- •1. Предмет, задачи и цели молекулярной биологии.
- •2. Химический состав нуклеиновых кислот.
- •3. Первичная структура нк
- •4.Открытие двойной спирали днк
- •5.Вторичная структура днк, правило э.Чаргаффа
- •6. Физико-химические свойства днк
- •7. Строение и свойства рнк
- •8. Матричные процессы синтеза биополимеров
- •9. Общая характеристика репликации
- •10. Белки и ферменты, участвующие в репликации днк
- •11. Инициация репликации, Ori-последовательность.
- •12. Терминация репликации
- •13. Репликация кольцевых молекул днк
- •14. Репликация теломерных концов днк
- •15. Явление обратной транскрипции
- •16. Репликативное метилирование днк
- •17. Репарация повреждений днк
- •Дезаминирование азотистых оснований.
- •Алкилирование.
- •18. Рекомбинация днк
- •19. Sos репарация
- •20. Мобильные генетические элементы и их типы про- и эукариот (транспозиция)
- •21.Мини-транспозоны
- •22. Амплификация фрагментов днк с помощью полимеразной цепной реакции
- •23. Определение нуклеотидной последовательности молекул днк, метод секвенирования Максомома-Гилберта, метод Сэнгера, секвенаторы.
- •24. Общая схема процесса транскрипции и характеристика его отдельных элементов
- •25. Инициация, элонгация и терминация транскрипции, промотор и терминатор.
- •Вопрос 26. Транскрипция у прокариот, строение оперонов на примере lac-оперона.
- •Вопрос 27 транскрипция эукариот
- •29. Особенности организации генов у прокариот и эукариот
- •30. Строение м-рнк
- •31)Процессинг рнк
- •32. Сплайсинг общая характеристика и механизмы
- •33. Модификация 5'- и 3'-концов транскриптов, кэп и полиА-хвост
- •34. Этапы расшифровки генетического кода
- •35)Эксперименты Ниренберга и Маттеи
- •36. Основные свойства генетического кода и кодового словаря
- •37. Общая схема процесса трансляции и характеристика его отдельных элементов.
- •У эукариот
- •Селекция инициаторной метионил-тРнк (Met-tRnAiMet)
- •Элонгация
- •Терминация
- •Компартментализация у эукариот
- •38. ТРнк: строение и свойства
- •39. ТРнк-синтетазы их фунуции и образование тРнк
- •Аминоацилирования
- •Механизм аминоацилирования
- •Безошибочность узнавания аминокислот[
- •Классификация
- •Доменная организация[
- •Технологические перспективы
- •40. Строение рибосом прокариот и эукариот
- •41. РРнк: строение и свойства
- •42. Этапы трансляции (инициация , элонгация, терминация) и их характеристика
- •1. Инициация
- •2. Элонгация
- •3. Терминация
- •43. Посттрансляционная модификация полипептидных цепей
- •44. Структура белков (первичная, вторичная, третичная и чевертичная)
- •1. Вторичная структура белков
- •2. Третичная структура белков
- •3. Конформационная лабильность белков
- •4. Денатурация белков
- •5. Факторы, вызывающие денатурацию белков
- •6. Медицинские аспекты конформационной
- •7. Применение денатурирующих агентов в биологических исследованиях и медицине
- •1. Супервторичная структура типа ?-бочонка
- •2. Структурный мотив "?-спираль-
- •3. Супервторичная структура в виде "цинкового пальца"
- •4. Супервторичная структура в виде "лейциновой застёжки-молнии"
- •1. Количество протомеров в структуре олигомерных белков
- •2. Сборка протомеров в олигомерный белок.
- •45. Фолдинг белков
- •46 Секреция белков у прокариот
- •47 Деградация белков
- •48 Передача информации через клеточную мембрану
- •49 Белковые домены, узнающие специфические последовательности днк
- •50 Сенсорные механизмы бактерий
- •51. Сенсорные механизмы эукариот
- •52. Проект «Геном человека» его этапы и значение
- •53. Геномика. Размеры, структура и особенности организации геномов различных групп организмов
3. Конформационная лабильность белков
Гидрофобные взаимодействия, а также ионные и водородные связи относят к числу слабых, так как их энергия лишь ненамного превышает энергию теплового движения атомов при комнатной температуре (т.е. уже при данной температуре возможен разрыв таких связей).
Поддержание характерной для белка конфор-мации возможно благодаря возникновению множества слабых связей между различными участками полипептидной цепи.
Однако белки состоят из огромного числа атомов, находящихся в постоянном (броуновском) движении, что приводит к небольшим перемещениям отдельных участков полипептидной цепи, которые обычно не нарушают общую структуру белка и его функции. Следовательно, белки обладают конформационной лабильностью - склонностью к небольшим изменениям конформации за счёт разрыва одних и образования других слабых связей. Конформация белка может меняться при изменении химических и физических свойств среды, а также при взаимодействии белка с другими молекулами. При этом происходит изменение пространственной структуры не только участка, контактирующего с другой молекулой, но и конформации белка в целом. Конформационные изменения играют огромную роль в функционировании белков в живой клетке.
4. Денатурация белков
Разрыв большого количества слабых связей в молекуле белка приводит к разрушению её на-тивной конформации. Так как разрыв связей под действием различных факторов носит случайный характер, то молекулы одного индивидуального белка приобретают в растворе форму случайно сформировавшихся беспорядочных клубков, отличающихся друг от друга трёхмерной структурой. Потеря нативной конформации сопровождается утратой специфической функции белков. Этот процесс носит название денатурации белков. При денатурации белков не происходит разрыва пептидных связей, т.е. первичная структура белка не нарушается.
В денатурированном белке гидрофобные радикалы, которые в нативной структуре молекулы спрятаны внутри гидрофобного ядра, оказываются на поверхности. При достаточно высокой концентрации белка и отсутствии сильного отталкивающего заряда молекулы могут объединяться друг с другом гидрофобными взаимодействиями, при этом растворимость белка снижается и происходит образование осадка.
Компактная, плотная пространственная структура нативного белка при денатурации резко увеличивается в размерах и становится легко доступной для расщепления пептидных связей протеолитическими ферментами. Термическая обработка мясной пищи перед употреблением не только улучшает её вкусовые качества, но и облегчает её ферментативное переваривание в пищеварительной системе. Кроме того, денатурирующим действием на пищевые белки обладает и кислая среда желудка, вызывающая денатурацию тех белков, которые не подвергались предварительной температурной обработке, а также оказывает денатурирующее действие на белки микроорганизмов, попавших в желудок с пищей.
5. Факторы, вызывающие денатурацию белков
Денатурацию белков вызывают факторы, способствующие разрыву гидрофобных, водородных и ионных связей, стабилизирующих кон-формацию белков:
высокая температура (более 50 °С), увеличивающая тепловое движение атомов в молекуле и приводящая к разрыву слабых связей;
интенсивное встряхивание раствора, приводящее к соприкосновению белковых молекул с воздушной средой на поверхности раздела фаз и изменению конформации этих молекул;
органические вещества (например, этиловый спирт, фенол и его производные) способны взаимодействовать с функциональными группами белков, что приводит к их конформа-ционным изменениям. Для денатурации белков в биохимических исследованиях часто используют мочевину или гуанидинхлорид, которые образуют водородные связи с амино- и карбонильными группами пептидного остова и некоторыми функциональными группами радикалов аминокислот. Происходит разрыв связей, участвующих в формировании вторичной и третичной структуры нативных белков, и образование новых связей с химическими реагентами;
кислоты и щелочи, изменяя рН среды, вызывают перераспределение связей в молекуле белка;
соли тяжёлых металлов (такие как медь, ртуть, серебро, свинец и др.) образуют прочные связи с важными функциональными группами белков (чаще всего с -SH), изменяя их конформацию и активность;
детергенты - вещества, содержащие гидрофобный углеводородный радикал и гидрофильную функциональную группу (такие вещества называют амфифильными). Гидрофобные радикалы белков взаимодействуют с гидрофобными частями детергентов, что изменяет конформацию белков. Денатурированный под действием детергентов белок обычно остаётся в растворённом виде, так как гидрофильные части денатурирующего вещества удерживают его в растворе. К наиболее известным детергентам относят различные мыла .
