
- •2. Наземные экосистемы как источник и сток парниковых газов.
- •3. Биологический цикл азота.
- •Азотфиксация
- •Нитрификация
- •Денитрификация
- •4. Таксономическое разнообразие микроорганизмов цикла азота, осуществляемые ими процессы и продукты реакций.
- •5. Условия протекания процессов в экосистемах.
- •6. Таксономическое разнообразие микроорганизмов цикла углерода, осуществляемые ими процессы и продукты реакций.
- •7. Условия протекания процессов в экосистемах.
- •Процесс разложения растительных остатков и формирование подстилки
- •Образование и разложение гумуса
- •Участие почв-х мо в разрушении и новообразовании минералов
- •8. Микробная трансформация углерода и азота в почвенных агрегатах.
- •9. Формирование анаэробных зон внутри почвенных агрегатов.
- •10. Влияние размера почвенных агрегатов на продукты микробного метаболизма.
- •11. Участие микроорганизмов в «парниковом эффекте».
- •17. Постулат Бейеринка, Правило Гаузе, Триада Гузева.
- •18. Экологические (функциональные) и филогенетические классификации почвенных микроорганизмов.
- •19. Вертикальная ярусность микробов и их функции в различных экосистемах (бгц).
- •20. Филогенетическая структура метаболически активных прокариот в пространственно-сукцессионном (вертикально-ярусном) ряду.
- •2. Свойства покоящихся клеток.
- •3. Пролиферативный и метаболический покой.
- •4. Репродуктивные покоящиеся формы микроорганизмов.
- •5. Этапы формирования покоящихся форм.
- •6. Механизмы катаболитной репрессии и репрессии конечным продуктом.
- •7. Роль микроорганизмов в формировании и разложении почвенного гумуса.
- •8. Автохтонная и зимогенная микрофлора.
- •9. Микробная популяция как многоклеточный организм.
- •10. Экологическая роль антибиотиков в почве.
- •11. Примеры микробных сукцессий в почве.
- •2. Полифазная таксономия.
- •3. Основные филумы домена Bacteria и Archaea, обнаруживающиеся в почве.
- •2. Строение бактериофагов и их геном.
- •3. Генетический аппарат эукариотических микроорганизмов (грибов).
- •4. Лизогения у бактерий. Специфическая трансдукция: особенности и механизмы.
- •5. Конъюгация у бактерий.
- •6. Сравнительные особенности процесса конъюгации у разных типов бактерий.
- •7. Плазмиды и мигрирующие элементы.
- •8. Биологическое значение плазмид и мигрирующих элементов в изменчивости и эволюции микроорганизмов.
- •9. Сообщества бактерий – биопленки: их структура, экспрессия бактериальных генов в состоянии биопленок.
- •Фототрофы
- •Хемосинтез
- •2. Миксотрофия.
- •4. Современные представления о роли микроорганизмов в образовании и разрушении глинистых (почвообразующих, вторичных) минералов.
- •5. Роль микроорганизмов в образовании и деградации гумусовых веществ, основные группы организмов, механизмы процессов.
- •6. Понятие о «затравочном» эффекте.
- •7. «Вторая (подземная) биосфера» принципы ее функционирования.
- •8. Микробное фракционирование стабильных изотопов в природе.
- •9. Основные методы изучения геохимической деятельности микроорганизмов.
- •10. Современные биогеотехнологии с использованием микроорганизмов.
- •2. Микроорганизмы и ксенобиотики.
- •3. Почвы, загрязненные нефтью и нефтепродуктами.
- •4. Биологическая индикация загрязнения почвенной среды, самоочищение и самовосстановление почв, санитарное почвоведение.
- •5. Микроорганизмы почв и современные почвенные биотехнологии.
- •6. Микроорганизмы и охрана почв.
- •2. Современные методы, направленные на определение видового и функционального разнообразия почвенного микробного сообщества.
- •3. Методы для определения биомассы почвенных микроорганизмов.
Фототрофы
К этой группе относятся бактерии, использующие для синтеза органики энергию света, которая преобразуется с помощью фотосинтетических пигментов.
Выделяют бесхлорофилльный и хлорофилльный фотосинтез.
Бесхлорофилльный фотосинтез
Система бесхлорофилльного фотосинтеза отличается значительной простотой организации. Эффективность достаточно низка (на один поглощённый квант переносится лишь один H+). Открытие у галофильных архей.
В «пурпурных мембранах» Halobacterium salinarium есть белок бактериородопсин – светозависимый генератор протонного градиента.
Фотосинтетический аппарат экстремальных галобактерий является наиболее примитивным из ныне известных; в нём отсутствует электрон-транспортная цепь. Цитоплазматическая мембрана галобактерий является сопрягающей мембраной, содержащей два основных компонента: светозависимую протонную помпу (бактериородопсин) и АТФ-синтазу.
Таким образом, в результате работы бактериородопсина (квант света --> конформационные изменения) энергия солнечного излучения трансформируется в энергию электрохимического градиента протонов на мембране.
При работе АТФ-синтазы энергия трансмембранного градиента трансформируется в энергию химических связей АТФ -->т.е осуществляется хемиосмотическое сопряжение.
При бесхлорофилльном типе фотосинтеза (как и при реализации циклических потоков в электрон-транспортных цепях) не происходит образования восстановительных эквивалентов (восстановленного ферредоксина или НАД(Ф)Н), необходимых для ассимиляции углекислого газа. Поэтому при бесхлорофилльном фотосинтезе нет ассимиляции СО2, а осуществляется исключительно запасание солнечной энергии в форме АТФ (фотофосфорилирование).
Основной путь получения энергии для галобактерий — аэробное окисление органических соединений. При дефиците О2 помимо бесхлорофилльного фотосинтеза источниками энергии для галобактерий может служить анаэробное нитратное дыхание или сбраживание аргинина и цитруллина. Однако в эксперименте было показано, что бесхлорофилльный фотосинтез может служить и единственным источником энергии в анаэробных условиях при подавлении анаэробного дыхания и брожения при обязательном условии, что в среду вносят ретиналь, для синтеза которого необходим кислород.
Хлорофилльный фотосинтез более эффективный. (те не менее одного H+ и в некоторых случаях энергия запасается в форме восстановленных соединений (ферредоксин, НАДФ).
Пигментами «антеннами» могут быть:
-
хлорофилл;
-
бактериохлорофилл.
Аноксигенный (или бескислородный) фотосинтез протекает без выделения кислорода. К аноксигенному фотосинтезу способны пурпурные и зелёные бактерии, а также гелиобактерии. Донорами водорода служит не вода, а др. вещества.
*Пурпурные (Purple bacteria), зеленые (Chlorobiaceae) и гелиобактерии (Heliobacteriaceae). Содержат особый хлорофилл (бактериохлорофилл) и каротиноиды. Растут и осуществляют фотосинтез в анаэробных условиях, без выделения кислорода. Многие фиксируют молекулярный азот. Распространены в соленых и пресных водоемах и в п., затопляемых водой (рисовниках).
Оксигенный (или кислородный) фотосинтез сопровождается выделением кислорода в качестве побочного продукта. В качестве донора электронов при нециклическом потоке используется крайне слабый донор электронов — вода.
Фототрофные (фотосинтезирующие) бактерии (phototrophic bacteria, photosynthetic bacteria)— бактерии, которые в качестве источника энергии используют солнечный свет. Основным источником углерода в одних случаях является углекислый газ (фотоавтотрофы), в других — органические кислоты (фотогетеротрофы). К. Ф.б. относятся пурпурные и зеленые бактерии, цианобактерии, прохлорофиты и некоторые галобактерии (семейство архей). Фотосинтез у всех Ф.б. (за исключением галобактерий (о них написано выше) присходит с участием хлорофиллов. Фотосинтетический аппарат Ф.б. состоит из трех основных компонентов:
1) светособирающих пигментов, поглощающих энергию света и передающих ее в реакционные центры;
2) фотохимических реакционных центров, где происходит трансформация электромагнитной формы энергии в химическую;
3) фотосинтетических электронтранспортных систем, обеспечивающих перенос электронов, сопряженный с запасанием энергии в молекулах АТФ.
В фотохимической реакции участвуют, как правило, хлорофиллы или бактериохлорофиллы a в модифицированной форме. Эти же виды хлорофиллов, наряду с другими, а также пигментами иных типов (фикобилипротеины, каротиноиды) выполняют функцию антенны. У некоторых пурпурных бактерий, содержащих только бактериохлорофилл b, он выполняет обе функции. У недавно описанных гелиобактерий бактериохлорофилл g также служит светособирающим пигментом и входит в состав реакционного центра. Многие Ф.б. усваивают молекулярный азот. Активно участвуют в накоплении органических веществ. Ф.б., особенно цианобактерии, играют значительную роль в круговороте углерода и азота, а серобактерии — и серы. Некоторые Ф.б. получили практическое использование, напр. азотфиксирующие цианобактерии применяют для повышения плодородия рисовых полей, пурпурные бактерии и цианобактерии культивируют в промышленных масштабах для получения кормового белка и т. д.
*Существует теория, что для фотосинтеза могут быть использованы и другие источники света. Так, обнаруженный в окрестностях подводного термального источника вид GSB1, относящийся к серобактериям (Chlorobiaceae), обитает на глубине более двух километров, куда не проникает солнечный свет. Предполагается, что бактериохлорофилл этого вида поглощает длинные световые волны термального источника.