
- •2. Наземные экосистемы как источник и сток парниковых газов.
- •3. Биологический цикл азота.
- •Азотфиксация
- •Нитрификация
- •Денитрификация
- •4. Таксономическое разнообразие микроорганизмов цикла азота, осуществляемые ими процессы и продукты реакций.
- •5. Условия протекания процессов в экосистемах.
- •6. Таксономическое разнообразие микроорганизмов цикла углерода, осуществляемые ими процессы и продукты реакций.
- •7. Условия протекания процессов в экосистемах.
- •Процесс разложения растительных остатков и формирование подстилки
- •Образование и разложение гумуса
- •Участие почв-х мо в разрушении и новообразовании минералов
- •8. Микробная трансформация углерода и азота в почвенных агрегатах.
- •9. Формирование анаэробных зон внутри почвенных агрегатов.
- •10. Влияние размера почвенных агрегатов на продукты микробного метаболизма.
- •11. Участие микроорганизмов в «парниковом эффекте».
- •17. Постулат Бейеринка, Правило Гаузе, Триада Гузева.
- •18. Экологические (функциональные) и филогенетические классификации почвенных микроорганизмов.
- •19. Вертикальная ярусность микробов и их функции в различных экосистемах (бгц).
- •20. Филогенетическая структура метаболически активных прокариот в пространственно-сукцессионном (вертикально-ярусном) ряду.
- •2. Свойства покоящихся клеток.
- •3. Пролиферативный и метаболический покой.
- •4. Репродуктивные покоящиеся формы микроорганизмов.
- •5. Этапы формирования покоящихся форм.
- •6. Механизмы катаболитной репрессии и репрессии конечным продуктом.
- •7. Роль микроорганизмов в формировании и разложении почвенного гумуса.
- •8. Автохтонная и зимогенная микрофлора.
- •9. Микробная популяция как многоклеточный организм.
- •10. Экологическая роль антибиотиков в почве.
- •11. Примеры микробных сукцессий в почве.
- •2. Полифазная таксономия.
- •3. Основные филумы домена Bacteria и Archaea, обнаруживающиеся в почве.
- •2. Строение бактериофагов и их геном.
- •3. Генетический аппарат эукариотических микроорганизмов (грибов).
- •4. Лизогения у бактерий. Специфическая трансдукция: особенности и механизмы.
- •5. Конъюгация у бактерий.
- •6. Сравнительные особенности процесса конъюгации у разных типов бактерий.
- •7. Плазмиды и мигрирующие элементы.
- •8. Биологическое значение плазмид и мигрирующих элементов в изменчивости и эволюции микроорганизмов.
- •9. Сообщества бактерий – биопленки: их структура, экспрессия бактериальных генов в состоянии биопленок.
- •Фототрофы
- •Хемосинтез
- •2. Миксотрофия.
- •4. Современные представления о роли микроорганизмов в образовании и разрушении глинистых (почвообразующих, вторичных) минералов.
- •5. Роль микроорганизмов в образовании и деградации гумусовых веществ, основные группы организмов, механизмы процессов.
- •6. Понятие о «затравочном» эффекте.
- •7. «Вторая (подземная) биосфера» принципы ее функционирования.
- •8. Микробное фракционирование стабильных изотопов в природе.
- •9. Основные методы изучения геохимической деятельности микроорганизмов.
- •10. Современные биогеотехнологии с использованием микроорганизмов.
- •2. Микроорганизмы и ксенобиотики.
- •3. Почвы, загрязненные нефтью и нефтепродуктами.
- •4. Биологическая индикация загрязнения почвенной среды, самоочищение и самовосстановление почв, санитарное почвоведение.
- •5. Микроорганизмы почв и современные почвенные биотехнологии.
- •6. Микроорганизмы и охрана почв.
- •2. Современные методы, направленные на определение видового и функционального разнообразия почвенного микробного сообщества.
- •3. Методы для определения биомассы почвенных микроорганизмов.
4. Таксономическое разнообразие микроорганизмов цикла азота, осуществляемые ими процессы и продукты реакций.
Продолжение ниже
5. Условия протекания процессов в экосистемах.
6. Таксономическое разнообразие микроорганизмов цикла углерода, осуществляемые ими процессы и продукты реакций.
Цикл углерода в почве.
В атмосфере углерод в основном представлен С02, который составляет 0,03%от ее объема. В гидросфере его на порядок больше, но основным источником углекислого газа является почва (до 9-15% по Ремезову), т.к. здесь сосредоточена деятельность микроорганизмов, разлагающих органические остатки, и осуществляется дыхание растений. В совокупности данные процессы носят название «почвенного дыхания».
-
Растения используют атмосферный СО2 в процессе фотосинтеза, который становится входит в их состав и становится их частью.
-
Животные, питающиеся растениями, передают соединения углерода по пищевой цепи.
-
Большая часть углерода, потребляемого животными, в процессе их дыхания преобразуется в СО2 и возвращается в атмосферу.
-
Когда животные и растения погибают, бактерии и грибы, обитающие в почве, разлагают их остатки, и углерод вновь возвращается в атмосферу в виде СО2.
-
Некоторые органические остатки остаются в почве и превращаются в ископаемые виды топлива (нефть, уголь, газ, торф), при сжигании которых также СО2 возвращается в атмосферу. Гумус также является формой захоронения углерода.
-
В воде основным продуцентом СО2 являются водоросли. В морской воде углерод содержится в виде угольной кислоты и ее растворимых солей, но накапливается он в форме карбоната кальция СаС03 (мел, известняки, кораллы). Часть углерода в виде карбонатов надолго исключается из круговорота, образуя осадки на дне водоемов. Однако с течением времени в процессах горообразования осадочные массы поднимаются на поверхность в виде горных пород.
-
Также СО2 поступает в атмосферу в результате вулканической деятельности и с выхлопными газами машин, заводов.
В цикле углерода можно выделить два звена, имеющих планетарные масштабы и связанных с выделением и поглощением кислорода: 1) связывание С02 в процессе фотосинтеза и генерация кислорода; 2) минерализация органических веществ с выделением С02 и затратой кислорода. Первый осуществляют высшие растения, водоросли и цианобактерии. Второй – микроорганизмы.
-
Спиртовое брожение –анаэробная химическая реакция брожения, осуществляемая дрожжамиродов Saccharomycesи Schizosaccharomyces, в результате которой одна молекула глюкозыпреобразуется в 2 молекулы этанола и в 2 молекулы углекислого газа.При доступе кислорода дрожжи окисляют углеводы (аэробное дыхание) с образованием СО2 и воды (эффект Пастера).
С6Н12О6
= 2С2Н5ОН + 2СО2
Условия для жизни дрожжей: слабокислый рН, оптимальная температура 28-30 градусов, аэрация сказывается лучше, т.к. аэробное дыхание дает больше энергии при небольших затратах углеводов.
-
Молочнокислое брожение - процесс анаэробного окисления углеводов, конечным продуктом при котором выступает молочная кислота. СО2 выделяется при так называемом гетероферментативном брожении (при гомоферментативном – только молочная кислота, при брожении, вызываемом бифидобактериями – ацетат и лактат).
Бактерии – родыLeuconostocсферической формы, гр+, анаэробоы, опт. температура 20-30 гр.; Lactobacillusнебольшие палочки, растущие при +45 гр.; Bifidobacterium – палочки, строгие анаэробы, температурный оптимум 36-38 гр., обитатели кишечника животных и человека, антагонисты болезнетворной микрофлоры кишечника, за счет производства антибиотиков и органических кислот.
-
Пропионовокислое брожение - Пропионовокислое брожение вызывается пропионовокислыми бактериями, относящимися к роду Propionibacterium.
Единственным источником энергии для пропионовокислых бактерий является процесс сбраживания различных веществ: моносахаридов (гексоз, пентоз), молочной, яблочной кислот, глицерина и других в пропионовую и уксусную кислоту, диоксид углерода и воду.
Пропионовокислыебактерии – небольшие, неподвижные грамположительные палочки, не образующие спор, факультативные анаэробы. Обитают в основном в кишечном тракте жвачных животных и в молоке.
-
Маслянокислое брожение - анаэробное окисление органических веществ маслянокислыми бактериями в масляную кислоту.
С6H12О6 → СНзСН2СН2СООН + 2 С02+ 2Н2 +Е
Маслянокислые бактерии относятся к роду Clostridium. Это крупные, подвижные грамположительные палочки, образующие устойчивые споры, при образовании которых клетка приобретает форму веретена или теннисной ракетки, облигатные (строгие) анаэробы.Эти бактерии могут сбраживать многие углеводы, в т.ч. (крахмал, гликоген, пектиновые вещества, целлюлозу), спирты (этиловый, маннит, глицерин) и аминокислоты. По характеру используемых субстратов маслянокислые бактерии делятся на две группы: сахаролитическиеклостридии,которыесбраживают в основном углеводы (Ctostridiumbutyricum), и протеопитическиеклостридии, которые разлагают белки и пептоны до аминокислот и затем их сбраживают (Clostridiumsporogenes, Clostridiumsubterminalis, Clostridiumperfringens, Clostridiumbotulinum).
-
Уксуснокислое брожение - аэробное окисление углеводов и спирта уксуснокислыми бактериями в уксусную кислоту.
С6H12O6 + 2 02 → 2СНзСООН + 2CO2+ 2Н20 + Е
Возбудителями уксуснокислого брожения являются уксуснокислые бактерии, относящиеся к двум родам: Gluconobacter и Acetobacter. Это короткие, подвижные грамотрицательные палочки, не образующие спор. Оптимальная температура развития – 30˚ С. Бактерии кислотоустойчивы, оптимальное значение рН для развития 5,4–6,3. Обитают на цветах, зрелых фруктах, ягодах, овощах, в прокисших соках, пиве, вине, квашенных овощах.
Также микроорганизмы способны разрушать другие различные вещества. Углеводороды разрушать могупредставители родов Arthrobacter, Methylomonas, Pseudomonas, Nocardia, Streptococcus, Candida и др. Практически все углеводороды, входящие в состав нефти могут разлагаться микроорганизмами. В разложении жира участвуют бактерии рода Pseudomonas, Serratia, Clostridium, а также грибы родов Aspergillus, Penicilliumна глицерин и жирные кислоты, и даже до СО2 и воды. Аэробно разлагают целлюлозу виды цитофаг, миксобактерии, Cellulomonas, актиномицеты родов Streptomyces, грибы Fusariumи др.