- •2.1 Связи, определяющие и стабилизирующие структуру биополимеров.
- •2.1.1 Ковалентная (химическая) связь
- •2.1.2 Ионные или электростатические взаимодействия.
- •2.1.3 Водородная связь.
- •2.1.4 Гидрофобные взаимодействия
- •2.2 Белки
- •2.2.1 Уровни структурной организации белковых молекул
- •2.2.1.1. Первичная структура белков
- •2.2.1.2. Вторичная структура белков
- •2.2.1.3 Надвторичная или супервторичная структура белков.
- •2.2.1.4 Третичная структура белков
- •2.2.1.5 Четвертичная структура белков
2.2.1.3 Надвторичная или супервторичная структура белков.
Надвторичные структуры представляют собой элементарные ансамбли вторичных структур, возникающие при свёртывании вторичной цепи.
Среди них различают (α,β-структуры) и более сложные сочетания структур (βββ, βαβ и др.).
2.2.1.4 Третичная структура белков
Третичная структура белков – это трёхмерная структура полипептидной цепи, которая определяется первичной и вторичной структурой и характеризуется наличием биологической активности.
Это объясняется тем, что в результате взаимодействий аминокислотных остатков полипептидной цепи уменьшается свободное вращение связей полипептидного остова.
Ограничение подвижности и тем самым формирование и поддержание третичной структуры возникает также за счёт вклада сил слабого взаимодействия:
гидрофобных связей, возникающих при сближении в пространстве неполярных радикалов (фенилаланина, изолейцинаи др.);
водородных связей, в образовании которых участвуют радикалы-доноры протонов (тирозина, серина и других аминокислот) и радикалы-акцепторы протонов (глутаминовой, аспарагиновой кислот и др.)
Рис. Типы связей, возникающих между радикалами аминокислот при формировании третичной структуры белка:
1 – ионная связь; 2 – водородная связь; 3 - гидрофобные связи; ковалентная (дисульфидная) связь
Рассмотрим особенности строения белков на примере одного из самых простых белков — инсулина.
Рис. 1. Первичная последовательность гормона инсулина. Показаны S–S-мостики и участки первичной последовательности, образующие вторичные структуры.
Гормон состоит из двух пептидных цепей — короткой (21 аминокислотный остаток) и длинной (30 аминокислотных остатка). Первичная последовательность инсулина приведена на Рис. , а третичная структура — на Error: Reference source not found
Рис. Третичная структура инсулина. Короткая цепь выделена более светлой. Здесь и далее спиралями представлены -спиральные участки, стрелками — -складки и цилиндрическими кривыми — нерегулярные участки. Пунктиром показаны водородные связи, а сплошными линиями — S–S‑мостики.
На рисунке хорошо видно, что три S–S-мостика играют ключевую роль в организации третичной структуры:
- один из них взаимно ориентирует две α-спирали короткой последовательности;
- два других скрепляют короткую и длинную цепи;
- кроме того, третичная последовательность буквально пронизана водородными связями;
- третичная структура инсулина состоит в основном из α-спиралей.
Третичная структура белковой молекулы возникает самопроизвольно. Движущей силой, свёртывающей полипетидную цепь белка в строгое трёхмерное образование, является взаимодействие аминокислотных радикалов с молекулами воды.
При этом гидрофобные радикалы втягиваются внутрь белковой молекулы, образуя там «сухие зоны» («жирная капля»), а гидрофильные радикалы ориентируются в сторону растворителя – воды.
