- •РЕПАРАЦИЯ ДНК
- •Видимо, уже на ранних стадиях эволюции ДНК заменила РНК в качестве носителя генетической
- •Репарация (repair) ДНК - один из общих биологических процессов, направленный на исправление ошибок
- •Часто системы репарации работают во время или сразу после репликации.
- •Причины появления повреждений в ДНК
- •Основные типы повреждения ДНК
- •Гидролиз
- •Дезаминирование
- •Чаще всего дезаминируется цитозин (в каждой клетке человека за день происходит около 100
- •Алкилирование
- •Иногда может происходить размыкание пуринового кольца.
- •Главным нарушением, возникающим под действием ультрафиолета, является насыщение двойных связей оснований и образование
- •Типы репарации:
- •Cтратегии коррекции повреждений
- •Очевидным случаем прямой репарации является сшивание
- •О6-meG образует пару с Т
- •Прямое удаление повреждений
- •Происходит необратимое ковалентное присоединение метильной или этильной группы к остатку Cys в активном
- •Лиа́зы — отдельный класс ферментов, катализирующих реакции негидролитического и неокислительного разрыва различных химических
- •Более радикальным и эффективным путем исправления нарушений нуклеотидов является
- •Последовательность событий:
- •Base excision repair (BER)
- •Как работают ДНК-гликозилазы?
- •2. После действия ДНК-N-гликозилаз в ДНК остается
- •(фосфодиэстераза отщепляет
- •3.Затем фосфодиэстераза отщепляет фосфодезоксирибозу, и в ДНК остается пробел длиной в один нуклеотид.
- •Механизм BER
- •Эксцизия нуклеотидов NER (nucleotide excision repair)
- •Последовательность событий:
- •1.UvrA и UvrB сканируют ДНК и выявляют поврежденные места
- •Узнавание и связывание
- •Вывод: эксцизионная репарация всегда использует один принцип: нарушенный участок ДНК удаляется, а затем
- •Последовательность событий:
- •Исправление ошибок репликации ( Мismatch repair )
- •Неспаренные основания ДНК могут возникать в результате трех событий:
- •Система репарации должна каким-то образом отличать друг от друга две цепи одной молекулы
- •В случае нарушений спаривания, возникающих в результате репликации или репарации, новосинтезированная цепь ДНК
- •По бактериальному геному распределены (на среднем расстоянии 256 пар оснований) короткие палиндромные последовательности
- •В бактериальной клетке за репарацию ошибочно спаренных нуклеотидов (мисметчей) отвечает система
- •Dam -зависимая система репарации mutHLSU
- •Как работает dam -зависимая система репарации?
- •У E. coli MutS сканирует ДНК. Ошибки (мисметчи) опознаются в силу того, что
- •-Белки МutН связываются с тетрануклеотидными
- •По логике событий ошибочно включенный нуклеотид должен находиться в новосинтезированной цепи ДНК. Эта
- •В эукариотических клетках также существует система коррекции ошибок репликации
- •Уэукариот механизм распознавания новосинтезированной цепи не известен.
- •2. Mut Y-зависимая система репарации
- •А если не успели все починить а ДНК уже реплицируется?
- •Репликативная машина обычно
- •Обход препятствия посредством смены матричных цепей - продолжение репликации с сохранением ошибки в
- •Репарация без репарации - SOS-репарация –
- •Таким образом,
- •Репарация двунитевых разрывов
- •С рекомбинацией
- •Процесс репарации двунитевых разрывов разделяют на три этапа.
- •Репарация двунитевого разрыва посредством гомологичной рекомбинации
- •Homologous Recombination Repairs ds Breaks
- •Non-Homologous End Joining (Double Strand Breaks)
- •Non-Homologous End Joining (Double Strand Breaks)
- •Таким образом, в процессе соединения происходит потеря нескольких пар оснований.
РЕПАРАЦИЯ ДНК
Видимо, уже на ранних стадиях эволюции ДНК заменила РНК в качестве носителя генетической информации. Этому событию должны были способствовать бóльшая химическая устойчивость ДНК, связанная с заменой рибозы на дезоксирибозу, и двуцепочечное строение, «скрывающее» целый ряд реакционноспособных группировок.
Но, несмотря на свои «преимущества», ДНК постоянно подвергается
химическим изменениям, как спонтанным, так и индуцируемым мутагенами и даже клеточными метаболитами.
Еще одна обычная причина повреждений ДНК – радиация и ультрафиолетовое (УФ) излучение.
Большинство происходящих с ДНК изменений недопустимы:
они либо приводят к вредным мутациям, либо блокируют репликацию ДНК и вызывают гибель клетки.
Поэтому все клетки имеют специальные системы исправления повреждений, репарации ДНК. Нарушение этих систем губительно. Так у людей, страдающих тяжелым наследственным заболеванием –
пигментной ксеродермой, нарушена репарация УФвых повреждений ДНК. Такие больные не могут бывать на солнце и обычно умирают в раннем возрасте от злокачественных заболеваний.
Репарация (repair) ДНК - один из общих биологических процессов, направленный на исправление ошибок синтеза ДНК при репликации, а также
многочисленных повреждений, возникающих в ДНК вследствие действия
химических и физических факторов.
Ктаким повреждениям относятся различные
-химические модификации азотистых оснований,
-ковалентные сшивки соседних пиримидинов (образование
пиримидиновых, чаще тиминових, димеров) под действием ультрафиолетового излучения,
-одно-и двуцепочечные разрывы под действием ионизирующей радиации
исвободных радикалов и т.д.
Часто системы репарации работают во время или сразу после репликации.
Большинство репарационных процессов предусматривает удаление
поврежденного одноцепочечного участка с последующим синтезом ДНК с помощью ДНК-полимеразы.
Но существуют и процессы, связанные с непосредственным «исправлением» поврежденного элемента за счет прямого действия
определенных ферментов.
Принципы репарации ДНК у различных организмов сходны.
Причины появления повреждений в ДНК
•Ошибки репликации
•Повреждения ДНК эндогенными агентами Гидролиз -
депуринизация (АР-сайт), дезаминирование
• Повреждения ДНК экзогенными агентами облучение (УФ, радиация) –
ковалентные сшивки соседних пиримидинов и разных цепей, одно- и двуцепочечные разрывы повреждение химическими агентами - алкилирование
•Репликация «через повреждения» с использованием полимераз, отличающихся низкой точностью копирования
Основные типы повреждения ДНК
Повреждение одиночных нуклеотидов
Врезультате гидролиза:
-Апуринизация — отщепление азотистых оснований
-Дезаминирование — отщепление аминогруппы от
азотистого основания
Алкилирование азотистых оснований – ковалентные присоединения метильных или этильных групп к атомам О или N.
Разрыв цепи ДНК
Образование поперечных сшивок между основаниями одной цепи или разных цепей ДНК
Гидролиз
ВДНК сравнительно часто и спонтанно происходит
апуринизация и дезаминирование оснований.
Результатом апуринизации является АР-сайт (apurinic-apyrimidinic) – дезоксирибоза, лишенная основания.
Дезаминирование
При дезаминировании гуанин превращается в ксантин,
цитозин - в урацил, аденин – в гипоксантин.
Наиболее вредно дезаминирование цитозина и аденина: обе реакции после репликации приводят к мутациям.