- •Компьютерная технология квантово-химических расчетов с помощью программного пакета “gaussian” Методическое пособие
- •Введение
- •Строение электронной оболочки атома
- •Волновая функция электрона и стационарное уравнение Шредингера
- •1.2 Решение уравнения Шредингера для атома водорода и водородоподобных атомов
- •1.3 Многоэлектронные атомы
- •Аналитические аппроксимации атомных орбиталей и атомные базисные наборы
- •Атомные псевдопотенциалы
- •II. Теория электронного строения молекул
- •2.1 Метод молекулярных орбиталей (мо лкао)
- •В заключение этого раздела необходимо обратить внимание еще на одно весьма важное обстоятельство.
- •2.2 Теория возмущений Мёллера-Плессе
- •2.3 Теория функционала плотности
- •2.4 Полуэмпирические методы квантовой химии
- •2.5 Модель реакционного поля для учета эффектов сольватации
- •III. Порядок работы с программным пакетом квантово-химических расчетов “ гауссиан”
- •3.1 Структура файла исходных данных
- •0 1 (Спецификация молекулы)
- •Variables:
- •3.2 Структура выходного файла
- •Variables:
- •Initialization pass.
- •Isotopes: n-14,h-1,h-1,h-1
- •Item Value Threshold Converged? Maximum Force .043925 .000450 no
- •Virtual (a1) (e) (e) (e) (e) (a1) (a1) (e) (e) (a1)
- •Ir Inten -- 381.2474 22.7331 22.7331
- •22.61138 (Kcal/Mol)
- •Vibrational temperatures: 1230.35 2673.15 2673.15 5243.52 5468.34
- •Vibrational 22.653 .605 .172
- •3.3 Алгоритм составления z-матрицы
- •3.3.1. Использование внутренних координат атомов.
- •Variables:
- •Variables:
- •3.3.2 Использование декартовых координат атомов.
- •3.3.3 Смешанное использование внутренних и декартовых координат.
- •Variables:
- •3.3.4 Использование псевдоатомов.
- •Variables:
- •IV. Оптимизация молекулярной геометрии
- •Расчет молекулы при фиксированной геометрии
- •Оптимизация геометрии
- •V. Расчет путей химических реакций
- •5.1 Поверхность потенциальной энергии реакций
- •5.2 Поиск переходного состояния.
- •Variables:
- •Variable Old X -de/dx Delta X Delta X Delta X New X
- •Item Value Threshold Converged?
- •Variable Old X -de/dx Delta X Delta X Delta X New X
- •Item Value Threshold Converged?
- •Ir Inten -- 18.4533 18.9748 128.0921
- •1 Imaginary frequencies ignored.
- •Variables:
- •Variables:
- •Iteration 8
- •I X gradient displacement newx
- •Item value threshold converged?
- •Ir Inten -- 18.5781 18.9228 128.1958
- •1 Imaginary frequencies ignored.
- •5.3 Расчет пути химической реакции.
- •Irc calculation in mass-weighted internal coordinates
- •Variables:
- •VI. Учет влияния эффектов сольватации
- •Version: matrix inversion
- •174 Tesserae over a maximum of 1500
- •VII. Дополнительные сведения
- •7.1. Порядок следования разделов в исходном файле
- •7.2. Методы расчета, реализованные в Гауссиане
- •7.3. Встроенные базисные наборы и псевдопотенциалы атомов
- •7.4. Наиболее часто употребляемые директивы
- •7.4.1 Опции директивы Opt
- •7.4.2 Опции директивы Freq
- •7.4.3 Опции директивы scrf
- •7.4.4 Опции директивы scf
- •7.4.5 Опции директивы Pop
- •7.4.6 Опции директивы Guess
- •7.4.7 Опции директивы Geom
- •7.4.8 Опции директивы irc
- •7.5. Задание базисных наборов и псевдопотенциалов во входном файле
- •VIII. Заключение
2.3 Теория функционала плотности
Одним из основных недостатков метода Хартри-Фока является применение многоэлектронной волновой функции , зависящей от 3n переменных (n – число электронов). При увеличении размеров системы такой подход может привести к значительным затруднениям как технического, так и принципиального характера. В то же время такая характеристика молекул, как электронная плотность (r), зависит только от трех пространственных переменных (координат x, y и z). Поэтому закономерно возникает вопрос, возможно ли описать важнейшие наблюдаемые характеристики молекулярных систем в терминах трехмерной электронной плотности (r). Подобное описание многоэлектронных систем называется теорией Томаса-Ферми (ТФ), согласно которой система взаимодействующих электронов рассматривается как “электронный газ”, то есть невзаимодействующие электроны, движущиеся в некотором внешнем потенциале, зависящем только от электронной плотности (r). Хотя теория ТФ весьма приближенная и плохо описывает химические системы, на ее основе удалось создать целый набор методов так называемого функционала плотности, главной идеей которых является теорема Хоэнберга-Кона, утверждающая, что для основного состояния энергия является функционалом электронной плотности:
Е=Е{(r)}, (2.3.1)
где (r) - функция электронной плотности. Поскольку сама теорема Хоэнберга-Кона не позволяет определить конкретный вид функциональной зависимости (2.3.1), существует много разновидностей, основанных на теории функционала плотности (ТФП или DFT) и отличающихся конкретным видом зависимости (2.3.1). При этом обычно выделяют несколько членов, дающих вклад в электронную энергию:
E=ET+EV+EJ+EXC , (2.3.2)
где ET - кинетическая энергия электронов, EV включает вклады, описывающие потенциальную энергию ядерно-электронного взаимодействия и взаимодействия между парами ядер, EJ это вклад электрон-электронного кулоновского взаимодействия, и EXC - обменно-корреляционный вклад (сюда также включается некоторая часть электрон-электронных взаимодействий). Следует отметить, что, в отличие от метода Хартри-Фока, эти члены зависят не от координат электронов и ядер, а от электронной плотности, являющейся функцией лишь трех пространственных координат, что значительно упрощает расчеты. При этом наиболее сложной задачей является поиск конкретного вида члена, описывающего обменно-корреляционные взаимодействия, и при его построении обычно используется ряд параметров, подбираемых таким образом, чтобы наилучшим образом удовлетворить экспериментальным данным.
Поскольку при использовании метода функционала плотности также приходится прибегать к итеративной процедуре, часто используют смешанный подход с использованием как метода Хартри-Фока, частично учитывающего электронную корреляцию, так и методов функционала плотности. Обычно это выглядит как построение гибридного обменно-корреляционного функционала, который включает два вклада:
, (2.3.3)
где
и
- некоторые эмпирические коэффициенты.
Следует отметить, что, поскольку методы функционала плотности не используют одноэлектронного приближения, в рамках такого подхода можно получить только полную электронную энергию и волновую функцию. Одноэлектронные спин-орбитали, их заселенности и энергии, получаемые в данном случае, носят формальный характер и не имеют физического смысла.
Это, однако, не умаляет важнейших достоинств методов, основанных на ТФП – точность расчета геометрии и энергии с учетом электронной корреляции и сравнительно низкая требовательность к машинным ресурсам, позволяющая рассматривать более крупные молекулярные системы, чем, например, на уровне MP2.
