
- •382 Глава 13
- •Глава 14
- •384 Глава 14
- •386 Глава 14
- •388 Глава 14
- •390 Глава 14
- •392 Глава 14
- •Если аминокислоты: триптофан, тирозин, фенилаланин и гистидин—перемещаются в менее полярное окружение, Хмакс и є возрастают. Следовательно:
- •394 Глава 14
- •Абсорбционная спектроскопия 395
- •400 Глава 14
- •402 Глава 14
- •404 Глава 14
- •406 Глава 14
- •408 Глава 14
- •410 Глава 14
- •412 Глава 14
- •414 Глава 14
- •Глава 15
РИС.
14-23.
КР-спектр
диоксана.
частоты,
с которым мы встречаемся при флуоресценции
(гл. 15), тем, что не происходит перехода
на более высокий электронный
уровень.
Причиной изменения частоты является
либо возбуждение на более высокий
колебательный
уровень,
либо добавление к электромагнитной
энергии световой волны колебательной
энергии молекулы.
Если
в процессе рассеяния свет возбуждает
рассеивающий центр на более высоком
колебательном уровне, энергия теряется
и частота уменьшается. С другой стороны,
если рассеивающий центр находится на
более высоком колебательном уровне
(например, за счет предварительных
столкновений с молекулами растворителя),
он может передавать свою колебательную
энергию падающему свету и таким
путем увеличивать его частоту. При
обычно используемых температурах число
молекул, обладающих запасом
колебательной энергии, меньше, чем
число молекул, не обладающих таковым,
поэтому чаще частота уменьшается.
Таким образом, спектроскопия
комбинационного рассеяния, как и
ИК-спектроскопия, изучает колебательные
переходы. Ранее, ввиду отсутствия
источников света высокой интенсивности
и очень низкой интенсивности рассеянного
света, метод КР-спектроскопии применялся
относительно редко. К тому же изменения
частот так малы, что требуется свет с
высокой степенью монохроматичности.
Обе эти проблемы были недавно решены
путем использования в современных
приборах лазеров. Это важный шаг вперед,
так как КР-спектроскопия имеет то
важное преимущество перед
ИК-спектроскопией, что можно работать
в растворах НгО. На рис. 14-23 показан
типичный КР- спектр.
КР-спектроскопия
пока не имеет широкого распространения.
Рассмотрим несколько возможных
применений этого метода, описанных в
литературе.412 Глава 14
АБСОРБЦИОННАЯ
СПЕКТРОСКОПИЯ 413
Доказательство
цвиттер-ионного строения различных
аминокислот.
Ионизация амино- и карбоксильной групп
сопровождается характерными
изменениями в спектрах.
Распознавание
аденозинмоно-, ди- и трифосфата и их
ионизованных форм в растворе.
Метод используется для изучения
некоторых ферментативных реакций,
потому что по КР-спектру реакционной
смеси можно определить относительные
количества молекул каждого типа в
процессе реакции или в равновесии.
Определение
содержания в полиаминокислотах:
а-спиралиг
р-структуры
и беспорядочного клубка.
Как и в случае ИК-спек- троскопии,
наблюдаются характерные амидные полосы,
интенсивность которых пропорциональна
относительному содержанию структуры
каждого типа.
Определение
числа S—S-связей
в белках.
S—S- и
S—Н-связи дают характерные
умакс-
Определение
числа спаренных и неспаренных оснований
в РНК.
Каждое основание можно отличить по его
КР-спектру, так что по относительной
интенсивности пиков, соответствующих
каждому основанию, можно определить
состав оснований. Кроме того спектры
меняются при дейтерировании, поэтому
удается идентифицировать места
медленного и быстрого обмена дейтерия
на водород. Считают, что основание, для
которого наблюдается медленный
обмен, находится в составе пары, поскольку
водородные связи препятствуют обмену
(см. пример 14-К).
Список
литературы
Beaven
G. Н., Johnson Е.
A., Willis Н. A., Miller R. G. }.,
Molecular Spectroscopy, Heywood, 1961.
Brewer
I. М.,
Pesce A. }., Ashworth R. B.,
Experimental Techniques: in Biochemistry, Prentice-Hali, 1974, ch.
7.
Donovan
J. W.
Ultraviolet Difference Spectroscopy: New Techniques and Applications
and Spectrophotometric Titration of the Functional Groups of
Proteins, in “Methods in Enzymology”, vol. 27, edited by С.
H. W. Hirs and S. N. Timasheff, Academic Press, 1973, pp. 497—525;
525—548.
Edisbury
J. R.,
Practical Hints of Absorption Spectrometry, Helger-Watts, 1965.
Herskovitz
J. Т.,
Difference Spectroscopy, in “Methods in Enzymology”, vol. 11,
edited by С. H. Hirs, Academic Press,
1967, pp. 748—775.
Horton
H. R., Koshland D. E.,
Environmental Sensitive Groups Attached to Proteins in “Methods in
Enzymology”, vol. 11, edited by С. H.
W. Hirs, Academic Press, 1967, pp. 856—870. Описание
использования репортерных
групп.
Timasheff
S. N.,
Some Physical Probes of Enzyme Structure in Solutions, in “The
Enzymes”, vol. 2, edited by P. D. Boyer, Academic Press, 1970, pp.
371—443.
Задачи
14-1.
Поглощение раствора, содержащего
вещество с молекулярным весом 423 в
концентрации 32 мкг/мл, составляет 0,27
при 540 нм в односантиметровой кювете.
Чему равен коэффициент молярного
погашения при 540 нм? Допустить, что закон
Бера соблюдается.
14-2.
Раствор соединения А имеет £)26о=0,45
и £450=0,03.
Раствор второго соединения Б имеет
£>2бо=0,004 и D450
= 0,81. 2 мл раствора А смешали с 1 мл раствора
Б. Результирующая оптическая плотность
смеси £)2бо=0,3
и £*450=0,46. Имеется ли взаимодействие
между А и Б? Объяснить. Какое допущение
делается, чтобы подтвердить это
заключение?
14-3.
Допустим, что только что приготовлены
два образца: один—■ нативной ДНК и
другой — денатурированной ДНК — и
каждый диализован против 0,01 М NaCl.
Затем добавляют к каждому раствору
очень маленькое количество фермента
и снимают этикетки с образцов. Как путем
измерения поглощения можно установить
природу каждого образца? Можно принять,
что в опыте расходуется небольшая часть
каждого образца и что фермент не мешает
опыту. Придумайте другой опыт, в котором
не требуется введения денатурирующего
агента или создания условий, вызывающих
денатурацию.
14-4.
Предположим, что вы захотели узнать,
сколько цитохрома с
содержится в одной клетке Е.
coli.
Известен молярный коэффициент погашения
в максимуме поглощения. Как вы проделаете
это измерение?
14-5.
Молярный коэффициент погашения данного
соединения 348 при 482 нм. Раствор этого
соединения имеет Z>4S2=
1,6. При разбавлении 1:1,
1:2, 1:3, 1:4,
1:5
и 1:6
величины Dm
составляют 1,52, 1,42, 1,05, 0,84, 0,70 и 0,61
соответственно. Какова молярность
исходного раствора?
6.
Молярные коэффициенты погашения
вещества А при 260 и 280 нм равны
соответственно 5248 и 3150. Для выделения
А используется реагент Б, имеющий
молярные коэффициенты погашения 311 и
350 при 260 и 280 нм. После выделения A
DZ60=2,50
и D28o=2,00.
Какова концентрация А?
7.
D2бо
денатурированной ДНК [измеренная
при той температуре, когда достигается
максимальная Z)2во
(см. рис. 14-13)] постоянно на 37% выше, чем
D
нативной ДНК, например, при 20°С. Однако
в 6
М растворе трифтор- ацетата натрия
£>26о образца ДНК только на 16%
выше, чем при 20°С. Предложите
объяснение этого.
8.
Белок помещают в 20%-ный
раствор этиленгликоля и снимают его
дифференциальный спектр против
раствора, не содержащего этиленгликоля.
При всех длинах волн Де = 0. Что вы можете
заключить о структуре белка?
Второй
белок изучают в 20%-ном диметилсульфоксиде
и 20%-ной сахарозе. В сахарозе Де = 0. В
диметилсульфоксиде проявляется
характерный дифференциальный спектр
триптофана. Наблюдаемая величина Де
удваивается, если белок нагревают
в диметилсульфоксиде до 60°С. В 20%-ной
сахарозе после нагревания до 60°С
величина Де эквивалентна Де
для 8
триптофановых остатков. Что вы можете
сказать об этом белке?
9.
В процессе титрования белка при 295 нм
найдено, что е295
резко возрастает при pH 9,6. При pH 11,7 е295
возрастает снова, причем это увеличение
составляет одну треть от первого. Если
затем pH понизить до 6
и далее постепенно увеличивать,
кривая зависимости є295
от pH почти идентична кривой белка
до титрования, за исключением того,
что увеличение е295
составляет только две трети от
наблюдаемого вначале. Известно, что в
белке имеется восемь тирозиновых
остатков. Что вы можете сказать о
структуре белка?
10.
ДНК выделена из Е.
coli.
Среднее содержание G-С-пар
в ДНК Е.
coli
50%. ДНК растворили в смеси 0,15 М NaCl
и 0,015 М цитрата Na. Получили
кривую плавления. Вместо плавной кривой
наблюдается двухступенчатая, с Гпл
80 и 88°С.
Первая ступень составляет 20% всего
возрастания. Какое объяснение можно
дать этому явлению?
ДНК
из другой бактерии выделена тем же
способом, но случайно нагрета до
75°С в течение 1 мин. Позднее ее использовали
в эксперименте по плавлению. Кривая
плавления была неожиданной в том смысле,
что, хотя главный переход был между
82 и 88°С,
имелось постепенное возрастание С2бо
на 10% в температурном интервале от 32 до
55°С. Объясните полученные данные.414 Глава 14