- •1. Предмет и задачи вирусологии. Связь вирусологии с другими биологическими дисциплинами.
- •2.Лизогенизация бактерий фазмидами. Использование фазмид в качестве векторов при изучении геномов бактерий.
- •3. Определения вируса. Отличие вируса от клеточных организмов. Особенности вирусов как живых организмов.
- •4. Особенности организации и репликации вирусов растений отличающих их от вирусов животных и бактерий.
- •6.Строение вирусов. Простые и сложные капсиды. Биохимический состав вирусных частиц.
- •7. Принципы классификации вирусов. Основные семейства вирусов животных и человека.
- •8. Медленные вирусные инфекции.
- •9. Вирусологические методы выделения и изучения вирусов
- •10. Генетика вирусов. Типы вирусных мутантов. Дефектные вирусные частицы.
- •11. Генетические взаимодействие между вирусами (комплементация, рекомбинация). Негенетическое взаимодействие вирусов (интерференция, фенотипическое смешение).
- •12. Структура геномов вирусов. Типы днк и рнк геномов.
- •Вирусы с непрерывным и сегментированным геномами. Кодирующая способность вирусного генома.
- •Основные гипотезы происхождения вирусов и факты их подтверждающие. Возможные пути эволюции вирусов.
- •Особенности строения вирусов бактерий и функции ее отдельных структур. Систематика вирусов бактерий.
- •Наиболее значительные достижения вирусологии и перспективы ее развития. Значение вирусологии в жизни человека
- •17. Титр бактериофага, методы его определения. Медоды выявление вирусов животных и растений. В методичке
- •18. Методы получения фаголизатов и их использование на практике..
- •19) Вирусологические методы исследования
- •25.Три состояния бактериофага. Механизмы лизогенизации и индукции профага лямбда.
- •26. Бактериофаги как переносчики генетической информации бактерий. Фаговая трансдукция и фаговая конверсия.
- •27. Генетическая организация фага λ
- •28. Организация геномов и особенности репликации мужских специфич бактериофагов (мs2, r17, м13)
- •30) Общая схема репликации вирусов (цикл одиночного развития фага, биохимия вирусной инфекции)
- •37) Патогенез заболеваний вирусной природы. Клеточные и организменные стадии вирусного патогенеза.
- •38) Распространение вирусов в организме хозяина и тропизм к определенным тканям.
- •39) Патологические эффекты, индуцируемые вирусами в клетках животных.
- •41.Онкогенные рнк-содержащие вирусы. Трансформация клеток и откогенез.
- •43. Иммунитет при вирусных заболеваниях. Синдром приобретенного иммунодефицита.
- •44. Вирусные инфекции растений. Пути передачи вирусных инфекций у растений. Методы борьбы с вирусными инфекциями растений.
- •45. Неканонические вирусы: прионы и вироиды и механизмы их репродукции
- •46. Химические антивирусные средства и механизм их действия. Интерфероны
- •47. Этапы репликации вирусов, уязвимые для действия лекарственных средств. Общая стратегия поиска антивирусных средств
- •48. Векторы на основе вирусов животных (ретровирусов, полиомавирусов) и их использование в генотерапии.
- •52. Получение чистых линий бактериофагов
- •53. Особенности репликации вируса гепатита в.
- •54. Бакуловирусы насекомых. Особенности их репликации и использование в качестве векторов экспрессии в биотехнологии.
- •55. Новые и возникающие вирусные инфекции.
- •56. Вакцинация. Типы вакцин: живые,убитые , субъединичные, днк-вакцины.
- •57. Вирусные гепатиты а,в,с,д и вирусы их вызывающие
- •58.Ортомиксовирусы:репликация, биологические свойства и представители.
- •59. Парамиксовирусы:репликация, биологические свойства и представители
- •60. Рабдовирусы:репликация, биологические свойства и представители.
- •64)Рнк-содержащие вирусы растений. Особенности репликации.
- •65)Днк-содержащие вирусы растений. Особенности репликации.
- •66) Вич инфекция. Особенности строения, репликации и патогенеза вич.
26. Бактериофаги как переносчики генетической информации бактерий. Фаговая трансдукция и фаговая конверсия.
Фаги, как и вирусы позвоночных, беспозвоночных и растений, по содержанию НК подразделяются на ДНК- и РНК-содержащие, а по характеру взаимодействия с бактериями - на вирулентные и умеренные с полноценным и дефектным геномами.
Различают простые и сложные фаги. При этом простые имеют форму шестигранников (колифаги MS-2, f2, фХ174) или нитей (фаги fl, fd), а сложные (колифаги группы Т1-Т7) - сперматозоидную.
Приобретение новых признаков, обусловленных профагом, называется фаговой (лизогенной) конверсией. Фаговая конверсия может затрагивать такие важные свойства бактерий как морфология колоний, биохимические признаки, способность синтезировать токсины или антибиотики, устойчивость к лекарственным препаратам и др. Утратившие часть своего генома умеренные фаги становятся дефектными и, будучи не способными к образованию зрелых частиц, осуществляют трансдукцию (лат. transductio - перенос, перемещение), т. е. перенос генов.
Трансдукция - вид рекомбинации, при которой перенос генетического материала от одних клеток (доноров) к другим (реципиентам) осуществляют умеренные фаги или их мутанты.
Установлено, что за трансдукцию ответственны умеренные фаги, потерявшие способность лизогенизировать бактериальные клетки вследствие того, что часть их генома при неправильном отщеплении замещается фрагментом ДНК бактерии-донора. Такие мутанты фагов называют дефектными фаговыми корпускулами или дефектными фагами. Они всегда присутствуют в популяции фагов, освобождаемых клетками в среду после индукции или суперинфекции. С помощью трансдуцирующего фага могут передаваться многие признаки и свойства: способность сбраживать различные углеводы, синтезировать аминокислоты и витамины, резистентность к антибиотикам, вирулентность, токсигенность, жгутики. При этом трансдуцирующие свойства фага не зависят от способности лизироватъ или лизогенизировать реципиентную клетку.
Виды трансдукции. По характеру передачи признаков различают три вида трансдукции - генерализованную, ограниченную (специализированную) и абортивную.
Генерализованную, или общую, трансдукцию осуществляют фаги с множественной локализацией на хромосоме бактерий. К ним, в частности, относится умеренный фаг Ми-1, содержащий линейную двухцепочечную ДНК.
Ограниченную трансдукцию связывают с фагами, обладающими избирательной локализацией на хромосоме бактерий и способными переносить ограниченное число генов, прилегающих к специфическим участкам интеграции. Этот вид трансдукции осуществляют умеренные фаги X, Р2, Р22 и многие другие.
Абортивная трансдукция отличается от первых двух тем, что перенесенный фагом фрагмент ДНК донора остается в цитоплазме реципиентной клетки в автономном состоянии. Не включаясь в хромосому клетки-реципиента, этот фрагмент ДНК в течение нескольких делений бактерий передается лишь одной клетке, а далее полностью исчезает.
27. Генетическая организация фага λ
Основное отличие – могут быть в 3-х состояниях:
Вирион
Вегетативный фаг
Профаг
Длинный хвостовой отросток, ДНК 2-х цепочечная, линейная внутри головки.
На 5/-конце каждой ее цепи имеется одноцепочечная последовательность из 12 нуклеотидов – липкие концы (cos-сайты). Сразу же после проникновения фаговой ДНК в бактериальную клетку, липкие концы ДНК ковалентно соединяются ДНК-лигазой клетки-хозяина и образуется кольцевая молекула.
Далее, как правило, эта кольцевая молекула бактериофаговой ДНК не приступает к транскрипции, а встраивается в бактериальную хромосому. Установлено, что гены фага λ кодируют синтез четырех регуляторных белков, один из которых репрессорный белок сI (кодируется геном сI) блокирует развитие событий литического цикла, а антирепрессорный белок Cro (кодируется геном сro), наоборот, запускает их. После поступления ДНК фага λ в клетку, выбор между литическим и лизогенным путями развития зависит от относительной скорости накопления регуляторных белков: если преобладает антирепрессорная функция белка Cro, то развиваются события литического цикла, если успевает проявиться функция репрессорного белка сI, литический цикл не осуществляется, так как белок сІ связывается с ДНК фага λ в особых участках, препятствуя транскципции фаговых генов.
Встраивание ДНК фага λ в бактериальную хромосому осуществляется согластно интегративной модели А.Кемпбелла. Этот процесс называется сайт-специфической рекомбинацией, так как встраивание ДНК фага λ осуществляется в одном и том же месте (сайте) между генами gal и bio и не зависит от rec A-системы бактериальной клетки.
За интеграцию ДНК фага λ ответственен фермент лямбда-интеграза. Этот фермент узнает две разные последовательности – одну в хромосомной ДНК (att λ), а другую в ДНК фага (b2). Затем происходит разрыв обеих молекул ДНК и последующее их перекрестное воссоединение.
После этого ДНК фага λ реплицируется с клеточной ДНК как единая структура, и все дочерние клетки при делении получают копию фаговой ДНК в составе хромосомы. Подобные клетки называются лизогенными, а ДНК фага λ в них – профагом.
Линейная мол ДНК длиной 49000 п.н. Гены фага можно разбить на 2 группы: существенные для формирования негативных колоний и несущественные. Сущ гены идентифицируются с помощью условно летальных мутаций: либо sus, либо ts. Эти мутции локализованы в 25 различных цистронах(оперонах). 7 отвечают за формирование нормального хвостового отростка, 7-за формирование головки фага. Эти гены необходимы для правильной сборки фаговых частиц, либо кодируют структурные белки, входящие в состав фага. 2 гена обеспечивают лизис клетки и высвобождения потомства фага. Еще 2 гена обеспечивают репликацию ДНК фага, остальные 3-регуляторные.
Несущественные гены идентифицируются по морфологии негативных колоний или при делециях участков генома, в кот они локализованы. Делеции в фаге обнаружить легко, поскольку несущие делеции фаги содержат в головке меньше ДНК по сравнени с нормальным фагом, следовательно их ДНК хараетеризуется иной плотностью, что выявляется при центрифугировании в градиенте хлористого цезия.
