Международная классификация ферментов

Класс	Тип катализируемой реакции
1. Оксидоредуктазы	Передача электронов
2. Трансферазы	Передача функциональных групп
3. Гидролазы	Гидролиз
4. Лиазы	Присоединение групп по двойным связям или образование двойных связей при удалении групп
5. Изомеразы	Перегруппировка молекулы с образованием изомерных форм
6. Лигазы	Образование C-C, C-S, C-O и C-N связей в реакциях конденсации с распадом АТФ на АДФ

В ферменте реализуется специфическое окружение, внутри которого заданная реакция энергетически более предпочтительна. Отличительной особенностью ферментативной реакции является наличие некого "кармана" у фермента, называемого активным центром. Молекула, связываемая активным центром, получила название субстрата. Образование фермент-субстратного комплекса является основой для описания механизма ферментативных реакций.

Е + S ES ЕР Е + Р ,

Е - фермент, S - субстрат, Р - продукт, ES - комплекс фермента с субстратом,

ЕР - комплекс фермента с продуктом.

Переходное состояние, (₊⁺)

Свободная Химическая

энергия, G G_SP+⁺ G_{PS +}⁺ реакция

S

G ₊⁺

P

Координата реакции

(₊⁺)

G_некат+⁺ Ферментативная

С вободная реакция

энергия, G G_{кат +}⁺

G_кат+⁺ < G_некат+⁺

ES EP

Координата реакции

Исходя из теории переходного состояния, скорость реакции равна:

K  T

k =  e ^{- G / RT}

h ,

где К - постоянная Больцмана, h - постоянная Планка.