
Бабьева И. П., Чернов И. Ю. Биология дрожжей. М. Товарищество научных изданий КМК, 2004
.pdf
К 250-летию Московского государственного университета им. М.В.Ломоносова
И.П.Бабьева, И.Ю.Чернов
Биология дрожжей
1
УДК 576.8
Рецензенты:
докт. биол. наук Д.Г.Звягинцев докт. биол. наук Ю.Т.Дьяков
При финансовом содействии гранта Президента Российской Федерации для поддержки
ведущих научных школ Российской Федерации
Бабьева И.П., Чернов И.Ю. Биология дрожжей. М.: ..., 2004, ... с.
В учебном пособии представлены сведения по основным разделам зимологии - науки о дрожжевых грибах. Показано, как менялись представления о природе дрожжей от их открытия до настоящего времени. Обсуждается значение дрожжей вкачестве модели для изучения многих вопросов клеточной биологии. Рассматриваются особенности строения дрожжевой клетки, химический состав и функции основных клеточных структур, особенностиморфологиидрожжевыхгрибов, типыихразмножения. Анализируются примеры жизненных циклов наиболее изученныхвидов. Прианализеособенностейфизиологиидрожжейособоевниманиеуделяетсясоотношениюдыхательногоибродильноготиповметаболизма, атакжеихэкофизиологическойхарактеристике. Наиболееподробно рассматриваются закономерности расселения дрожжей в природных местообитаниях, биотические взаимодействия дрожжей и других организмов, особенности географического распространения. Данные, приводимыевэтомразделе, накопленыавторами врезультатемноголетнейработыпоизучениюэкологиидрожжейвприродныхместообитаниях. Обсуждается функциональная роль дрожжей в экосистемных процессах. Дается обзор практического использования дрожжей как в традиционных бродильных производствах, так и в современной биотехнологии. Взаключенииприводитсясистематический обзорродовдрожжевых грибов и обсуждаются последние достижения в их классификации.
Длястудентовбиологическихфакультетовифакультетовпочвоведения университетов.
2
Содержание |
|
ВВЕДЕНИЕ ................................................................................................. |
5 |
ЗАРОЖДЕНИЕ И РАЗВИТИЕ ЗНАНИЙ О ДРОЖЖАХ........................ |
7 |
ДРОЖЖЕВАЯ КЛЕТКА. ЦИТОЛОГИЯ................................................ |
11 |
Компоненты дрожжевой клетки.......................................................... |
12 |
Изменения клеточных структур в онтогенезе.................................... |
21 |
Цитологические особенности дрожжей в различных условиях роста. 22 |
|
МОРФОЛОГИЯ И БЕСПОЛОЕ РАЗМНОЖЕНИЕ ............................... |
26 |
Микроморфология дрожжей................................................................ |
28 |
Клеточный цикл.................................................................................... |
40 |
ПОЛОВОЕ РАЗМНОЖЕНИЕ И ЖИЗНЕННЫЕ ЦИКЛЫ ДРОЖЖЕЙ42 |
|
Аскомицетовые дрожжи....................................................................... |
45 |
Базидиомицетовые дрожжи................................................................. |
52 |
ОСОБЕННОСТИ МЕТАБОЛИЗМА ....................................................... |
57 |
Спиртовое брожение ............................................................................ |
58 |
Дыхание................................................................................................. |
61 |
Вторичные продукты метаболизма..................................................... |
64 |
Источники азота.................................................................................... |
65 |
ЛИМИТИРУЮЩИЕ ФАКТОРЫ............................................................ |
68 |
РАСПРОСТРАНЕНИЕ ДРОЖЖЕВЫХ ГРИБОВ В ПРИРОДЕ........... |
75 |
Специфические локусы развития дрожжей ....................................... |
77 |
Дрожжи на растениях, растительных остатках и в почве................. |
86 |
Географические закономерности в распространении дрожжей....... |
99 |
Функции дрожжевых грибов в природных экосистемах ................ |
110 |
ДРОЖЖИ - ВОЗБУДИТЕЛИ ЗАБОЛЕВАНИЙ ЧЕЛОВЕКА............. |
115 |
Кандидоз.............................................................................................. |
115 |
Криптококкоз....................................................................................... |
117 |
Malassezia ............................................................................................ |
120 |
ПРОМЫШЛЕННОЕ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ДРОЖЖЕЙ ...................... |
122 |
Традиционные процессы.................................................................... |
122 |
Дрожжи в современной биотехнологии ........................................... |
128 |
3
СИСТЕМАТИКА ДРОЖЖЕЙ............................................................... |
134 |
Концепция вида у дрожжей ............................................................... |
136 |
Признаки и критерии, используемые в систематике дрожжей ...... |
138 |
Схема стандартного описания вида у дрожжей............................... |
145 |
Особенности систематики анаморфных дрожжей .......................... |
147 |
Классификация дрожжей ................................................................... |
149 |
Идентификация дрожжей................................................................... |
216 |
Коллекции дрожжей ........................................................................... |
223 |
ЛИТЕРАТУРА.......................................................................................... |
226 |
НЕКОТОРЫЕ ИНТЕРНЕТ САЙТЫ, ПОЛЕЗНЫЕ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ |
|
БИОЛОГИИ ДРОЖЖЕЙ ................................................................... |
227 |
ИСТОЧНИКИ ЗАИМСТВОВАННЫХ ИЛЛЮСТРАЦИЙ ................. |
229 |
УКАЗАТЕЛЬ ТЕРМИНОВ..................................................................... |
230 |
УКАЗАТЕЛЬ ЛАТИНСКИХ НАЗВАНИЙ ........................................... |
236 |
4
ВВЕДЕНИЕ
Чтобыописатьсущностьиперспективыразвитиянаукиодрожжахзимологии, следует в первую очередь дать определение самому объекту этой науки - дрожжевым организмам. Казалось бы, вопрос о том, что такоедрожжи, весьмапростой: одрожжахзнаеткаждый, безнихнеприготовить кислого теста, вина, пива. И все же дать научное определение дрожжам и четко очертить границы этой группы микроорганизмов становится все труднее по мере расширения наших знаний об этих микроскопических существах, которые включают в царство Mycota.
То, чтодрожжиэтогрибы, сталопонятнымужесначалапервыхнаучных описаний этих организмов, сделанных в первой половине прошлого века. Несмотря на одноклеточное строение, внешне более сходное с крупнымибактериями, чемсмицелиальнымигрибами, дрожжипоультраструктурнойорганизацииклеткииспособамбеспологоиполовогоразмножения сразужебылиотнесеныкгрибам. Однакоизучалиих, какправило, немикологи, амикробиологи. Причинаэтогозаключаетсявтом, чторостдрожжей наплотныхсредахоченьсходенсбактериальным. Крометого, человекавсегдапривлекалосвойстводрожжейвызыватьспиртовоеброжение, и, следовательно, вработесдрожжамипреобладалифизиолого-биохимическиепод- ходыиметоды. Микологижеисторическибылисвязанысботаниками, так как долгое время грибы считали низшими растениями, и поэтому в основе ихизучениявсегда были методы описательной морфологии, анефизиологии. Все это привело к тому, что дрожжи были искусственно оторваны от всехостальныхгрибов, ихотяим«повезло», чтоонибылиобъектамиработ такихкорифеевмикробиологии, какЛуиПастер, А.Клюйвер, Г.А.Надсон, в таксономическом отношении были допущены серьезные ошибки, которые ивнаше время исправлять непросто. Подсильным влияниембродильных свойствнекоторыхвидовдрожжейэтугруппуорганизмовдолгоевремяограничивалиодноклеточнымигрибами, которыеобразуютаскоспорыиспособны вызывать спиртовое брожение. Все другие грибы с одноклеточной стадией в жизненном цикле называли дрожжеподобными грибами. Только всамомконцеXX в. наукаодрожжахполностьювернуласьвмикологию, а представление обобъектах зимологиизначительнорасширилось.
Сейчаскдрожжампринятоотноситьвсетегрибы, которыеспособны вегетативно размножаться в одноклеточной форме, независимо от того, имеютлионимицелиальнуюфазувжизненномциклеиродственныаско-
5
мицетовым или базидиомицетовым грибам. Среди дрожжей сейчас рассматривают даже гаплоидные одноклеточные стадии таких грибов, которые образуют макроскопические плодовые тела. При таком понимании дрожжей, их границы с мицелиальными грибами становятся расплывчатыми, а классификация сливается с общей системой грибов.
В связи с новым подходом к трактовке группы дрожжей существенно расширяется и поиск среди них тех биологических способностей, которые могут быть полезными для человека. Наряду с традиционными процессамииспользованиядрожжейвбродильныхпроизводствах, впищевой промышленности и для получения кормовых препаратов на разных источниках сырья, разрабатываются новые пути применения дрожжей для синтеза многих ценных веществ, таких как полисахариды, ферменты и коферменты, микоцины, витамины, органические кислоты, полиолы, каротиноидыимногиедругиесоединения. Дрожжииспользуются как векторные системы при разработке биотехнологических процессов производства инсулина, интерферона, гетерологичных белков.
По-новому следует оценивать и роль дрожжей в природных экосистемах. Например, считавшиеся долго безвредными комменсалами многие эпифитные дрожжи, обильно обсеменяющие зеленые части растений, могут оказаться не такими уж «невинными», если учесть, что они представляютсобойлишьгаплоиднуюстадиювжизненномциклеорганизмов, близкородственныхфитопатогеннымголовневымилиржавчинным грибам. И, наоборот, очень опасные патогены для человека - дрожжи, вызывающие болезнь мозга - криптококкоз - в природе имеют сапротрофную стадию и легко выделяются из мертвых органических субстратов, таких как помет голубей. Из этих примеров видно, что для пониманияэкологическихфункцийдрожжейнеобходимоизучениеполных жизненныхцикловкаждоговида. Однаруженыи«почвенные» дрожжис особыми функциями, важными для образования почвенной структуры. Неисчерпаемы по многообразию и связи дрожжей с животными.
Настоящая книга - это краткая сводка современного состояния наших знаний о разных сторонах жизни дрожжевых грибов: их морфологии и цитологии, способах размножения и жизненных циклах, физиологии и биохимии, экологии и географии, таксономии, а также об основных направлениях их промышленного использования.
6

ЗАРОЖДЕНИЕ И РАЗВИТИЕ ЗНАНИЙ О ДРОЖЖАХ
Всю историю тесного общения человека со своими постоянными одноклеточными микроскопическими спутниками - дрожжами можно условно разделить на отдельные периоды (табл. 1).
Впервый, донаучный период, начало которого уходит корнями в
ХХв. до н.э., человек сумел «приручить» дрожжи, даже не зная об их существовании. Дрожжи работали на человека, производя различные бодрящие напитки, содержащие этиловый спирт. Напиток, напоминающий современное пиво («буза»), был известен уже в Древнем Египте. Там же возник способ приготовления хлеба из кислого дрожжевого теста. Это стало ясно после того, как в раскопках храма и гробниц фараона Эхнатона и его супруги – легендарной Нефертити, живших во второй половинеXIV в. дон. э., археологинатолкнулисьнаскоплениеформдля выпечки хлеба и кувшинов для пивоварения. В Китае уже в Х в. до н.э. умелиотгонятьспиртиздрожжевойбражкидляполучениякрепкихспиртных напитков. Европейцы пристрастились к спиртному несколько позже: производствовискиначалось вИрландиивХI в., авХIII в. вЕвропе широко распространилось пивоварение. Венцом этого периода можно считатьпервоеописаниедрожжей, которыев1680 г. увиделвкаплебродящего пива под микроскопом голландец АнтониванЛевенгук (рис. 1). Хотяонинесвязал процессобразованияпивасжизньюэтихмельчайших«анималькулей», ноегорисункидосих пор поражают точностью изображения дрожжевой клетки. После этого ничего нового о дрожжах не появлялось целых 150 лет.
Второй период занимает весь ХIХ век, на-
чинаяс30-хгодов. Этопериодзарождениянаучных знаний о дрожжах, когда были сдела-
ны первые научные описания дрожжей (КаньярдеЛатурвоФранции, ТеодорШванниФрид-
рихКютцингвГермании), способовихразмножения, спорообразования, жизненных циклов. Именно в этот период дрожжи были названы Мейеномсахарнымигрибами- Saccharomyces.
Рис. 1. Рисунок Левенгука: клетки дрожжей в капле бродящего пива – первоенаблюдениедрожжей человеком.
7

8
Таблица 1. Исторический путь развития зимологии
Этап |
Основная характе- |
Сроки |
События, люди, страны |
|
|
ристика |
|
|
|
1. «Эмбрио- |
Использование че- |
до IXX в. |
Получение хмельных напитков. Египет, 6000 л. до н.э. |
|
нальный». |
ловеком продуктов |
|
Выпечка кислого хлеба, Египет. < 1200 л. до н.э. |
|
Донаучный. |
жизнедеятельности |
|
Отгонка спирта, Китай. 1000 л. до н.э. |
|
|
дрожжей без зна- |
|
Возникновениепивоварения. Европа (монастыри вГермании, 1200-130 |
|
|
ния самих |
|
Производство виски. Ирландия, 1192 |
|
|
«виновников». |
|
Первые зарисовки клеток дрожжей. Левенгук (Голландия), 1680 |
|
2. «Детство». |
Дрожжи - однокле- |
1832 - до |
Первые описания дрожжей как грибов, Т.Шванн, М.Я.Шлейден, Ш.К |
|
Рождение нау- |
точные грибы и |
конца |
де Латур, Х.де Фриз, 1832 |
|
ки на уровне |
возбудители спир- |
века |
Первое название - Saccharomyces cerevisiae. Мейен (Германия), 1838 |
|
накопления |
тового брожения. |
70 лет |
Спиртовоеброжениекакэнергетическийпроцесс. Л.Пастер(Франция), 1 |
|
фактов. |
|
|
Первоеописаниежизненногоцикладрожжей. Г.А. ДеБари(Германия), 1 |
|
Первичная |
|
|
Получение чистых культур для пивоварения. Э.Хансен (Дания), 1881 |
|
простота. |
|
|
Наблюдение брожения в бесклеточных экстрактах дрожжей. Возникн |
|
|
|
|
энзимологии. Бюхнер (Германия), 1897 |
|
|
|
|
Первая классификация дрожжей. Э.Хансен, А.Клёкер (Дания), 1896 |
|
3. «Зрелость». |
Окончательное ста- |
Первая |
Эволюционныепринципывсистематикедрожжей. А.Гийермон (Франци |
|
Цветущая |
новление и диффе- |
полови- |
Организация коллекции: зарождение CBS. A.J.Клюйвер (Голландия) |
|
сложность. |
ренциация |
на XX в. |
Открытие мутагенеза у дрожжей. Г.А.Надсон, С.Г.Филиппов (СССР) |
|
|
зимологии, появле- |
|
Генетикадрожжей. Сменаядерныхфаз. Гетероталлизм. Винге(Дания), 1 |
|
|
ние «ветвей». |
|
Цитология дрожжей (световая микроскопия). М.Н.Мейсель (СССР) |
|
|
|
|
Первые определители. В.И.Кудрявцев (СССР), Дж.Лоддер (Голланди |
|
4. «Старение» |
Дальнейшая диф- |
Вторая |
Жизненныйциклубазидиомицетовыхдрожжей. И.Банно(Япония), 1969 |
|
Вторичное |
ференциация |
полови- |
Признание полифилетичности дрожжей, Дж.А. вон Аркс (Голландия |
|
смесительное |
и научная интегра- |
на XX в. |
Электроннаямикроскопияицитология. М.Н.Мейсель, В.И.Бирюзова(СС |
|
упрощение. |
ция. «Стыки». |
|
Создание международной организации ISY |
|
|
|
|
Формирование почвенной зимологии. И.П.Бабьева (СССР) |
|
|
|
|
Серия коллективных определителей. Голландия, Англия, США |
|
|
|
|
Молекулярная биология дрожжей, новые разделы биотехнологии |
Важнейшим событием этого периода было исследование Луи Пастером в 1860-76 гг. спиртового брожения и доказательство его биохимической природы. В 1881 г. Эмилем Хансеном в Дании были впервые получены чистые культуры дрожжей. Использование чистых культур преобразило виноделие и пивоварение, превратив их из вида искусства в крупную отрасль промышленности. Исследования братьев Бюхнер в Германии (1890-е гг.) по сбраживанию сахара бесклеточными экстрактами дрожжейположилиначало развитиюэнзимологииибиохимии. Всамом конце ХIХ в. Э.Хансеном и А.Клекером в Дании была создана первая классификация дрожжей.
Третий период охватывает XX век. Он характеризуется дифференциацией научных направлений в области изучения дрожжей. В первой четверти прошлого века создается эволюционно-филогенетическое направление в систематике дрожжей (А.Гийермон во Франции, 1909-28 гг.), организуется первая коллекция дрожжевых культур (А.Клюйвер в Голландии, 1920-е гг.). С 1931 г. началось издание серииопределителей дрожжейвДельфте(Голландия). Этиопределителивтаксономиидрожжей имели такое же значение, как определители Берги в бактериологии. В1954 г. вышелпервыйотечественныйопределительдрожжейВ.И.Кудрявцева.
Открытие радиационного мутагенеза Г.А.Надсоном и С.Г.Филипповымв1925 г. вСССРзаложилоосновырадиобиологииистимулировало исследования по генетике дрожжей. Они касались доказательств существования чередования поколений в жизненном цикле дрожжей с изменением плоидности. Было показано, что аскоспоры Saccharomyces cerevisiae гаплоидны, и конъюгация спор или их потомков приводит к восстановлениюдиплоидногосостояния, характерногодлявегетативной стадии сахаромицетов. О.Винге разработал метод тетрадного анализа с изоляцией 4 спор из одного аска с помощью микроманипулятора. ВпоследствиидрожжиSaccharomyces cerevisiae оказалисьпрекрасныммодельным объектом для генетических исследований, и со времени этих работ генетика дрожжей развивалась очень бурно. Были выполнены тысячи работ как теоретического, так и прикладного характера, касающиеся конструирования генетически измененных штаммов дрожжей для биотехнологической промышленности.
9
Вторая половина XX в. отличается еще большей дифференциацией разделов зимологии, выделением новых направлений. Возникаютфункциональнаяморфологияицитологиядрожжей(М.Н.Мейсель, В.И.Бирюзова в СССР, Матиль в Швейцарии, Е.Штрейблова в Чехословакии), молекулярнаягенетикаигенетическаясистематика(работы японских, американских, канадских ученых, в СССР - исследования Г.И.Наумова), почвеннаязимология(работыв50-60-хгг. ДиМеннывНовой Зеландии, И.П.Бабьевой в СССР), морская зимология (А.Е.Крисс, М.И.Новожилова в СССР, Дж.Фелл в США), экология и закономерности географического распределения дрожжей (Г.Фафф в США, М.А.Лачанс в Канаде, И.Ю.Чернов в России). Появляются новые отрасли на стыке разных направлений, растут запросы и потребности биотехнологии, широко использующей дрожжевые организмы в самых разных производствах. Дрожживсебольшевовлекаютсявработыпосозданиювекторныхсистем для получения ценных продуктов биологического синтеза.
Особенно сильное влияние на изучение дрожжей, также как и большинствадругихгруппмикроорганизмов, оказалобурноеразвитиевконце XX в. молекулярной биологии. В современной систематике дрожжей широко используются методы геносистематики, основанные на непосредственном сравнении геномов и секвенировании нуклеотидных последовательностей. Применение единых молекулярно-биологических методов позволило еще больше сблизить подходы к таксономии дрожжевых и мицелиальных грибов, установить связи между дрожжевыми анаморфами и мицелиальными телеоморфами, разработать новые критерии для создания единой филогенетической системы всего царства Mycota. Втожевремя, новыезнанияпородилииновыенаучныепроблемы, в частности, проблему соотношения новейших молекулярных методов с традиционными, основанными на морфологических и физиологических подходах к изучению дрожжей. Практически полностью расшифровангеномSaccharomyces cerevisiae, чтооткрываетогромныеперспективыгеномикидрожжей, новыегоризонтыихбиотехнологического использования. Таким образом, наука о дрожжах, проделав более чем полуторавековой путь, продолжает интенсивно развиваться и в XXI в.
10