
- •Оценка степени сходства или различия между популяциями по комплексу признаков
- •Обобщенное расстояние Махаланобиса
- •Критерий Животовского
- •2. Оценка внутрипопуляционного разнообразия
- •2.1. Показатели наследуемости количественных признаков в широком смысле
- •2.1.1. Метод Роне – Петрова
- •2.1.2. Метод дисперсионного анализа
- •2.1.3. Метод Шрикганди
- •2.2.Определение коэффициента наследуемости в узком смысле
- •2.3. Индексная оценка потомства
- •2.4.Информационная мера внутрипопуляционного разнообразия
- •2.5.Оценка доли редких фенотипов популяции
- •3. Использование коэффициента наследуемости при прогнозировании эффективности отбора
2. Оценка внутрипопуляционного разнообразия
2.1. Показатели наследуемости количественных признаков в широком смысле
2.1.1. Метод Роне – Петрова
В данной разработке приводится ряд методов определения наследуемости. В экспериментальных популяциях, состоящих из нескольких клонов, степень генетической обусловленности изменчивости того или иного количественного признака можно определить по следующим упрощенным формулам.
1. По формуле, предложенной В. М. Роне (1980):
(2.1.)
где
- усредненное значение интервалов
изменчивости признака в клонах,
- интервал
изменчивости того же признака в пределах
всей популяции.
2. По формуле, предложенной С. А. Петровым (1981):
(2.2.)
где
- поправочные коэффициенты на размер
выборки соответственно в пределах
клонов и для всей популяции. В работе
Дж. Снедекова (1961) приведена таблица
значений поправочных коэффициентов
для выборок объемом от 2 до 50 наблюдений.
Основываясь на этой таблице, легко
рассчитать значения
в зависимости от количества растений
в клонах и числа клонов, составляющих
популяцию (табл. 2.1).
Пример. Популяция состоит из 5 клонов, созданных прививкой, по 5 растений в каждом клоне. Необходимо выявить генотипическое разнообразие данной популяции по высоте составляющих ее клонов.
Таблица 2.1 – Значение поправочных коэффициентов «К»
Число растений в клоне |
Число клонов |
|||||||
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
10 |
|
3 |
3,076 |
3,706 |
4,211 |
4,618 |
4,862 |
5,327 |
5,558 |
5,818 |
4 |
2,506 |
2,948 |
3,287 |
3,602 |
3,936 |
4,101 |
4,170 |
4,427 |
5 |
2,199 |
2,573 |
2,822 |
3,080 |
3,265 |
3,463 |
3,621 |
3,752 |
6 |
2,000 |
2,381 |
2,598 |
2,756 |
2,960 |
3,165 |
- |
- |
7 |
1,940 |
2,230 |
2,418 |
2,589 |
2,829 |
- |
- |
- |
8 |
1,880 |
2,120 |
2,307 |
2,455 |
- |
- |
- |
- |
9 |
1,817 |
2,005 |
2,223 |
- |
- |
- |
- |
- |
10 |
1,758 |
1,980 |
2,143 |
- |
- |
- |
- |
- |
Для расчета коэффициента наследуемости количественных признаков методом Роне, разработана программа RONE.
РАЗМЕРНОСТЬ ПРОГРАММЫ: число клонов и число растений в клоне может быть от 3-х до 10-ти.
ПРИ ЗАПУСКЕ программы, т.е. при запуске файла RONE1.EXE, на экране Вашего дисплея появится надпись:
ВЫБРАТЬ ФУНКЦИЮ:
ВВОД ДАННЫХ С ТЕРМИНАЛА --------- 1
ЧТЕНИЕ ДАННЫХ ИЗ ФАЙЛА --------- 2
Если Ваши данные уже записаны в файле (например, если Вы уже раньше работали с этой программой и набирали данные с клавиатуры), то необходимо нажать цифру 2 на клавиатуре – произойдет чтение данных из файла, имя которое Вы укажете в ответ на запрос на экране:
ВВЕДИТЕ ИМЯ ФАЙЛА (6 символов)
Необходимо ввести с клавиатуры 6 символов имени файла, например `D_RONE.
Если Вы только собираетесь вводить свои данные с клавиатуры, то нажмите цифру 1 – компьютер готов к вводу Ваших данных, а Вы будьте готовы ответить на следующие запросы, которые появятся на экране:
ВВЕДИТЕ ЧИСЛО КЛОНОВ (вводится соответствующая цифра, например,5)
ВВЕДИТЕ ЧИСЛО РАССТЕНИЙ В КАЖДОМ КЛОНЕ (в нашем случае 5)
Затем Вас попросят ввести значения параметров для каждого клона, что осуществляется набором соответствующего числа на клавиатуре и нажатием клавиши «ENTER».
В программе предусмотрена процедура внесения исправлений после ввода данных по одному клону, т.е. на экране появляется запрос:
ХОТИТЕ ВНЕСТИ ИСПРАВЛЕНИЯ? – (Y/N)
Если исправления требуются, нужно нажать Y (Yes) и сделать ввод данных в клоне заново, в противно случае следует нажать N (No).
ВЫВОД результатов работы программы осуществляется в файл, имя которого необходимо ввести в ответ на запрос:
ВВЕДИТЕ ИМЯ ФАЙЛА С РАСШИРЕНИЕМ
Например, можно ввести имя D1RONE.TXF или любое другое на ваш выбор. Важно только, чтобы на том дисковом пространстве, на котором Вы работаете, не было файла с таким именем, т.к. в программе он описан как «новый».
Приведем пример того как выглядят результаты работы программы для нашего случая в файле D1RONE.TXF:
РЕЗУЛЬТАТЫ РАБОТЫ ПРОГРАММЫ «RONE»
(определение наследуемости количеств признаков)
Д А Н Н Ы Е П О К Л О Н А М: |
|||||
|
10,00 |
9,50 |
10,50 |
9,10 |
9,00 |
|
10,30 |
10,80 |
10,90 |
9,40 |
9,60 |
|
10,70 |
9,70 |
11,70 |
9,60 |
9,80 |
|
10,90 |
10,30 |
11,40 |
9,60 |
10,10 |
|
11,50 |
10,00 |
11,10 |
10,00 |
10,00 |
Число растений в клоне: |
5 |
|
|
|
|
СРЕДНЕЕ: |
10,680 |
10,060 |
11,120 |
9,540 |
9,700 |
ОШИБКА СРЕДНЕГО: |
0,258 |
0,229 |
0,208 |
0,147 |
0,195 |
ДИСПЕРСИЯ: |
0,576 |
0,513 |
0,460 |
0,329 |
0,436 |
КОЭФФ. ВАРИАЦИИ: |
0,054 |
0,051 |
0,041 |
0,034 |
0,045 |
ОШИБКА ОПЫТА: |
0,024 |
0,023 |
0,019 |
0,015 |
0,020 |
МАКС. ЗНАЧЕНИЯ: |
11,500 |
10,800 |
11,700 |
10,000 |
10,100 |
МИНИМ. ЗНАЧЕНИЕ: |
10,000 |
9,500 |
10,500 |
9,100 |
9,000 |
ИНТ. ИЗМ. В КЛОНЕ: |
1,500 |
1,300 |
1,200 |
0,900 |
1,100 |
УСРЕД. ИНТ. ИЗМЕНЧ. В КЛОНЕ: |
1,200 |
|
|
|
Ошибка усреднения: |
0,100 |
Дисперсия: |
0,224 |
Коэффициент вариации: |
0,186 |
Точность опыта: |
0,083 |
ИНТ. ИЗМЕНЧИВОСТИ В ПОПУЛЯЦИИ 2,700
Усредненный интервал изменчивости признака в клонах = (1,5+0,8+1,2+0,9+1,1)/5=1,1
Для выборки из 5
клонов по 5 растений в каждом клоне
поправочный коэффициент К = 2,822. Значение
,
вычисленное по формуле (2.1)
Тогда , вычисленное по формуле (2.2) оказалось близким