- •Вопрос 7 Активный центр белков и его специфическое взаимодействие с лигандом как основа биологической функции белков. Комплементарность взаимодействующих белков с лигандом. Обратимость связывания.
- •Вопрос 9 Физико-химические свойства белков. Молекулярная масса, размеры и форма, растворимость, ионизация и гидратация.
- •2. Различия белков по форме молекул
- •1. Реакции осаждения белков бывают обратимыми и необратимыми.
Вопрос 9 Физико-химические свойства белков. Молекулярная масса, размеры и форма, растворимость, ионизация и гидратация.
Основные физико-химические свойства белков:
1. Различия белков по молекулярной массе: белки явл. высокомолекулярныыми
соединениями, но могут сильно отличаться по молекулярной массе, которая колеблется от 6000 до 1 000 000 Д и выше. Молекулярная масса белка зависит от количества АК остатков в ППЦ, а для олигомерных белков – и от количества входящих в него протомеров (или субъединиц).
2. Различия белков по форме молекул
Глобулярные – имеют более компактную структуру, в третичной стр-ре имеют
шарообразную форму, их гидрофобные радикалы в большинстве своём спрятаны в гидрофобное ядро, и они значительно лучше растворимы в жидкостях организма (гемоглобин, инсулин)
Фибриллярные – имеют нитевидн. стр-ру, нерастворимы (коллаген, кератин)
3. Растворимость – это способность белка равномерно располагаться
(распространяться) между молекулами растворителя, зависит от аминокислотного состава белка и природы растворителя.
Растворимость белка определяется составом растворителя, т.е. наличием в растворе
других растворённых веществ. Например, некоторые белки легче растворяются в слабом солевом растворе, чем в дистиллированной воде.
Увеличение конц. нейтральных солей может способствовать выпадению определённых белков в осадок.
Денатурирующие агенты, присутствующие в растворе, также снижают
растворимость белков.
4. Гидратация – способность белков прочно связывать значительное количество
влаги. На поверхности большинства внутриклет. белков преобладают полярные радикалы, однако соотношение полярных и неполярных групп отлично для разных индивидуальных белков. Протомеры олигомерных белков в области контактов друг с другом часто содержат гидрофобные радикалы.
Поверхности белков, функционирующих в составе мембран или прикрепляющиеся
к ним в процессе функционирования, также обогащены гидрофобными радикалами. Такие белки лучше растворимы в липидах, чем в воде.
5. Кислотно основные свойства – белки обладают кислотными и основными
свойствами из-за присутствия -СООН и - NН2 групп.
6. Ионизация – заряд белковой молекулы обусловлен реакцией среды и
соотношением ионогенных групп в белковой молекуле.
Полярные (неионогенные) группы: - ОН (сер, тре, тир) SН (цис), Амидная (глн, асн), Пептидные группировки
Полярные (ионогенные) группы: СОО-(асп, глу), NН3+ (лиз, арг), N – (гис)
Суммарный заряд белковой молекулы зависит от соотношения ионизированных анионных радикалов Глу и Асп и катионных радикалов Лиз, Apг и Гис.
Степень ионизации функц-х групп этих радикалов зависит от рН среды.
При рН раствора около 7 все ионогенные группы белка находятся в ионизированном состоянии.
В кислой среде увеличение концентрации протонов (Н+) приводит к подавлению диссоциации карбоксильных групп и уменьшению отрицательного заряда белков: -СОО- + Н+ → -СООН.
В щелочной среде связывание избытка ОН" с протонами, образующимися при диссоциации NH3+с образованием воды, приводит к уменьшению положительного заряда белков:
-NH3+ +ОН- → -NH2 + H2O.
Изоэлектрическая точка (pI) – значение рН, при котором белок приобретает
суммарный нулевой заряд. В pI количество «+» и «-» заряженных групп белка одинаково, т.е. белок находится в изоэлектрическом состоянии.
Так как большинство белков в клетке имеет в своём составе больше
анионогенных групп (-СОО-), то pI этих белков лежит в слабокислой среде.
pI белков, в составе которых преобладают катионогенные группы,
находится в щелочной среде.
Наиболее яркий пример таких внутриклеточных белков, содержащих много аргинина и лизина, - гистоны, входящие в состав хроматина.
Одноименно заряженные молекулы белка отталкиваются друг от друга, что предотвращает агрегацию молекул белка и образование осадка.
Белки, имеющие суммарный положительный или отрицательный заряд, лучше растворимы, чем белки, находящиеся в pI
Заряженные белки могут двигаться в электрическом поле:
Анионные белки («-» заряд) будут двигаться к «+» заряженному аноду
Катионные белки («+» заряд) будут двигаться к «-» заряженному катоду
Вопрос 10
Методы выделения индивидуальных белков: методы осаждения солями и органическими растворителями, гель-фильтрация, электрофорез, ионообменная и аффинная хроматографии. Методы количественного определения белка.