- •2. Наземные экосистемы как источник и сток парниковых газов.
- •3. Биологический цикл азота.
- •Азотфиксация
- •Нитрификация
- •Денитрификация
- •4. Таксономическое разнообразие микроорганизмов цикла азота, осуществляемые ими процессы и продукты реакций.
- •5. Условия протекания процессов в экосистемах.
- •6. Таксономическое разнообразие микроорганизмов цикла углерода, осуществляемые ими процессы и продукты реакций.
- •7. Условия протекания процессов в экосистемах.
- •Процесс разложения растительных остатков и формирование подстилки
- •Образование и разложение гумуса
- •Участие почв-х мо в разрушении и новообразовании минералов
- •8. Микробная трансформация углерода и азота в почвенных агрегатах.
- •9. Формирование анаэробных зон внутри почвенных агрегатов.
- •10. Влияние размера почвенных агрегатов на продукты микробного метаболизма.
- •11. Участие микроорганизмов в «парниковом эффекте».
- •17. Постулат Бейеринка, Правило Гаузе, Триада Гузева.
- •18. Экологические (функциональные) и филогенетические классификации почвенных микроорганизмов.
- •19. Вертикальная ярусность микробов и их функции в различных экосистемах (бгц).
- •20. Филогенетическая структура метаболически активных прокариот в пространственно-сукцессионном (вертикально-ярусном) ряду.
- •2. Свойства покоящихся клеток.
- •3. Пролиферативный и метаболический покой.
- •4. Репродуктивные покоящиеся формы микроорганизмов.
- •5. Этапы формирования покоящихся форм.
- •6. Механизмы катаболитной репрессии и репрессии конечным продуктом.
- •7. Роль микроорганизмов в формировании и разложении почвенного гумуса.
- •8. Автохтонная и зимогенная микрофлора.
- •9. Микробная популяция как многоклеточный организм.
- •10. Экологическая роль антибиотиков в почве.
- •11. Примеры микробных сукцессий в почве.
- •2. Полифазная таксономия.
- •3. Основные филумы домена Bacteria и Archaea, обнаруживающиеся в почве.
- •2. Строение бактериофагов и их геном.
- •3. Генетический аппарат эукариотических микроорганизмов (грибов).
- •4. Лизогения у бактерий. Специфическая трансдукция: особенности и механизмы.
- •5. Конъюгация у бактерий.
- •6. Сравнительные особенности процесса конъюгации у разных типов бактерий.
- •7. Плазмиды и мигрирующие элементы.
- •8. Биологическое значение плазмид и мигрирующих элементов в изменчивости и эволюции микроорганизмов.
- •9. Сообщества бактерий – биопленки: их структура, экспрессия бактериальных генов в состоянии биопленок.
- •Фототрофы
- •Хемосинтез
- •2. Миксотрофия.
- •4. Современные представления о роли микроорганизмов в образовании и разрушении глинистых (почвообразующих, вторичных) минералов.
- •5. Роль микроорганизмов в образовании и деградации гумусовых веществ, основные группы организмов, механизмы процессов.
- •6. Понятие о «затравочном» эффекте.
- •7. «Вторая (подземная) биосфера» принципы ее функционирования.
- •8. Микробное фракционирование стабильных изотопов в природе.
- •9. Основные методы изучения геохимической деятельности микроорганизмов.
- •10. Современные биогеотехнологии с использованием микроорганизмов.
- •2. Микроорганизмы и ксенобиотики.
- •3. Почвы, загрязненные нефтью и нефтепродуктами.
- •4. Биологическая индикация загрязнения почвенной среды, самоочищение и самовосстановление почв, санитарное почвоведение.
- •5. Микроорганизмы почв и современные почвенные биотехнологии.
- •6. Микроорганизмы и охрана почв.
- •2. Современные методы, направленные на определение видового и функционального разнообразия почвенного микробного сообщества.
- •3. Методы для определения биомассы почвенных микроорганизмов.
Нитрификация
– окисления азота в форме аммиака и соединений аммония, получающийся в процессах биогенной азотфиксации, до нитратов и нитритов нитрифицирующими бактериями. Нет бактерии, которая бы прямо превращала аммиак в нитрат. В его окислении всегда участвуют две группы бактерий: одни окисляют аммиак, образуя нитрит («нитритные» бактерии, роды Nitrosomonas, Nitrosococcus, Nitrosospira, Nitrosolobus, Nitrosovibrio), а другие окисляют нитрит в нитрат («нитратные» бактерии — Nitrobacter, Nitrospina, Nitrococcus). Наиболее известные виды нитрифицирующих бактерий — это Nitrosomonas и Nitrobacter. Все они — грамотрицательные, в очень мелкие, подвижные, с полярными/перитрихиальными (по всей пов-ти) жгутиками.
-
Nitrosomonas окисляет аммиак:NH3 + 1½ O2 = (NO2-) + 2H+ + H2O
-
Nitrobacter окисляют нитрит: (NO2-) + ½ O2 = NO3-
Бактерии, окисляющие аммиак, поставляют субстрат для бактерий, окисляющих нитрит. Поскольку высокие концентрации аммиака оказывают на Nitrobacter токсическое действие, Nitrosomonas, используя аммиак и образуя кислоту, тем самым улучшает и условия существования для Nitrobacter. По типу метаболизма хемолитоавтотрофы (используют энергию окисления NH3/HNO2 для синтеза орг. вещ. из CO2). Окисление аммиака и нитритов – на ЦМ.
Иммобилизация азота. Иммобилизированный N – наиболее лабильная (неустойчивая) часть орг-го N в почве. Минерализуется в первую очередь, ближайший резерв питания растений. Поступив в клетки МО, N выводится из круговорота (т.к. недоступен для растений). Это сказывается на применении удобрений: происходит снижение коэффициента использования азотных удобрений растениями в условиях микробной конкуренции за субстрат.
Денитрификация
– (восстановление нитрата) — восстановление нитратов до нитритов и далее до газообразных оксидов (NO, N2O) и молекулярного азота. В результате их азот возвращается в атмосферу и становится недоступным большинству организмов. Осуществляется только прокариотами (причём как бактериям, так и археями) в анаэробных условиях и связана с получением ими энергии.
Все денитрифицирующие бактерии — факультативные анаэробы, восст-ют нитраты только в отсутствие свободного кислорода. Аэробно – могут переключаться на дыхание для получения энергии, а нитраты использовать в процессах ассимиляционной нитратредукции как источники N. ВСЕ денитрификаторы способны к азотфиксации.
Пример: азотфиксатор Azospirillum lipoferum при наличии нитратов в анаэробных условиях проводит денитрификацию, а в аэробных — ассимилирует нитрат. В определенных условиях процессы азотфиксации и нитратредукции могут идти в клетке параллельно.
в рез-те в атмосферу ежегодно поступает 270-330 млн т N2, большая часть – потери из почвы (особенно в переувлажненных п); в сухих бесструктурных почвах: при увлажнении – денитрификация, при иссушении – нитрификация, и быстрое чередование процессов => быстрая потеря N почвой
-
Денитрификация бывает: ассимиляционная и диссимиляционная.
-
Ассимиляционная денитрификация (или а. нитратредукция) – восстановление нитратов до NH4, далее из него – синтез азотсодержащих клеточных компонентов. Аэробно и анаэробно. Диссимиляционная нитратредукция – анаэробно, МО получают энергию, но происходит потеря восстановленных соде-ий N или N2.
Денитрификация анаэробна, подавляется O2. Нитраты выступают акцепторами электронов с окисляемого субстрата (как орг-го, так и неорг-го). Орг. субстрат – хемоорганотрофы, неорг. – хемолитотрофы. Ферменты диссимиляционной н. – нитратредуктазы с MoFeS-белками (сидят в клеточной мембране). Конечные продукты газообразны (NO, N2O, N2 – зависит от среды и вида). Восстановление нитратов: NO3- -> NO2- -> NО -> N2О -> N2. Также называют «анаэробным нитратным дыханием», потому что при переносе электронов к NO2- и N2O энергетический выход ок. 70% энергетического выхода при дыхании со свободным кислородом.
Хемоорганототрофные бактерии-денитрификаторы. Нитраты до нитритов восстанавливают прокариоты, эукариоты (водоросли, грибы, дрожжи). Полная денитрификация до N2 – только прокариоты. Это факультотивно анаэробные хемоорганотрофы, им нужны нитраты для окисления орг. субстрата, и они окисляют его до CO2 b H2O с потерей газообразного азота: Органическое вещество + KN03 -> С02 + Н20 + N2.
Хемолитототрофные бактерии-денитрификаторы: Thiobacillus denitrificans, Thiomicrospira denitrificans, Paracoccus denitrificans. Нитраты для них выступают в качестве окислителей неорганических веществ, например серы, Н2 или тиосульфата, восстанавливаясь при этом либо полностью до N2, либо только до нитритов (у Thiobacillus thioparus).
Процессы
ассимиляционной и диссимиляционной
нитратредукции, азотфиксации и
денитрификации взаимно связаны и могут
осуществляться одними и теми же
бактериями:

Проблема образования стока и закиси азота (=> разрушение озонового слоя стратосферы, фотохимические реакции). Источник N2O – микробная денитрификация. Ацетилен – ингибитор восст-я N2O в N2, при его добавлении в почву N2O в среде накапливается. Также избыток N2О получается при нитрификации при лимите O2.
Пути удаления N2O в аэробиозе: с помощью МО, образующих H2O2 и каталазу. В этих окислительных условиях из закиси азота образуются NO и NO2-.
Пути удаления N2O в анаэробиозе: использование N2O как субстрата нитрогеназы, и она восстановит N2O до N2 или NH4.
На денитрификацию влияет аэрация и pH. Большая аэрация и кислая среда снижают скорость денитрификации, повышают N2O:N2 в конечных продуктах. Из-за денитрификации растения не полностью используют N из вносимых удобрений. Для решения нужно вносить гранулированные удобрения, вносить дробно, создать определенный водный режим, меняя аэрацию.
