
- •Конспект лекций по медицинской химии
- •История медицинской химии
- •Поиск и конструирование соединений лидеров
- •Рациональное конструирование соединений лидеров
- •Оптимизация соединения лидера
- •Разработка лекарственного препарата
- •Комбинаторный синтез
- •1. Комбинаторный синтез для оптимизации лекарственного препарата
- •2. Комбинаторный синтез для нахождения лекарственного препарата
- •Жидкофазный синтез
- •Твердофазный синтез
- •Твердая подложка
- •Выбор твердой подложки
- •Линкеры
- •Методы параллельного синтеза Процедура t-bags (чайные пакетики Хоугтена)
- •Автоматический параллельный синтез
- •Методы комбинаторного синтеза Основные принципы
- •Принцип “смешай и раздели”
- •Смесь реагентов
- •Фотолитография
- •Развертка – выделение активных соединений из смеси
- •Микроманипуляция
- •Обратная развертка
- •Последовательное разделение
- •Определение строения активного соединения
- •Прикрепление меток
- •Кодировочные таблицы
- •Ограничения комбинаторного синтеза
- •Планирование и дизайн комбинаторного синтеза Паукообразные молекулы
- •Дизайн молекул лекарств
- •Центроиды или подпорки (scaffolds)
- •Варьирование заместителей
- •Дизайн библиотек для оптимизации лидера
- •Определение активности Высокопроизводительный скрининг
- •Скрининг на грануле
- •Примеры комбинаторного синтеза
- •Ациклические библиотеки
- •Гетероциклические библиотеки
- •Синтез пирролидинов
- •Синтез индолов
- •Судьба лекарства в организме
- •Взаимодействие медиаторных соединений с их рецепторами
- •Передача нервного импульса
- •Агонисты глутамат связывающего сайта
- •Антагонисты глутамат связывающего сайта
- •Агонисты и антагонисты глицинового сайта
- •Агонисты фенциклидинового сайта
- •Ионотропные глутаматные рецепторы ampa – каинатный подтип
- •Агонисты
- •Антагонисты ampa каинатных рецепторов
- •Метаботропные глутаматные рецепторы
- •Физиологически активные соединения, взаимодействующие с серотониновым рецептором
- •Противомикробные препараты
- •Антибиотики
- •Противотуберкулезные препараты
- •Противовирусные препараты
- •Противоопухолевые препараты
- •Анальгетики
- •Наркотические анальгетики
Конспект лекций по медицинской химии
Уфа 2005
Набрал Костин Д.С. (группа В, химфак, БГУ). Он же главный редактор, он же художественный оформитель, он же корректор.
Конспект лекций по медицинской химии. Издание 3‑е (исправленное).
В конспекте лекций по медицинской химии использованы лекции, прочитанные Бигловой Р.З., а также материал из Интернета по комбинаторному синтезу (которые даже чуть-чуть больше, чем те, что читала Биглова Р.З.). Наборщик не отвечает за допущенные преподавателем ошибки в формулах, хотя большинство из них все-таки были проверены из надежных источников (книги по фармацевтике и справочник).
Конспект лекций предназначен для студентов, которые в силу разных причин отсутствовали на лекциях по медицинской химии, не пожелали законспектировать лекции или не успевали это делать, а также для тех, кто плохо слышит и видит (особенно с последней парты) и тех, кто просто хочет на более качественном уровне подготовиться к семинарам (не каждый сможет разобрать свои каракули).
Кроме того, наборщик надеется, что данное пособие станет неплохим подспорьем в изучении медицинской химии, особенно в связи с его актуальностью (другого материала по этой тематике в библиотеке нет, а в других местах найти трудно).
Наборщик выражает благодарность тем, кто не пожалел своей тетради для него (т.е. меня), в частности Бурхановой Альбине и Батыршину Ильнуру «за разборчивый подчерк и полные записи лекций».
Посвящается всем студентам стершим руки по самые локти, пытаясь успеть записать все лекции по медицинской химии.
Наборщик примет все замечания по поводу правильного написания тех или иных терминов, а также формул по e-mail: kostindenis@mail.ru и лично.
Подписано к печати 16.10.2005
Отпечатано на домашнем лазерном принтере
®Костин и Ко. All rights reversed.
История медицинской химии
Впервые курс медицинской химии был прочитан в МГУ в 1998 году. Как наука медицинская химия сформировалась к 1970 году.
В 19 веке медицинская химия начала прогрессировать. Были выделены средство против малярии из хинного дерева, морфин, салициловая кислота (противомикробное средство).
В 1888 году Байер впервые в мире поставил промышленное производство фенацетина
а в 1899 году – производство аспирина
К этому времени люди научились анализировать белки, жиры и углеводы, которые являются основными мишенями действия лекарственных препаратов.
В 1910 году Пауль Эрлих изобрел средство от сифилиса – сальварсан
Это обусловило возникновение концепции химиотерапии. Концепция химиотерапии предполагает не просто применение химических веществ для лечения патологий, но и необходимость модификации структур предполагаемых лекарственных соединений с тем чтобы максимально эффективно воздействовать на пораженный орган.
Эрлих также разработал теорию рецепторов и структурных изменений физиологически активных органических соединений, происходящих при их взаимодействии с рецепторами. Эта теория явилась отправной точкой для медицинской химии.
В 1928 году был открыт пенициллин, а в 1944 году Ваксберг открыл стрептомицин. Так началась эра антибиотиков.
В 60-ые годы были разработаны психотропные препараты: аминазин, мекробамат (транквилизатор).
а также резерпин, метилдофа (сердечно-сосудистые препараты).
Все эти препараты были открыты «на ощупь». Ученые продолжали искать ФАВ.
ФАВ (БАВ) – физиологически (биологически) активные вещества.
С другой стороны, проникновение компьютерных методов в органическую химию привело к бурному развитию методов расчета структуры молекул (геометрия и конформация, заряды, молекулярные орбитали, электростатические потенциалы, топологические индексы и т.д.). В силу этого количественное описание структурных особенностей даже очень сложных молекул биологического уровня становится обычным инструментом химика-органика.
В 70-ых годах была создана методологическая основа для возникновения и использования рациональных подходов к синтезу ФАВ, которая называется drug design. Это привело к формированию медицинской химии с ее современным аппаратом.
Медицинская химия – междисциплинарная наука, в ней задействованы органическая, биоорганическая, фармацевтическая химии, фармакология и биохимия. Но они не дают ответа на вопросы: «Какую структуру надо синтезировать, чтобы создать ФАВ?», «Какую структурную формулу спрогнозировать для конкретного кандидата в лекарство?». Эти вопросы являются центральными для медицинской химии.
Предметом медицинской химии является поиск и структурный дизайн ФАВ, выявление взаимосвязи химической структуры и физиологической активности и решение обратной задачи «строение-свойство», а именно конструирование необходимых структур обладающих заданным свойством.
Процесс поиска и конструирования включает в себя три основные стадии:
Поиск соединения лидера (lead compound).
Оптимизация соединения лидера.
Разработка лекарственного препарата.
Стратегия поиска лекарственных препаратов зависит от накопленных знаний о препаратах, мишени, их взаимодействия и т.д. Под названием «мишень» понимают клетки, ткани, органы, функциональные системы, ферменты, акцепторы, рецепторы.
Рецепторы по Эрлиху – это небольшой участок химически определенный на большой молекуле протоплазмы, участвующей в питании и метаболизме клетки, и способный связывать специфические антигены или лекарственные вещества.
Антигены – вещества, которые воспринимаются организмом как чужеродные и вызывают специфический иммунный эффект.
Рецепторы – главным образом белковые структуры, функции которых заключаются в узнавании химического сигнала и последующей его трансформации в адекватный ответ клетки. Другими словами рецепторы представляют собой материальные субстраты активности и чувствительности клеток.
Возможны четыре ситуации при начале поиска лекарственного средства:
Структура как рецептора, так и лиганда неизвестны. Рецептор является мишенью лекарственного вещества в организме, а понятие лиганд предполагает любое эндогенное (endon – внутри) соединение, взаимодействующее с этим рецептором в организме.
Известна только структура рецептора.
Известна только структура лиганда.
Известна структура как рецептора, так и лиганда.