- •Оглавление
- •Введение
- •1. Общие принципы организации везикулярного транспорта
- •1.1. Понятие о везикулярном транспорте: определение, его роль в клетке и в организме в целом
- •1.2. Общее представление об основных транспортных путях: биосинтетическом (экзоцитозном) и эндоцитозном. Ретроградный и антероградный транспорт
- •1.3. Основные стадии транспортного процесса
- •1.4. Малые гтфазы, принципы их действия
- •1.5. Формообразование и везикулярный транспорт. Роль липидов и белков
- •1.6. Методологические подходы к изучению везикулярного танспорта
- •2.Характеристика основных транспортных путей
- •2.1. Биосинтетический и экзоцитозный путь
- •2.1.1. Основные компартменты биосинтетического пути: эндоплазматический ретикулум и аппарат Гольджи
- •2.1.2. Прохождение грузов через аппарат Гольджи. Обзор современных гипотез
- •2.1.3. Транс-сеть аппарата Гольджи – основная сортирующая стадия биосинтетического пути
- •2.1.4. Секреторный, или экзоцитозный путь
- •2.2. Эндоцитозный путь. Общая характеристика
- •2.2.1. Пути входа макромолекул в клетку
- •2.2.2. Основные компартменты эндоцитозного пути. Ранние, рециклирующие и поздние эндосомы. Мультивезикулярные тела (мвт). Лизосомы
- •2.2.3. Общие принципы организации эндоцитозного пути
- •2 .2.4. Ранние эндосомы ― главная сортирующая стадия эндоцитозного пути. Возможные механизмы сортировки на путь рециклирования и лизосомной деградации
- •2.2.5. Проблемы идентификации ранних и поздних эндосом. Современные представления об организации эндоцитозного пути. Роль мультивезикулярных эндосом и лизосом
- •3. Формирование транспортных пузырьков
- •3.1. Окаймления и их типы
- •3.2. Сорi окаймление
- •3.3. Copii-окаймление
- •3.4. Клатриновые окаймления. Строение адапторных комплексов семейства ар и gga. Клатрин
- •3.4.1. Сборка gga- и ap1-зависимых окаймлений
- •3.4.2. Сборка aр3 окаймления
- •3.4.3. Aр4 окаймление
- •3.4.4. Сборка и разборка ар2-окаймления
- •3.4.5. Динамин – атипичная гтФаза. Динамин-подобные белки
- •3.4.6. Механизмы сортировки грузов в клатрин-окаймленные ямки
- •3.4.7. Окаймления. Заключение
- •4. Регуляция слияния мембран
- •4.1. Характеристика компонентов системы nsf-snap-snare
- •4.1.1. Принцип действия snare-комплекса
- •4.2.1. Первый цикл после синтеза de novo
- •4.3. Взаимодействие rab-белков и snare в ходе слияния мембран. 3 фазы слияния
- •4.4. Полное слияние и полуслияние (semifusion). Механизм «kiss-and-run». Реорганизация липидных бислоев в процессе слияния
- •4.6. Роль ионов кальция в регуляции слияния
- •5.1. Роль rab-белков в транспортировке грузов
- •6. Липиды и везикулярный транспорт
- •6.1. «Трансмембранная» ассиметрия распределения липидов в мембранах
- •6.2. Латеральная ассиметрия распределения липидов в мембранах
- •6.3. Липиды и формообразование
- •6.4. Фосфатидилинозитиды как регуляторы транспортных процессов
- •6.4.1. Фосфоинозитиды и экзоцитозный путь
- •6.4.2. Фосфоинозитиды на эндоцитозном пути. Механизм действия Vps34
- •6.4.3. Механизм действия фосфорилированых форм PtdIns
- •7. Роль убиквитинирования в регуляции везикулярного транспорта белков
- •7.1. Типы убиквитинирования: моно-, мульти- и полиубиквитинирование
- •7.2. Убиквитин-конъюгирующая система. Деубиквитинирование. Убиквитин-узнающие домены
- •7.3. Убиквитинирование и регуляция эндоцитоза. Убиквитинирование белков-грузов и регуляторных белков
- •7.4. Убиквитин-подобные белки, их роль в транспортных процессах. Связь убиквитин-зависимых механизмов сортировки белков с направлением инвагинации мембраны
- •7.5. Убиквитинирование. Заключение
- •9. Роль цитоскелета в позиционировании органелл и транспортных процессах
- •9.1. Типы цитоскелета, их основные свойства
- •9.2. Цитоскелет и позиционирование органелл
- •9.3. Цитоскелет в транспортных процессах
- •9.3.1. Цитоскелет и транспорт по антероградному пути
- •9.3.2. Цитоскелет и эндоцитозный путь
- •9.3.3. Роль цитоскелета и везикулярного транспорта в обеспечении пигментации кожи и мимикрии
- •10. Везикулярный транспорт в митозных клетках
- •11. Регуляция эндоцитоза рецепторов эфр как пример функционирования транспортной машинерии
- •12. Эндоцитоз и передача сигнала
- •13. Патологии, связанные с нарушением функционирования транспортных систем
- •Заключение
- •Библиографический список
1. Общие принципы организации везикулярного транспорта
1.1. Понятие о везикулярном транспорте: определение, его роль в клетке и в организме в целом
В общем случае под везикулярным транспортом подразумевается перенос белков от одного внутриклеточного компартмента к другому с помощью мембранных везикул. Транспортируемые белки принято называть белками-грузами, или карго (англ. cargo). Однако это определение следует считать несколько упрощенным, поскольку, во-первых, взаимодействие белков с липидами, составляющими мембрану везикулы, делают последние полноправным «грузом». Во-вторых, не всегда перенос осуществляется именно везикулами, т. е. пузырьками; некоторые транспортные пути обслуживаются длинными тубулярными структурами.
Везикулярный транспорт является одним из базовых процессов, свойственных живым организмам. Его значение чрезвычайно велико и многообразно.
Во-первых, везикулярный транспорт в отдельной клетке «работает» на организм в целом, опосредуя такие физиологически значимые процессы, как стимулируемая секреция, фагоцитоз, передача сигналов, синаптическая передача, участие в иммунном ответе.
Во-вторых, без везикулярного транспорта невозможно существование и функционирование многих жизненно важных органелл (например, зрелые гидролитические ферменты транспортируются в лизосомы из аппарата Гольджи). Именно благодаря везикулярному транспорту эукариотическая клетка имеет характерный для нее набор и вид компартментов, поскольку механизмы везикулярного транспорта обеспечивают гомеостаз внутриклеточных органелл, поддерживая постоянный состав белков и липидов, характерных именно для данной органеллы и позволяющей ей выполнять определенную функцию (так называемые «резидентные молекулы»). Кроме того, везикулярный транспорт участвует в таких подчас неожиданных процессах, как быстрое закрытие разрывов мембран скелетных мышц при повреждении в результате больших физических нагрузок, формирование разделяющих мембран после деления клеток, перемещение клетки по субстрату.
Учитывая, что через многие органеллы идет постоянный поток белков-грузов (например, через аппарат Гольжи (АГ) проходят вновь синтезированные белки, подвергаясь ряду модификаций, или «созревая», там синтезируется ряд липидов, доставляемых впоследствии в разные пункты конечного назначения), для поддержания идентичности компартментов клетка должна «уметь» различать резидентные молекулы и молекулы-грузы, оставляя в составе мембраны первые и исключая вторые. Можно говорить о том, что в процессе везикулярного транспорта идет постоянная сортировка макромолекул, и существующие молекулярные механизмы регуляции этого процесса выполняют свою работу с высокой точностью. Более того, транспортные потоки «в» органеллу и «из» нее строго сбалансированы. Именно тонко регулируемый баланс этих потоков позволяет нам думать, что в клетке существуют стабильные компартменты. Ярким примером является действие токсина Брефельдина А, который блокирует транспорт из цис-Гольджи в эндоплазматический ретикулум (ЭПР), не влияя на транспорт из ЭПР в АГ. Уже через 5 мин после добавления Брефельдина мембраны аппарата Гольджи начинают тубулироваться и затем полностью смешиваются с мембранами ретикулума. АГ исчезает.
