Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

МОЛБИОЛ 2014-лекции / ООФ / Л05_РЕПАРАЦИЯ

.pdf
Скачиваний:
178
Добавлен:
12.02.2015
Размер:
1.63 Mб
Скачать

Лекция 5

ДНК-лигаза репарирует дефект хромосомы

Репарация ДНК

Репарация,

или исправление повреждений в ДНК

Репарация генетических повреждений - способность живых организмов восстанавливать повреждения, возникшие в ДНК уже после ее синтеза

От того, как клетки справляются с повреждениями ДНК, зависят такие кардинальные процессы, как появление наследственных болезней и раковых опухолей, а также старение.

Ферменты репарации исправляют как ошибки, возникшие при репликации, так и не зависящие от репликации.

Ферментативные системы репарации по сложности приближаются к репликационному ферментативному аппарату.

Системы репарации и репликации имеют много общих компонентов.

Принципы репарации ДНК у различных организмов сходны.

Дефекты ДНК после репликации

Этапы контроля последовательности дочерней цепи ДНК при репликации:

Первичный отбор нуклеотидов идет по принципу комплементарности. Способностью к этому виду

отбора обладают все ДНК-полимеразы благодаря полимеризующей 5' 3' активности.

Редактирующий отбор. Его проводят все ДНК-

полимеразы благодаря экзонуклеазной активности 3'

5'.

Первичный и редактирующий отбор допускают примерно 1 ошибку на 109 включенных в ДНК нуклеотидов.

Исправление ошибок в уже синтезированной ДНК. Этим занимаются ферменты репарации.

Повреждающие изменения в ДНК

Точечные мутации

Тип повреждения

Последствия

 

 

 

 

 

 

Нарушается правильное

Влияние на будущие поколения

спаривание оснований

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Структурные нарушения

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Тип повреждения

 

Последствия

 

 

 

 

 

 

 

Введение одноцепочечных

 

Нарушение матричных свойств

 

разрывов

 

ДНК

 

 

 

 

 

 

 

Удаление основания или

 

«---»

 

размыкание пуринового кольца

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Введение ковалентных связей

 

Остановка полимеразы, брешь

 

между основаниями одной цепи

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Введение ковалентных связей

 

Невозможность разделения цепей,

 

между основаниями на

 

остановка полимеразы

 

антипараллельных цепях

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Как возникают повреждения ДНК, не зависящие от репликации?

1.Спонтанно.

2.При индукции мутагенами (химические вещества окружающей среды, многие углеводороды, реагенты, используемые в противоопухолевой химиотерапии) и

даже клеточными метаболитами (например, активные радикалы кислорода, образуемые во время нормального клеточного дыхания в различных биохимических путях).

3.Под действием ионизирующей радиации (гамма-лучи,

рентгеновские лучи).

4.Под действием ультрафиолетового излучения

(особенно ~260 нм, именно в этой области происходит максимальное поглощение ДНК).

1а. Спонтанные повреждения ДНК: апуринизация

Происходит разрыв N-гликозидной связи между пуриновым основанием и дезоксирибозой.

ДНК каждой клетки человека теряет за сутки 5 000-10 000 пуринов (!). В ДНК образуются апуриновые сайты (АР-сайты).

Причины апуринизации: изменение рН, ионизирующее

излучение, повышение температуры и т.д.

Пиримидины тоже могут отщепляться, но скорость этого процесса на два порядка ниже.

Под AP-сайтом сейчас понимается апуриновый/апиримидиновый сайт.

6-оксипурин

2,6-диоксипурин

2,6- диоксипиримидин

1b. Спонтанные повреждения ДНК: дезаминирование

Дезаминирование цитозина до урацила – наиболее частый случай дезаминирования (в ДНК каждой клетки человека происходит около 100 раз за сутки).

Образование продуктов спонтанного дезаминирования может приводить к мутациям при последующей репликации ДНК, поскольку:

гипоксантин образует пару с C (А-Т -> HX-C),

ксантин – с Т (G-C -> X-T), урацил – с А (C-G -> U-A).

Продукты дезаминирования не характерны для ДНК, их можно отличить от обычных оснований и удалить.

Вероято, поэтому в ДНК присутствует Т вместо У – последний нельзя было бы отличить от продукта спонтанного дезаминирования.

2. Повреждения ДНК под действием мутагенов: алкилирование (например, метилирование)

• Гуанин может быть метилирован до О6метилгуанина, что дает мутагенный эффект:

O6-MeG образует пару с Т

(G-C -> O6-MeG –Т).

• Другие частые продукты метилирования –

7-метилгуанин и

3-метиладенин – легко подвергаются

апуринизации вследствие лабилизации N-гликозидной связи между основанием и сахаром.

гуанин О6-метилгуанин

3. Повреждения ДНК под действием ионизирующей

радиации (воздействие гамма-лучей, рентгеновских лучей)

Возникновение разрывов (двух- и одноцепочечных) в ДНК. Двухцепочечные разрывы - это фактически разрывы хромосом (главная причина летального действия ионизирующей радиации).

Возникновение дефектов в ДНК (разрыв пуринового кольца, фрагментация оснований, окисление апуринового сайта).

Радиационно-индуцированная нестабильность генома (РИНЦ): возникновение de novo множественных генетических нарушений неклонального характера у 10-30% потомков облучённых клеток, выживших после облучения.

Радиационно-индуцированная нестабильность генома пepeдaётcя мнoгим пoкoлeниям клeтoк, пpи этом гeнeтичecкиe измeнeния, нaблюдaeмыe в клeткax дoчepниx пoкoлeний, oтличaютcя oт вoзникшиx в caмoй oблyчённoй клeткe.

РИНЦ - повышение вероятности возникновения непредсказуемых спонтанных дефектов.

4.Повреждения ДНК под действием ультрафиолетого света: образование пиримидиновых димеров

 

При облучении ультрафиолетом фотон

 

может беспрепятственно пролететь

 

сквозь клеточные мембраны и другие

 

структуры, и столкнувшись с ДНК,

 

передать ей свою энергию. Когда эта

 

энергия поглощается нуклеотидом, он

 

переходит в возбужденное состояние.

Тиминовый димер

В результате может произойти

ковалентное сшивание атомов углерода

 

 

рядом стоящих пиримидинов (Т-Т, Т-С, С-

 

С) с образованием циклобутанового

 

кольца: циклобутановые димеры.

 

В результате нарушается структура

 

двойной спирали, и ДНК уже не может

 

участвовать в репликации или

 

транскрипции.