ДЕЛЬ ПОЛУКОНСЕРВАТИВНОЙ ПРЕРЫВИСТ
ЕПЛИКАЦИИ ДНК В РЕПЛИКАТИВНОЙ ВИЛК
РЕПЛИКАТИВНАЯ ВИЛКА БАКТЕРИОФАГА Т7
NATURE
Vol 439
2 Feb 2006
a, The bacteriophage T7 replisome consists of the hexameric T7 gene 4 protein (gp4) and two copies of the T7 DNA polymerase (T7 gene 5 protein (gp5) complexed with E. coli thioredoxin (trx)).
T7 gene 2.5 protein (gp2.5), the ssDNA-binding protein, coats the transiently exposed ssDNA in the replication loop.
b, Gp4 consists of a primase and a helicase domain, connected by a linker region. The primase domain consists of two subdomains: a zinc-binding domain (ZBD) and the RNA polymerase domain (RPD).
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
Экспрессия генов –
это процесс реализации информации, закодированной в структуре ДНК, на уровне РНК и белков.
Ген – участок ДНК, кодирующий одну полипептидную цепь или одну молекулу tРНК, rРНК или sРНК
АНСКРИПЦИЯ: CИНТЕЗ РНК ПО ДНК-МАТРИ
РНК-полимераза расплетает дуплекс ДНК в участке начала транскрипции и осуществляет синтез РНК, используя одну из цепей ДНК в качестве матрицы
ДНК-ЗАВИСИМЫЕ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ
РНК-полимераза E. coli Кор-фермент Холофермент
Thermus aquaticus RNA polymerase holoenzyme
А-СУБЪЕДИНИЦА: ИНИЦИАЦИЯ ТРАНСКРИП
«Рабочий цикл» -субъединицы |
факторы E. coli |
|
Sigma factor |
Gene |
function |
70 |
RpoD |
principal sigma factor |
54 |
rpoN (ntrA, glnF) nitrogen-regulated gene transcription |
|
32 |
RpoH |
heat-shock gene transcription |
S |
RpoS |
gene expression in stationary phase cells |
F |
RpoF |
expression of flagellar operons |
E |
RpoE |
involved in heat shock and oxidative |
|
|
stress responses; regulates expression of |
|
|
extracytoplasmic proteins |
FecI |
fecI |
regulates the fec genes for iron dicitrate |
|
|
transport |
Участия различных -субъединиц в споруляции Bacillus subtilis
ИНИЦИАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
Типичный промотор E.coli
транскрипции различных генов E.coli и бактериофагов
ИНИЦИАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
Связывание холоферментной формы РНК-полимеразы с областью промотора
РНК-полимераза белок перекрывает область длиной 50 нуклеотидов, начинающуюся немного раньше -35-последовательности и кончающуюся внутри транскрибируемого участка. Связывание стимулирует расплетание спирали и транскрипцию.
ИЦИАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ: СИЛА ПРОМОТЕ
Влияние мутаций в -10- и -35-последовательностях на силу промотора
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
независимые
-зависимый терминатор
остатков U Примеры шпилек в -независимых и-зависимых терминаторах транскрипции