
книги из ГПНТБ / Иваницкий Г.Р. Исследование микроструктуры объектов методами когерентной оптики
.pdfВзаимодействие таких независимых потоков от различных точек Поля препарата может быть охарактеризовано как аддитивное в от ношении амплитуд (при когерентном освещении) или в отношении интенсивностей (при некогерептном освещении).
Весьма существенным при использовании методов оптимального обнаружения является вопрос о стационарности и законе распреде ления амплитуд шумового фона изображении.
Стационарным в широком смысле слова будем называть ми кроскопическое поле, в котором:
1) соблюдается постоянство математического ожидания функции, описывающей распределение интенсивности в атом ноле:
Mfff.v, //)] = const;
2) сохраняется постоянной величина дисперсии указанной функ
ции
/у)— //)]}■ = const;
3)корреляционная функции зависит лишь от величины разности текущих координат, по не зависит от самих координат
|
у)1( х + 1, (/+п)]=/<(£, |
п). |
|
Поле, в котором свойства по всем направлениям неизменны, бу |
|||
дем называть изотропным |
|
|
|
A t[/(*, |
'/)/(-v+ S. '/ + Ч)] = |
К(1ь1- |
In D - |
Если усреднение |
по множеству с |
вероятностью, стремящейся |
к I, может быть заменено усреднением по координатам, то для рас сматриваемой совокупности микроскопических полей зрения выпол няется условие эргодичности
М If (*■ У)] = jim - j- Ц / (х. у) dx dy,
где S — область усреднения.
Рассмотрим условия, выполнение которых необходимо для со блюдения стационарности рассматриваемых двумерных функций. В биологии нарушения стационарности связаны как с методическими погрешностями, так и самой природой анализируемых препаратов.
Методические погрешности, приводящие к нарушению стационар ности, определяются разной толщиной приготовляемых для анализа срезов, неоднородностями фиксации и заливки, нарушением чистоты красителя и условий окрашивания (изменением pH, продолжитель ности и пр.), выцветанием красителя и некоторыми менее существен ными факторами (Л . 20, 28, 70].
Изменения параметров биологических препаратов приводит к изменениям статистических моментов. Например, увеличение объ ема гистологических препаратов при фиксации и заливке приводит к увеличению средней плотности и соответственно к уменьшению математиечского ожидания (при измерении пропускания).
Если характер препаратов таков, что изменяется лишь матема тическое ожидание, это еще не говорит о нарушении стационарности, поскольку центрирование рассматриваемых случайных процессов попрежнему позволяет применять методы анализа стационарных функ ций. Использование когерентных оптических систем для анализа ми-
70
кропзображений позволяет производить центрирование достаточно простыми средствами: путем блокирования в спектральной плоскости участка, соответствующего нулевым пространственным частотам.
Однако, если методические погрешности приготовления препара тов могут быть сведены к минимуму, нарушения стационарности, связанные с самой природой биологической структуры, неустранимы. Устойчивость статистических параметров распределений при условии их стационарности определяется протяженностью анализируемых полей. С увеличением этой протяженности эффективность статисти ческой оценки увеличивается, а среднеквадратичная погрешность оценки уменьшается.
Так, нарушение стационарности может быть связано с опреде ленным функциональным состоянием части клеточной популяции, вызывающим изменения интенсивности окраски. В работе }Л . 14]
приведены |
результаты исследования Фельген-ДНК в |
некоторых |
видах лейкоцитов человеческой крови. |
|
|
В общем случае для оценки стационарности необходим учет |
||
конкретных |
методических особенностей приготовления |
препаратов |
и биологической специфики анализируемых объектов. Например, од ним из авторов (Л . 40] исследовались статистические характеристики давленых препаратов корешков Vicia faba структур, удобных для анализа хромосомных повреждений. Препараты готовились по стан дартной методике. Четырех-пятисаптиметровые корпи подвергались облучению, после чего фиксировались в фиксаторе Карнуа. Гидролиз Д Н К производился в холодной, а затем в подогреваемой соляной кислоте. После воздействия реактива Шиффа корешки помещались для размягчения в 45% -ную уксусную кислоту. Раздавливались ко решки с помощью специальных приспособлений и с соблюдением нужного соответствия между твердостью корешка и необходимым усилием, что обеспечивало вполне удовлетворительную однородность
препаратов. |
|
|
|
Препараты |
сканировались |
микроскопическим зондом |
{Л . 4]. П о |
сле усилителя |
и импульсного |
модулятора сканограмма |
подавалась |
па вход амплитудного анализатора АН-100. Полученные гистограммы регистрировались на бумажной ленте. На Э Ц ВМ «Минск-22» рассчи тывались первые четыре момента функции плотности вероятности распределения амплитуд: математическое ожидание, дисперсия, асим метрия, эксцесс.
Анализ пр.опзводплся на произвольно выбранных участках пре паратов. Для оценки степени стационарности исследуемых распре делений рассчитывались также математическое ожидание, диспер сия, срсднеквадратпческое отклонение и коэффициент вариации рас пределений выборочных значений математического ожидания, дис персии, коэффициентов асимметрии и эксцесса функции плотности вероятности распределения амплитуд.
Анализ показал, что на коэффициент вариации основных ста тистических характеристик особое влияние оказывают методические погрешности, связанные с приготовлением препаратов. Так, изме нение средней интенсивности окраски, приводящие к изменениям математического ожидания распределений, связывается с продолжи тельностью гидролиза ДНК. и температурой, при которой он про исходит, а также с качеством реактива Шиффа. Расфокусировка препарата в анализируемом поле зрения приводит к уменьшению среднего контраста изображения и соответственно к уменьшению ди сперсии D и среднеквадратичного отклонения а. Однородность пре
71
парата зависит от способа раздавливания корешков п от их жестко сти, которая определяется продолжительностью пребывания в фик саторе и в уксусной кислоте.
Все указанные погрешности при тщательном контроле за методи кой приготовления препаратов могут быть существенно уменьшены.
При измерении серии препаратов получены средние значения коэффициентов вариации статистических моментов от 4 до 15% при
доверительной |
вероятности |
99%. |
|
Проверка |
гипотезы |
о |
нормальном распределении амплитуд фо |
на, производившаяся |
по |
критерию х 2. показала, что в 95% слу |
чаев гипотезу .нормальности можно считать правдоподобной с ве роятностью, не меньшей 0,8.
Вероятность ошибки при обнаружении биообъектов во многом определяется априорной информацией о структуре фона. При синтезе согласованных фильтров учет спектральных характеристик фона обязателен. Обыч но для этих целей используют энергетический спектр фона. Если обозначить S(co.v, шу) спектр заданного рас пределения плотности, то энергетический спектр будет
результатом усреднения квадрата модуля |
|
|
G(cov, шу) = lim -<|S(ov' O I 2> . |
(123) |
|
Л--+00 |
ХУ |
|
f/-»00 |
|
|
Функция (123) может принимать только положитель ные значения, поэтому она реализуется на фотопластин ке заданным распределением интенсивности. При фильт рации эта пластинка соединяется с голограммой Фурье эталонного изображения, содержащей функцию, ком плексно сопряженную спектру эталона. Обе пластинки помещаются в частотную'плоскость оптической системы. Измерение спектральной плотности фона производится в оптической системе, выполняющей преобразование Фурье, выходная плоскость которой анализируется фото электрическим детектором [Л. 118]. Смещенность и сте пень сглаживания оценки спектральной плотности фона зависят от протяженности вводимых в коллимирован ный пучок входных распределений, а также от размеров и формы сканирующей диафрагмы в выходной плоскости.
15.ОБНАРУЖЕНИЕ ОБЪЕКТОВ СЛУЧАЙНОЙ ФОРМЫ
Вбольшинстве задач микроскопического анализа геометрическая структура объектов, составляющих попу ляцию, может варьировать достаточно широко.
72
Решение задачи об обнаружении с помощью методов двумерной согласованной фильтрации объектов с флюк туирую щей формой рассмотрено ниже на примере обна ружения клеток, находящихся в анафазной стадии деле ния. Постановка этой задачи важна при исследовании хромосомных мутаций в радиационной генетике.
В качестве первого этапа при автоматическом под счете аберрантных «леток необходимо осуществить опе рацию их обнаружения на мешающем фоне. Использо вать селективные методы окрашивания и другие методы, позволяющие дискриминировать фон, здесь не удается. Это приводит к использованию в подобной ситуации методы статистической теории обнаружения [Л. 75].
Неопределенность |
при автоматическом |
обнаружении |
анафазных клеток связывается не только |
с положением |
|
и ориентацией их в |
анализируемом поле |
зрения, но и |
с существенной неоднозначностью формы. Поэтому об щая структура алгоритма обнаружения будет сводиться не только к отысканию максимальных значений корреля ционной функции по неопределенным параметрам объек та, связанным с переносом и поворотом, но и по пара метрам, определяющим неопределенность формы:
00 |
|
р = max fffaTjC*. У)9(х, у, Дл', Ду, a)dxdy. |
(124) |
(Дх, Ду, a, j) J J |
|
Максимум в этом случае отыскивается по совокуп ности j эталонных изображений, отражающих динамику изменения формы опознаваемых объектов. Эталонные изображения являются результатом статистического ус реднения некоторой совокупности .(класса) изображений, обладающих морфологической устойчивостью.
Геометрия контура анафазных клеток может быть весьма разнообразной, т. е. неопределенность, касаю щаяся формы, довольно значительна. Это разнообразие относится не только к форме отдельных структурных
элементов клетки |
(например, анафазных |
«шапок»), |
но |
и к их положению. |
|
|
|
Таким образом, фактически одноальтернативная за |
|||
дача обнаружения |
объекта одного класса |
(клеток, |
на |
ходящихся в анафазной стадии деления) благодаря ши рокой изменчивости формы опознаваемых объектов и благодаря конечной чувствительности фильтра к из менениям формы превращается в многоальтернативную
73
задачу. |
Решение принимается па основании срав |
|
нения |
полученных |
значений двумерной корреляци |
онной |
функции с |
соответствующим набором порогов |
pnj п констатируется факт присутствия объекта, если pji>pnj и факт отсутствия объекта, если pj<pnj.
В какой-то степени значительная вариабельность при знаков опознаваемых объектов может быть скомпенсиро вана большой информационной емкостью двумерного фильтра. Число запасаемых па различных пространст венных несущих частотах эталонов, перекрывающих весь диапазон возможных изменении формы [Л. 37], в основ ном ограничено лишь шумовыми свойствами применяе мых фотоматериалов п апертурами используемых для обработки линз. Одна'ко чрезвычайно важно рациональ но использовать эту емкость. Уточнение границ классов необходимо производить, оценивая допустимость измене ния некоторых параметров обнаружения.
Основным критерием качества автоматического ана лиза мнкрообъектов является ошибка измерения, одно значно связанная в случае использования статистических методов с вероятностями ложного срабатывания и про пуска объекта. Под вероятностью ложного срабатывания понимается вероятность превышения порога выходным напряжением, полученным в результате преобразования фотоэлектрическим детектором распределения интенсив ностей в корреляционном поле при условии, что объекта на выходе нет:
Л л .с = Л ( Л > . \ п | 0 ) . |
( 1 2 5 ) |
Вероятность пропуска соответственноопределяется вероятностью того, что выходное напряжение не превы шает порог в случае, когда объект в анализируемом поле зрения присутствует:
Лпр= Л(А<Лп|5). |
(126) |
Вероятность правильного обнаружения при |
этом |
будет: |
|
Л 0оп= 1 Р пр- |
(127) |
Так как распределение амплитуд фона при обнару жении анафазных клеток подчиняется нормальному за кону, то можно записать:
РII |
|
л цр = л (р < pu |S) = j w (р 15) d p , |
(128) |
—00 |
|
74
где р — распределение на выходе системы |
двумерной |
||
согласованной |
фильтрации; |
р„ — значение |
порога; |
ау(р|5)— условная плотность |
вероятности величины р |
||
при наличии сигнала. |
|
|
Поскольку .показано [Л. 44], что случайная функция, распределенная по нормальному закону, в результате линейного преобразования типа согласованной фильтра ции сохраняет закон распределения, то можно утверж дать, что закон распределения величины р нормальный
|
w (р |S) ■ У&< |
ехр |
(р — р)2 |
(129) |
|
2а1f o J |
|||
|
|
|
|
|
Вероятность пропуска при этом равна: |
|
|||
|
Рц |
р)2 rfp = -5 "[I + ® ( zu)]. |
|
|
up |
(р — |
(130) |
||
|
|
Ро |
|
|
где |
Ф(2„) — функция Лапласа, |
|
|
*П
ф (z" ) = Т У j* ехР(— О У
о
в которой
р
Z 11
Ро
Чтобы определить вероятность ложных срабатываний, напишем закон распределения величины р при отсутст вии объекта
ш(Р1°) = 71ф ■ехр ( |
-----—р |
у |
(131) |
1 |
^ |
; |
|
На рис. 11,а показана плотность распределения функ ции се(р [0) (в анализируемом поле зрения объект отсут ствует). Дисперсия шумового распределения на выходе
согласованного фильтра будет аГ =2ЕС/Ет. Если рп —
пороговое значение, то вероятность ложного срабатыва ния будет равна определенному интегралу от плотности
распределения иу(р 10) |
в пределах от рп до оо |
РЛ .С |
(132) |
75
На рис. 11,а это соответствует заштрихованной пло щади под кривой ш(р|0).
При появлении объекта в анализируемом поле зрения кривая иу(р|S) смещается на величину, равную среднему
значению р. В случае, когда объект имеет детерминиро ванную форму, случайной составляющей во входном рас пределении является лишь составляющая фона. Поэтому плотность вероятностей tty (р |S) подчиняется также нор
мальному закону с тем же значением дисперсии а~ ,
но среднее значение процесса из-за наличия объекта
изменяется и становится равным также о“ . Вероятность
правильного обнаружения при этом будет равна опре деленному интегралу от да(р|5) с пределами от рп до оо:
ОО |
ОО |
|
|
Л>0н = ^ay(p|S)dp |
(р -р )2 |
dp. |
(133) |
2о; |
|||
|
Ро |
|
|
На рис. 11,6 вероятность правильного обнаружения определяется площадью заштрихованной области справа
от порога рп.
Рассмотрим более под робно, как влияет неопреде ленность формы на вероят ности ошибок при автомати ческом анализе. Согласно принятой модели микроско пическое изображение пред ставляется в виде аддитив ной совокупности объекта и фона. В свою очередь неоп ределенность формы объек та учитывается представле
нием изображения |
объекта |
д виде комбинации |
эталон |
ного изображения и шумо вой составляющей
Рис. 11. Плотность распределе
ния вероятности величины р.
а — отсутствие объекта в поле зре ния: б — наличие Объекта в поле зрения,
<р(х, У) =fos{x, у) +
у) + ! ф ( х , у) . (134)
Нетрудно убедиться, что вероятности ошибок при анализе такой модели бу дут определяться теми же
76
интегральными преобразованиями (130), (132), но в подынтегральных выражениях условная плотность ве роятности будет представлять плотность вероятности суммы случайных величин, соответствующих распределе нию интенсивности фона и шумовой составляющей изоб ражения объекта. Плотность вероятности суммы случай ных величин определяется, как известно, правилами композиции законов распределения слагаемых (Л. 10]. Учитывая, что распределения интенсивности фона и шу мовой составляющей объекта независимы и подчинены нормальному закону, можно утверждать, что результи рующее распределение тоже нормально.
■Вероятность пропуска будет определяться выраже нием
|
Г 1Г |
|
|
1 П |
|
|
P i ,р = [ И>рез (Р I 5 ) rfp = |
------ |
Г ехр |
(Р — Ррез)2 |
dp, |
||
|
J |
|
“’,VРвез |
J |
^рез |
|
|
|
|
|
|
(135) |
|
где |
aypo3(p|S) — результирующая |
плотность вероятности; |
||||
з |
= | / з 2 |
-|-о2 — среднеквадратичное |
отклонение |
ре- |
||
Ррез |
V |
Pm |
|
|
|
|
зультирующей плотности ве роятности, равное корню квадратному из суммы дис персий распределений, обу словленных фоном и шумо вой составляющей изображе
ния объекта; ррез = Р о + Рш— среднее значение результи рующей плотности вероятно сти. Флюктуации формы об наруживаемого объекта ма ло сказываются на измене нии формы кривой ш(р|5|) и в основном приводят лишь
к флюктуациям величины р. Для анализа закона рас
пределения величины р необ ходимо произвести измере ния пиковых значений корре
Рис. 12. Гистограмма распреде ления пиковых значении корре ляционной функции в пределах класса.
77
ляционной функции. Сравнение полученного распределе ния с теоретически нормальным распределением с теми же значениями математического ожидания и дисперсии
показывает, что распределение величины р (рис. 12), не противоречит гипотезе нормальности при доверительной вероятности 0,85. Проверка гипотезы осуществлялась по критерию х2- 'Производились прнкидочные оценки харак тера распределения величины р в ряде классов. Получен ные результаты в основном не противоречат гипотезе нормальности.
Таким образом, в пределах класса величина р рас пределена по нормальному закону со средним значением
рср, пропорциональным средней энергии изображения
объекта и дисперсией а!_.
р
Следовательно, при обнаружении объекта со случай ными флюктуациями формы, вероятность пропуска объекта будет определяться выражением
^ up= J |
jau(p)ay(p|5)rfpc?p. |
(136) |
<Р<РП> (7)
Распределение амплитуд в корреляционном поле при появлении объекта описывается выражением (129).
В свою очередь согласно сказанному выше
ау(р) = |
ехр |
(р — Рср)2 |
(137) |
|||||
|
V2л |
|
|
|
|
|
||
Таким образом, |
вероятность |
пропуска |
равна: |
|
||||
|
1 II 0 0 |
|
(р— Рср)2 |
(р— р)2 |
|
|||
Рup — |
exp |
dр dp = |
||||||
2аС |
|
|
2а; |
|||||
|
|
|
р |
|
|
|
|
|
|
|
- ( а 2р + |
аТ) р=— |
2 (а2рсР — |
|
|||
1 |
ехр |
— °| рГ р — (°^РсР + а^-?2) |
dpdp. |
|||||
2тга„о— |
|
|
|
|
|
|||
Р Р |
|
|
|
|
|
|
|
|
Воспользовавшись |
табличным |
|
интегралом [Л. 59], |
|||||
вычислим внутренний интеграл |
|
|
|
|
78
р |
= |
п я т |
! |
ехр |
(Р — Рср) |
|
Г |
up --- |
2 (°о + °г) |
d p . |
|||
|
У |
2п(°р + о^-) |
—оо |
|
|
|
|
|
р |
|
|
|
|
Окончательно |
получим: |
|
|
|
|
|
|
Л ф = — /1 + |
Ф |
(Рп — Рср) |
( 138) |
||
|
|
|
||||
|
|
|
. |
/ |
2 (-р+ “г ) |
|
где Ф(л') — интеграл вероятностей.
Воспользовавшись выражениями (127) и (138), мож но построить рабочие характеристики системы для слу чаев обнаружения объекта с флюктуирующей формой. Вероятность правильного обнаружения при этом будет определяться выражением
Вычисленная зависимость вероятности правильного обнаружения объекта с флюктуирующей формой от ве роятности ложного срабатывания при использовании в качестве параметра величины среднего значения сиг-
нал/шум р = ар представлена на рис. 13.
При обнаружении объектов детерминированной формы величина рс1, в формуле (139) становится р, a al_ обра
щается в нуль. Зависимости вероятности правильного обнаружения от вероятности ложного срабатывания в этом случае представлены на том же рисунке пунктир ными линиями. Из рисунка видно, что наиболее ощути мые потери в надежности обнаружения при анализе объектов случайной формы в сравнении с анализом де терминированных объектов наблюдаются при соотноше нии сигнал/шум, не превышающем 15. При увеличении соотношения сигнал/шум различия в рабочих характери стиках обоих систем становятся менее заметными, хотя и здесь вероятность правильного обнаружения выше при анализе детерминированных объектов.
Несомненный интерес представляет более подробный анализ дисперсии величины р, обусловленной флюктуа.
79