, Corynebacterium, Mycobacterium, Gardnerella, Bifidobacterium, Propionibacterium, Mobiluncus).