Доказана возможность использования промежуточных продуктов фотосинтеза в акте дыхания, как и возможность включения промежуточных продуктов дыхания в реакции фотосинтетического цикла. Противоположны лишь направления, в которых протекают реакции при фотосинтезе и при дыхании.

1)процессы окисления в цикле трикарбоновых кислот, а также ряда других органических соединений

2)транспрорт электронов от окисляемых соединений через систему промежуточных передатчиков на кислород

3)аккумулирование энергии окисления в форме макроэргических фосфатных связей (окислительное фосфорилирование).

Вполне естественно, что в ЭТЦ дыхания не нашлось места для пигментов, поскольку речь в данном случае идет о функции, осуществляющейся без непосредственного участия света. Все остальные отличия ЭТЦ дыхания от ЭТЦ фотосинтеза касаются лишь деталей.

Как при фотосинтезе, так и при дыхании целями запасания энергии служит одно и то же соединение, содержащее богатые энергией пирофосфатные связи.

Подавляющая масса органических веществ, создаваемых в процессе фотосинтеза, принадлежит к соединениям запасным, неспецифическим, в химическом отношении инертным. То же относится и к содержащейся внутри их молекул химической энергии, которая также не может быть непосредственно использована клеткой для осуществления какого – либо из видов работы. Придание этой энергии активной формы, ее превращение в энергию действия, а также преобразование неспецифических продуктов фотосинтеза в специфические для организма компоненты протоплазы, то есть ассимиляция этих продуктов, становится осуществимыми только в акте дыхания.