- •Функциональная организация ферментов.
- •Регуляция биосинтеза ферментов.
- •Изоферменты.
- •Мультиферментные системы.
- •Зависимость скорости ферментативной реакции от количества ферментов.
- •Зависимость скорости ферментативной реакции от температуры среды.
- •Зависимость скорости ферментативной реакции от рН среды.
- •Зависимость скорости ферментативной реакции от количества субстрата.
- •Способы регуляции активности ферментов.
- •Регуляция количества ферментов.
- •Влияние активаторов и ингибиторов на активность ферментов, активаторы ферментов, ингибиторы ферментов.
- •Регуляция каталитической эффективности ферментов.
- •Активность ферментов, методы измерения активности.
- •Воспроизводимые суммарные параметры реакций; Удельная активность, Степень активности фермента.
- •Очистка фермента, методы определения ферментных белков.
- •Пути исследования ферментов.
- •Методы выделения ферментов.
- •Методы очистки ферментов, физические методы, биологические методы. Выдавливание клеток.
- •Получение белков в чистом виде.
- •Высаливание. Методы дезинтеграции клеток.
- •Ферменты гликозилирования.
- •Медицинская энзимология: энзимопатология, энзимодиагностика и энзимотерапия, наследственные энзимопатии, клеточные ферменты, Секреторные ферменты, Экскреторные ферменты.
- •Применение ферментов в промышленности и сельском хозяйстве. Иммобилизованные ферменты.
- •Применение ферментных препаратов в молочной промышленности.
- •Применение ферментных препаратов в хлебопечении.
- •Ферменты как аналитические реагенты.
Получение белков в чистом виде.
Получение белков в чистом виде.
Есть несколько уровней задач. Если в исследовании важна именно структура, то используют именно чистый белок. Если преследуются цели для технического использования и изучения кинетических свойств, то примеси очищаются не полностью.
Два класса примесей:
·Небелковые примеси. Характерна относительная простота удаления за счет различия в структурном строении и свойства
·Белковые примеси
После получения первичного гомогената, удаляем примеси, желательно как можно быстрее.
Удаление низкомолекулярных примесей осуществляется путем диализа (очистка коллоидных растворов и субстанций высокомолекулярных веществ от растворённых в них низкомолекулярных соединений при помощи полупроницаемой мембраны).
Процесс достаточно медленный, требуется много растворителя, чем больше, тем лучше. Иногда делают ступенчатым.
Капиллярный диализ. То же самое, только еще мельче, а следовательно, и увеличивается чувствительность метода. Внешнее пространство – раствор, внутреннее– гомогенат.
Минусы:
·Полностью очистить нельзя, но уровень все равно низок
·Процесс медленный
Плюсы:
·Объемы большие
Иногда примеси не удаляют, а попросту осаждают белок. Однако, при удалении воды возможно слипание белков и димеризация, тем самым образуется белковый осадок.
Высаливание. Методы дезинтеграции клеток.
Высаливание. Принцип:
В белковый раствор добавляют высокие концентрации ионов, которые вызывают слипание белков при связывании воды. Соль должна быть растворимой и не должна влиять на белок. Никаких солей тяжелых металлов, никаких восстановителей/окислителей, никаких фосфатов и так далее.
Хорошей солью может стать сульфат аммония. Экстракт разделяют на порции и разливают в пробирки, затем в каждую добавляют сульфат аммония в соотношениях в процентах от насыщенного. Далее берут либо раствор, либо осадок. Сначала активности нулевые, потом активность постепенно поднимается. В итоге мы получим диаграмму осаждения при разных концентрациях. Далее растворы отсортировывают по концентрациям.
Иногда белок осаждается раньше.
Плюсы:
·Осаждаются только белки и ничего больше,
·Большая стабильность с солью.
Органические растворители.
При взаимодействии с водой хорошо гидратируются. Используют либо этанол, либо ацетон. Смешиваются в любых соотношениях и обладают хорошей гидрофобностью.
Необходима хорошая чистка веществ. Растворители удобнее, так как их можно перегнать. При смешении возможна денатурация, поэтому нужно охлаждение:
·Теплоотвод ·Медленное смешивание ·Ледяная баня
Однако тщательное перемешивание, может быть опасно вспениванием (денатурация белка), так что это делают в толще раствора.
Осадки нельзя высушивать на воздухе, так как происходит разрушение структуры. Поэтому сушат всегда под вакуумом или повторно растворяют.
Методы дезинтеграции клеток
Выделение и очистка ферментов пожалуй самый сложный процесс в энзимологии, требующий знаний особенности выделяемого фермента и его источника, культуры проведения тонких анализов. Каждый отдельный фермент требует к себе особого внимания и подхода. Большинство ферментов выделяют при низких температурах во избежание инактивации. Существуют много способов выделения ферментов как в лабораторных условиях, так и в промышленности.
основные способы:
1.дезинтеграция,
2.экстракция,
3.осаждение (высаливание),
4.хроматография,
5.электрофорез.
Дезинтеграция клеток. в зависимости от локализации по отношению к клеточной мембране фермента бывают внеклеточные (экзоферменты), внутриклеточные (эндоферменты) и мембранные или клеточносвязанные. Если мы получили (вырастили) суспензию клеток или культуральную жидкость, ферменты будут по разному распределятся в этой жидкости. Некоторые ферменты выделены клетками наружу и находятся в к/ж, некоторые сидят в стенках клеток, некоторые заключены в клетки. Ясно, что для выделения первых можно клетки не трогать, просто отделить, а вот для выделения 2-х и 3-х необходимо разрушить клетки.
Процесс разрушения клеточной стенки называют дезинтеграцией. Существуют несколько методов дезинтеграции (разрушения).
· -механические: баллистический, экструзионный, декомпрессионный;
· -физические: осмос и термошоки, плазмолиз, криотехника, ультразвук, сушка, ионизирующая радиация, температура
· -химические: действие кислот, щелочей, солей, органических растворителей, ПАВ, сдвиг рН;
· -энзиматические: действие литических ферментов (лизоцим; · -биологические: действие фагов, антибиотиков.
Чаще всего первой стадией получение ферментов является получение гомогената. Гомогенат получают измельчением биологического материала (растительная или животная ткань, мицелий и т.д.) в ступке с добавлением песка или осколков стекла, или в специальных гомогенизаторах. В настоящие время применяют различные модели гомогенизаторов. Основной принцип работы этих аппаратов заключается в следующим: в стеклянной или металлическом стакане поступательно-вращательно перемешивается хорошо подогнанный к стенкам стакана металлический, стеклянный или фторопластовый шток. Предварительно измельченная биологическая ткань попадая между стенкой и штоком с наконечником механическим разрушаются. Подбирая обороты, тип гомогенизатора, среду можно выделить очень большой класс ферментов.
В последние время очень широко применяют УЗ-дезинтеграторы. Здесь также необходимо подобрать такие условия, чтобы исключить максимально инактивацию ферментов. Хорошим способом разрушения большинства микробных клеток является перематывание шариками, состоящие во встряхивании клеток с маленькими стеклянными шариками в быстро вибрирующем сосуде.
Дезинтегрирующие действие химических соединений заключается в нарушение меж. И внутримолекулярных связей между структурными элементами клеточной стенки за счет связывание ионов металлов, удаление липидов и т.д.
При энзиматической дезинтеграции можно выделять малоустойчивые внутриклеточные структуры. Ферменты или ферментные комплексы литического действия получают из бактерий, грибов, тканей животных и растений. Например, в состав дрожжелитического ферментного комплекса входят различные глюконазы, протеазы, хитиназы. Из-за различия в строение клеточных стенок в зависимости от рода, вида, штамма одних и тех же клеток, в каждом конкретном случае необходимо подбирать соответствующий ферментный комплекс. Особенно большой скачок в использовании энзиматической дезинтеграции был сделан после применение иммобилизованных ферментов.
Биологическая дезинтеграция осуществляется фагами, бактериоцинами вызывающих лизис клетки ведущий и распаду клетки. Если ферменты прочно связаны с внутриклеточными структурами, то вначале выделяют эти структуры дифференциальном центрифугированием, а затем экстрагируют из них ферменты органическими растворителями или водными растворами дозоксихолата, твина и т.д. (детергенты).
