32. Підкреслити атом вуглецю пентози, до якого приєднані різні групи у рибози та дезоксирибози: с1', с2', с3', с4', с5'.

33. Скільки існує типів динуклеотидних контактів у полінуклеотиді, що складається з залишків чотирьох типів? 16

34. Білково-нуклеїнове впізнання здійснюється переважно через цукрофосфатний остов чи жолобки подвійної спіралі ДНК?

35. Які нековалентні взаємодії майже завжди реалізуються в білково-нуклеїнових комплексах (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

36. Позитивна надспіралізація циркулярної ДНК полегшує розкручування чи закрутку подвійної спіралі?

37. Яку природу мають взаємодії між гістонами та ДНК в нуклеосомі (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

38. Які амінокислотні залишки піддаються ацетилуванню в гістонах? Lys

39. Як називається сукупність послідовностей ДНК в гаплоїдному наборі даного організму? Геном

40. В якому напрямі здійснюється синтез мРНК? 5’-3’

41. Скільки консенсусних послідовностей містить стандартний промотор E coli? 2

42. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази видаляється з неї під час очистки промотору (α, β, β', σ)?

43. Регуляція транскрипції, що залежить від ефективності впізнання термінуючого елементу, є: а) негативною; б) позитивною; в) атенюацією; г) аллостеричною.

44. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів РНК-полімерази ІІ: TFII A, TFII B, TFII C, TFII D, TFII E, TFII F, TFII G, TFII H, TFII I, TFII J, TFII K.

45. С-кінцевий домен РНК-полімерази ІІ на певних етапах транскрипції піддається: а) ацетилуванню; б) метилуванню; в) фосфорилюванню; г) формілюванню; д) не модифікується.

46. Ацетильованими чи деацетильованими є гістони в гетерохроматині?

47. Ацетилування гістонів корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає?

48. Як називається фермент, що здійснює метилування ДНК? ДНК-метилаза

49. МікроРНК приймають участь у (підкреслити одну або кілька можливостей): (а) інактивації транскрипції шляхом взаємодії з мРНК; (б) інактивації транскрипції шляхом взаємодії з РНК-полімеразою; (в) утворенні сплайсосоми; (г) блокуванні білкового синтезу; (д) впізнанні стоп-кодонів

50. Білок ТВР є необхідним елементом системи ініціації транскрипції: (а) РНК-полімеразами І та ІІ; (б) РНК-полімеразами І та ІІІ; (в) лише РНК-полімеразою ІІ; (г) РНК-полімеразами ІІ та ІІІ; (д) усіма еукаріотичними РНК-полімеразами

Білет 34.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Як називається кодуюча ділянка гена? (екзон)

2. Коли здійснюється процесінг мРнк [(а) під час транскрипції; (б) після закінчення транскрипції; (в) під час транспорту мРнк в цитоплазму; (г) після транспорту в цитоплазму]?

3. Розшифруйте позначення snRNA. (мала ядерна РНК)

4. В який позиції антикодона може відбуватися неоднозначне спарювання з кодоном? (перша)

5. Яка неканонічна основа часто зустрічається в першій позиції антикодона ? І

6. Скільки існує типів АРСаз [(а) менше ніж амінокислот; (б) 20; (в) більше ніж амінокислот, але менше ніж антикодонів; (г) більше ніж антикодонів]?

7. В якому напрямі пересувається рибосома вздовж мРНК при трансляції? 5’ – 3’

8. Синтез пептидного зв’язку здійснюється шляхом перенесення (а) амінокислоти на поліпептид, що зростає, чи (б) навпаки?

9. Якої рРНК немає в складі еукаріотичної рибосоми: 5S, 18S, 23S, 28S?

10. На рибосомі антикодонова петля тРНК зв’язана з маленькою субодиницею, великою, чи обома?

11. Підкреслити два сайти рибосоми, до яких приєднуються тРНК: A, B, D, G, P, T.

12. Прискорення якого етапу елонгаційного циклу білкового синтезу забезпечує фактор EF-G (EF2)? транслокація

13. Гідроліз GTP при елонгації трансляції використовується: а) як джерело вільної енергії для забезпечення невигідного процесу елонгації; б) як джерело вільної енергії для синтезу пептидного зв’язку; в) для переключення конформаційних станів рибосоми; г) для фосфорилювання рибосомних білків.

14. Який сайт рибосоми (А, Р чи Е) має більш високу спорідненість до пептидил-тРНК? Р

15. Ініціаторний метіонин в клітинах прокаріотів: а) ацетильований; б) фосфорильований; в) формільований; г) глікозильований; д) не модифікований.

16. Впізнання стартового кодону в еукаріотичній мРНК залежить від послідовності: а) Прибноу; б) Козак; в) ТАТА-бокса; г) Шайна-Дальгарно; д) Бойля-Маріотта.

17. Які елементи мРНК (підкреслити один або кілька) приймають участь в ініціації трансляції в еукаріотів (сар, послідовність Шайна-Дальгарно, 5’-границя першого інтрону, polyA послідовність)?

18. Чи є наявність шаперонів необхідною умовою забезпечення укладання структури білка in vitro? ні

19. Які сполуки є субстратами синтезу ДНК? dNTP

20. В якому напрямі здійснюється синтез лідуючого ланцюга при реплікації? 5’ – 3’

21. Більшість ДНК-полімераз мають також активність: а) 5’-екзонуклеазну; б) 3’-екзонуклеазну; в) обидві екзонуклеазні; г) ендонуклеазну.

22. Який фермент видаляє РНК-праймери на початку фрагментів Оказакі в еукаріотів? РНКаза

23. Як називається ділянка ДНК, що є єдиною реплікативною одиницею і в якій реплікація ініціюється однократно? реплікон

24. Як називається ділянка інінціації реплікації (promoter, origin, enhancer, initiator, opener)?

25. В якій фазі клітинного циклу синтезуються гістони? S

26. Ексцизійна репарація ДНК здійснюється системою: а) mutHLSU; б) uvrABC; в) NHEJ; г) EDRS.

27. Що означає абревіатура PCR. Полімеразна ланцюгова реакція

28. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.

29. Пептидна група по відношенню до водневого зв’язку є: а) донором; б) акцептором; в) і донором, і акцептором; г) не формує водневих зв’язків.

30. Зростання чи зниження вільної енергії є умовою здійснення будь-якого процесу? зниження

31. Якого хімічного елементу немає в складі амінокислот (азот, сірка, кисень, фосфор, вуглець)?

32. Як називається ковалентний зв'язок між нуклеотидами в полінуклетидному ланцюзі (глікозидний, фосфодіефірний, пептидний, цукрофосфатний, полінуклеотидний)?

33. В якій формі існує подвійна спіраль РНК за фізіологічних умов (A, B, C, D, E, F, X, Z)?

34. З великим чи маленьким жолобком взаємодіє переважна більшість білків, що впізнають певні нуклеотидні послідовності? великим

35. Як називаються ферменти, що змінюють топологічний стан циркулярної ДНК? ДНК – топоізомерази

36. Як називається елементарна структурна одиниця хроматину? нуклеосома

37. Яку природу мають взаємодії між гістонами та ДНК в нуклеосомі (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

38. Які амінокислотні залишки піддаються ацетилуванню в гістонах? залишки Lys

39. Як називається частина хроматину, яка значно декомпактизується і є потенційно транскрипційно активною в інтерфазі? еухроматин

40. Яка приблизно частка геному еукаріотів приходиться на кодуючи послідовності (0.02, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 0.95)?

41. Скільки консенсусних послідовностей містить стандартний промотор E coli? 2

42. Підкреслити субодиниці, які входять до складу голо-ферменту бактеріальної РНК-полімерази: α, β, β', σ.

43. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою ІІІ: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.

44. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ зв'язується з ТАТА-боксом (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

45. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ має кілька ферментативних активностей (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

46. Як називається транскрипційний фактор, який стає активним у відповідь на зв'язування зі стероїдним гормоном? Гормоновий рецептор

47. Ацетилування гістонів корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає? активацією

48. Основним наслідком АТР-залежного ремоделювання хроматину є: а) деконденсація хроматину; б) руйнування нуклеосом; в) репозиціювання нуклеосом; г) зміна структури нуклеосом.

49. Скільки полінуклеотидних ланцюгів містить молекула РНК, що запускає процес РНК-інтерференції? 2

50. Гетерохроматиновий стан у центромерах підтримується завдяки: (а) метилування ДНК та специфічних залишків у ацетильованих гістонах; (б) метилування ДНК та специфічних залишків у деацетильованих гістонах; (в) деметилування ДНК та специфічних залишків у деацетильованих гістонах; (г) деметилування ДНК та метилування специфічних залишків у ацетильованих гістонах

Білет 35.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Як називається ділянка гена, що знаходиться між двома кодуючими ділянками? інтрон

2. Де здійснюється процесінг мРНК [(а) ядерний матрикс, (б) ядерна мембрана, (в) РНК-полімеразний комплекс, (г) цитоплазма]?

3. Як називається білково-нуклеїновий комплекс, в межах якого здійснюється сплайсинг мРНК? сплайсосома

4. В який позиції антикодона (перша, друга, третя) може відбуватися неоднозначне спарювання з кодоном?

5. До якої хімічної групи в складі тРНК (-NH, -NH2, -OH, =O, CH3) приєднується амінокислота?

6. В складі аміноацил-тРНК, що зв’язана з рибосомою, амінокислота приєднана до: а) 3’-ОН групи рибози; б) 2’-ОН групи рибози; в) тієї чи іншої в залежності від амінокислоти.

7. Скільки субстратів зв’язує АРСаза? 3

8. Який кінець поліпептиду першим виходить за межі рибосоми при білковому синтезі? N’

9. Більшість активних центрів рибосоми сформована: а) переважно рРНК; б) переважно білками; в) сумісно рРНК та білками.

10. На рибосомі мРНК зв’язана з маленькою субодиницею, великою, чи обома?

11. G-білки дисоціюють від рибосоми: а) втрачаючи GТP; б) у комплексі з GТP; в) у комплексі з GDP; г) у комплексі з GМP.

12. При гідролізі GTP на рибосомі фосфат переноситься на: а) G-білок; б) рибосому; в) пептидил, що синтезується; г) тРНК; д) молекулу води.

13. Гідроліз GTP при елонгації трансляції використовується: а) як джерело вільної енергії для забезпечення невигідного процесу елонгації; б) як джерело вільної енергії для синтезу пептидного зв’язку; в) для переключення конформаційних станів рибосоми; г) для фосфорилювання рибосомних білків.

14. Який етап елонгаційного циклу білкового синтезу є найбільш швидким? транспептидація

15. Чи можлива транслокація рибосоми без участі факторів елонгації? Так (але повільно)

16. Впізнання стартового кодону в еукаріотичній мРНК залежить від послідовності: а) Прибноу; б) Козак; в) ТАТА-бокса; г) Шайна-Дальгарно; д) Бойля-Маріотта.

17. У комплексі з якою молекулою зв’язується з рибосомою фактор елонгації трансляції EF- G (EF2)? GTP

18. Який етап формування структури білка [(а) формування вторинної структури, (б) надвторинної структури, (в) розплавленої глобули, (г) щільна упаковка глобули] потребує найбільшого часу?

19. Нативна структура білків визначається: а) лише амінокислотною послідовністю; б) амінокислотною послідовністю й структурою рибосоми; в) амінокислотною послідовністю й дією шаперонів; г) амінокислотною послідовністю, структурою рибосоми й дією шаперонів.

20. Як називається ланцюг ДНК, що синтезується безупинно під час реплікації? лідуючий

21. ДНК-полімераза Корнберга має також активність: а) 5’-екзонуклеазну; б) 3’-екзонуклеазну; в) обидві екзонуклеазні; г) ендонуклеазну.

22. Який фермент видаляє РНК-праймери на початку фрагментів Оказакі в еукаріотів? РНКаза

23. Як називається ділянка ДНК, що є єдиною реплікативною одиницею і в якій реплікація ініціюється однократно? реплікон

24. Як називається ділянка інінціації реплікації (promoter, origin, enhancer, initiator, opener)?

25. Який фермент використовується для того, щоб запобігти скорочення еукаріотичної хромосоми після реплікації? теломераза

26. Як називається ділянка ДНК, яка утворюється при гомологічній рекомбінації й містить два ланцюги, що не є абсолютно комплементарними один до одного? гетеродуплекс

27. Що означає абревіатура PCR. Полімеразна ланцюгова реакція

28. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.

29. Одна з двох груп, що формують водневий зв'язок, містить атом водню. Як вона називається? донор

30. До чого призводить занурення неполярної групи чи молекули у водне середовище (зниження вільної енергії, зростання ентропії, зниження ентропії, зростання ентальпії, зниження ентальпії)?

31. Які нековалентні взаємодії стабілізують вторинну структуру білків? Водневі зв’язки

32. Підкреслити атом вуглецю пентози, до якого приєднані різні групи у рибози та дезоксирибози: С1', С2', С3', С4', С5'.

33. Між якими елементами нуклеотидів (азотисті основи, пентози, фосфати) реалізуються стекінг-взаємодії в полінуклеотидах?

34. З великим чи маленьким жолобком взаємодіє переважна більшість білків, що впізнають певні нуклеотидні послідовності? Великим

35. Які нековалентні взаємодії, як правило, відіграють провідну роль у білково-нуклеїновому впізнанні (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

36. Як називається елементарна структурна одиниця хроматину? нуклеосома

37. Яка середня густина нуклеосом в хроматині (1/100, 1/200, 1/300, 1/400 нуклеосом на пари основ)?

38. Як називається частина хроматину, яка зберігає високий ступінь компактності і є повністю репресованою в інтерфазі? гетерохроматин

39. Скільки пар основ ДНК міститься в геномі людини (3 тис, 3 млн, 3 млрд, 33 млрд)?

40. Яка приблизно частка геному еукаріотів приходиться на кодуючи послідовності (0.02, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 0.95)?

41. Скільки консенсусних послідовностей містить стандартний промотор E coli? 2

42. Підкреслити субодиниці, які входять до складу голо-ферменту бактеріальної РНК-полімерази: α, β, β', σ.

43. Регуляція транскрипції, що залежить від ефективності впізнання термінуючого елементу, є: а) негативною; б) позитивною; в) атенюацією; г) аллостеричною.

44. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів РНК-полімерази ІІ: TFII A, TFII B, TFII C, TFII D, TFII E, TFII F, TFII G, TFII H, TFII I, TFII J, TFII K.

45. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ забезпечує первинне розкручування подвійної спіралі при ініціації транскрипції (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

46. Ацетильованими чи деацетильованими є гістони в активному хроматині? ацетильованими

47. Ацетилування гістонів корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає? активацією

48. Основним наслідком АТР-залежного ремоделювання хроматину є: а) деконденсація хроматину; б) руйнування нуклеосом; в) репозиціювання нуклеосом; г) зміна структури нуклеосом.

49. Білки HMG забезпечують: (а) утворення стеблоподібної структури на виході з нуклеосоми; (б) загальну лабілізацію структури хроматину; (в) ацетилування ДНК; (г) приєднання хроматинової фібрили до ядерного матриксу; (д) підтримання гетерохроматинового стану

50. У якому процесі під час транскрипції приймає участь фактор TFIIS? ? Індукує нуклеазну активність РНК-полімерази, забезпечує виправлення помилок

Білет 36.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Як називається кодуюча ділянка гена? екзон

2. Як називається процес видалення інтронів з пре-мРНК? сплайсинг

3. Ключову роль в якому процесі відіграють маленькі ядерні РНК? сплайсинг

4. Кепування 5’-кінця мРНК відбувається: а) одночасно з ініціацією транскрипції; б) незабаром після ініціації транскрипції; в) одночасно зі сплайсингом першого інтрону; г) одночасно з термінацією транскрипції; д) після закінчення синтезу пре-мРНК.

5. До якого кінця тРНК приєднується амінокислота? Акцепторне стебло 3’ ССА

6. Амінокислота в аміноацил-тРНК приєднується до: а) 3’-ОН групи рибози; б) 2’-ОН групи рибози; в) тієї чи іншої в залежності від амінокислоти.

7. Як називається реакція, що вона каталізується АРСазою, перенесення АМР з АТР на амінокислоту? Активація амінокислоти з утворенням аміноаденілату.

8. До якого кінця поліпептиду, що зростає, приєднується чергова амінокислота при білковому синтезі? C’

9. Рибосомні білки: а) формують основу структури рибосоми; б) розміщені на поверхні рРНК; в) є обидва типи рибосомних білків.

10. На рибосомі мРНК зв’язана з маленькою субодиницею, великою, чи обома?

11. GTPазна активність G-білків проявляється: а) у відповідь на зв’язування GTP; б) у відповідь на зв’язування тРНК; в) на рибосомі; г) після дисоціації з рибосоми.

12. Гідроліз якого нуклеозид трифосфату здійснюється на рибосомі в процесі білкового синтезу? GTP

13. На яку хімічну групу амінокислоти (аміногрупа, карбоксильна, боковий залишок, Сα-атом) переноситься пептидил при транспептидації на рибосомі?

14. Як називається останній етап елонгаційного циклу білкового синтезу – пересування рибосоми на один кодон та пептидил-тРНК в Р-сайт? транслокація

15. Якій амінокислоті відповідає стартовий кодон AUG? Met

16. Яка субодиниця рибосоми першою зв’язується з мРНК при ініціації трансляції?

17. Фактор елонгації трансляції EF-Tu (EF1) зв’язується з рибосомою у вигляді комплексу з якими двома молекулами? GTP aa – tRNA

18. Як називаються білки, що забезпечують нативне укладання структури білка in vivo? шаперони

19. В якому напрямі здійснюється зчитування інформації з матричного ланцюга в ході реплікації? 3’ – 5’

20. Як називається ланцюг ДНК, що синтезується безупинно під час реплікації? лідуючий

21. Більшість ДНК-полімераз мають також активність: а) 5’-екзонуклеазну; б) 3’-екзонуклеазну; в) обидві екзонуклеазні; г) ендонуклеазну.

22. Який фермент видаляє РНК-праймер і заліковує прогалини між фрагментами Оказакі у E coli? ДНК – полімераза 1

23. Яка структура забезпечує високу процесивність ДНК-полімерази? Ковзний обруч (PCNA)

24. Який фермент є ферментом реплікативного синтезу ДНК в еукаріотів (DNAP I, II, III, α, β, γ, δ)?

25. В якій фазі клітинного циклу синтезуються гістони? S

26. Як називається фермент, що здійснює розділення (resolution) структури Холідея? резольваза

27. Що означає абревіатура PCR. Полімеразна ланцюгова реакція

28. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.

29. Пептидна група по відношенню до водневого зв’язку є: а) донором; б) акцептором; в) і донором, і акцептором; г) не формує водневих зв’язків.

30. Як називаються нековалентні взаємодії, які призводять до агрегації неполярних груп чи молекул? гідрофобні

31. Які нековалентні взаємодії стабілізують вторинну структуру білків? Водневі зв’язки

32. Як називається ковалентний зв'язок між нуклеотидами в полінуклетидному ланцюзі (глікозидний, фосфодіефірний, пептидний, цукрофосфатний, полінуклеотидний)?

33. Між якими елементами нуклеотидів (азотисті основи, пентози, фосфати) реалізуються стекінг-взаємодії в полінуклеотидах?

34. Які динуклеотидні контакти можуть утворитися між двома сусідніми GC парами в ДНК? GC, CG, GG, CC.

35. Які нековалентні взаємодії, як правило, відіграють провідну роль у білково-нуклеїновому впізнанні (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

36. Скільки пар основ ДНК входить до складу корової частинки нуклеосоми (1056, 125, 145, 175)?

37. Яку природу мають взаємодії між гістонами та ДНК в нуклеосомі (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

38. Як називається частина хроматину, яка зберігає високий ступінь компактності і є повністю репресованою в інтерфазі? еухроматин

39. Скільки пар основ ДНК міститься в геномі людини (3 тис, 3 млн, 3 млрд, 33 млрд)?

40. Зростає, знижується чи не змінюється загальна спорідненість до ДНК бактеріальної РНК-полімерази при наявності σ-фактора в складі ферменту? знижується

41. В якому напрямі здійснюється зчитування інформації з ДНК в ході транскрипції? 3’ – 5’

42. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази видаляється з неї під час очистки промотору (α, β, β', σ)?

43. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою ІІ: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.