- •Biochimie
- •Partie 1
- •Биологическая химия
- •Часть 1
- •Table des matières
- •I. La partie théorique l'objet de la biochimie
- •1. La chimie des protéines
- •1.1. Les méthodes d` élimination et d`épuration des protéines
- •1.2. Les fonctions des protéines
- •1.3. La composition acido-aminée des protéines
- •1.4. L`organisation structurale des protéines
- •1.5. Les propriétés physico-chimiques des protéines
- •1.6. La classification des protéines
- •1.6.1. Les protéines simples
- •1. Les albumines et les globulines.
- •2. Les protamines et les histones.
- •3. Les prolamines et les glutélines.
- •1.6.2. Les protéines complexes
- •2. Les enzymes
- •2.1. La nature chimique des enzymes
- •2.2. Le mécanisme de l`action des enzymes
- •2.3. La cinétique des réactions enzymatiques
- •2.4. Les propriétés des enzymes
- •2.5. La régulation de l`activité des enzymes
- •1. Le contrôle de la quantité de l`enzyme.
- •2. Le contrôle de l'activité de l`enzyme.
- •2.1. L'influence des activateurs et des inhibiteurs aux enzymes.
- •2.2. La modification chimique de l`enzyme.
- •2.3. La régulation allostérique.
- •2.6. La classification et la nomenclature des enzymes
- •L`oxydation la réduction
- •Acide palmitique
- •Tripalmitine
- •2.7. Les enzymes dans la médecine
- •2. Les enzymopathies acquises.
- •3. Les vitamines
- •3.1. Les vitamines liposolubles
- •3.2. Les vitamines hydrosolubles
- •4. Les principes essentiels de l'organisation des biomembranes
- •4.1. La structure et les fonctions des membranes
- •1. Les phospholipides (jusqu'à 90 %) – les phosphoacylglycérols et les sphingolipides:
- •La phosphatidylcholine
- •Le céramide
- •Le galactosilcéramide
- •Uniport
- •Symport
- •Antiport
- •Contransport
- •2. La diffusion facilitée.
- •5. Les mécanismes de la transduction du signal hormonal
- •Ribosome Cytoplasme Hormone stéroïde Protéine arNm noyau Récepteur adn
- •6. L`introduction au métabolisme
- •6.1. La voie totale du catabolisme
- •6.2. La bioénergétique
- •6.3. L`organisation et le fonctionnement de la chaîne respiratoire
- •6.4. Le découplage de l`oxydation et de la phosphorylation
- •Dnp dnph membrane
- •6.5. La génération des radicaux libres dans la cellule
- •6.6. Les réaction de la voie totale du catabolisme
- •6.6.1. La décarboxylation oxydative de l`acide pyruvique
- •6.6.2. Le cycle des acides tricarboxyliques
- •Succinate
- •Fumarate
- •Succinatedéshydrogénase
- •Fumarate
- •Fumarate
- •7. Le métabolisme des glucides
- •7.1. La digestion des glucides
- •7.2. L`échange du glycogène
- •7.3. La glycolyse
- •7.4. L`incorporation de la fructose et du galactose à la glycolyse
- •7.5. Les mécanismes de navette
- •7.6. Le cycle de Cori
- •7.7. La fermentation alcoolique
- •7.8. La voie des pentoses phosphates de la transformation du glucose
- •Xylulose-5-phosphate
- •Isomérase
- •7.9. La néoglucogenèse
- •7.10. La régulation du métabolisme glucidique
- •Phosphoénolpyruvate → pyruvate (glycolytique)
- •Pyruvate → oxaloacétate → phosphoénolpyruvate
- •7.11. Les troubles du métabolisme glucidique
- •Maladies liées aux troubles métaboliques du glycogène
- •L`hyperglycémie et l`hypoglycémie
- •La glycosurie
- •2. Les réactions colorées sur les protéines
- •2.1. La réaction de Millone
- •2.2. La réaction d'Adamkevitche
- •2.3. La réaction ninhydrique
- •2.4. La réaction de Choultse – Raspajle
- •3. Les réactions de la précipitation des protéines
- •3.1. La précipitation des protéines pendant la chauffage
- •3.2. La précipitation des protéines par les sels des métaux lourds
- •3.3. La précipitation des protéines par les acides concentrés minéraux
- •3.5. La précipitation des protéines par les acides organiques
- •1.3. La détermination du point isoélectrique de la caséine
- •2.4. La preuve de la présence de l'hydrate de carbone dans l'albumine d'oeuf
- •1.2. La réaction avec le diphénylamine
- •2. Les chromoprotéines
- •2.1. L'essai benzidinique sur le groupement héminique de l'hémoglobine
- •Le travail 4. Les enzymes
- •1. La découverte de la peroxydase dans la pomme de terre
- •2. La découverte de la pepsine dans le suc gastrique
- •3. L'hydrolyse de l'amidon par α – amylase du salive
- •4. Le trait spécifique de l'action des enzymes de l’amylase et de la saccharase
- •Le travail 5. La détermination de l'activité des enzymes
- •1. L'action des activateurs et des inhibiteurs
- •2. La détermination de l'activité de α – amylase du salive selon Volguemoute
- •Le travail 6. Les vitamines l'expérience 1. Les réactions qualitatives sur la vitamine a
- •1.1. La réaction avec le chlorure de l’antimoine (III)
- •1.2. La réaction avec l'acide sulfurique (la réaction de Droummond)
- •L'expérience 6. La réaction qualitative sur la vitamine в (le ribophlavine)
- •L'expérience 9. Les réactions qualitatives sur la vitamine c (acide ascorbique)
- •9.1. La coopération de la vitamine c avec к3[Fe(cn)6]
- •9.2. La réaction avec le bleu de méthylène
- •L'expérience 10. La détermination quantitative de l'acide ascorbique dans l'urine par la méthode de Tilmanse
- •2. La comparaison des redox-potentiels du ribophlavine et du bleu de méthylène
- •3. La détermination de la catalase selon a.N. Bach et a.I. Oparine
- •Le travail 8. Le métabolisme des glucides l'expérience 1. La détermination quantitative de l'activité de l’amylase dans le sérum du sang
- •L’expérience 2. La détermination quantitative de l’acide piruvique dans l'urine
- •L'expérience 3. Le diagnostic rapide des pathologies du métabolisme glucidique
- •3.1. La réaction de Trommer avec l’hydroxyde du cuivre
- •3.2. La révélation de la fructosirie par l’essai de Selivanov
- •3.3. La méthode enzymatique de la détermination semi-quantitative du glucose dans l'urine à l'aide de la raie de test "glucophan"
- •Littérature
6.3. L`organisation et le fonctionnement de la chaîne respiratoire
L'oxydation des substrats dans le processus de la respiration représente le transfert des électrons et des protons (c.a.d. des atomes de l`hydrogène) des matières organiques sur l'oxygène. Une série des transporteurs intermédiaires participent à ce processus, en formant la chaîne respiratoire.
La chaîne respiratoire (la chaîne du transport des électrons) – le système des protéines transmembranaires et des transporteurs des électrons, qui transmettent les électrons des substrats à l'oxygène. Dans les cellules eucaryotes la chaîne respiratoire est située dans la membrane intérieure des mitochondries.
NAD réduit sert du donneur universel des atomes de l'hydrogène pour la chaîne respiratoire. À la coopération de NAD+ et NADP+ avec les atomes de l'hydrogène il y a une adjonction réversible des atomes de l'hydrogène. De plus, la molécule NAD+ (NADP+) contient 2 électrons et un proton, mais le deuxième proton reste dans le milieu:
Une autre source primaire des atomes de l'hydrogène et des électrons – c`est la flavoprotéine réduite FAD ou FMN:
Les formes réduites de ces cofacteurs sont capables de transporter l'hydrogène et les électrons vers la chaîne respiratoire des mitochondries.
Les composants de la chaîne respiratoire sont insérés à la membrane mitochondriale en forme de 4 complexes péptido-lipidiques (Fig 19).
Fig. 19. La chaîne respiratoire mitochondriale
Le complexe I (NADН- déshydrogénase) comprend FMN et la protéine FeS (le fer non-hèmatique). La protéine FeS participe au processus d`oxydo-réduction. Le complexe I oxyde NADН, en transférant de lui 2 électrons sur KoQ (l`ubiquinone). Le complexe I pompe 4 protons du matrixe à l'espace intermembranaire de la mitochondrie.
KoQ (l`ubiquinone) – le dérivé du benzoquinone. C'est la molécule moyenne lipophile. En se déplaçant dans la couche lipidique de la membrane, l`ubiquinone assure la transmission des électrons entre les complexes I – III et II – III.
Le complexe II (succinate-déshydrogénase) comprend FAD et la protéine FeS. Assure l'entrée à la chaîne des électrons supplémentaires pour le compte de l'oxydation du succinate.
Le complexe III (QН2-déshydrogénase) compred les cytochromes b, с1, et la protéine FeS. Les cytochromes – les hémoprotéines, dans lequelles le groupe prosthétique héminé est proche de l'hème de l'hémoglobine (du cytochrome b est identique). Le complexe III transfère les électrons de l`ubiquinone sur le cytochrome avec et pompe 2 protons à l'espace intermembranaire.
Le complexe IV (le cytochrome c–oxydase) comprend les cytochromes a et a3, qui, à part de l`hème, contiennent les ions du cuivre. Le complexe IV catalyse le transfert des électrons des molécules du cytochrome sur O2, et pompe 4 protons à l'espace intermembranaire.
Le cytochrome а3 représente le terrain terminal de la chaîne respiratoire – cytochromeoxydase, qui réalise l'oxydation du cytochrome c et la formation de l'eau. Dans l'organisme de l`homme la chaîne respiratoire mitochondriale forme 300-400 ml de l`eau par jour (l'eau métabolique).
Les composants de la chaîne respiratoire des mitochondries sont rangés en ordre de la diminution du potentiel d'oxydoréduction. Le déplacement des électrons se passe par le gradient du potentiel d'oxydoréduction et est la source de l'énergie pour le transfert des protons. Le transfert de deux électrons à travers tous les complexes assure le transfert de quatre protons. Finalement de tous les côtés de la membrane il y a une différence des concentrations des protons et la différence des potentiels électriques avec le signe «plus» sur la surface extérieure. Le potentiel électrochimique incite les protons à avancer dans le sens inverse – de la surface extérieure à l'intérieur. Cependant la membrane leur est imperméable, à l'exception des terrains, où s'installe l`enzyme ATP-synthase de proton (Fig. 20). Elle comprend deux parties – le stator et le rotor.
Le stator comprend trois α – sous-unités et 3 β – sous-unités – elles participent directement à la synthèse de l`АТP de l`АDP et le phosphate. Leur adhère δ – sous-unité, et tous ensemble ils forment F1- sous-unité.
Le stator se tient dans la membrane, mais le rotor tourne aux frais de l'énergie des protons.
Le rotor se compose de - et - sous-unités.
Le stator se tient dans la membrane, et le rotor tourne à l`aide de l'énergie des protons.
Fig. 20. La structure de l`ATP-synthase protonique
Dans le stator il y a un canal de proton (F0). Il comprend deux semi-canaux, qui sont déplacés l`un par rapport à l'autre. Le proton passe une moitié du canal, puis sur le rotor tournant se trouve dans la deuxième moitié du canal. La différence des potentiels électrochimiques, qui apparaît au mouvement des protons à travers le canal met en marche l`ATP-synthase, qui catalyse la réaction:
ADP + H3PO4 ATP + H2O
La conception chémiosmotique de la transformation de l'énergie dans les cellules vivantes était proposée par P. Mitchell en 1960 pour l'explication du mécanisme moléculaire de la conjugaison du transport des électrons et la formation de l`АТP dans la chaîne respiratoire. Pour les recherches dans le domaine de la bioénergétique P. Mitchell en 1978 a reçu le prix Nobel.
Dans la chaîne respiratoire il y a seulement 3 terrains, où le transfert des électrons est associé avec l'accumulation de l'énergie, suffisant pour la formation de l`АТP. Le coefficient de phosphorylation – le rapport de la valeur de l`ATP formé à l'oxygène absorbé: ATP/O ou Р/О. La valeur maxima du coefficient de phosphorylation est 3, si la réaction de l'oxydation passe avec la participation de NAD; et 2, si l'oxydation du substrat passe par FAD. Les valeurs réellement reçues sont plus petites (2,5 et 1,5). C.a.d. le procès de la respiration n'est pas entièrement associé avec la phosphorylation. Le degré de la conjugaison dépend de l'intégrité de la membrane mitochondriale.
L`ATP formée avec la participation de ADP-ATP-translocase est transporté de la matrice sur la partie extérieure de la membrane et se trouve au cytosole. Simultanément même la translocase transfère l`АDP dans la direction inverse.
Le contenu total de l`АТP dans l'organisme 30-50 gr, mais la durée de vie de la molécule de l`АТP est moins qu`une minute. 40-60 kg de l`АТP est synthétisé chez l`homme par jour et autant se désagrège.
A chaque contraction du myocarde se dépense près de 2 % de l`ATP qui y se trouve. Tout l`АТP serait dépensé pendant 1 minute, s'il n'y avait pas de régénérescence. À la formation du thrombus dans l'artère coronaire l'entrée de l'oxygène aux cellules cesse, en conséquence la régénérescence de l`АТP cesse aussi, et les cellules périssent (l'infarctus du myocarde).
L'augmentation de la concentration de l`АDP amène à l'accélération de la respiration et la phosphorylation.
La dépendance de l'intensité de la respiration des mitochondries de la concentration de l`АDPH s`appelle le contrôle respiratoire.
Pour l`évaluation de l'influence des nucléotides adénylés aux processus du métabolisme, on utilise la charge énergétique de la cellule (ECC):
Dans la norme ECC = 0,7-0,8: la vitesse de la formation de l`ATP est égale à la vitesse de son emploie, le système adénylique est saturé de l'énergie.
À la ECC < 0,7 la formation de l`АТP s'accélère par voie de l`augmentation de vitesse des réactions de la voie totale du catabolisme.
Si ECC = 1, les processus de la synthèse de l`ATP sont freinés, et son utilisation s'accélère.
Les états hypoénergétiques se subdivisent en:
– аlimentaires (le jeûne, l'avitaminose);
– hypotoxiques:
– Les troubles de l'entrée de l'oxygène au sang (l'hypoxie pulmonaire),
– Les troubles du transport de l'oxygène aux tissus – hémodynamique (la perte sanguine, le choc, l`affection valvulaireles) et hémoglobinique (la pathologie de l'hémoglobine, le blocage par les poisons, l'hypoxie),
– mitochondriales (la difficulté de l'utilisation de l'oxygène dans les cellules) – les troubles des fonctions des mitochondries par les inhibiteurs des enzymes de la chaîne respiratoire, les découpleurs de l`oxydation et de phosphorylation, les substances membranotropes.
Au jeûne complet les réserves alimentaires de l'organisme sont suffisants pour quelques semaines, et l'oxygène – pour 2-3 minutes. L'hypoxie – la raison la plus fréquente des états hypoénergétiques, et l'hypoxie du cerveau – la raison directe de la mort. C'est pourquoi parmi les procédures de réanimation la place principale est prise par les mesures dirigées à la réactivation de l'approvisionnement des organes par l'oxygène.
