
- •2. Наземные экосистемы как источник и сток парниковых газов.
- •3. Биологический цикл азота.
- •Азотфиксация
- •Нитрификация
- •Денитрификация
- •4. Таксономическое разнообразие микроорганизмов цикла азота, осуществляемые ими процессы и продукты реакций.
- •5. Условия протекания процессов в экосистемах.
- •6. Таксономическое разнообразие микроорганизмов цикла углерода, осуществляемые ими процессы и продукты реакций.
- •7. Условия протекания процессов в экосистемах.
- •Процесс разложения растительных остатков и формирование подстилки
- •Образование и разложение гумуса
- •Участие почв-х мо в разрушении и новообразовании минералов
- •8. Микробная трансформация углерода и азота в почвенных агрегатах.
- •9. Формирование анаэробных зон внутри почвенных агрегатов.
- •10. Влияние размера почвенных агрегатов на продукты микробного метаболизма.
- •11. Участие микроорганизмов в «парниковом эффекте».
- •17. Постулат Бейеринка, Правило Гаузе, Триада Гузева.
- •18. Экологические (функциональные) и филогенетические классификации почвенных микроорганизмов.
- •19. Вертикальная ярусность микробов и их функции в различных экосистемах (бгц).
- •20. Филогенетическая структура метаболически активных прокариот в пространственно-сукцессионном (вертикально-ярусном) ряду.
- •2. Свойства покоящихся клеток.
- •3. Пролиферативный и метаболический покой.
- •4. Репродуктивные покоящиеся формы микроорганизмов.
- •5. Этапы формирования покоящихся форм.
- •6. Механизмы катаболитной репрессии и репрессии конечным продуктом.
- •7. Роль микроорганизмов в формировании и разложении почвенного гумуса.
- •8. Автохтонная и зимогенная микрофлора.
- •9. Микробная популяция как многоклеточный организм.
- •10. Экологическая роль антибиотиков в почве.
- •11. Примеры микробных сукцессий в почве.
- •2. Полифазная таксономия.
- •3. Основные филумы домена Bacteria и Archaea, обнаруживающиеся в почве.
- •2. Строение бактериофагов и их геном.
- •3. Генетический аппарат эукариотических микроорганизмов (грибов).
- •4. Лизогения у бактерий. Специфическая трансдукция: особенности и механизмы.
- •5. Конъюгация у бактерий.
- •6. Сравнительные особенности процесса конъюгации у разных типов бактерий.
- •7. Плазмиды и мигрирующие элементы.
- •8. Биологическое значение плазмид и мигрирующих элементов в изменчивости и эволюции микроорганизмов.
- •9. Сообщества бактерий – биопленки: их структура, экспрессия бактериальных генов в состоянии биопленок.
- •Фототрофы
- •Хемосинтез
- •2. Миксотрофия.
- •4. Современные представления о роли микроорганизмов в образовании и разрушении глинистых (почвообразующих, вторичных) минералов.
- •5. Роль микроорганизмов в образовании и деградации гумусовых веществ, основные группы организмов, механизмы процессов.
- •6. Понятие о «затравочном» эффекте.
- •7. «Вторая (подземная) биосфера» принципы ее функционирования.
- •8. Микробное фракционирование стабильных изотопов в природе.
- •9. Основные методы изучения геохимической деятельности микроорганизмов.
- •10. Современные биогеотехнологии с использованием микроорганизмов.
- •2. Микроорганизмы и ксенобиотики.
- •3. Почвы, загрязненные нефтью и нефтепродуктами.
- •4. Биологическая индикация загрязнения почвенной среды, самоочищение и самовосстановление почв, санитарное почвоведение.
- •5. Микроорганизмы почв и современные почвенные биотехнологии.
- •6. Микроорганизмы и охрана почв.
- •2. Современные методы, направленные на определение видового и функционального разнообразия почвенного микробного сообщества.
- •3. Методы для определения биомассы почвенных микроорганизмов.
Хемосинтез
Хемосинтез— тип питания бактерий, основанный на усвоении СO2 за счет окисления неорганических соединений. Хемосинтез был открыт в 1888 году русским биологом С.Н.Виноградским, доказавшим способность некоторых бактерий образовывать углеводы, используя химическую энергию. Существует несколько групп хемосинтезирующих бактерий, из которых наибольшее значение имеют нитрифицирующие, серобактерии и железобактерии (+тионовые и водородные). Например, нитрифицирующие бактерии получают энергию для синтеза органических веществ, окисляя аммиак до азотистой, а затем до азотной кислоты, серобактерии — окисляя сероводород до сульфатов, водородные бактерии - окисляя водород до воды, а железобактерии — окисляют двухвалентное железо до трёхвалентного. Освобожденная энергия аккумулируется в клетках хемобактерий в форме АТФ, только потом тратится на синтез органических соединений. Процесс хемосинтеза, при котором из СO2 образуется органическое вещество, протекает аналогично темновой фазе фотосинтеза. Благодаря жизнедеятельности бактерий-хемосинтетиков в природе накапливаются большие запасы селитры и болотной руды.
Реакции хемосинтеза:
1. нитрифицирующие бактерии
2NH3 + 302 ? 2HN02 + 2H20 + Q
2HN02+02 ? 2HN03 + Q
2. серобактерии
2H2S + O2
S+ 302 + 2H20 ? 2H2S04 + Q
3. водородные 2Н2 + 02 ? 2Н20 + Q
способны окислять молекулярный водород, являются умеренными термофилами (растут при температуре 50 °C)
4. железобактерии 4Fe(HCO3)2 + 6H2O + O2 ? 4Fe(OH)3 + 4H2CO3 +4CO2 + Q
При этой реакции энергии выделяется немного, поэтому железобактерии окисляют большое количество закисного железа
Тионовые бактерии (Thiobacillus (англ.)русск., Acidithiobacillus (англ.)русск.) способны окислять тиосульфаты, сульфиты, сульфиды и молекулярную серу до серной кислоты (часто с существенным понижением pH раствора), процесс окисления отличается от такового у серобактерий (в частности тем, что тионовые бактерии не откладывают внутриклеточной серы). Некоторые представители тионовых бактерий являются экстремальными ацидофилами (способны выживать и размножаться при понижении pH раствора вплоть до 2), способны выдерживать высокие концентрации тяжёлых металлов и окислять металлическое и двухвалентное железо (Acidithiobacillus ferrooxidans) и выщелачивать тяжёлые металлы из руд.
Литотрофные микроорганизмы
Используют в качестве источника энергии неорганические вещества. К литотрофным МО относят: водородные, окисляющие водород с образованием воды (большинство видов представлено грамотрицательными родам Pseudomonas, Alcaligenes, Aquaspirillum, Paracoccus и Xantobacter, некоторые виды - грамположительными родам Nocardia, Mycobacterium и Bacillus); нитрифицирующие, окисляющие аммиак до азотной кислоты (Nitrosomonas, Nitrosolobus, Nitrosococcus, Nitrosospira и Nitrobacter); тионовые, окисляющие сероводород до элементарной серы, откладывающейся внутри клеток, или элементарную серу до серной кислоты (Thiobacillus thiooxidans), или сернокислое закисное железо до окисного в кислой среде (Thiobacillus ferrooxidans); железобактерии, окисляющие закисное железо до окисного (Gallionella и Leptothrix) в нейтральных средах; метанобразующие, стимулирующие природный синтез метана из углекислоты и водорода в анаэробных условиях (Methanobacterium, Methanococcus, Methanosarcina и Methanospirillum); сульфатредуцирующие, жизнедеятельность которых происходит за счет процесса восстановления сульфатов до сероводорода (Desulfovibrio, Desulfotomaculum, Desulfobacter, Desulfococcus, Desulfosarcina, Desulfonema); нитратвосстанавливающие, вызывающие в почве процесс денитрификации - восстановления окисленных форм азота по схеме: нитрат-нитрит-азот-аммиак (Thiobacillus denitrificans). Различают фото- и хемолитотрофные МО. Литотрофные бактерии вносят значительный вклад в превращения веществ в экологической системе и принимают прямое участие в образовании полезных ископаемых (самородная сера, селитра, пирит, природный газ). Они участвуют в разрушении металлоконструкций, стимулируя процессы перехода и разрушения полимерных и неорганических материалов, образуя агрессивные среды. Окисление литотрофных микроорганизмов сульфидов металлов с образованием серной кислоты и растворенных металлов нашло применение для выщелачивания бедных металлических руд.
Органотрофы (некоторые выдержки о них) — организмы, для которых донорами электронов являются органические вещества.
Разнообразие микроорганизмов вблизи корня определяется разнообразием поступающих веществ, разнообразием трофических взаимодействий микроорганизмов между собой (гидролитики и диссипотрофы, бактериолитическая петля) и влиянием специфических веществ растений. Здесь можно ожидать очень широкий круг органотрофных аэробных организмов, пищевые потребности которых ориентированы на экссудаты. Как правило, эта область развития микроорганизмов характеризуется избытком органического углерода и лимитирующим содержанием азота и фосфора. (Заварзин)
Еще одна интересная особенность — четкое разделение между организмами, имеющими восстановительный пентозофосфатный цикл и не имеющими такового. Принято считать, что литотрофы имеют этот цикл, а органотрофы, в том числе органотрофные дышащие организмы, как правило, его не имеют. Частичное исключение— фотоорганотрофы, у которых при использовании неорганических восстановителей цикл Кальвина работает 10 .
ЖЕЛЕЗОБАКТЕРИИ, микроорганизмы, способные отлагать окисное железо на поверхности клетки. Процесс отложения не обязательно связан с окислением Fe(II) (иногда это разрушение органич. комплекса); окисление железа — источник энергии только для некоторых бактерий, растущих в очень кислой среде. Ж.— органотрофные организмы разного таксономии, положения. Нитчатые Ж. Leptothrix, Sphaerotilus вместе с Gallionella участвуют в образовании болотных руд, засоряют водотоки, нарушают водоснабжение. Развиваются обычно на границе окисленной и восстановленной зон в водоемах и затопленных почвах. Отложение железа этими Ж. рассматривается как побочный процесс разложения перекиси, образуемой при органотрофном обмене.
Итого 4 группы:
Фотолитотрофные ор-мы используют Е солнца и неорганический донор электрона. Сюда относятся, зеленые растенпия, цианобактерии + некоторые бактерии.
Фотоорганотрофы ор-мы используют Е солнца и органический донор электрона. Некоторые серобактерии, некоторые несерные бактерии. Особенно Athiorhodacea
Хемолитотрофные ор-мы используют ОВ реакция + неорганич. донор . тут только бактерии.
Хемолитотрофные ор-мы используют ОВ реакция + органич. Донор. Сюда относятся гетеротрофы (животные + некоторые бактерии)
http://humbio.ru/humbio/tarantul_sl/abc.htm