Число триангуляции
•Каждая треугольная грань икосаэдра содержит 3Т субъединиц, где Т (количество субъединиц в асимметричной ячейке икосаэдра) - число триангуляции, = h2 + hk + k2, где h и k индексы гексамеров равносторонних треугольников. Значения Т варьируют от 1, 2, 4, 7, 9, 13, 19, 21, 25 и т.д. С увеличением числа Т увеличивается размер и объем капсида. Каждая частица содержит 60Т субъединиц, которые представлены 12 пентамерами и 10(Т- 2) гексамерами
9
Число триангуляции
•Каждая треугольная грань икосаэдра содержит 3Т субъединиц, где Т (количество субъединиц в асимметричной ячейке икосаэдра) - число триангуляции, = h2 + hk + k2, где h и k индексы гексамеров равносторонних треугольников. Значения Т варьируют от 1, 3, 7, 13, 19, 21, 31 и т.д. С увеличением числа Т увеличивается размер и объем капсида. Каждая частица содержит 60Т субъединиц, которые представлены 12 пентамерами и 10(Т-1) гексамерами
10
11
12
Топология капсидов некоторых гигантских фагов. Hua et al. mBio, 2017
Элонгационное число Q = h1h2 + h1k1 + k1k2 У Т4 T=13, Q=20; у ϕ29 Т=3, Q= 5
Chainmail structure in HK97, cross-linked by the covalent bonds provides extraordinary robustness. In majority of the phages heads are not cross- linked and assembled in chain- mail.
2
5
Нековалентная chain-mail структура капсида фага Bordetelle pertusis Bpp1 стабилизированная цементирующим белком
phi29
Hoc & soc декорирующие белки головки фага |
Horn |
Т4 |
Synechococcus phage Syn5 |
14 |
|
15
16
17