Частная вирусология 1
.pdfФедеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования
“Уральский государственный медицинский университет” Министерства здравоохранения Российской Федерации
Кафедра микробиологии, вирусологии и иммунологии
Литусов Н.В.
Частная вирусология
Иллюстрированное учебное пособие
Екатеринбург
2019
2
УДК 578.7
Рецензент: профессор кафедры эпидемиологии ФГБОУ ВО УГМУ доктор медицинских наук профессор Слободенюк А.В.
Литусов Н.В. Частная вирусология. Иллюстрированное учебное пособие. – Екатеринбург: Изд-во УГМУ, 2019. – 313 с.
Иллюстрированное учебное пособие “Частная вирусология” подготовлено в качестве информационного сопровождения самостоятельной работы студентов, осваивающих основные образовательные программы высшего образования укрупненной группы специальностей Здравоохранение. Учебное пособие разработано в соответствии с требованиями ФГОС ВО и предусматривает формирование знаний по частной вирусологии.
В иллюстрированном учебном пособии приводятся сведения о таксономическом положении, структуре, особенностях строения, репродукции вирусов – возбудителей инфекционных заболеваний человека, клинике, диагностике, лечении и профилактике вызываемых ими заболеваний. Пособие содержит вопросы для контроля усвоения материала и тренировочные тестовые задания. Пособие снабжено иллюстрациями, помогающими усваивать изучаемый материал.
Иллюстрированное учебное пособие предназначено для работы студентов как при подготовке к практическим занятиям, так и непосредственно на практических занятиях.
© ФГБОУ ВО УГМУ, 2019
© Литусов Н.В.
|
3 |
Содержание |
|
1. РНК-СОДЕРЖАЩИЕ ВИРУСЫ........................................................................................................ |
5 |
1.1. АСТРОВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО ASTROVIRIDAE).................................................................... |
5 |
1.2. КАЛИЦИВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО CALICIVIRIDAE) ............................................................. |
10 |
1.2.1. НОРОВИРУСЫ.............................................................................................................................. |
10 |
1.3. ОРТОМИКСОВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО ORTHOMYXOVIRIDAE)........................................ |
16 |
1.3.1. ВИРУСЫ ГРИППА ....................................................................................................................... |
16 |
1.4. ПАРАМИКСОВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО PARAMYXOVIRIDAE) ........................................... |
39 |
1.4.1. ВИРУСЫ ПАРАГРИППА............................................................................................................ |
39 |
1.4.2. ВИРУС ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПАРОТИТА ........................................................................... |
44 |
1.4.3. ВИРУС КОРИ................................................................................................................................. |
49 |
1.5. ПИКОРНАВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО PICORNAVIRIDAE) ...................................................... |
65 |
1.5.1. ЭНТЕРОВИРУСЫ......................................................................................................................... |
67 |
1.5.1.1. ВИРУСЫ ПОЛИОМИЕЛИТА................................................................................................. |
71 |
1.5.1.2. ВИРУСЫ КОКСАКИ................................................................................................................. |
84 |
1.5.1.3. ВИРУСЫ ГРУППЫ ЕСНО ...................................................................................................... |
87 |
1.5.2. РИНОВИРУСЫ.............................................................................................................................. |
88 |
1.5.3. ВИРУС ГЕПАТИТА А.................................................................................................................. |
93 |
1.6. ПНЕВМОВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО PNEUMOVIRIDAE)....................................................... |
108 |
1.6.1. РЕСПИРАТОРНО-СИНЦИТИАЛЬНЫЙ ВИРУС ............................................................... |
108 |
1.7. РАБДОВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО RHABDOVIRIDAE)............................................................ |
115 |
1.7.1. ВИРУС БЕШЕНСТВА................................................................................................................ |
115 |
1.8. РЕОВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО REOVIRIDAE) .......................................................................... |
136 |
1.8.1. РОТАВИРУСЫ ............................................................................................................................ |
138 |
1.9. РЕТРОВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО RETROVIRIDAE)................................................................ |
146 |
1.9.1. ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА....................................................................... |
146 |
1.10. ТОГАВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО TOGAVIRIDAE) .................................................................. |
178 |
1.10.1. ВИРУС КРАСНУХИ ................................................................................................................. |
178 |
1.11. ФЛАВИВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО FLAVIVIRIDAE) ............................................................. |
192 |
1.11.1. ВИРУС КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА............................................................................... |
192 |
1.11.2. ВИРУС ГЕПАТИТА С.............................................................................................................. |
211 |
2. ДНК-СОДЕРЖАЩИЕ ВИРУСЫ ................................................................................................... |
226 |
2.1. АДЕНОВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО ADENOVIRIDAE) .............................................................. |
226 |
2.2. ГЕПАДНАВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО HEPADNAVIRIDAE) ................................................... |
234 |
2.2.1. ВИРУС ГЕПАТИТА В ................................................................................................................ |
234 |
2.3. ГЕРПЕСВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО HERPESVIRIDAE) .......................................................... |
253 |
2.3.1. ВИРУСЫ ПРОСТОГО ГЕРПЕСА ........................................................................................... |
259 |
|
4 |
2.3.2. ВИРУС ВЕТРЯНОЙ ОСПЫ – ОПОЯСЫВАЮЩЕГО ГЕРПЕСА.................................... |
267 |
2.3.3. ВИРУС ГЕРПЕСА ЧЕЛОВЕКА 6 ТИПА ............................................................................... |
274 |
2.3.4. ВИРУС ЭПШТЕЙНА-БАРР...................................................................................................... |
279 |
2.3.5. ЦИТОМЕГАЛОВИРУС ............................................................................................................. |
289 |
2.4. ПАПИЛЛОМАВИРУСЫ (СЕМЕЙСТВО PAPILLOMAVIRIDAE) ....................................... |
299 |
2.4.1. ВИРУС ПАПИЛЛОМЫ ЧЕЛОВЕКА ..................................................................................... |
300 |
УЧЕБНАЯ ЛИТЕРАТУРА................................................................................................................... |
312 |
5
1. РНК-содержащие вирусы
1.1. Астровирусы (семейство Astroviridae)
Астровирусы (греч. astron – звезда) относятся к семейству безоболочечных вирусов с одноцепочечной геномной плюс-РНК, Астровирусы были обнаружены в 1975 г. при электронной микроскопии препарата, приготовленного из кала больного человека. Название вирусов происходит от звездчатой формы вирионов, наблюдаемой при электронной микроскопии.
Таксономическое положение. Астровирусы относятся к семейству Astroviridae, объединяющему два рода: Avastrovirus (инфицируют птиц, 3 вида) и Mamastrovirus (инфицируют млекопитающих, 19 видов). Астровирусы относятся к IV группе по Балтимору, то есть к (+)оцРНКвирусам. Поражение у человека вызывают виды Human astrovirus, входящие в состав рода Mamastrovirus. Внутри рода Mamastrovirus выделяют геногруппы I и II. Виды Human astrovirus входят в состав обеих геногрупп (рисунок 1).
Mamastrovirus
геногруппа I
Avastrovirus
геногруппа I
Avastrovirus |
|
|
|
геногруппа II |
|
Mamastrovirus |
|
|
|
|
|
|
|
геногруппа |
II |
|
|
|
|
Рисунок 1 – Классификация астровирусов. Заимствовано из Интернетресурсов.
6
Виды астровирусов подразделяются на серовары.
Структура. Вирионы астровирусов имеют сферическую форму диаметром 28-35 нм икосаэдрической симметрии. При электронной микроскопии вирионы имеют звездчатую форму (рисунок 2), что и послужило основанием для названия вирусов.
Рисунок 2 – Звездчатая форма астровирусов при электронной микроскопии. Заимствовано из Интернет-ресурсов.
Суперкапсид у астровирусов отсутствует. Капсид состоит из белка VP34. В капсид встроены отростки, образованные белками VP27 и VP25. Геном представлен линейной молекулой плюс-РНК. Структура астровирусов представлена на рисунке 3.
Белок капсида
VP34
VP27
VP25
Рисунок 3 – Структура астровирусов. Заимствовано с сайта ViralZone.
7
Геном астровирусов содержит 3 перекрывающиеся рамки считывания (ORF1a, ORF1b и ORF2). Неструктурные белки кодируются ORF1a и ORF1b, а структурный белок-предшественник кодируется ORF2 (рисунок 4).
Расщепление |
каспазой хозяина |
Расщепление |
трипсином хозяина |
Рисунок 4 – Геном астровирусов. Заимствовано с сайта ViralZone.
Резистентность. Астровирусы устойчивы при рН 3,0 – 7,0. Эпидемиология. Источником астровирусной инфекции является
человек с клинически выраженной или бессимптомной формами заболевания. Вирусоносительство при астровирусной инфекции не доказано. Механизмы передачи – фекально-оральный и контактный. Пути передачи – водный, пищевой (алиментарный), контактно-бытовой. Преимущественно поражаются дети, пожилые люди и лица с иммунодефицитами. Пик заболеваемости астровирусной инфекцией регистрируется зимой.
Клиника. Астровирусы человека являются одной из причин гастроэнтеритов у детей раннего возраста. Инкубационный период составляет 3-4 дня. Симптомами заболевания являются диарея, тошнота, рвота, недомогание, субфебрильная температура и абдоминальные боли. Длительность заболевания – 2-3 дня. Инфицированные не нуждаются в госпитализации, так как симптомы заболевания проходят сами собой в течение короткого периода.
Диагностика. Вирусные частицы, антигены вирусов и их нуклеиновые кислоты можно выявить в фекалиях инфицированных людей с помощью электронной микроскопии, ИФА, иммунофлюоресценции и ПЦР. Метод ПЦР в реальном времени позволяет выявлять все генотипы астровирусов человека.
8
Профилактика и лечение. Средства специфической профилактики и лечения астровирусной инфекции отсутствуют.
Вопросы для контроля усвоения материала
1.Таксономическое положение вируса астровирусов.
2.Структура астровирусов.
3.Цикл репродукции астровирусов.
4.Патогенез и клиническая картина астровирусной инфекции.
5.Диагностика, профилактика и лечение астровирусной инфекции.
Тренировочные тесты
1.Астровирус относится к семейству:
1.1.Astroviridae
1.2.Picornaviridae
1.3.Filoviridae
1.4.Orthomyxoviridae 1.5 Reoviridae
2.Астровирус человека относится к роду:
2.1.Respirovirus
2.2.Rubulavirus
2.3.Avastrovirus
2.4.Mamastrovirus
2.5.Orthopneumovirus,
3.Геном астровирусов представлен:
3.1.молекулой минус-РНК
3.2.фрагментированной ДНК
3.3.линейной молекулой плюс-РНК
3.4.двуспиральной линейной ДНК
3.5.фрагментированная минус-РНК
4. Для астровирусов характерно:
4.1.отсутствие суперкапсида
4.2.наличие суперкапсида
4.3.сферическая форма
4.4.плюс-РНК-геном
4.5.фрагментированный ДНК-геном
9
5.Для астровирусов характерно:
5.1.водный путь передачи
5.2.контактно-бытовой путь передачи
5.3.алиментарный путь передачи
5.4.трансплацентарная передача
5.5.воздушно-пылевой путь передачи
6.Для профилактики астровирусной инфекции используют:
6.1.инактивированную вакцину
6.2.вакцина не разработана
6.3.живую ослабленную вакцину
6.4.убитую вакцину
6.5.субвирионную вакцину
Правильные ответы: 1.1; 2.4; 3.3; 4.1, 4.2, 4.4; 5.1, 5.2, 5.3; 6.2.
10
1.2. Калицивирусы (семейство Caliciviridae)
Семейство Caliciviridae объединяет РНК-геномные вирусы, поражающие широкий круг видов позвоночных животных, включая человека, и насекомых. Калицивирусы относятся к IV группе вирусов по Балтимору: (+)оцРНК-вирусам. Все калицивирусы распределены в 4 рода: Lagovirus (вирусы, поражающие зайцеобразных), Norovirus (вирусы, поражающие человека), Sapovirus (вирусы, поражающие свиней, норок), Vesivirus (вирусы, поражающие крупный рогатый скот, свиней, кошек и других животных). Внутри родов выделяют виды. Каждый вид калицивирусов связан с одним или группой близких видов хозяев.
1.2.1. Норовирусы
Норовирусы относятся к роду Norovirus. Род Norovirus (прежнее название – норуолкили норфолк-подобные вирусы) входит в семейство калицивирусов (Caliciviridae). Примерно в 90 % случаев этот вирус является причиной вирусных желудочно-кишечных инфекций человека.
Впервые норовирусная инфекция была зарегистрирована в местечке Норуолк (Норфолк), Огайо в ноябре 1968 г. во время вспышки острого гастроэнтерита среди школьников. В 1972 г. вирус был обнаружен при электронной микроскопии препаратов, приготовленных из фекалий больных людей.
Таксономическое положение. Норовирусы относятся к роду
Norovirus, семейству калицивирусов (Caliciviridae). Различают 5 геногрупп норовирусов, большинство поражающих человека норовирусов включены в геногруппы GI, GII и GIV. Например, геногруппа GI включает вирус Норволк, вирус Пустыни Шилд и вирус Саут-хэмптон, а геногруппа GII объединяет вирус Бристоль, вирус Лордсдейл, вирус Торонто, вирус Мексико, вирус Гавайи и вирус Снежных гор. Геногруппы подразделяются на кластеры или генотипы. Например, геногруппа GII содержит 19 генотипов. Большинство вспышек гастроэнтерита у взрослых обусловлено норовирусом геногруппы GII генотипа 4 (сокращенно GII.4). Геногруппа GIII инфицирует рогатый скот, а геногруппа GV недавно была обнаружена у мышей.
Структура вируса. Норовирусы имеют сферическую форму, размер 27-38 нм (рисунок 5).