
книги из ГПНТБ / Иваницкий Г.Р. Исследование микроструктуры объектов методами когерентной оптики
.pdfрнческую кювету 6 со взвесыо или суспензией 7, помещенную в кю
вету с бензолом |
9. Проходящий |
луч поглощается |
в ловушке 10, |
а рассеянный луч, |
пройдя через |
диафрагмы 11, 13 |
и поляроид-ана |
лизатор 12, попадает на фотокатод торцевого ФЭУ-71 14. С ФЭУ сигнал через усилитель 15 поступает на самописец 16 или на магни тоэлектрический осциллограф.
Синхронный электродвигатель 20 позволяет сканировать интен сивность рассеянного света по азимуту Ф с постоянной скоростью 1,28 град/с и 0,256 град/с, по углу места ср (двигатель 19) со скоро стью 0,3 град/с. Пучок света в кювете имеет диаметр равный 1 мм. Конструкция кювет позволяет не вводить поправку па Снелловскую рефракцию [Л 9].
Изменяя диаметр диафрагм ( I I, 13), можно получить желаемую апертуру наблюдения. Поскольку луч О КГ имеет очень небольшую расходимость, а расстояние от центра кювет до ФЭУ достаточно велико, то поправка па изменение видимого рассеивающего объема
приобретает вид: |
|
|
|
|
|
|
5 „ ( Ф ) = 5 '1,(Ф )К (Ф ), |
|
(74) |
где S „ ( ® ) — истинная |
интенсивность; S '„ ( ® ) — |
измеренная |
имтен-. |
|
снвпость; |
К (Ф ) — поправка, вычисленная для |
различных апертур; |
||
таблица |
поправочных |
коэффициентов приведена |
в работе ![Л. |
134]. |
Система поляроидов (3, 5) позволяет получить равную интен сивность для горизонтальной и вертикальной составляющих падаю щего излучения.
Второй фотоумножитель (17) закреплен неподвижно под углом 90° к падающему лучу, и его сигнал регистрируется самописцем (18). Измерение интенсивности под углом 90° дает дополнительную информацию об изменении структуры мнкрообъектов. Несовпадение кривых означает, что одновременно с изменением объема изменялся коэффициент преломления. Изменение интенсивности рассеяния под углом 90°, при неизменном объеме, также свидетельствует об изме
нении коэффициента преломления объекта. |
|
Сканирование индикатрисы занимает довольно |
большой отре |
зок времени — около 2 imhh, поэтому без специальных |
мер невозмож |
но измерять изменение размеров с меньшим периодом.
На рис. 10,s показана система, позволяющая быстро производить измерение •интенсивности при двух фиксированных углах Ф, и Ф2 (на рис. 10,6 она показана в виде блока под цифрой 8). Система состоит из четырех коллимирующих диафрагм d\, d2; шагового дви гателя с флажком 5 и фокусирующей линзы 4, которые расположены в одном корпусе с фотоумножителем. Угол ДФ равен 2°. Ось фото умножителя с помощью блока перемещения 21 и электродвигателя 20 может быть расположена под любым требуемым углом Ф0 по от ношению к падающему пучку света. Если Фо=14°, то при открыва
нии |
верхней |
диафрагмы |
на ФЭУ падает рассеянный свет под углом |
® i = |
12°, при |
закрывании |
верхней диафрагмы и открывании нижней |
на ФЭУ падает свет под углом Ф2=16°. Перемещением флажка 5
управляет |
шаговый двигатель, питаемый от блока переключения |
22 (рис. 10,6). |
|
Время, в течение которого одна диафрагма открыта, а другая |
|
закрыта, |
может .плавно регулироваться в пределах от трех секунд |
до одной |
минуты. Ток фотоумножителя, пропорциональный 5 „ (16°) |
и S,, (12°), регистрируется па ленте самописца 16.
50
Измерив отношение 'Интенсивностей 5„ (16°)/5 „ (12°) н исполь зуя график рис. 10,а или соответствующую номограмму [Л. 54], можно определить размер микрообъектов.
Кроме того, установка оборудована устройством, позволяющим производить измерения при непрерывном перемешивании суспензии, препятствующим оседанию мнкрообъектов.
Теоретические вопросы, рассмотренные в этом пара графе, касались определения кинетики изменения разме ров мнкрообъектов больших длины световой волны. Однако, описанная установка позволяет определять раз меры частиц приблизительно равных пли даже несколь ко меньших длины волны света. В последнем случае можно использовать приближение Релея-Ганса и ввести коррекцию в формулы (69 п 71) [Л. 54]. Рассмотрение этого случая выходит за рамки книги.
Г л а в а т р е т ь я
ПОИСК МИКРООБЪЕКТОВ ПРИ АВТОМАТИЧЕСКОМ АНАЛИЗЕ
11. ЛИНЕЙНАЯ ДВУМЕРНАЯ ФИЛЬТРАЦИЯ МИКРОСКОПИЧЕСКИХ ИЗОБРАЖЕНИЙ
Как уже было сказано, из-за отсутствия признаков, по которым бы объект абсолютно отличался от фона, за дача обнаружения или выделения изображения микро объектов приобретает вероятностный характер.
Положение усугубляется также тем, что изображения биологических мнкрообъектов, принадлежащие одному классу, достаточно сильно варьируют и не могут быть описаны детерминированными двумерными функциями. Случайный характер носит и распределение плотности сопровождающего их фона.
Наконец, мы можем производить исследование, лишь анализируя распределения конечной протяженности (по ля зрения микроскопа пли их фотографические изобра жения). Все это определяет целесообразность статисти ческого подхода к решению поставленных задач.
Уточним вероятностную формулировку некоторых за дач автоматического анализа микроскопических изобра жений. Для этого рассмотрим часто встречаемую на практике задачу исследования двумерных распределений неоднородной интенсивности. Каждое из таких распреде лений cp(jc, у) (поле зрения микроскопа или его фотогра
фическое изображение) |
в общем случае является комби- |
4* |
51 |
нацией объекта, представляющего интерес для исследо вателя, {об(х, у) п некоторого случайного распределения интенсивности, сопутствующего объекту и маскирую щего его, которое может рассматриваться как двумерная шумовая функция f^{x, у)
ср(л-, у) =Я[/об(А-, у), /ф(а\ ;/)]. |
(75) |
Оператор F определяет характер взаимодействия объ екта и шума. Ниже будут высказаны некоторые сообра жения по поводу способа комбинирования объекта и шу ма в микроскопических изображениях. Будем предпола гать пока характер взаимодействия аддитивным, что достаточно близко к действительности.
Из-за наличия шумового фона п вследствие случайно го характера самого объекта анализ микроскопических изображений всегда связан с некоторой неопределенно стью, приводящей к появлению ошибок.
Использование оптимальных методов для решения за дач микроскопического анализа сводит к минимуму ука занную неопределенность. В зависимости от специфики решаемых задач критерии оптимальности могут быть различными. Можно указать два таких критерия, чрез вычайно эффективных в исследованиях биологических микроизображенпй.
Это критерий минимума среднеквадратичной ошибки и критерий максимума отношения пикового значения сигнала к среднеквадратичному значению шума, причем под сигналом понимается распределение амплитуд (или интенсивностей) в изображении представляющего инте рес объекта. Назначение их различно. Если первый кри терий предназначен для наилучшего воспроизведения формы объекта из аддитивной смеси объекта и фона, то второй критерий используется не для воспроизведения формы объекта, а для формирования максимально воз можного пика сигнала на шумовом фоне.
Распределение интенсивности на выходе микроскопи ческой системы может быть представлено как результат свертки распределения интенсивности на объекте и не которой функции, характеризующей параметры оптиче ской системы, так называемой функции рассеяния пли аппаратной функции:
|
СО |
|
|
/из |
у ) =z= J |* /об (-^1» У \) h ( х |
*^1» У 1 y \ ) d x ^ d y Xi |
(7(3) |
|
—00 |
|
|
52
где /об(A'i, уi ) — распределение интенсивности на объек те; h(x—хи у— ij\) — аппаратная функция или функция рассеяния.
Многие искажения изображения объекта могут рас сматриваться как результат свертки с соответствующей аппаратной функцией. Восстановление истинного изобра жения объекта может быть представлено как результат решения интегрального уравнения (76), в котором аппа ратная функция полагается известной. На основании тео ремы о спектре свертки это решение в общем виде может быть представлено в виде
5 0б К . |
шу): |
.'^из((0.-е- ыи) |
(77) |
||
' |
Н (« ., <ви) ’ |
||||
|
где 5ос(сол-) СОу) , 5 из (со*, со,,), Я(сох, соу) — двумерные пре образования Фурье соответственно от f0e(x, у), fu3(x, у), h(x, у). В тех случаях, когда аппаратная функция равна
5-функцнп, / нп(х, .у) = /о и (-V, у).
Однако для большинства реальных объектов в урав нении (76) появляется дополнительное слагаемое, пред ставляющее согласно уравнению (75) некоторую шумо вую составляющую:
|
ОО |
y — y^dx.dy, - f |
и (л, |
у) = ^ I* /об (-М, у0 h (X — |
|
|
—ОО |
(78) |
|
/ф(-'-1) Ui)- |
|
В случае, когда спектры сигнала и шума не перекры |
||
ваются, |
задача выделения объекта |
из шума сводится |
к блокированию пространственного спектра шума и про пусканию спектра объекта. Оптимальным фильтром бу дет фильтр, выполняющий эту операцию.
Степень взаимного перекрытия двумерных спектров полезного сигнала п шума определяется характером их структуры. Локализация спектральных составляющих сигнала на ограниченном участке плоскости двумерного спектра, как правило, облегчает разделение спектров. Такая формаспектра может наблюдаться, например, у периодических структур, ориентированных определен ным образом. Упорядоченность ориентации в биологиче ских объектах чаще всего проявляется на электронномикроскопическом уровне исследований ![Л. 62]. Двумер ные спектры участков электронно-микроскопических изображений вирусов и бактериофагов, полученных
53
с помощью оптического дифрактометра {Л. 104], имеют четко выраженную периодичность. Двумерная фильтра ция в этом случае может быть чрезвычайно эффектив ной. Клуг п Розайер [Л. 105] показывают, как «двусто роннее» изображение хвостового чехла фага, являющее ся результатом наложения изображений от ближней и дальней сторон частицы и затрудняющее исследование структуры, может быть преобразовано в «одностороннее» изображение методами двумерной фильтрации.
В случае, когда спектры сигнала и шума существенно перекрываются и нет достоверных различий в других па раметрах, выделение сигнала возможно лишь за счет различия в вероятностных характеристиках шума и сиг нала. Понятие оптимального фильтра при этом не одно значно. Такой фильтр может быть синтезирован по-раз ному в соответствии с приведенными выше критериями оценки. Например, если целью фильтрации является вос произведение определенных участков изображения с ма ксимально возможным подобием, в качестве критерия может быть выбрано требование минимальности средне квадратичной ошибки ![Л. 89].
Если параметры шума неизвестны, уравнение (78) не может быть решено непосредственно. Можно лишь про извести некоторую оценку 1'0в{х, у) решения. Если рас сматривать распределение интенсивности в изображе ниях объекта и шума как пространственные случайные процессы, то лучшая оценка должна максимизировать апостериорную плотность вероятностей /'0п(-v, у), давае мую f„3(x, у) согласно правилу Байеса {Л. 51]. Полагая, что распределения, описываемые /0о(М У) и !ф{х, у), представляют собой независимые нормальные случайные процессы с нулевыми средними значениями, апостериор ная плотность вероятностей будет наибольшей для оценки
fоб (х, у) = J f К (х — л'„ у — у,) fva(л-, у) dx dy. (79)
—СО
вкоторой 1г'(х—Х|, у—yd) выбрано так, чтобы минимизи ровать среднеквадратичную ошибку
s |
== <7. [Уоб (х, у) /об (М t/)]]>, |
(80) |
где символ < |
> означает осреднение. |
|
Н. Винер (Л. 5] разработал теорию фильтрации по |
||
указанному критерию для одномерного случая. |
Без осо- |
54
бых затруднении она распространяется па двумерный случай [Л. 90]. Было показано, что в случае, когда сигнал и шум статистически независимы, фильтр, минимизирую щий среднеквадратичную ошибку, должен иметь ча стотную характеристику вида
Н (шх, шу) = |
Gоб(ых. Цу) |
(81) |
Мб (“ =о <°y)+ M (ш*, СОу)’ |
где Gоб(ыл-, соу) и Gф(шл-, о)у) — энергетические спектры объекта и шумового фона, представляющие преобразо вания Фурье от корреляционных функций объекта и фона.
Из формулы (81) видно, что когда помеха отсутст вует G,[1(co.v, (о(/) = 0 , коэффициент передачи фильтра ма ксимален и равен 1. Наоборот, когда интенсивность по мех существенно превышает интенсивность сигнала, ко эффициент передачи минимален н равен:
Мб М*. Му)
н (<°х, 10и) = |
Сф (шж, “ у) ‘ |
|
В некоторых случаях цель микроскопического анали за может быть сформулирована иначе. Вместо попытки наиболее точно воспроизводить форму исследуемой структуры можно осуществить операцию, которая отве чала бы на вопрос, присутствует ли в поле зрения объект известной формы. Детально решение подобной задачи будет обсуждаться ниже. Можно, однако, сказать, что при нормальном законе распределение амплитуд шумо вого фона операция, на основании которой принимается решение о наличии или отсутствии объекта в анализи руемом поле зрения, может выполняться с помощью ли нейных согласованных фильтров.
Решение задачи в этом случае сводится к выбору та кой аппаратной функции в уравнении (78), которая бы удовлетворяла критерию получения максимального отно шения пикового значения сигнала к среднеквадратично му значению шума.
Таким образом, задача согласованной фильтрации со стоит не в воспроизведении формы сигнала, а в форми ровании максимально возможного пика сигнала на шу мовом фоне. Второй существенной особенностью этого класса фильтров является то, что сигнал на выходе со гласованного фильтра по форме совпадает с функцией автокорреляции входного полезного сигнала.
55
В общем случае двумерная частотная характеристика такого фильтра, являющаяся преобразованием Фурье от аппаратной функции, определяется выражением [Л. 66]
Н (шд., |
Шц) = к |
S* (<■>«■ Мц) |
(82) |
|
|
a (to*, w,j) ’ |
|
где k — постоянная; |
S*(co.v., |
со;/) — функция, |
комплексно |
сопряженная спектру сигнала; G(co.v, (оу) — спектральная плотность шума.
Можно показать, что из всех линейных фильтров фильтр с частотной характеристикой такого вида обес печивает максимальное отношение пикового значения сигнала к среднеквадратичному значению шума, равное
К = |S(co„ ау)Г- du>xdui„ (83)
G(со*, (£>у )
=- Я
Вслучае, если спектральная плотность шума посто янна («белый» шум), частотная характеристика согла сованного фильтра с точностью до постоянного множи теля является функцией комплексно сопряженной спектру объекта. Поэтому в случае «белого» шума ампли тудно-частотная и фазово-частотная характеристики со гласованного фильтра должны определяться соответст вующими характеристиками объекта
Н(сод, coy) =kS(u>x, со„); |
|
ср(ыд, со,,) = — сроб(й)д, со„), |
(84) |
где ср (сйд, соу)— фазовая характеристика |
фильтра; |
фоб(сОд:, соу)— фазовая характеристика объекта. Совпадение формы амплитудно-частотных характери
стик объекта и фильтра обеспечивает наилучшие усло вия для выделения наиболее интенсивных спектральных составляющих объекта и ослабления слабых спектраль ных составляющих для того, чтобы предотвратить про хождение шумов на этих участках. «Обратная» фазовая характеристика фильтра компенсирует взаимные фазо вые сдвиги между отдельными спектральными состав ляющими. Так как вся фазовая информация сосредото чена в деформациях волнового фронта, то после прохож дения волновой поверхностью плоскости согласованного фильтра, компенсирующего фазовые изменения, световая
56
волна становится плоской. Плоская волна концентриру ется оптической системой в плоскости изображения в точку, определяющую положение исследуемого объ екта.
12. ЗАДАЧА ОБНАРУЖЕНИЯ МИКРОСКОПИЧЕСКИХ ОБЪЕКТОВ ПРИ АВТОМАТИЧЕСКОМ АНАЛИЗЕ
Уже отмечалось, что достаточно часто при автомати ческом анализе микрообъектов -возникает необходимость, не воспроизводя формы объекта, ответить на вопрос, имеется ли в поле зрения анализирующей системы объект известной формы. Подобная задача может быть сведена к задаче обнаружения двумерных оптических сигналовна сложном шумовом фоне. Решение ее должно базироваться на широко используемых в теории анализа одномерных сообщений методах математической стати стики п теории решений [Л. 7, 12, 36, 51].
С такой точки зрения задачу автоматического анали за микрообъектов можно интерпретировать следующим образом.
Результатом исследования должно быть принятие
одной |
из |
гипотез |
(в |
простейшем случае |
одной |
из |
|
двух |
гипотез) |
о |
том, |
что произошло |
какое-либо |
||
из событий. |
В случае двухальтернативной ситуации (рас |
||||||
сматриваются |
два |
события) одно из этих событий |
А — |
наличие объекта в исследуемом поле зрения, другое со бытие В — отсутствие объекта. Гипотезы Нл о том, что произошло событие А, или Нв о том, что произошло со бытие В, взаимно исключают друг друга, так как собы тия А и В образуют полную систему событий. При авто матическом анализе микрообъектов наряду с задачами обнаружения лишь одной разновидности объектов, кото рые принципиально могут быть отнесены к двухальтернатнвным, существует большое количество задач, кото рые могут рассматриваться как многоальтернативные (например, определения видовой принадлежности лейко цитов при построении лейкоцитарной формулы крови). Необходимо заметить, что даже двухальтернативные си туации фактически сводятся к многоальтернативным, так как вследствие широкой вариабельности биологических микрообъектов необходимо членение совокупности объек тов, принадлежащих одной биологической разновидно сти, на более мелкие структурные подразделения,
57
объединенные, как правило, близостью некоторых фор мальных (часто геометрических) признаков.
Выбор одной из гипотез и представляет собой стати стическое решение. В общем случае имеется определен ный набор решений. Решение должно удовлетворять не которой совокупности условий, называемой обычно кри терием. Функция потерь учитывает последствия выбора решения. Принятие решения осуществляется путем ана лиза апостериорных вероятностей.
Вероятность совместного появления события, состоя щего в наличии анализируемого распределения интенсив
ности У [У—т-мерный |
вектор |
с составляющими г/; = |
= У(a'j, tji), где /’= 1 , 2, |
. .., т, |
а т — число анализируе |
мых значений интенсивности в микроскопическом изо бражении], и события, заключающегося в наличии объекта 5 в таком распределении, можно выразить, вос
пользовавшись |
теоремой умножения |
вероятностей |
|||
[Л. |
12]: |
|
|
|
|
|
Я (У, |
S) = Р (Y) Р (S \Y) = |
Р (S) Р (Y \S), |
(85) |
|
где |
Я (У) п P { S ) — безусловные, |
а Я(5|У) |
и Z3 (У|S) — |
условные вероятности. Апостериорные вероятности нали чия Я(5|У) и отсутствия Я(0]У) сигнала при условии, что получено распределение У, будут соответственно равны:
P(S\Y)= |
P{-% P{l ]' lS) ; |
(86) |
Я(0|У) = |
- ^10?Р((Н °) . |
(87) |
Вероятность появления анализируемого распределе ния интенсивности можно оценить по формуле полной вероятности
P(Y)=P(S)P(Y\S)+P(0)P(Y\0), (88)
где Я(У|5) — вероятность появления распределения при условии наличия объекта, а Я(У|0)— то же при отсут ствии объекта; P(S) и Р (0 ) — априорные вероятности наличия п отсутствия объекта соответственно. Подста новка (88) в (86) и (87) приводит к одной из форм за писи известной Байесовской теоремы, показывающей как из априорных данных и результатов анализа принятой реализации формируются апостериорные вероятности.
56
Поделив (86) |
и (87) |
п полагая, что Р(5| У) + Я(0| У) — |
||
= 1, получим: |
|
|
|
|
P{S\Y) |
_ . P ( S ) |
Я (У |S) _ |
Л |
|
1 — |
( S I У) |
Р ( 0) |
Я ( У |0 ) |
'К |
Выражение (89), получившее название абсолютного отношения правдоподобия, полностью характеризует ве роятность появления объекта. Действительно:
, |
Л, |
|
|
|
М |
|
(90) |
Р (S |Y)— - 1+ Ау |
|
||
Отношение условных |
вероятностей |
Р (У I S) |
входя- |
|
|
Р (У I 0) |
|
щее в (89), — просто |
отношение |
правдоподобия Л, |
используется, как правило, в случаях, когда неизвестна априорная вероятность наличия объекта. Если предпо ложить равновероятным как наличие объекта, так и его отсутствие P { S ) = P ( 0) = 1/2, то Лл = Л. При этом апо стериорная вероятность связана с отношением правдо подобия зависимостью
P(S\Y)-- |
P(S) Л |
(91) |
P(0) + P( S) A - |
В самом общем случае правило решения формули руется так: принимается та гипотеза, согласно которой произошло событие, апостериорная вероятность которо го выше, чем противоположной гипотезы.
Поскольку согласно формулам (86) п (87), апосте риорная вероятность наличия объекта определяется ра венством
P(S\Y) = |
Р (S) Р (У |S) |
|
Р (У) |
||
|
а апостериорная вероятность отсутствия объекта — ра венством
P( 0) P( Y |0)
P ( 0 \ Y ) =
Р (У)
то, если Р IS |Y)^> Р (0 1Y), т. е.
Я(5|У) ^ ,
(92)
Р (0 |У) ^
принимается решение о наличии объекта. При выполне нии неравенства, обратного (92), принимается гипотеза об его отсутствии.
Я9