- •1. Предмет, задачи и цели молекулярной биологии.
- •2. Химический состав нуклеиновых кислот.
- •3. Первичная структура нк
- •4.Открытие двойной спирали днк
- •5.Вторичная структура днк, правило э.Чаргаффа
- •6. Физико-химические свойства днк
- •7. Строение и свойства рнк
- •8. Матричные процессы синтеза биополимеров
- •9. Общая характеристика репликации
- •10. Белки и ферменты, участвующие в репликации днк
- •11. Инициация репликации, Ori-последовательность.
- •12. Терминация репликации
- •13. Репликация кольцевых молекул днк
- •14. Репликация теломерных концов днк
- •15. Явление обратной транскрипции
- •16. Репликативное метилирование днк
- •17. Репарация повреждений днк
- •Дезаминирование азотистых оснований.
- •Алкилирование.
- •18. Рекомбинация днк
- •19. Sos репарация
- •20. Мобильные генетические элементы и их типы про- и эукариот (транспозиция)
- •21.Мини-транспозоны
- •22. Амплификация фрагментов днк с помощью полимеразной цепной реакции
- •23. Определение нуклеотидной последовательности молекул днк, метод секвенирования Максомома-Гилберта, метод Сэнгера, секвенаторы.
- •24. Общая схема процесса транскрипции и характеристика его отдельных элементов
- •25. Инициация, элонгация и терминация транскрипции, промотор и терминатор.
- •Вопрос 26. Транскрипция у прокариот, строение оперонов на примере lac-оперона.
- •Вопрос 27 транскрипция эукариот
- •29. Особенности организации генов у прокариот и эукариот
- •30. Строение м-рнк
- •31)Процессинг рнк
- •32. Сплайсинг общая характеристика и механизмы
- •33. Модификация 5'- и 3'-концов транскриптов, кэп и полиА-хвост
- •34. Этапы расшифровки генетического кода
- •35)Эксперименты Ниренберга и Маттеи
- •36. Основные свойства генетического кода и кодового словаря
- •37. Общая схема процесса трансляции и характеристика его отдельных элементов.
- •У эукариот
- •Селекция инициаторной метионил-тРнк (Met-tRnAiMet)
- •Элонгация
- •Терминация
- •Компартментализация у эукариот
- •38. ТРнк: строение и свойства
- •39. ТРнк-синтетазы их фунуции и образование тРнк
- •Аминоацилирования
- •Механизм аминоацилирования
- •Безошибочность узнавания аминокислот[
- •Классификация
- •Доменная организация[
- •Технологические перспективы
- •40. Строение рибосом прокариот и эукариот
- •41. РРнк: строение и свойства
- •42. Этапы трансляции (инициация , элонгация, терминация) и их характеристика
- •1. Инициация
- •2. Элонгация
- •3. Терминация
- •43. Посттрансляционная модификация полипептидных цепей
- •44. Структура белков (первичная, вторичная, третичная и чевертичная)
- •1. Вторичная структура белков
- •2. Третичная структура белков
- •3. Конформационная лабильность белков
- •4. Денатурация белков
- •5. Факторы, вызывающие денатурацию белков
- •6. Медицинские аспекты конформационной
- •7. Применение денатурирующих агентов в биологических исследованиях и медицине
- •1. Супервторичная структура типа ?-бочонка
- •2. Структурный мотив "?-спираль-
- •3. Супервторичная структура в виде "цинкового пальца"
- •4. Супервторичная структура в виде "лейциновой застёжки-молнии"
- •1. Количество протомеров в структуре олигомерных белков
- •2. Сборка протомеров в олигомерный белок.
- •45. Фолдинг белков
- •46 Секреция белков у прокариот
- •47 Деградация белков
- •48 Передача информации через клеточную мембрану
- •49 Белковые домены, узнающие специфические последовательности днк
- •50 Сенсорные механизмы бактерий
- •51. Сенсорные механизмы эукариот
- •52. Проект «Геном человека» его этапы и значение
- •53. Геномика. Размеры, структура и особенности организации геномов различных групп организмов
32. Сплайсинг общая характеристика и механизмы
Многие гены эукариот состоят из экзонов – кодирующих по-следовательностей и интронов – некодирующих последовательно-стей. При транскрипции таких генов считывается РНК, содержащая в своем составе как экзоны, так и интроны. Образовавшийся первичный транскрипт, подвергается процессингу, в результате которого интроны вырезаются, а экзоны, сшиваясь, образуют зрелую РНК . Данный процесс получил название сплайсинг. Сплайсингу подвергаются предшественники различных эука-риотических РНК: иРНК, тРНК, рРНК. У эукариот в предшественниках иРНК (пре-РНК) интроны вы-резаются в сплайсосомах – комплексах, состоящих из мяРНК и бел-ков. Интроны на границах с экзонами имеют канонические последо-вательности на 5’-конце – ГУ, на 3’-конце – АГ. Они также содержат последовательности, необходимые для удаления: акцепторный сайт, донорный сайт и бранч-сайт (рис.5.13). мяРНК в соответствии с пра-вилом комплементарности и белки, взаимодействуя с этими сайтами, обеспечивают удаление интронов.
Процесс удаления интронов включает
a) разрыв молекулы РНК на границе интрон-экзон со стороны 5’-конца интрона;
b) образование сложнофирных связей между фосфатной груп-пой первого нуклеотидаинтрона (Г) и гидроксильной груп-пой рибозы (у 2’ атома углерода) аденозина, входящего в со-став бранч-сайта. Сформировавшаяся структура напоминает лассо;
c) удаление и последующее разрушение интрона;
d) воссоединение экзонов посредством образования фосфодиэфирных связей.
Следует также отметить, что у первичных транскриптов в митохондриях и хлоропластах, а также у предшественников дрожжевых тРНК канонические последовательности ГУ– АГ на границе интронэкзон отсутствуют. Альтернативный сплайсинг Определенные полинуклеотидные последовательности РНК в одних случаях могут выступать в качестве интрона, в других – в качестве экзона. В связи с этим сплайсинг РНК может осуществляться альтернативными путями Образовавшиеся в результате альтернативного сплайсинга зрелые РНК будут отличаться друг от друга первичной структурой. Такие РНК будут иметь как идентичные, так и свои собственные фрагменты полинуклеотидных последовательностей.
Альтернативный сплайсинг
Альтернативный сплайсинг обеспечивает образования разнообразных белков с одного и того же первичного транскрипта. Например, в клетках щитовидной железы в результате транскрипции определенного гена и последующего сплайсинга образуется иРНК, служащая матрицей для синтеза гормона кальцитонина, ответствен-ного за регуляцию обмена кальция. В мозге же из первичного транс-крипта, считанного с этого же гена, вследствие альтернативного ва-рианта сплайсинга образуется иРНК, кодирующая белок, отвечающий за восприятие вкуса. В случае альтернативного сплайсинга экзоны обычно выстраи-ваются в той же ориентации, в какой они располагались в гене. Транссплайсинг – форма сплайсинга, при которой соединяются экзоны разных РНК
Аутосплайсинг (самосплайсинг) – сплайсинг первичного транс-крипта РНК, происходящий без участия каких-либо ферментов, т.е. РНК сама является катализатором этого процесса. Так у инфузории Tetrаchymenа thermophyla образуется 35S предшественник рРНК (пре-рРНК) длиной 6400 нуклеотидов. Без участия белков из этой пре-рРНК вырезается интрон длиной 414 нуклеотидов. При этом два экзона сшиваются с образованием 26S рРНК. Для протекания сплайсинга необходимо присутствие нуклеотида содержащего гуанин (ГТФ, или ГДФ, или ГМФ, или гуанозин). На 3’-гидроксильную группу этого гуанинового нуклео-тида переносится фосфатная группа 5’-конца интрона. Затем образовавшаяся на конце первого экзона 3’-гидроксильная группа используется для присоединения к 5’-концу второго экзона посредством фосфодиэфрной связи. Вырезание интрона сопровождается его циклизацией и удалением из его состава небольшого фрагмента, содержащего тот гуаниновый нуклеотид, который использовался для инициации сплайсинга, Интроны, аналогичные интронам Tetrаchymenа thermophyla, встречаются в пре-рРНК митохондрий, хлоропластов, грибов.
