- •Шаронова н.Л., Пахомова в.М., Бунтукова е.К. Экология почвенной микробиоты и диагностика почв
- •Содержание
- •Глава 5. Влияние сельскохозяйственного использования почв на почвенную микробиоту 107
- •Глава 6. Влияние антропогенной деградации биоценозов на почвенную микробиоту 167
- •Введение
- •Глава 1. Общие представления о почвенной микробиоте
- •Почвенные водоросли
- •Почвенные животные
- •Простейшие
- •Коловратки
- •Нематоды
- •Тихоходки
- •Членистоногие
- •Почвенные грибы
- •Прокариоты
- •Цианобактерии
- •Протеобактерии
- •Спирохеты
- •Цитофаги
- •Грамположительные бактерии
- •Микоплазмы
- •Архебактерии
- •Глава 2. Специфика почвы как среды обитания микроорганизмов
- •Твердая фаза почвы
- •Жидкая фаза почвы
- •Газовая фаза почвы
- •Концентрация ионов водорода
- •Окислительно-восстановительные условия
- •Температура
- •Глава 3. Основные принципы биологической индикации и диагностики почв
- •Ботаническая и зоологическая биоиндикация и диагностика почв
- •Почвенно-альгологическая индикация
- •Микробиологическая диагностика и биологическая активность почв
- •Биологическая индикация загрязнения почвенной среды и самоочищения почв
- •Глава 4. Влияние промышленного загрязнения на почвенную микробиоту
- •Загрязнение тяжелыми металлами
- •Концепция предельно допустимых концентраций (пдк) тяжелых металлов в почве
- •Влияние тяжелых металлов на микроорганизмы в почве
- •Микробиологическое нормирование загрязнения почв тяжелыми металлами
- •Радиоактивное загрязнение
- •Загрязнение нефтью и нефтепродуктами
- •Влияние углеводородного загрязнения почв на показатели комплекса микромицетов
- •Влияние загрязнения углеводородами на водоросли
- •Биодеградация нефти в почве
- •Воздействие кислых дождей
- •Глава 5. Влияние сельскохозяйственного использования почв на почвенную микробиоту
- •Микробиологические аспекты загрязнения почв пестицидами
- •Влияние пестицидов на почвенные микроорганизмы
- •Микробиологические подходы к оценке действия пестицидов
- •Детоксикация пестицидов в почве
- •Влияние внесения минеральных удобрений
- •Влияние минеральных удобрений на общую численность и биомассу микроорганизмов в почве
- •Влияние минеральных удобрений на численность различных физиологических групп микроорганизмов и активность процессов азотфиксации и денитрификации в почве
- •Минеральные удобрения как фактор воздействия на видовой состав почвенных микроорганизмов и устойчивость микробных систем почв к удобрениям
- •Оценка устойчивости микробных систем различных почв к воздействию минеральных удобрений
- •Влияние длительного применения минеральных удобрений на микробную систему почв
- •Влияние эрозионных процессов
- •Глава 6. Влияние антропогенной деградации биоценозов на почвенную микробиоту
- •Влияние рекреационной и пастбищной дегрессии почв на микроорганизмы
- •Влияние рубки леса на микроорганизмы
- •Лабораторный практикум работа 1. Определение численности микроорганизмов различных физиологических групп в почве
- •1. Приготовление плотных и жидких питательных сред для выявления разных физиологических групп микроорганизмов
- •Ход работы
- •2. Выявление групп микроорганизмов методом обрастания комочков почвы
- •3. Взятие средней почвенной пробы и подготовка образца к микробиологическому анализу
- •4. Приготовление почвенной суспензии
- •Учет различных групп микроорганизмов
- •Материалы и оборудование
- •Работа 2. Исследование реакции микроорганизмов на факторы внешней среды
- •Ход работы
- •Материалы и оборудование
- •Работа 3. Исследование микробиоценозов почвы и определение ее биологической активности
- •1. Исследование микробоценозов почвы методом обрастания стекол по Холодному - Росси Ход работы
- •2. Определение биологической активности почвы по интенсивности разложения полотна методом Мишустина – Вострова - Петровой Ход работы
- •3. Определение биологической активности почвы по интенсивности разложения целлофановых мембран методом Гузева – Иванова - Левина Ход работы
- •4. Определение изменений в инициированном микробном сообществе Ход работы
- •Материалы и оборудование
- •Работа 4. Выявление ризосферной и корневой (ризопланы) микрофлоры методом теппер
- •Ход работы
- •Материалы и оборудование
- •Работа 5. Исследование свободноживущих и симбиотических азотфиксирующих бактерий
- •Ход работы
- •Материалы и оборудование
- •Работа 6. Исследование азотфиксирующей активности ацетиленовым методом в лабораторных условиях
- •Ход работы
- •Материалы и оборудование
- •Работа 7. Определение мобилизуемых запасов фосфора и калия в почве по методу буткевича
- •Ход работы
- •Материалы и оборудование
- •Работа 8. Определение токсичности водных экстрактов почвы и индивидуальных соединений с использованием в качестве тест-объекта бактерий pseudomonas putida
- •Ход работы
- •Материалы и оборудование
- •Работа 9. Определение общей микробной биомассы в почве
- •Ход работы
- •Материалы и оборудование
- •Работа 10. Определение ферментативной активности почвы
- •1. Газометрический метод определения активности каталазы в почве
- •Ход работы
- •Ход работы
- •3. Определение активности инвертазы в почве
- •Ход работы
- •2. Определение активности дегидрогеназы в почве
- •4. Определение активности уреазы в почве
- •Ход работы
- •Материалы и оборудование
- •Приложение
- •Глоссарий
- •Список использованной и рекомендованной литературы
Материалы и оборудование
Для исследования свободноживущих азотфиксаторов: жидкая среда Виноградского; колбы Эрленмейера емкостью 100-150 мл или высокие пробирки; почва; чайные ложки или шпатели; раствор Люголя; гелевые пластины, пропитанные средой Виноградского для азотобактера; часовые стекла; колбы на 100 мл; микроскопы и все необходимое для микроскопирования.
Для исследования симбиотических азотфиксаторов: стерильные чашки Петри, пробирки со стерилизованной водой, спирт 960-ный, пинцеты, бобовые растения с клубеньками на корневой системе, питательные среды (бобовый агар, среда Лазаревой, среда для выращивания растений), аппарат Кьельдаля, все реактивы для определения общего азота микрометодом Кьельдаля и нитрогеназной активности ацетиленовым методом, пробирки или колбы для выращивания растений, семена бобовых растений, концентрированная серная кислота, колбы емкостью 1 л со стерилизованной водопроводной водой для отмыва кислоты от семян.
Работа 6. Исследование азотфиксирующей активности ацетиленовым методом в лабораторных условиях
Цель работы - овладеть простым и быстрым методом определения потенциальной активности азотфиксации в почве для оценки происходящих изменений в результате проведения агротехнических мероприятий, а также различного рода антропогенных воздействий. Метод позволяет провести раннюю диагностику загрязненности почв агрохимикатами и тяжелыми металлами. Результаты такого обследования можно использовать при санитарно-гигиеническом нормировании токсических веществ и соединений в почве. Важно ознакомиться также с ацетиленовым методом определения азотфиксирующей активности бактерий у чистых (или накопительных) культур, поскольку ацетиленовый метод примерно в 103 раз более чувствителен, чем изотопный метод, и в 106 раз, чем метод измерения фиксации азота по Кьельдалю. Вследствие этого длительность проведения анализа в зависимости от активности исследуемого образца субстрата не превышает 1-24 ч, в то время как при использовании других методов необходимо проведение длительных (до 2 мес.) экспериментов. К тому же анализ с помощью ацетилена и этилена (С2Н2 и С2Н4) проводится без каких-либо предварительных химических обработок, что также дает возможность при необходимости повторить анализы на одних и тех же образцах, не разрушая их. Метод легко применим в лабораторных и полевых условиях, отличается большой эффективностью, поскольку требующееся оборудование, кроме газового хроматографа, стоит недорого и является простым в обращении.
Ход работы
1. Определение потенциальной активности азотфиксации. 5 г освобожденной от корней и просеянной через мелкое сито почвы помещают в пенициллиновый флакон, вносят 2% глюкозы (от массы абсолютно сухой почвы) и увлажняют стерилизованной водопроводной водой до 80% полной влагоемкости. Почву тщательно перемешивают стеклянной палочкой, закрывают флакон ватной пробкой и ставят на сутки в термостат при 280. Из каждого образца отбирают не менее трех навесок для определения потенциальной активности азотфиксации. Через сутки инкубации в термостате ватные пробки заменяют на резиновые, закрепляют зажимами и вводят в них шприцем около 0,5 мл ацетилена, затем вновь помещают флакон в термостат. Через 1 ч (24 ч) шприцем отбирают газовую пробу объемом 0,5 мл и вводят ее для анализа в газовый хроматограф. Контроль - флакон с почвой без ацетилена (для определения неспецифического эндогенного выделения этилена). После окончания измерений резиновые пробки снова заменяют на ватные и флаконы помещают на сутки в термостат. Затем анализ повторяют: вводят ацетилен и определяют количество образовавшегося этилена. Измерение считается законченным, если в двух (ближайших по времени взятия) пробах количественное содержание этилена различается не более чем на 5 %. Полученные данные характеризуют потенциальную активность азотфиксации в исследуемой почве. Этилен определяют по стандартным пикам калибровочной кривой. Количество фиксированного азота в почве рассчитывают по формуле:
А= ((а2 – а1)*2N*V0*1000)/(V1*3*m),
где А - количество фиксированного азота в г на 1 кг почвы за 1 ч;
а2 - количество восстановленного этилена в наномолях С2Н4 на 0,5 мл
газовой пробы за 1 ч;
al - количество фонового этилена в наномолях на 0,5 мл газовой пробы
за 1 ч;
N - молекулярный вес азота, г;
Vo объем газовой фазы реакционного сосуда, мл;
V1 - объем газовой пробы, вводимой в колонку хроматографа, мл;
3 - коэффициент, определяющий соотношение между восстановленным
этиленом и аммиаком;
m - вес опытной навески, г.
2. Определение азотфиксирующей активности в чистых или накопительных культурах. Существуют следующие варианты определения азотфиксирующей активности:
1) 5 мл бактериальной суспензии переносят в стерильные пенициллиновые флаконы, снабженные специальными зажимами для закрепления резиновых пробок. Резиновые пробки кипятят в течение 20 мин. Из флаконов медицинским шприцем откачивают воздух и дважды заполняют аргоном. Затем вводят 0,5 мл ацетилена, после чего флаконы инкубируют в термостате. В зависимости от уровня нитрогеназной активности через определенные отрезки времени (1-3 или 24 ч) определяют содержание этилена на газовом хроматографе;
2) питательную среду разливают по 15-20 мл в специальные флаконы емкостью 25 мл, вносят в среду чистые культуры. Флаконы помещают в термостат при 28-300. На 1-3-е сут (в зависимости от скорости роста штамма) ватные пробки заменяют резиновыми и закрепляют зажимами, через которые вводят ацетилен, затем инкубируют 1-3 ч и проверяют наличие этилена.
3. Определение нитрогеназной активности. Нитрогеназную активность измеряют в присутствии 10% -ного ацетилена, помещая 1 мл суспензии клеток в пенициллиновые флаконы емкостью 10 мл, снабженные специальными зажимами для закрепления резиновых пробок. В контрольные пробирки ацетилен не вводят.
Фиксацию азота устанавливают, учитывая нитрогеназную активность по концентрации образующегося этилена:
М С2Н4 = ((а2 – а1)*V0)/(V1*m) = (а - V0)/ (V1*m),
где М С2Н4 - моль этилена на единицу массы за 1 или 24 ч;
а2 - количество восстановленного этилена в наномолях С2Н4; на 0,5 мл
газовой пробы;
al - количество фонового этилена;
V0 - объем газовой фазы реакционного сосуда, мл;
V1 - объем газовой пробы, вводимой в колонку хроматографа, мл;
m - вес (объем) опытной навески.
4. Работа на газовом хроматографе. Степень активности процесса азотфиксации определяется косвенным путем на основе количественных изменений образовавшегося этилена. Анализ газовых проб проводят на газовом хроматографе любой модели, снабженном пламенно-ионизированным детектором (ПИД). Колонка прибора должна обеспечивать хорошее разделение газов (этилен, ацетилен). Газоносителями могут быть азот, аргон или гелий; адсорбентом - силикагель, парапак или другие материалы подобного класса. Прибор калибруют по этилену, измеряют температуру, давление газов. Объем вводимой пробы газовой смеси обычно составляет 0,5 мл.
Пробу вводят медицинским шприцем (или микрошприцем), при этом необходимо следить за плотностью прилегания поршня к стенкам. После каждого определения шприц необходимо «промывать» воздухом или инертным газом для удаления адсорбированных газов. Соотношение между восстановленным азотом и этиленом должно составлять 1 : 3, т. е. данные, полученные для этилена, необходимо разделить на три, чтобы получить величину активности фиксации азота.
