- •Isbn 5-03-003304-1
- •Isbn 5—03—003304—1 (русск.) isbn 3-13-759402-2 (нем.)
- •I протонов
- •Базовая структура стероидов I
- •Б. Стереохимия аминокислот
- •2. Графики диссоциации pH 2 pH 3 pH 5
- •Пептидный синтез I
- •Номенклатура пептидов t
- •Гель-фильтрация о
- •Кт: константа Михаэлиса
- •0 °H h3c0 с ch3 HjCo с cHj
- •Уридиндифосфат-глюкоза [удф-глюкозе (udp-глюкоза)]
- •2. Цитидиндифосфат-холин [цдф-холин (cdp-холин)]
- •Фосфоаденозинфосфосульфат [фафс (paps)]
- •4 Сульфатированные субстраты ► (р
- •2 Пируват
- •7 I высвобождение продукта
- •X мутация
- •Холевая кислота I
- •Мицеллы I
- •Образование инозинмонофосфата
- •Эстрадиол
- •Тестостерон
- •Инозит-1,4,5-трифосфвт и дивцилглицерин I
- •Рацемазы или эпимеразы
- •Переносят электроны внутри молекулы
- •4. Бвзовые константы
- •Фосфатидил инозит-4-фосфат 372 Фосфатидилсерин 56, 172, 218, 397 Фосфатидилхолин 56, 172, 216, 218, 397 Фосфатидилхолин-стерин-ацилтрансфераза
- •Фосфоглицерат 152, 156, 396,401
- •Фосфоглицерат 132, 152, 156, 395, 396
- •Гормоны. Медиаторы
72 Биомолекулы Пептиды и белки
Пептидная
связь
Главными
структурными единицами белков и пептидов
являются остатки аминокислот (см. с.
66), связанные карбоксамидной
пептидной связью
(см с. 18) между «-карбоксильной и
а-аминогруппой
В
клетках пептиды и белки синтезируются
в процессе трансляции
на рибосомах (см. сс. 244-249). При химическом
синтезе пептидов следует помнить,
что целевой продукт образуется с высоким
выходом лишь при условии, что
функциональные группы, не участвующие
в реакции, заблокированы защитными
группировками (X.Y)
В противном
случае в приведенном примере наряду с
целевым дипептидом
Ala-Gly
должны
образовываться Gly-Ala,
Gly-Gly и
Ala-Ala Кроме
того, необходимо активировать
карбоксильную группу (Z),
что
облегчает нуклеофильное присоединение
по аминогруппе. В настоящее время
пептиды с определенной аминокислотной
последовательностью получают с
помощью автоматических пептидных
синтезаторов
Б.
Мезомерия пептидной связи I
Как
всякая карбоксамидная связь, пептидная
связь стабилизирована за счет мезоме-
рии (резонансно
стабилизирована) (см.
с.
12)
и поэтому является практически плоской
(планарной) Вращение вокруг связи C—N
требует
больших затрат энергии и следовательно,
затруднено
на схеме плоскость, в которой расположены
6 атомов пептидной группы, окрашена в
светло-голубой цвет
Пептидная
цепь имеет одно направление
и два разных конца — N-конец,
несущий
свободную аминогруппу первой
аминокислоты, и С-конец
несущий
карбоксильную группу последней
аминокислоты. Напомним, что в белках и
пептидах аминокислотные остатки связаны
в цепочку последовательно. Для того
чтобы назвать конкретный пептид,
достаточно перечислить (начиная с
N-конца)
последовательность
входящих
в его состав аминокислотных остатков
в трехбуквенном или однобуквенном
коде Например, аминокислотная
последовательность
пептидного
гормона ангиотензина
II
(см с. 322) читается следующим образом:
Asp-
Arg-Val-Tyr-lle-His-Pro-Phe или
соответственно DRVYIHPF.
Г.
Конформация полипептидной цепи О
Каждый
аминокислотный остаток, за исключением
концевых, принимает участие в образовании
двух пептидных связей (с предыдущим
и последующим фрагментами). Поскольку
вращение вокруг связи C-N
затруднено,
повороты возможны только вокруг связей
N—Са
и Са—С
(2). Такие повороты измеряются двугранными
углами ф
и \|/. Угол ф характеризует поворот вокруг
связи N—Са,
а следовательно, положение предшествующей
пептидной связи; угол \|/ характеризует
поворот вокруг связи Са—С,
т е положение последующей связи.
Для
каждого конкретного аминокислотного
остатка ввиду стерических ограничений
разрешены только определенные комбинации
углов вращения ф и у. Для наглядности
информацию о связи между углами ф и у
в каждом пептидном звене представляют
графически с помощью ф/у-карты (1)- На
карте видно, что большинство комбинаций
двугранных углов оказываются
запрещенными (поля, выделенные красным
цветом) Так, например, при комбинации
ф = 0°/V =
180° (4)
атомы
кислорода карбонильных групп должны
сблизиться на расстояние 115 пм, что
намного меньше, чем сумма вандерваальсо-
вых радиусов двух атомов Аналогичным
образом, при комбинации ф = 180°/V
=
0е
(5) происходит наложение водородных
атомов двух NH-групп
Поэтому для углов ф и у
остаются разрешенными сочетания,
лежащие в пределах дискретных областей,
окрашенных в зеленый цвет (2, 3) В эти
разрешенные области попадают все
приведенные на последующей схеме
вторичные структуры. Конформации,
попадающие в зоны, выделенные желтым
цветом, энергетически невыгодны, но
возможны
Конформационные
карты (карты
Рама- чандрана)
построены на основе модельных
экспериментов с небольшими пептидами
Однако конформационные параметры
большинства аминокислотных остатков
в бвлках также попадают в разрешенные
области карты. На карте 1
черными
точками показаны пары углов ф и у в
небольшом белке инсулине (см. с. 78)
Пептидный синтез I
Номенклатура пептидов t
Пептидная
связь 73
74 Биомолекулы. Пептиды и белки
Вторичные
структуры белков
Определенные
сочетания двугранных углов <р и у (см.
с. 72) встречаются в белках довольно
часто. Если множество последовательно
связанных аминокислотных остатков
принимает стандартные конформации,
формируются вторичные
структуры, стабилизированные
водородными мостиками в пределах
одной пептидной цепи или между соседними
цепями. Если такая регулярная структура
распространяется на достаточно большой
фрагмент молекулы белка, такой белок
образует механически прочные нити или
волокна. Подобного рода структурные
белки (см.
с. 76) имеют характерный аминокислотный
состав.
Здесь
приведены основные элементы вторичных
структур. На рисунках представлен
остов полипептмдной цепи, лишенный
боковых цепей аминокислотных остатков.
Для наглядности плоскости пептидных
связей изображены в виде голубых
пластин. Двугранные углы указанных
структур приведены на конформационной
карте И на с. 73.
А. а-Спираль
I
Наиболее
распространенным элементом вторичной
структуры является правая
а-
спираль
(ccr).
Пептидная
цепь здесь изгибается винтообразно
(ось выделена оранжевым цветом). На
каждый виток приходится 3,6 аминокислотного
остатка, шаг
винта
(т.е. минимальное расстояние между двумя
эквивалентными точками) составляет
0,54 нм. а-Спирапь стабилизирована почти
линейными водородными
связями
(красный пунктир, см. с. 14) между NH-группой
и СО-группой четвертого по счету
аминокислотного остатка. Таким
образом, в протяженных спиральных
участках каждый аминокислотный остаток
принимает участие в формировании двух
водородных связей. Неполярные или ам-
фифильные а-спирапи с 5-6 витками часто
обеспечивают заякоривание белков в
биологических мембранах (трансмембранные
спирали,
см. сс. 135, 216).
Зеркально-симметричная
относительно otR-спирали
левая
а-спираль (ai_)
встречается
в природе крайне редко, хотя энергетически
возможна.
Б.
Спираль коллагена >
Другая
форма спирали присутствует в кол*
лагене, важнейшем компоненте
соединительных тканей (см. сс. 76,
334). Это левая
спираль коллагена с
шагом 0,96 нм и 3,3 остатка в каждом витке,
более пологая по сравнению с а-спирапью.
В отличие от а-
спирали
образование водородных мостиков здесь
невозможно. Структура стабилизирована
за счет скручивания трех пептидных
цепей в правую
тройную спираль (см.
с. 76).
В. Складчатые
структуры Ь
Две
следующие
почти вытянутые конформации пептидной
цепи называются «p-складчатым
листом», так
как плоскости пептидных связей
расположены в пространстве подобно
равномерным складкам листа бумаги. В
складчатых структурах также образуются
поперечные
межцепочечные
водородные связи. Если цепи ориентированы
в противоположных направлениях (1),
структура называется антипараллельным
складчатым листом (ра).
а если цепи ориентированы в одном
направлении (2), структура называется
параллельным
складчатым листом (рп).
В складчатых структурах а-С-атомы
располагаются на перегибах, а боковые
цепи ориентированы почти перпендикулярно
средней плоскости листа, попеременно
вверх и вниз (см. с. 77, В). Энергетически
более предпочтительной оказывается
(5а-
складчатая структура
с почти линейными
Н- мостиками. В растянутых складчатых
листах отдельные цепи чаще всего не
парвллельны, а несколько изогнуты
относительно друг друга.
Г.
р-Петля >
В
тех участках, где пептидная цепь
изгибается достаточно круто, часто
находится р-пет- ля. Это короткий
фрагмент, в котором 4 аминокислотных
остатка расположены таким образом, что
цепь делает реверсивный поворот (на
180°). Оба приведенных на схеме варианта
петли (типы I и 11) встречаются довольно
часто. Обе структуры стабилизированы
водородным мостиком между 1 и 4 остатками.
Вторичные
структуры белков 75
Ч>
=
-57° у = -47°
А.
а-Спираль
-80"
< ер < -50"
+130 ° < < +155 °
Б.
Спираль коллагена
Антипараллельный «>
= -139°
складчатый
лист у = +135 °
В. Складчатые
структуры
2.
Параллельный складчатый лист
Ф
= -119 ‘
V»
= +113°
Тип
I Г. В-Петля
?
/г
2.
Тип
II
76
Биомолекулы.
Пептиды и белки
Структурные
белки
Структурные
белки придают экстрацеллю- лярным
структурам механическую прочность,
а также участвуют в построении цито-
скелета (см. с. 206). В большинстве
структурных белков преобладает одна
иэ вторичных структур (см. с. 74), что
предопределяется их аминокислотным
составом.
А. а-Кератин
О
Структурным
белком, построенным преимущественно
в виде а-спирали, является а-ке- ратин
Волосы (шерсть), перья, иглы, когти и
копыта животных состоят главным образом
иэ кератина. В качестве компонента
промежуточных филаментов (см с. 206)
кератин (цитокератин) является
важнейшей составной частью цитоскелета.
В
кератинах большая часть пептидной
цепи свернута в правую a-спирапь.
Две пептидные цепи образуют единую
левую супер- спираль как это имеет место
и в миозине (см. с. 71). Суперспиралиэованные
димеры кератина объединяются в тетрамеры,
которые агрегируют с образованием
протофибрилл диаметром 3 нм. Наконец,
восемь протофибрилл образуют
микрофибриллы диаметром 10 нм (см. с.
207).
Волосы
построены из таких же фибрилл. Так, в
отдельном волокне шерсти диаметром
20 мкм переплетены миллионы фибрилл.
Отдельные цепи кератина скреплены
поперечно многочисленными дисульфидны-
ми связями, что придает им дополнительную
прочность При химической завивке
происходят следующие процессы: вначале
путем восстановления тиолами разрушаются
дисульфидные мостики, а затем для
придания волосам необходимой формы
их высушивают при нагревании При
этом за счет окисления кислородом
воздуха образуются новые дисульфидные
мостики, которые сохраняют форму
прически
Б.
Коллаген I
В
организме млекопитающих коллаген —
преобладающий в количественном отноше
нии
белок: он составляет 25% общего белка.
Коллаген присутствует в различных
формах прежде всего в соединительной
ткани. Этот белок имеет необычный
аминокислотный состав: 1 /3 составляет
глицин
(Gly),
примерно
10% пролин
(Pro), а
также гидроксипро-
лин
(Нур) и гидроксилизин
(Hyl).
Последние
две аминокислоты образуются после
биосинтеза коллагена путем
посттрансляцион-
ной модификации
(см. с. 334). В структуре коллагена постоянно
повторяется триплет
Gly-X-Y
(2), причем
положение X часто занимает пролин,
a Y —
гидроксилизин. Имеются веские основания
тому, что коллаген повсеместно
присутствует в виде прааой тройной
спирали, скрученной из трех первичных
левых спиралей (1) (см. с. 74). В тройной
спирали каждый третий остаток оказывается
в центре, где по стерическим причинам
помещается только глицин (3, остаток
глицина окрашен в желтый цвет) Здесь
представлен небольшой фрагмент
тройной спирали Вся молекула коллагена
имеет длину около 300 нм
В. Фиброин
шелка О
Шелк
получают из коконов гусениц тутового
шелкопряда (Bombyx
mori)
и
родственных видов. Основной белок
шелка, фиброин, обладает структурой
анти параллельно го складчатого
листа,
причем сами листы располагаются
параллельно друг другу, образуя
многочисленные пласты (1). Так как в
складчатых структурах боковые цепи
аминокислотных остатков ориентированы
вертикально вверх и вниз, в промежутках
между отдельными слоями могут
поместиться лишь компактные группировки
Фактически фиброин состоит на 80% из
глицина, аланина и серина, т.е. из трех
аминокислот, характеризующихся
минимальными размерами боковых
цепей. Молекула фиброина содержит
типичный повторяющийся фрагмент
(Gly-Ala-
Gly-Ala-Qy-Ser)n.
Установлено,
что в фиброине промежуток между
складчатыми слоями составляет 0,35 и
0,57 нм В первом случае в промежуток
ориентирован глицин (R
= Н).
Промежуток 0,57 нм создается за счет
отталкивания боковых цепей серина
и аланина (2).
(фрагмент) |
|
Gly — |
Arg |
Gly - |
Gin |
Gly — |
Pro |
Gly — |
Pro |
Gly — |
Ala |
Gly |
X |
Нур
Aig
2.
Типовой триплет
Gly
3.
Тройная спираль (вид сверху)
Б.
Коллаген
микрофибрилла
А. о.-Кератин |
|
|
г ш I I |
|
|
протофибрилла
1.
Объемное изображение
Ala
\J
Gly
-
А "
т
JL А
Ala
Ala
Gly
s
Ser
T
%
'~f
X
t
Gly
Ala Г Ala
2.
Схематическое
изображение
В. Фиброин
шелка
78
Биомолекулы.
Пептиды и белки
Глобулярные
белки
В
отличие от нерастворимых фибриллярных
белков растворимые белки имеют почти
сферическую (глобулярную) форму.
Глобулярным
белкам свойственна
высокоупорядоченная
пространственная структура
(конформация), которая способствует
выполне- нию специфических биологических
функций, В данном разделе разбираются
особенности строения глобулярных
белков на примере небольшого белка
инсулина
(см
сс. 82, 162)
А. Инсулин:
первичная структура О
Под
первичной структурой понимают
аминокислотную
последовательность поли-
пептидной цепи. Инсулин был первым
белком, строение которого было
установлено полностью еще в начале
50-х годов Молекула функционально
активного инсулина состоит их двух
полипептидных цепей (А-
и
В-цепи)
соединенных
дисульфидными мостиками (на схеме
A-цепь
окрашена
в светло-коричневый
цвет,
В-цепъ
— в темно-коричневый,
дисульфидные мостики — в желтый).
Дополнительный дисульфидный мостик
локализован в пределах A-цепи.
В поджелудочной железе, где происходит
биосинтез инсулина, вначале синтезируется
белок-предшественник — проинсулин,
в
котором С-концевой аминокислотный
остаток В-цепи связан с N-концевым
остатком A-цепи
33-членным фрагментом (на схеме не
окрашен). После образования в происулине
правильно замкнутых дисуль- фидных
мостиков С-пептид
отщепляется
протеолитическими ферментами (см. с.
162).
Б.
Вторичная структура О
Вторичными
структурами называются участки
полипептидной цепи с упорядоченной
конформацией,
стабилизированной водородными
связями (см. с. 74). В большинстве глобулярных
белков присутствуют одновременно
как а-спирали,
так
и р-складчатые
листы. Кроме
того, имеются участки с неупорядоченной
структурой.
Распространенным структурным
элементом глобулярных белков является
р-петля
В
молекуле инсулина участки, имеющие
форму а-спирали, составляют 57%, 6%
приходится на р-складчатую структуру,
10% по
строено
в виде р-петли, оставшиеся 27% не имеют
упорядоченной структуры.
В. Третичная
структура О
Трехмерные
функционально активные конформации
белков носят название третичной
структуры. Третичную структуру белков
исследуют главным образом методом
кристаллографии.
Этот
трудоемкий метод основан на дифракции
рентгеновских лучей на хорошо
сформированных белковых кристаллах.
На основании дифракционных картин
рассчитывают распределение электронной
плотности в кристалле, а по электронной
плотности восстанавливают пространственную
структуру молекул белка с атомным
разрешением. В настоящее время
определены трехмерные структуры сотен
белков. Однако многие белки пока нельзя
изучить этим методом, поскольку их
не удается получить в виде хорошо
сформированных кристаллов достаточно
крупных размеров.
Анализ
третичной структуры инсулина показал,
что в А-цеп и имеются два коротких
участка, а в В-цепи — один длинный
участок, построенные в виде а-спирали
(1). При этом N-конец
A-цепи
и С-конец В-цепи располагаются в
непосредственной близости друг от
друга Единственная структура типа
складчатого листа образуется в димере
инсулина (см. Г,
4) Третичная
структура проинсулина еще не
установлена.
Г.
Четвертичная структура )
Белковые
молекулы часто образуют симметрично
построенные комплексы, стабилизированные
за счет нековалентных взаимодействий.
Такие комплексы называются олигомерами,
а
составные единицы комплексов (от 2
до 12) — субъединицами
или
мономерами.
Инсулин
также образует четвертичные структуры.
В крови инсулин присутствует частично
в виде димера
(1). Димер
имеет ось симметрии второго порядка.
Кроме того, в поджелудочной железе в
качестве запасной формы содержится
гексамер
инсулина
(из 6 мономеров), стабилизированный
ионами Zn2+
(см. с.
162). В образовании двух комплексов с
катионом Zn2+
принимают
участие остатки гистидина в положении
В-10 всех шести субъединиц. На схеме 2
показано, что каждый октаэдрический
комплекс включает один катион Zn2+,
три
остатка гистидина и три молекулы
воды (см также с. 83).
Глобулярные
белки 79
В-цепь
А-цепь
8 9 10
А.
Инсулин: первичная структура
дисульфидные
мостики |
100% |
|
|
|
-УДУ/ |
iVAVAV |
А =4 |
/" |
|
а-спираль
57%
Б.
Вторичная структура
р-складчатыи
лист с
неупорядоченная
структура 27%
р-петли
10%
А-цепь
ООС
С-пептид
В-цепь
Мономер:
схема свертывания
Мономер,
вандерваальсова модель
В. Третичная
структура
1.
Димер
His
В-10
2.
гп2+-комплекс
в гексамере Г.
Четаертичная структура
80
Биомолекулы. Пептиды и белки
Свертывание
белков
Информация
относительно биологически активной
(нативной) конформации полипептидной
цепи закодирована в аминокислотной
последовательности. Вторичные,
третичные и четвертичные структуры
многих белков образуются в растворе
самопроизвольно в пределах нескольких
минут. Тем не менее в клетке имеются
специальные белки (шапероны, см. с.
230). функция которых обеспечивать
свертывание полипептидных цепей вновь
синтезируемых белков Выяснение
закономерностей свертывания
полипептидных
цепей является одной из важнейших задач
биохимии. В случае успеха появилась бы
возможность предсказывать нативные
конформации белков на основании
данных об аминокислотных последовательностях,
реконструируемых на основании
относительно легко доступных
ДНК-последова- тельностей (см. с. 256).
А.
Свертывание белков I Свертывание
полипептидной
цепи в нативную конформацию ццет
наиболее успешно в физиологических
условиях. Потеря нативной конформации,
денатурация
наступает
при экстремальных значениях pH высокой
температуре или под действием органических
растворителей, детергентов и других
денатурирующих веществ.
К
факторам, стабилизирующим конформацию
белка, относятся водородные саязи,
дисульфидные мостики, электростатическое
взаимодействие и комплексообразование
с ионами металлов (см. с. 78). Другим очень
важным стабилизирующим фактором
является «гидрофобный
эффект». Как
отмечалось на с. 34 в смеси неполярных
веществ с водой происходит разделение
фаз («эффект масляных капель»), т. е.
идет самопроизвольный
процесс, при котором поверхность
контакта между фазами стремится
быть минимвль- ной. По аналогии с этим
процессом полипептид- ная цепь
свертывается в водной среде таким
образом, чтобы как можно больше
неполярных боковых фупп аминокислотных
остатков были бы спрятаны внутри
глобулы, тогда как полярные группы
контактируют с водой (1). Такой механизм
позволяет объяснить распределение
соответствующих группировок и в
молекуле инсулина (см с. 83)
В
настоящее время не существует полного
описания энергетики
процесса
свертывания полипептидной цепи (2)
В этом разделе обсуждается лишь
предельно простая модель. В заданных
условиях конформация полипептидной
цепи будет устойчивой лишь в том случае,
если она обладает минимумом свободной
энергии (изменение свободной энергии
свертывания Д0св
имеет знак минус) (см. с. 22). Вместе с тем
свертывание
полипептидной
цепи повышает степень упорядоченности
белковой молекулы. А как указывалось
на с. 26, рост упорядоченности означает
уменьшение энтропии системы (ДБконф
— величина отрицательная), а
следовательно возрастание энтропийного
члена в уравнении Гиббса—Гельмгольца
(-Т ДБконф имеет знак плюс) (фиолетовая
стрелка). На процесс свертывания также
оказывают стабилизирующее
воздействие ковалентные и другие
типы связей, образующиеся в белковой
глобуле. Поэтому изменение энтальпии
свертывания дНсВ
— величина отрицательная (красная
стрелка). Другим фактором, влияющим на
ход процесса, является изменение
энтропии окружающей среды (воды) за
счет гидрофобного эффекта При свертывании
полипептидной цепи снижается степень
упорядоченности воды и образуется
максимально возможное число водородных
связей. При этом возрастает энтропия
водной
среды,
т. е. ДЭвод—величина положительная,
а следовательно, энтропийный член
уравнения -Т ДБэод имеет знак минус
(синяя стрелка). Таким образом, уменьшение
энтропии полипептидной цепи
перекрывается ростом энтропии окружающей
среды и энтропия системы в целом
возрастает Следовательно, полипептидная
цель самопроизвольно принимает нативную
конформацию, характеризующуюся
минимумом свободной энергии суммарной
системы (AGcB—
величина
отрицательная) (зеленая стрелка).
Б.
Свертывание белков: примеры 3
При
сравнении наиболее крупных глобулярных
белков становится очевидным, что
существует определенная схема
свартывания полипептидной
цепи, которая воспроизводится с
незначительными вариациями. Рассмотрим
ряд примеров (а-спирали выделены
красным цветом, плоскости складчатого
листа — зеленым). Глобулярные белки,
построенные из а-спиралей, как например,
миоглобин
(см
с. 330, гем выделен желтым цветом),
встречаются редко. Обычно наблюдаются
сочетания складчатых листов и спирал
изованных участков, как, например, во
фла-
водоксине, небольшом
флавопротеине (FMN
выделен
желтым цветом), где 5 расположенных
веером складчатых листов из пяти
параллельных тяжей формируют ядро
молекулы: 4 а-спираль- ных участка
окружают ядро снаружи Иммуног
лобулин (см.
с. 288) построен из нескольких по хожих
доменов
(независимых,
компактно свер нутых фрагментов
полипептидной цепи), в которых два
антипараллельных складчатых листа из
трех или четырех тяжей образуют
бочкообразную структуру (см. с. 292).
Приведенный на схеме СН2-домен
несет олисахарид (желтый), который в
более наглядной форме приведен на с.
51.
Свертывание
белков 81
1
-
Основные принципы
гидрофобное
ядро
О
©
увеличение
степени
упорядоченности
—I
молекулы
стабилизация
молекулы
дополнитель-
ными
связями
снижение
степени
упорядоченности
водной
фазы
со
<
свободная
энтальпия
свертывания
AGCB
= AhL„
Энергетика
А.
Свертывание белков
Т’
ASboa
Т-
А5конф
Б.
Свертывание белков: примеры
82
Биомолекулы.
Пептиды и белки
Молекулярные
модели: инсулин
На
схеме А приведена молекулярная модель
небольшого белка инсулина.
Строение,
биосинтез и функции этого важнейшего
гормона подробно обсуждаюся в других
разделах (см. сс. 78,162).
Чистый
инсулин необходим в большом количестве
для лечения диабета (Diabetes
mellitus)
—
заболевания, которое чаще всего
обусловлено абсолютным или относительным
дефицитом инсулина в организме (см. с.
162). В Германии ежегодный объем
производства инсулина составляет
более 500 кг. До недавнего времени гормон
приходилось получать дорогостоящим
и трудоемким способом из поджелудочной
железы животных. Другой недостаток
животного инсулина состоит в том,
что при продолжительном применении
он вызывает образование антител и
гиперэргическую реакцию. Поэтому в
последнее время инсулин
человека стремятся
получать с помощью супер-
экспрессии
гена инсулина в штаммах бактерий,
трансформированных с помощью методов
генной инженерии (см. с. 258).
В
качестве примера рассматривается
молекула инсулина свиньи, который
отличается от инсулина человека только
одним аминокислотным остатком
(вместо Ala-ЗО
в инсулине человека стоит треонин). На
схеме А
выделены
наиболее существенные структурные
элементы мономера инсулина, а на
схеме Б
показана
схема упаковки гексамера в двух
проекциях.
А. Инсулин
(мономер) О
Мономер
инсулина состоит из 51 аминокислотного
остатка (см с. 78), т е. по молекулярной
массе (5,5 кДа) он вдвое уступает самому
низкомолекулярному ферменту. Тем не
менее инсулин остается типичным
глобулярным белком В растворе инсулин
имеет четвертичную структуру, которая
существенна для его сигнвльной
функции На приведенной слева
вандервавльсовой модели А-цепь
(см.
с. 78) окрашена в желтый цвет, а В-цепь
—
в оранжевый. Известно, что молекула
имеет клинообразную форму. Острие клина
сформировано В-цепью, которая в этом
месте меняет направление.
На
модели (в центре) боковые группы полярных
аминокислот (см. с. 66) окрашены в синий
цвет, а неполярные группы — в желтый
или красно-фиолетовый. Это сделано с
тем, чтобы подчеркнуть важное значение
гидрофобного
эффекта в
свертывании белков (см. с. 80). Большинство
гидрофобных боковых цепей находится
внутри глобулы, в то время как
гидрофильные группировки остаются
на поверхности Этому правилу явно
противоречит присутствие на поверхности
неполярных боковых групп (окрашены
в красно-фиолетовый цвет). Однако
все эти группы принимают участие в
гидрофобных взаимодействиях,
стабилизирующих димер (см. с. 78) и
гексамер инсулина (см Б)
На
модели справа выделены остатки, которые
лежат на поверхности и инвариантны
(красный
цвет) или почти инвариантны (оранжевый
цвет) для инсулина любого происхождения.
При этом принималось во внимание,
что наиболее важными в функциональном
отношении являются аминокислотные
остатки, не претерпевшие изменений в
ходе эволюции. В инсулине почти все
инвариантные остатки сгруппированы
на одной стороне молекулы. Предположительно,
эти аминокислоты принимают участие в
связывании гормона с рецептором
Б.
Инсулин (гексамер) )
До
поступления в кровь инсулин накапливается
В-клетками в островках Лангерган- са в
виде цинксодержащего
гексамера
(см.
с. 162). На схеме Б
приведен
гексамер (олигомер из 6 субъединиц) в
упрощенном, ленточном, изображении Как
и на схеме А,
А-цепь
окрашена в желтый цвет, а В-цепь
в
оранжевый. Гексамерная форма
стабилизирована за счет образования
комплекса
с цинком,
в котором принимают участие остатки
гистидина в положении В-10 всех 6
субъединиц (см. с. 78, Г).
Молекула
(массой 33 кДа) имеет симметрию
третьего порядка,
что лучше всего видно при взгляде
сверху (слева) Модель, повернутая
на 90°, показывает, что два иона Zn2+
расположены
на некотором расстоянии друг от друга.
Молекулярные
модели: инсулин 83
А.
Инсулин (момомер)
ион
цинка
вид
сверху вид сбоку
(модель
повернута на 90°)
Б.
Инсулин (гексамер)
