2. Полифазная таксономия.

Полифазный подход — комбинация хемотаксономических, фенотипических и генетических признаков (конгруэнтность). Только 16sРНК не служит показателем. Термин полифазная таксономия был предложен в 1970 году Ритой Колвер для обозначения таксономии которая включает в себя много уровней информации от молекулярного до экологического, и учитывает несколько определённых порций информации происходящих из негомогенных источников.

Первоначально термин использовался микробиологами (бактериологами) в значении, сходном с фенетической систематикой. Отличием являлось то, что полифазная таксономия стремится объединить много уровней информации, от молекулярного до экологического. В настоящее время под полифазной таксономией понимают практику использования всей имеющейся информации для выделения консенсусных таксономических групп, т. е. консенсусную таксономию. Обычно она включает в себя генотипическую, фенотипическую и филогенетическую информацию об организме. Идея комплексного подхода, интегрирующего данные разных типов, для систематики грибов сама по себе не нова. Подобные идеи декларировались еще в начале прошлого века, допуская возможность одновременного использования морфологических, экологических, физиологических признаков, особенностей жизненного цикла и т. д. Однако данный подход нечасто находил масштабное применение и не всегда оказывался продуктивен. На наш взгляд, в последние годы можно наблюдать более перспективную попытку создания такой комплексной методологии и попытку объединения филогенетических течений в систематике с полифазным подходом. Базовым принципом объединенного подхода должно быть то, что деление на таксоны не должно противоречить филогении – основной постулат филогенетической систематики. Для определения границ видов предпочтительно использование наиболее продуктивной на настоящий момент концепции генеалогической согласованности. Для членения филогенетического древа и определения границ таксонов видового ранга и более высоких рангов можно использовать разнообразные фенотипические и генетические признаки (полифазный подход). Членение на таксоны с помощью какого-либо набора однотипных фенотипических признаков может считаться достоверным, если оно согласуется с филогенией и с делением, проведенным с помощью признаков другого типа. Морфологические признаки наиболее популярны для целей таксономии, но не дают возможность получить непротиворечивую си- стему для многих групп грибов, особенно микромицетов. Проблема заключается в малочисленности признаков, трудности их наблюдения и нестабильности. Физиологические и биохимические признаки у микромицетов имеют большее адаптивное значение, чем морфологические и поэтому потенциально должны лучше коррелировать с филогенией. Поэтому неоднократно совершались попытки найти надежные стабильные хемотаксономические маркеры, которые позволили бы разделить виды и впоследствии проводить идентификацию. Метаболитные профили, полученные с помощью хроматографии (преимущественно ВЭЖХ), видятся наиболее простым способом получе- ния информативных данных, которые можно использовать для целей таксономии грибов.Морфологические маркеры, тем не менее, остаются актуальными ввиду глубокой традиции их использования для систематики и идентификации.