Кишечных патогенов и факторов, связанных с острой кровавой диареи, Кения

Чарльз Нжугуны, ^1,2 Иэн Njeru,⁴ Элизабет Mgamb,⁴ Даниэль Langat,⁴ Anselimo Makokha,¹ Дисмас Ongore,⁵ Эван Mathenge,^2,3 и Самуил Кариуки³

Информация об авторе ► статьи, заметки ► авторские права и Лицензия информация ►

Перейти к:

Аннотация

Фон

Шигеллез является основной причиной кровавой диареи во всем мире и распространена в большинстве развивающихся стран. В Кении, кровавая диарея сообщает еженедельно в рамках приоритетных заболеваний в условиях интегрированного Эпиднадзора и реагирования системы (IDSR) в Министерство здравоохранения.

Методы

Мы провели исследование случай-контроль с 805 участников (284 случаях и 521 управление) в период с января по декабрь 2012 года в Килифи и Найроби округов. Округе килифи-это в основном сельское население, в то время как графство Найроби в основном городских. Случае определяется как лицо любого возраста, которые представлены в поликлинике с острой диареей с видимой крови в кале в шести медицинских учреждениях в двух графствах в течение периода исследования. Контроль определен как здоровый человек аналогичного возраста и пола с делом и жил в районе дела.

Результаты

Основной представляя клинические особенности для кровавых дел были диарея; боль в животе (69 %), слизистой в стуле (61 %), дискомфорт в животе (54 %) и анорексия (50 %). Показатель изоляции возбудителя составило 40,5% с бактериальными и протозойными возбудителями приходится 28,2% и 12.3 % соответственно. Шигеллы было наиболее распространенных бактериальных патогенов, изолированных в 23.6 % случаев, тогда как дизентерийная амеба наиболее распространенных протозойных патогенов, изолированных в 10.2 % случаев. На бинарной логистической регрессии трех переменных были найдены самостоятельно и существенно связаны с острой кровавой диареи на 5 % уровне значимости; для хранения питьевой воды отдельно от воды для других целей (или = 0.41, 95 % ди 0.20–0.87, р = 0.021), мытье рук после прошлой дефекации (или = 0.24, 95 % ди 0.08–.076, р = 0,015) и наличие бактерий группы кишечной палочки в основной источник воды (или = 2.56, ди 1,21–5.4, р = 0.014). Количество осадков и температуру имел сильную положительную корреляцию с кровавой диареей.

Заключение

Основными этиологическими агентами кровавой диареи были Шигелл и е. histolytica. Личной гигиены, таких как мытье рук после дефекации и хранения питьевой воды отдельно от воды для других целей оказались ключевых защитных факторов для заболевания при наличии группы кишечной палочки в основной источник воды был найден, чтобы быть фактором риска. Поэтому реализация воды, санитарии и гигиены (Wash) вмешательств является ключевым фактором в профилактике и борьбе кровавой диареи.

Ключевые слова: дело, Управление, острая кровавая диарея, Найроби, Килифи, факторы, возбудителями кишечных

Перейти к:

Фон

Всего в мире насчитывается около 1,7 млрд случаев диареи ежегодно около 800 000 случаев смерти среди детей в возрасте до пяти лет [1]. Дизентерия является одной из основных причин диареи заболеваемости и смертности, особенно в развивающихся странах, по оценкам, ежегодная заболеваемость 165 млн. и 1 млн. случаев [2, 3]. Девяносто девять процентов инфекциях, вызванных Шигеллами , происходят в развивающихся странах [4]. Кения переживает значительное увеличение острых случаях кровавая диарея, особенно на побережье, Западное, Ньянза и Найроби регионов. В случаях сообщалось через неделю комплексного Эпиднадзора за болезнями и ответных мер системы (IDSR) увеличилась с 48,272 в 2009 году до 64,107 в 2010 году. Несмотря на увеличение количества дел, роль лаборатории в подтверждающих диагноз был ограничен из-за своей слабой мощности, следовательно антимикробная терапия большинства пациентов на основании клинической картины диагноз при первом контакте в медицинское учреждение. Выявление факторов риска, связанных с болезнью станет платформой для внедрения мер по смягчению последствий, что позволит снизить заболеваемость и смертность отнести к острой кровавой диареи.

Это было продемонстрировано в исследованиях, что заболеваемость острой кровавой диареи и других кишечных инфекций не зависит от осадков и изменений температуры [5–10]. Информация о сезонности заболевания имеет ключевое значение для укрепления системы раннего предупреждения, предотвращения и контроля. В Кении, нет исследований, которые бы писали для демонстрации какой-либо корреляции между острой кровавой диареи и основных климатических факторов.

Задачами исследования были: выявить представления клинические особенности острой кровавой диареи, определить распространенность и распределение кишечных патогенов, выделенных из кала образцов пациентов с острой кровавой диареи, продемонстрировать существующие различия в сезонности острой кровавой диареи между городским и сельским населением и определить факторы, ассоциированные с острой кровавой диареи.

Перейти к:

Методы

Исследование сайта

Исследование проводилось на базе Окружной больницы Килифи, Окружная больница Суб Бамба и центр здоровья в микрорайоне Килифи округе и в Фонд африканских медицинских исследований (amref) центр здоровья Кибера, Центр'ata Лэнг здоровья и Рирута медицинский центр в Найроби Западном округе. Два Суб-округов и шести медицинских учреждений были выбраны потому, что они имели высокую заболеваемость острой кровавой диареи в 2009-2010 годах. Килифи округе является одним из 6 подокругов в округе Килифи. Население Килифи округе был 456,297 (перепись 2009) и значительной части сельского населения. Суб-округ имеет в общей сложности 73 медицинских учреждениях, но и доступности услуг здравоохранения низкий; 57 % населения живет за 5 км от ближайшего медицинского учреждения (Килифи район стратегического плана, 2005-2010). Найроби Запад является одним из трех подокругов в округе Найроби. Население Найроби Запад был 684,765 (перепись 2009) и в основном городских. Трущобы кибера, один из самых больших трущоб в Африке находится в Найроби Западном округе.

Дизайн исследования

На базе больницы сопоставлены исследование случай-контроль проводилось с контрольной районе в январе-декабре 2012 года. Соотношение случаев для контроля 1:2 и рассчитали минимальный размер выборки составил 198 случаев и 396.

Прием дел и управления

Случае определяется как лицо любого возраста, которые посещали поликлинику в выбранных Вами медицинских учреждениях в Килифи и Найроби Западного округа в январе-декабре 2012 года при острой диарее с видимой крови в кале. Из исследования исключали больных с сопутствующей инфекцией и лиц с затяжной диареей (длительностью ≥14 дней). Случаи были зачислены в поликлиническом отделении из 6 выбранных медицинских учреждений. В течение 14 дней после зачисления дела, работников здравоохранения посетили случаев в своих домах. Дело было соответствовать возрастной группе до двух здоровых (<2 лет, 2-4 лет, 5-10 лет, 11-17 лет, 18-65 и >65 лет). Контроль определен как здоровый человек аналогичного возраста и пола с делом и жили по соседству дела. Никакого контроля человека, сообщившего в любой форме диареи или любые другие желудочно-кишечные симптомы в течение 14 дней после зачисления были исключены из исследования. Для идентификации органов управления, интервьюеры впервые выявленный, потом дела дома выбраны две семьи в районе с помощью систематической случайной выборки. В каждом из домохозяйств, одна критериям был выбран случайным образом.

Коллекция образцов

Образцы кала были собраны из всех случаев на уровне учреждений здравоохранения. Чтобы убедиться, что органы управления были здоровы, образцы кала были собраны с 25 % в контрольной группе на бытовом уровне. Образцы были доставлены в лабораторию в течение 2 ч. Где анализ кала не могли добраться до лаборатории в течение двух часов, Кэри-Блэр транспортной среде.

Пробы воды отбирали из домов всех случаях и 25 % контрольной группы. Было собрано в общей сложности два образца, один из внутренних источников, например, скважины, реки, ручья, колодца, водопроводной и других из контейнер бытовой (питьевой). Образцы были доставлены в лабораторию с 2 ч. на сбор.

Сбор данных

Данные были собраны с использованием четырех различных инструментов; форму отчета лабораторные формы наблюдения, бытовых расследования форма и сбора проб воды форма. Форму отчета корпус был заполнен на все случаи. Собранная информация включала: демографические сведения, жизненно важные признаки, признаки и симптомы, историю болезни и лечения. Форме расследования потребительскими был использован для сбора данных по демографии, а также информации о факторах риска, которые были разделены на четыре широкие категории следующим образом; безопасности людей на водных объектах, безопасности питания, гигиены и санитарии окружающей среды. Лаборатория основана бланк наблюдения и образец формы для сбора воды сопровождал табурет и проб воды соответственно.

Два набора данных о количестве осадков и температуры в Килифи и Найроби графств были получены от Метеорологический Департамент Кении; среднемесячное количество осадков и температура на 2012 год и на длительный срок, среднее количество осадков и температуру (1971-2012). Среднемесячное количество осадков и температуру за 2012 год (период исследования) были по сравнению с числом случаев острой кровавой диареи каждого месяца. Корреляции Пирсона был использован для установления наличия и силы ассоциаций.

Лабораторный анализ кала образцы

Лабораторные исследования были проведены в медицинском учреждении и национальных медицинских контрольных лабораторий согласно стандартным операционным процедурам. Методов микроскопии для эритроцитов и паразитов, а также культуры для бактериальных кишечных патогенов. Образцы кала были исследованы макроскопически на грубых крови и слизи. Влажный крепления свежего стула были сделаны в нормальном солевом растворе и проверяться на паразитов и эритроцитов. Прямое микроскопическое исследование свежих испражнений был использован для того чтобы обнаружить дизентерийная амеба, мансоня Шистосомы, Лямблии лямблий и Власоглавы trichiura. Тампоны табурет и образцы засевают на поверхность Мак-конки агар (Mac) и эозин метиленовый синий агары и прожилками для колонии изоляции. В национальной референс-лаборатории, культуральные планшеты инкубировали при 37 °C в течение 24 ч, без лактозы брожения колоний (проведенного) были собраны и подвергнуты граму. Впоследствии, все грам-отрицательных колоний были выбраны из соответствующих пластин и подготовили для биохимической идентификации с использованием полуавтоматической системы идентификации бактерий, Витек 2®. Колонии были коротко эмульгированных в 0.45 % физиологического раствора для системы, чтобы достигнуть 0.5–0.63 сила Макфарланд. У грамотрицательных идентификации кассета была вставлена в соответствующие трубки, а затем в систему. После 18-24 ч инкубации биохимические реакции были получены путем распечатки из машины.

Результаты бактериальных культур были ознакомлены с медицинским персоналом на каждом участке наблюдения. Каждый пациент с положительными результатами культуры табуретки, оценка их клинического состояния, либо по телефону или следить за посещением, был устроен. Любое изменение в управления была зафиксирована в случае ноты. Pathotyping е. coli изолятов для пяти типов diarrhoeagenic кишечной палочки (энтеропатогенные е. coli (ЕРЕС), энтеротоксигенных е. coli (ЕТЕС), энтероинвазивные е. coli (скорость хода), диагностические тест-системы е. coli (ЕАЭС), и enterohemorrhagic E. coli в (ЭГКП) был сделан с использованием реального времени Полимеразной цепной реакции (ПЦР) протокол и праймеры ранее описанный Hardegen [11]. Смесь для ПЦР содержала; 2× quantitect зонд ПЦР мастер-микс, 0.3 мкл вперед праймер (40 мкм), 0.3 мкл обратного праймера (40 мкм), 0.15 ул зонд (40 мкм) и 12.25 мкл нуклеазы свободной воды. Целевые мастер-миксы были сделаны, 28 мкл переносили в 0,1 мл ПЦР пробирок и 2ul добытого Дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) Добавлено в конкретных труб. Условия термоциклирования состояла из циклов горячего активации начнется при 95 °C в течение 15 мин, усиление циклов из 95 °С, 15 с, 55 °С, 60 сек. Амплификация шаг был повторен в течение 45 циклов. Любой образец с порогового значения цикла (CT), что из <37 был рассмотрен положительно. Любой образец с порогом >37 были проанализированы и считаются отрицательными, положительными или неопределенными в зависимости от характеристик Кривой.