4.6 Структура рнк
В клетках любых биологических объектов содержатся три основных вида РНК: рибосомальная РНК (рРНК), транспортная РНК (тРНК) и информационная, или матричная РНК (мРНК). Они являются одноцепо-чечными молекулами различной длины, различаются по локализации, свойствам, строении, функциям. В большинстве клеток содержание РНК в 5–10 раз превышает содержание ДНК.
рРНК. Основная часть РНК клетки –70–80 % приходится на долю рРНК, которая содержится в рибосомах – внутриклеточных частицах, принимающих участие в биосинтезе белка рРНК образует каркас, к которому прикрепляются белки, образуя плотноупакованный рибонук-леопротеин. Нуклеотидный состав рРНК из разных источников сходен.
мРНК. Существование матричной или информационной РНК (РНК-посредника передачи информации от ДНК в белоксинтезирующий аппарат клетки) было предсказано в 1957 г., а выделена мРНК в 1962 г. Содержание матричной РНК в клетке от 3 % до 7 % от общей суммы содержания РНК. Строение матричной РНК несколько специфично. В ее составе есть информативные участки, т.е. работающие как матрицы в процессе биосинтеза белка и неинформативные зоны. Предполагается, что неинформативные участки являются акцепторными при взаимодействии матричной РНК с рибосомой или отдельными белковыми факторами.
На 5`-конце молекулы РНК имеется участок, содержащий минорные нуклеотиды. Это часть также неинформативна и называется «шапочка», или «кэп». Предполагают, что «кэп» защищает мРНК от разрушительного действия ферментов экзонуклеаз. На 3`-конце мРНК находится участок, содержащий от 50 до 400 остатков аденозинмонофосфата. Предполагают, что полиадениловый участок определяет время жизни мРНК, а так же участвует в процессе созревания и переноса мРНК из ядра в цитоплазму.
Название матричной РНК связано с функцией, которую она выполняет. Она служит матрицей, на которой синтезируется полипептидная цепь в рибосоме. Также ее называют информационной, так как она содержит информацию о том, какие аминокислоты и в какой последовательности, располагаются в белке. Эта информация представляет тройной нуклеотид, который называется кодоном. Каждый последовательно присоединенный набор из трех нуклеотидов (кодон) обеспечивает информацию для пос-ледовательного (упорядоченного) присоединения аминокислот при био-синтезе полипептида, например, АУА-изолейцина, ГAУ-аспарагиновой кислоты и т.д. Последовательность УУУAУAГAУ (читается по три нук-леотида УУУ-AУA-ГAУ) определяет фрагмент трипептида фен-иле-асп. В клетках синтезируются тысячи различных белков, поэтому существуют тысячи матричных РНК по структуре своей комплементарных отдельным участкам ДНК.
тРНК. Содержание транспортной РНК – 10 % от общего содержания
РНК, это самые малые по размеру молекулы РНК. Транспортная РНК не
связана с клеточными структурами и находится в клетке в растворенном виде. Ее функция состоит в переносе, транспорте аминокислот к месту белко-вого синтеза – в рибосомы. Каждая тРНК переносит определенную амино-кислоту; тРНК богаты минорными нуклеотидами.
Вторичная структура РНК, в отличие от молекул ДНК, представлена одной нуклеотидной цепью, однако в этой цепи имеются комплементарные друг другу участки, которые могут взаимодействовать, образуя двойные спирали. При этом соединяются следующие нуклеотидные пары: Аденин-Урацил, Гуанин-Цитозин. Такие спирализованные участки (шпильки) обычно содержат небольшое число нуклеотидных пар и чередуются с неспирали-зованными участками. Характерную вторичную структуру имеет транс-портная РНК. Она имеет 3–4 спирализованных участка, и на плоскости эта структура напоминает фигуру клеверного листа. Кроме этого, имеется участок, содержащий нуклеотид комплементарный кодону матричной РНК, он называется антикодоном. С его помощью транспортная РНК прикреп-ляется к кодону матричной РНК. Имеется конец, который содержит остаток аденозинмонофосфата, к которому присоединяется соответствую-щая аминокислота (рисунок 13).
Рисунок 13 – Вторичная структура тРНК – клеверный лист
Третичная структура всех транспортных РНК схожа. Это позволяет всем им взаимодействовать с рибосомой. Незначительные отличия в пространственной структуре позволяет им взаимодействовать со специфическими ферментами тРНК синтезами, участвующими в биосинтезе белка. Третичная структура других видов РНК пока точно не установлена.