(фосфодиэстераза отщепляет

фосфодезоксирибозу, и в ДНК остается пробел длиной в один нуклеотид.)

3.Затем фосфодиэстераза отщепляет фосфодезоксирибозу, и в ДНК остается пробел длиной в один нуклеотид.

4.У эукариот этот пробел заполняется ДНК-полимеразой β, которая присоединяет нуклеотид к 3'-ОН группе предыдущего нуклеотида цепи.

У прокариот заполнение пробела осуществляется

ДНК-полимеразой І. При этом, за счет своей 5'-экзонуклеазной

активности, полимераза может разрушать определенный участок с

5'-конца пробела, одновременно продолжая 3'-конец.

5. Фосфодиэфирная связь присоединенного нуклеотида с последующим нуклеотидом цепи восстанавливается лигазой.

У эукариот обнаружен фермент ДНК-инсертаза, способный

непосредственно пришивать к дезоксирибозе основание в соответствии с комплементарной цепью ДНК.

Механизм BER

Эксцизия нуклеотидов NER (nucleotide excision repair)

прокариоты и эукариоты

Этот механизм используется для коррекции «серьезных» повреждений, которые блокируют репликацию (у человека таковыми являются, в частности, тиминовые димеры).

Эксцизионная репарация нуклеотидов - процесс, связанный с вырезанием участка ДНК, содержащего повреждения заметно нарушающие структуру молекулы (такие как модифицированное основание или пиримидиновый (тиминовый) димер), образующиеся под действием УФ облучения.

Последовательность событий:

(инцизия)

(эксцизия)

1.UvrA и UvrB сканируют ДНК и выявляют поврежденные места

2.После выявления поврежденного участка происходит

-АТР-зависимое изменение конформации UvrB,

-изгиб ДНК и

-диссоциация UvrA (освобождение) из комплекса

-UvrB вызывает локальную денатурацию поврежденного участка и

-привлекает UvrC.

3.Комплекс UvrBС вносит однонитевые разрывы с 5’- и 3’- конца от повреждения:

Оба белка (UvrB + UvrС) в составе комплекса приобретают эндонуклеазную активность:

UvrC делает одноцепочечный разрез в поврежденной цепи за несколько нуклеотидов по направлению к 5'-концу от повреждения,

UvrB - разрез с другой стороны от повреждения.

Длина участка между разрезами равна 12 (или 13 в случае для тиминового димера) нуклеотидам.

4.DNA хеликаза UvrD разрушает двойную спираль между двумя разрезами, т.е. удаляет поврежденный участок из дуплекса (+гидролиз АТР) .

5.DNA Pol I (или Pol II) застраивает брешь и лигаза «зашивает» однонитевой разрыв.