
- •Конкретные задачи
- •Вопросы для самоподготовки
- •Этапы занятия и контроль усвоения знаний
- •Основные направления реакционной способности углеводородов в зависимости от их электронного строения
- •Ковалентная связь
- •Циклоалканы
- •Циклопропан с3н6
- •Транс-1,4-диметилциклогексан цис-1,4-диметилциклогексан
- •1. Гидрирование:
- •Пропен пропан
- •2. Галогенирование:
- •3. Гидрогалогенирование:
- •6. Полимеризация:
- •Алкадиены Это углеводороды, содержащие две двойные связи. Общая формула Сn h2n-2.
- •1. Гидрирование:
- •2. Гидрогалогенирование:
- •Ароматические углеводороды (арены)
- •Химические свойства
- •1. Галогенирование:
- •2. Нитрование:
- •3.Сульфирование:
- •4. Алкилирование:
- •Тема 2. Спирты. Фенолы. Нафтолы. Тиолы
- •Вопросы для самоподготовки
- •Этапы занятия и контроль усвоения знаний
- •Кислотность и основность органических соединений
- •Кислоты тон
- •Одноатомные спирты
- •Дегидрирование альдегид
- •Дегидрирование кетон
- •Многоатомные спирты
- •Спирты высшей атомности
- •Свойства фенолов как ароматических соединений. Реакции электрофильного замещения
- •Нафтолы
- •Ароматические спирты
- •Тема 3. Альдегиды и кетоны
- •Пиридоксаль пиридоксальфосфат
- •Этапы занятия и контроль усвоения знаний
- •I. Реакции нуклеофильного присоединения
- •4. Взаимодействие с галогенсодержащими реагентами
- •II. Реакции за счет -сн2-звена
- •Галогенирование:
- •III. Реакции, характерные только для альдегидов
- •Тема 4. Карбоновые кислоты и их функциональные производные
- •Конкретные задачи
- •Вопросы для самоподготовки
- •Этановая кислота 2-метилпропановая бутен-3-овая кислота
- •Малеиновая фумаровая кислота
- •Линолевая кислота
- •2. Реакции нуклеофильного замещения (sn ):
- •Двухосновные карбоновые кислоты
- •Трехосновные кислоты
- •Ноос–сн2–с–сн2–соон лимонная 3-гидрокси – 3-карбокси -
- •Специфические реакции двухосновных кислот
- •Тема 5. Липиды
- •Конкретные задачи
- •Вопросы для самоподготовки
- •Этапы занятия и контроль усвоения знаний
- •Омыляемые липиды
- •Омыляемые липиды
- •Жирные кислоты
- •Простые омыляемые липиды
- •Сложные омыляемые липиды
- •Ф осфолипиды
- •Глицерофосфо- сфингофосфо-
- •Гликолипиды
- •Цереброзиды ганглиозиды
- •Цереброзиды
- •Ганглиозиды
- •Неомыляемые липиды
- •Стероиды
- •Классификация стероидов
- •Эстрадиол
- •Тема 6. Соединения со смешанными функциями
- •Конкретные задачи
- •Вопросы для самоподготовки
- •Этапы занятия и контроль усвоения знаний
- •Содержание этапов занятия
- •Оксокислоты
- •2. Кето-енольная таутомерия -оксокислот.
- •Оксокислоты
- •Стереоизомерия
- •(Оптические,
- •Энантиомеры
- •Тема 7. Аминокислоты.
- •III. Биологически важные реакции - аминокислот
- •Тема 8. Углеводы
- •Вопросы для самоподготовки
- •Этапы занятия и контроль усвоения знаний
- •Тема 8-1. Углеводы. Моносахариды Теория
- •Стереоизомерия моносахаридов
- •Важнейшие природные моносахариды а льдопентозы
- •Альдогексозы Кетогексоза
- •Цикло-цепные таутомеры моносахаридов
- •Перспективные формулы Хеуорса
- •Цикло-цепная таутомерия моносахаридов – это существование в водном растворе смеси таутомерных форм, способных превращаться друг в друга через открытую таутомерную форму:
- •3. Мутаротация сахаров При растворении кристаллической таутомерной формы углевода в воде наблюдается явление мутаротации.
- •4. Конформации моносахаридов
- •5. Эпимеризация
- •6. Химические свойства моносахаридов
- •Реакции, характерные для цепной формы углеводов
- •Кислоты
- •Реакции циклических таутомерных форм моносахаридов
- •Тема 8-2. Ди – и полисахариды
- •Дисахариды
- •Цикло-цепная таутомерия дисахаридов
- •Реакция «серебряного зеркала»:
- •Полисахариды
- •Тема 9. Гетероциклические соединения
- •Конкретные задачи
- •Вопросы для самоподготовки
- •Этапы занятий и контроль усвоения знаний
- •Содержание этапов занятия
- •Электронное строение «пиррольного» атома азота
- •Шестичленные гетероциклические системы с одним гетероатомом
- •Электронное строение «пиридинового» атома азота
- •Химические свойства
- •Пятичленные гетероциклы с двумя гетероатомами
- •Химические свойства
- •Шестичленные гетероциклические соединения с двумя гетероатомами п иримидин
- •Производные пиримидина
- •Полициклические гетероциклы
- •Триптофан
- •Хинолин и изохинолин
- •Нуклеиновые кислоты
- •Общая схема построения нуклеиновых кислот
- •Нуклеиновые кислоты
- •Нуклеотиды
- •Методические разработки по биоорганической химии
- •Методические разработки по биоорганической химии Санкт-Петербург
III. Биологически важные реакции - аминокислот
1. Способность к образованию внутренних солей (биполярных, или «цвиттер» – ионов). Карбоксильная группа проявляет кислотные свойства, диссоциирует с отщеплением протона. Амино-группа проявляет основные свойства – способна протонироваться по неподеленной электронной паре атома азота. В результате в водных растворах и в кристаллическом состоянии аминокислоты существуют в виде внутренних солей:
+
NH2-CH-COOH
NH3-CH-COO-
R R
Суммарный заряд молекулы зависит от строения радикала R и рН среды:
а) моноаминомонокарбоновая кислота:
OH- + H+ +
NH2-CH2-COO- -1 NH3-CH2-COO -0 NH3-CH2-COOH+1
б) моноаминодикарбоновая кислота:
+
+
NH2-CH-COO- -2 NH3-CH-COO- -1 NH3-CH-COO- °
HO- Н+
CH2 CH2 CH2
COO- COO- COOН
2Н+
+
NH3-CH-COOH +1
CH2
СOOH
в) диаминомонокарбоновая кислота:
NH2-CH-COO- ° + NH3-CH-COO- +1 + NH3-CH-COOH +2
HO- Н+
(CH2 )4 ( CH2 )4 (CH2)4 -
+ NH3 +NH3 +NH3
2НО-
NH2-CH-COO- -1
(CH2)4
NH2
Свойство аминокислот изменять заряд при определенном значении рН, а, следовательно, двигаться в электрическом поле к разным электродам лежит в основе метода электрофореза, который используется для разделения смесей аминокислот и белков.
Значение рН среды, при котором суммарный заряд молекулы равен нулю, называется изоэлектрической точкой (ИЭТ, или рНi). В ИЭТ молекула теряет электрофоретическую подвижность, снижается растворимость белка в воде, он может выпадать в осадок.
2. Способность к образованию комплексных солей с ионами тяжелых металлов:
··
2NH2-CH-C=O + Cu2+ +2Н+
R OH
··
Комплексная соль Cu2+ хорошо растворима в воде и окрашена в ярко-синий цвет, что может быть использовано как качественная реакция на - аминокислоты.
3. Реакция декарбоксилирования:
in
vivo
декарбоксилаза
CO2 +
in
vitro
t°, Ba(OH)2
гистидин гистамин
СО2 +
триптофан триптамин
В результате реакции декарбоксилирования - аминокислот образуются биогенные амины, обладающие сильной физиологической активностью.
4. Реакции дезаминирования:
а) дезаминирование по Ван-Слайку in vitro:
N H2-CH2-COOH + HONO N2 + HO-CH2-COOH + H2O
глицин гликолевая кислота
По объему выделяющегося газообразного азота судят о количестве аминокислоты в растворе.
б) неокислительное дезаминирование in vivo протекает у низших организмов (бактерий, грибов):
-NH3
H OOCCH2CHCOOH HOOC –CH=CH-COOH
фумаровая кислота
NH2
аспарагиновая кислота
в) окислительное дезаминирование in vivo:
фермент, НАД+
H
OOC
– (CH2)2
– CH _
COOH HOOC-(CH2)2-C-COOH
-НАД.H;-H+
NH2 NH
глутаминовая кислота
H2O
HOOC-(CH2)2-C-COOH
- NH3
O
- кетоглутаровая кислота
Реакция протекает под действием фермента глутаматдегидрогеназы и кофермента НАД+.
5. Образование оснований Шиффа:
H -C=O + H2N-CH2-COOH H2C-NH-CH2-COOH H2O +
глицин
H OH
+ CH2=N-CH2-COOH
метилениминокислота
Реакция лежит в основе метода формольного титрования по Зеренсену. Сами аминокислоты вследствие амфотерности не могут быть оттитрованы щелочью. Иминокислота содержит свободную карбоксильную группу и может быть определена количественно титрованием щелочью.
6. Взаимодействие с 2,4-динитрофторбензолом – ДНФБ (реактивом Сенджера):
+ H2N-CH-COOH
–HF
R
ДНФБ -аминокислота ДНБ-производное
ДНБ-производное аминокислоты может быть выделено и идентифицировано хроматографически. Метод служит для определения аминокислотной последовательности белка.
7
.
Нингидриновая реакция обусловлена
наличием - аминогруппы,
качественная реакция на -
аминокислоты, пептиды и белки:
t°
+ NH2-CH-COOH
2
R
- аминокислота
нингидрин
H + CO2 + 3H2O + R-CHO
продукт сине-фиолетового цвета
8. Реакция трансаминирования (переаминирования) in vivo:
фермент трансфераза
NH2-CH-COOH
+
пиридоксальфосфат
CH3 (вит. В6)
аланин - кетоглутаровая
кислота
О=С-СOOH + НООС-СH-(СH2)2-СOOH
CH3 NH2
пировиноградная глутаминовая
кислота кислота
9
.
Способность к образованию полипептидов.
Карбоксильная группа одной аминокислоты
может реагировать с аминогруппой другой
аминокислоты с образованием пептидной
связи:
-H2O
NH2-CH-C=O + H-NH-CH-C=O
R 1 OH R2 OH
Дипептид
Последовательность аминокислот, соединенных между собой пептидными связями, является первичной структурой белков.
Процесс, обратный образованию пептида, называется гидролизом.
Существуют три вида гидролиза белка: кислотный, щелочной и ферментативный. Результатом является образование смеси аминокислот, которые могут быть разделены и идентифицированы методами хроматографии или электрофореза. Таким образом определяют аминокислотный состав белка.
Рассмотрим пример:
Составить трипептид Глу-Асн-Про и дать ему полную характеристику.
Р
ешение:
-2H2O
+
+
глутамил-аспарагинил-пролин
В названии пептида окончания аминокислот меняются на «ил», кроме последней аминокислоты.
Характеристика пептида. 1. Реакция пептида на индикатор – кислотная, так как в пептиде две кислотные группы – СOOH и одна основная –NH2
(группа – С=О не проявляет основных свойств – см. классификацию)
NH2
2. Суммарный заряд пептида в водной среде:
-1
+
3
.
Изменение суммарного заряда с изменением
рН среды. Запишем пептид в упрощенном
виде, выделив лишь заряженные группы и
обозначив остальную часть пептида
радикалом R:
+
0
+1
-1 H+
+
H+
+
OH-
-2
4. Изоэлектрическая точка пептида (определение см. выше) лежит в слабокислой среде.
5. Поверхностные свойства пептида зависят от соотношения гидрофильных и гидрофобных боковых радикалов и концевых групп.
В пептиде содержатся 4 гидрофильные группы: 2-СOOH, -C=O, +NH3
и одна гидрофобная: радикал пролина
NH2
Гидрофильных групп больше, поэтому поверхность пептида гидрофильна, он растворим в воде.
Пептиды являются продуктом частичного гидролиза белков. Но многие пептиды присутствуют в свободном состоянии в клетках и тканях и выполняют специфические биологические функции. К ним относятся гормоны, антибиотики и другие соединения, обладающие высокой биологической активностью.
Самостоятельное значение пептидов в процессах жизнедеятельности человеческого организма велико.
В нервной ткани выделены нейропептиды, влияющие на функции нервной системы: энкефалины, эндорфины – «опиоидные» пептиды, аналогично морфину подавляющие боль; пептиды, действующие на сон; пептиды памяти и др.
Известны гормоны пептидной природы: окситоцин, вазопрессин (гормоны задней доли гипофиза), меланоцитстимулирующий гормон (выделяется средней долей гипофиза), адренокортикотропный гормон (АКТГ) (передней доли гипофиза), глюкагон (поджелудочной железы), гормоны желудочно-кишечного тракта и др.
К пептидам относятся токсины, выделенные из бледной поганки, токсины яда пчел, змей, скорпионов, морских позвоночных.
В медицине используются пептиды-антибиотики: грамицидин S, актиномицин и др.; пептиды-регуляторы иммунитета: тафцин; пептиды – заменители сахара: аспартам и т.д.
Строение пептидной связи
..
N
H
А
том
углерода пептидной связи находится в
sp2 –гибридизации.
Неподеленная электронная пара атома
азота вступает в сопряжение с -
связью . Таким образом,
пептидная связь представляет собой
трехцентровую ,-
сопряженную систему.
.
.
:…. ….
N
H
В результате связь C-N приобретает характер двоесвязанности, становится «полуторной». Вращение вокруг этой связи затруднено. В большинстве природных белков и пептидов имеет место транс-конфигурация пептидной связи, что важно для стабилизации вторичной структуры.
Д
ля
пептидной связи характерно явление
лактам-лактимной таутомерии:
OH
N C = N
H
лактам лактим
За счет лактимной формы пептиды дают качественную цветную реакцию с ионами Сu2+ аналогично биурету – веществу, получаемому из 2 молекул мочевины:
+
-NH3
мочевина биурет
лактамная форма биурета лактимная форма биурета
Эта реакция называется биуретовой. Она используется как качественная реакция для обнаружения пептидов и белков.