- •Трансформанты растут в присутствии Amp, но не в присутствии Tet
- •Низкая эффективность трансформации
- •Конец ин let рации; 'переход к пизогенному состоянию
- •Конструирование векторов на основе бактериофага X
- •Xbo I/Soil Замещение
- •Глава 2
- •Глава 3
- •На уровне полосы бактериофага наклейте на пробирку полоску липкой ленты. Затем проткните стенку пробирки через
- •Соберите материал полосы с частицами бактериофага, жак было описано выше. Храните его в растворе хлористого цезия при 4°с в плотно закупоренной пробирке.
- •Открытая кольцевая и линейная днк Замкнутая кольцевая ллазмидная днк
- •Глава 4
- •3 Матрица—-рнк
- •Глава 5
- •Глава 6
- •Использование экзогенных ингибиторов рнКаз
- •Методы разрушения клеток с одновременной инактивацией нуклеаз
- •Использование свободной
- •Тщательное приготовление растворов
- •Глава 7
- •4 Трансформация
- •Выделенный фрагмент (кДнк)'
- •. Обычно присоединяют от 50 до 150 остатков dA к линейной векторной днк и соответствующее количество остатков dT к двухцепочечной кДнк.
- •Присоединение концевых последовательностей dC-dG
- •Глава 8
- •Глава 9
- •Глава 9
- •Препаративное выделение частично расщепленной днк
- •Получение геномных библиотек в космидных векторах
- •7П11'1 пii1г1iiiггтипптп 11птш л| I н к III II I и шипи hi I;
- •Глава 10
- •Идентификация клонов кДнк гибридизационной селекцией
- •Глава 11
- •Глава 12
- •1,2 Н. NaOh 1 мМ эдта
- •50 ММ какодилат натрия, pH 8,0 1 мМ эдта Доводить pH обычно нет необходимости.
ВЫДЕЛЕНИЕ
И АНАЛИЗ мРНК ИЗ ЭУКАРИОТИЧЕСКИХ КЛЕТОК
187
многими
РНКазами и практически полностью
подавляющими их активность (Berger,
Birkenmeier, 1979).
Четыре ©анадилри- бонуклеозидных
комплекса добавляют к инта^тным клеткам
и (используют их в (концентрации 10
мМ на всех стадиях выделения и очистки
РНК. Это обеспечивает высокий выход
РНК, получаемой в форме, которую можно
эффективно транслировать в беоклеточной
системе синтеза белка. При необходимости
ванадилрибонуклеозидные комплексы
могут 'быть удалены из препарата РНК с
помощью многократной экстракции
фенолом, содержащим 0,1%
8-гидроксихи1нолина.
Ванадилрибонуклеозидные
.комплексы получают следующим образом
(Berger,
Birkenmeier, 1979).
Растворите
0,5 ммоль одного из четырех рибонуклеози-
дов в 8
мл воды в кипящей водяной бане.
Пропуская
через раствор газообразный азот,
добавьте 1
мл 2 М сульфата ванадия.
Доведите
pH до ~6,0, добавляя по каплям 10 М NaOH.
Доведите
pH точно до 7,0, добавляя по каплям 1 М
NaOH
в
атмосфере газообразного азота в водяной
бане. По мере образования комплексов
раствор меняет окраску с синей на
темно-зеленую.
Доведите
объем до 10 мл; разделите раствор на
небольшие аликвоты и храните при
—20 °С в атмосфере газообразного
азота. Концентрация образовавшегося
комплекса 200 мМ. Перед использованием
разбавьте раствор в соотношении 1 : 20.
Имеющиеся
в продаже препараты ванадилрибонуклеозид-
ных (комплексов производят исследовательские
лаборатории Бе- тезды (Bethesda
Research Laboratories, P. О.
Box
577, Gaithersburg, M. D. 20760).
РНКазин.
РНКазин —
белок
(мол. масса ~40 000), сильный ингибитор
РНКазы, выделенный из печени крысы и
плаценты человека. РНКазин эффективно
ингибирует РНКазу при трансляции в
бесклеточной системе (Scheel,
Blackburn, 1979)
и обратной транскрипции мРНК (de
Martynoff et al., 1980). Так
же как и ванадилрибонуклеозидные
комплексы, РНКазин можно использовать
в ферментативных реакциях. Его
преимущество перед ванадилрибонуклеозидными
комплексами состоит в том, что он легко
экстрагируется фенолом.
Имеющиеся
в продаже препараты РНКазина производит
фирма Biotec
(Biotec Inc., 2800
Fish
Hatchery Rd., Madison, W1 53711).
Белки
легко растворяются в растворах сильных
хаотропных агентов, таких, как
гуанидинхлорид и гуанидинизотиоцианат
(Сох, 1968). При разрушении клеточных
структур после утраты
Методы разрушения клеток с одновременной инактивацией нуклеаз
188
ГЛАВА
6
регулярных
вторичных структур происходит быстрое
отделение нуклеопротеинов от нуклеиновых
кислот. Даже РНКаза — фермент,
устойчивый ко многим видам сильных
физических воздействий (таких, как
кипячение),—-неактивна в присутствии
4 М гуанидинизотиоцианата и восстановителей,
подобных (З-меркап- тоэтанолу (Sela
et al., 1957).
Поэтому комбинация этих соединений
может быть использована для выделения
недеградированной РНК из богатых
РНКазой тканей, например поджелудочной
железы (Chirgwin
et al., 1979).
Гуанидинизотиоцианат
получают следующим образом.
В
банку с гуанидинизотиоцианатом (100 г;
фирма East
man
Laboratory and Special Chemicals или
Fluka)
добавьте
100
мл
деионизованной Н20,
10,6 мл 1 М трис-HCl,
pH
7,6, и
мл
2 М ЭДТА. Перемешивайте в течение ночи
при комнатной температуре. '
Для
улучшения растворения прогревайте
раствор при непрерывном перемешивании
при 60—70 °С в течение 10 мин. При этом
часто остается осадок нерастворившегося
материала, который удалите
центрифугированием при 3 000
g
в
течение 10
мин при 20
°С.
К
надосадочной жидкости добавьте 21,2
мл 20%-ного
саркозила (лаурилсаркозината натрия)
и 2,1
мл (3-меркапто-
этанола и доведите объем до 212
мл, используя стерильную
Н20.
Профильтруйте
через фильтр Nalgene
и
храните при 4°С
в плотно закрытой склянке из коричневого
стекла.
от
РНКазы стеклянной и пластмассовой
посуды
Имеющаяся
в лабораториях стерильная пластмассовая
посуда полностью лишена РНКазы и
может быть использована для выделения
и хранения РНК без предварительной
обработки. Однако обычная лабораторная
стеклянная посуда часто оказывается
источником загрязнения РНКазой, и ее
следует прокалить при 250 °С в течение
4 ч или более. Помимо этого, некоторые
исследователи обрабатывают стеклянную
посуду в течение 12
ч при 37°С раствором 0,1%-иого диэтилпирокарбо-
ната —аильного, но не абсолютного
ингибитора РНКазы {Fedorcsak,
Ehrenberg, 1966).
Перед использованием посуды, обработанной
таким способом, важно удалить следы
диэтил- мрокарбоната с помощью нагревания
до 100 °С в течение 15 мин (Kumar,
Lindberg, 1972)
или автоклавирования. В противном
случае существует опасность, что
остаточный диэтил- пирокарбонат
инактивирует РНК в результате
карбоксимети- лирования.
Весьма
разумно отделить стеклянную и
пластмассовую посуду, которая будет
использована только для экспериментов
с
Использование свободной
