
- •Биохимия
- •Содержание
- •1 Введение
- •1.1 Предмет биохимии
- •1.2 Области исследований биохимии.
- •История развития биохимии.
- •1.4 Методы изучения
- •1.5 Значимость биохимии как науки.
- •2. Аминокислоты, их строение и свойства
- •2.1 Элементарный состав белков.
- •2.2 Аминокислотный состав белков
- •2.3 Классификация аминокислот
- •1) Классификация аминокислот по r-группам
- •2) Классификация аминокислот по функциональным группам
- •2.4 Общие химические свойства
- •Электрофильно-нуклеофильные свойства.
- •1 Стадия.
- •2 Стадия
- •3. Строение и свойства белков. Методы их выделения и очистки
- •3.1 Содержание белков в органах и тканях
- •Биологические функции белков
- •Каталитическая (ферментативная) функции
- •3.2.2 Транспортная функция белков
- •Рецепторная функция:
- •3.2.4 Защитная функция
- •Структурная функция
- •Двигательные белки
- •3.3 Классификация белков
- •3.4 Структуры белка
- •Третичная структура белка. Под третичной структурой белка подразумевают пространственную ориентацию полипептидной спирали или способ укладки полипептидной цепи в определенном объеме.
- •3.5 Физико-химические свойства белков
- •Химия нуклеиновых кислот
- •4.1 Методы выделения нуклеиновых кислот.
- •4.2 Химический состав нуклеиновых кислот
- •4.3.Структура нуклеиновых кислот
- •4.4 Первичная структура нуклеиновых кислот
- •4.5 Вторичная структура нуклеиновых кислот
- •4.6 Третичная структура нуклеиновых кислот
- •4.7 Транспортные рнк
- •4.8 Матричная рнк
- •5. Ферменты
- •Характеристика ферментов, их свойств
- •Отличительные признаки ферментативного и химического катализа.
- •5.3 Пространственное строение
- •5.4 Функции коферментов и простетических групп
- •5.4.4 Кофермент ацетилирования (коэнзим а, или просто КоА)
- •5.5 Классификация и номенклатура ферментов
- •5.6 Механизм действия ферментов
- •6. Ферментативная кинетика
- •6.1 Уравнения Михаэлиса-Ментен и Лайнуивера-Бэрка
- •Факторы, определяющие активность ферментов. Зависимость скорости реакции от времени
- •6.3 Влияние концентраций субстрата и фермента на скорость ферментативной реакции
- •6.4 Активирование и ингибирование ферментов
- •6.5 Применение ферментов
- •7 Химия липидов
- •7.1 Биологическая роль и классификация липидов
- •7.2 Жирные кислоты
- •7.3 Глицериды (ацилглицеролы)
- •7.4 Фосфолипиды
- •7.5 Сфинголипиды (сфингофосфолипиды)
- •7.6 Стероиды
- •Химия углеводов
- •8.1 Биологическая роль углеводов
- •Классификация углеводов
- •Моносахариды
- •Основные реакции моносахаридов, продукты реакций и их свойства.
- •Олигосахариды
- •8.6 Полисахариды
- •8.7 Гетерополисахариды
- •9 Витамины
- •9.1 Классификация витаминов
- •9.2 Витамины, растворимые в жирах.
- •9.2.1 Витамины группы а
- •9.2.2 Витамины группы d
- •9.2.3 Витамины группы к
- •9.2.4 Витамины группы е
- •9.3 Витамины, растворимые в воде
- •9.3.1 Витамин b1
- •9.3.2 Витамин в2
- •9.3.3 Витамин рр
- •9.3.4 Витамин в6
- •9.3.5 Биотин (витамин н)
- •9.3.6 Фолиевая кислота
- •9.3.7 Витамин в12
- •9.3.8 Пантотеновая кислота (витамин в3)
- •9.3.8 Витамин с
- •9.3.9 Витамин р
- •10. Гормоны
- •10.1 Общее понятие о гормонах
- •10.2 Номенклатура и классификация гормонов
- •10.3 Гормоны гипоталамуса
- •10.3 Гормоны гипофиза
- •10.4 Вазопрессин и окситоцин
- •10.5 Меланоцитстимулирующие гормоны (мсг, меланотропины)
- •10.6 Адренокортикотропный гормон (актг, кортикотропин)
- •10.7 Соматотропный гормон (стг, гормон роста, соматотропин)
- •10.8 Лактотропный гормон (пролактин, лютеотропный гормон)
- •10.9 Тиреотропный гормон (ттг, тиротропин)
- •10.10 Гонадотропные гормоны (гонадотропины)
- •10.11 Липотропные гормоны (лтг, липотропины)
- •10.12 Гормоны паращитовидных желез (паратгормоны)
- •10.13 Гормоны щитовидной железы
- •10.15 Гормоны поджелудочной железы
- •10.16 Гормоны надпочечников
- •10.17 Половые гормоны
- •10.18 Гормоны вилочковой железы (тимуса)
- •10.19 Молекулярные механизмы передачи гормонального сигнала
- •Аденилатциклазная мессенджерная система. Наиболее изученным является аденилатциклазный путь передачи гормонального сигнала. В нем задействовано минимум пять хорошо изученных белков:
- •11. Обмен веществ и энергии
- •11.1 Понятие метаболизма.
- •11.2 Биологическое окисление
- •11.3 Атф (аденозинтрифосфорная кислота)
- •12. Обмен углеводов
- •12.1 Переваривание и всасывание
- •12.2 Промежуточный обмен
- •12.2.1 Общая характеристика
- •2 Молекулы пвк (2 молекулы по 3 атома углерода)
- •12.2.2 Анаэробный распад
- •I этап 1. Фосфорилирование (активация) глюкозы:
- •7. Гидролиз 3 фосфоглицероилфосфата
- •8. Изомеризация 3-фосфоглицерата
- •III этап 9. Дегидратация 2-фосфоглицерата
- •12.2.3 Аэробный распад
- •13 Синтез углеводов
- •13.1 Строение и синтез гликогена
- •13.2 Регуляция синтеза и его нарушения
- •Глюконеогенез
- •1 ,3 Дифосфоглицерат
- •14 Обмен липидов
- •14. 1 Метаболизм триглицеридов
- •14.2 Промежуточный обмен
- •14.2.1 Превращение триглицеридов и окисление глицерина.
- •14.2.2 Окисление жирных кислот
- •14.2.3 Биосинтез жирных кислот
- •14.2.3 Превращения глицерофосфатидов
- •Обмен белков
- •15.1 Значение белков в организме
- •15.2 Переваривание и всасывание белка
- •Промежуточный обмен
- •Биосинтез белка
- •Дезаминирование аминокислот
- •Переаминирование (трансаминирование) аминокислот
- •Декарбоксилирование аминокислот
- •16 Обмен сложных белков
- •16.1 Обмен нуклеопротеидов
- •17.2 Обмен гемоглобина
- •17 Обмен белков. Цикл мочевины
- •17. 1 Конечные продукты распада аминокислот
- •17. 2 Синтез мочевины, орнитиновый цикл
- •17.3 Обмен отдельных аминокислот
- •18 Взаимосвязь обмена белков, жиров и углеводов. Обмен воды и минеральных солей.
- •18.1 Взаимосвязь обмена углеводов и жиров.
- •18.2 Взаимосвязь обмена углеводов и белков.
- •18.3 Взаимосвязь обмена белков и жиров.
- •18.4 Понятие о гомеостазе.
- •18.5 Водный обмен и его регуляция.
- •18.6 Минеральный обмен
Основные реакции моносахаридов, продукты реакций и их свойства.
Реакции полуацетального гидроксила. Уже отмечалось, что моносахариды как в кристаллическом состоянии, так и в растворе в основном существуют в полуацетальных формах. Полуацетальный гидроксил отличается большей реакционной способностью и может замещаться другими группировками в реакциях со спиртами, карбоновыми кислотами, фенолами и т.д.
Продукт реакции называют гликозидом. Соответственно α- и β-изомерам моносахаридов существуют α- и β-глюкозиды. Например, при реакции метилового спирта с глюкозой (допустим, в β-пиранозной форме) в присутствии неорганических кислот образуется продукт алкилирования метил-β-D-глюкопиранозид:
При действии на β-D-глюкопиранозу уксусной кислотой образуется продукт ацилирования ацетил-β-D-глюкопиранозид:
Ацилированию и метилированию способны подвергаться и остальные группы моносахаридов, но при намного более жестких условиях. Если в реакцию вступают спирты, фенолы или карбоновые кислоты, продукты реакции называют О-гликозидами. Следовательно, метил-β-D-глюкопира-нозид и ацетил-β-D-глюкопиранозид являются О-гликозидами (связь осуществляется через кислород). Природные О-гликозиды, большинство из которых образуется в результате жизнедеятельности растений, существуют преимущественно в β-форме.
Важным классом гликозидов являются N-гликозиды, в которых глико-зидная связь осуществляется через азот, а не через кислород . N-гликозиды рассматривают как производные моносахаридов, у которых гликозидная часть молекулы связана через атом азота с радикалом органического соединения R, не являющегося углеводом. Как и О-гликозиды, N-гликозиды могут быть построены как пиранозиды или как фуранозиды и иметь α-и β-форму:
К N-гликозидам принадлежат исключительно важные в обмене веществ продукты расщепления нуклеиновых кислот и нуклеопротеидов (нуклеотиды и нуклеозиды), АТФ, НАД, НАДФ, некоторые антибиотики.
Реакции с участием карбонильной группы. Линейная форма в кристаллических препаратах моносахаридов и их растворах присутствует в незначительных количествах, но ее участие в таутомерном равновесии обеспечивает моносахаридам все свойства, присущие альдегидам (в альдозах) или кетонам (в кетозах).
Окисление моносахаридов. Обработка альдоз слабыми окислителями приводит к превращению альдегидной группы в положении атома С-1 в карбоксильную группу с образованием так называемых альдоновых кислот. Альдоновой кислотой может быть D-глюконовая кислота, которая образуется при окислении альдегидной группы D-глюкозы. Фосфорилированная форма D-глюконовой кислоты играет важную роль в качестве промежуточного продукта углеводного обмена. Другой пример – D-галактоновая кислота – продукт окисления альдегидной группы D-галактозы.
В альдуроновых, или уроновых, кислотах окислена (с образованием карбоксильной группы) первичная спиртовая группа, а альдегидная группа остается неокисленной. Уроновая кислота, образующаяся из D-глюкозы, носит название D-глюкуроновой кислоты, а образующаяся из D-галактозы – D-галактоуроновой кислоты.
Уроновые кислоты весьма важны в биологическом отношении, многие из них являются компонентами полисахаридов.
Восстановление моносахаридов. Моносахариды легко гидрируются по связи С—О и при этом превращаются в многоатомные спирты (сахароспирты). D-глюкоза, например, образует спирт сорбит, а D-манноза – маннит. Такого рода восстановление может осуществляться и ферментативным путем.
Фосфорнокислые эфиры углеводов. Моносахариды, этерифицированные фосфорной кислотой, играют исключительно большую роль в обмене веществ. Первым обнаруженным в природе фосфорнокислым эфиром углевода был фруктозо-1,6-дисфосфат, который выявили при брожении Л.А. Иванов, а также А. Гарден и В. Юнг в 1905 г. В последующие годы из природных источников выделено много новых моно- и дисфосфатов моносахаридов, в частности большое количество фосфатов кетоз, например рибулозо- и ксилулозофосфаты. В настоящее время установлена важная роль во многих биохимических процессах наряду с фосфатами гексоз и пентоз также фосфатов гептоз (в первую очередь седогептулозо-7-фосфата) и фосфатов тетроз (эритрозо-4-фосфата и др.).
Большой интерес представляют пирофосфорные эфиры моносахаридов, например 5-фосфорибозил-1-пирофосфат (ФРПФ), который участвует в синтезе пуриновых и пиримидиновых нуклеотидов.
Ниже приводятся формулы некоторых фосфатов сахаров, играющих важную роль в обмене веществ:
Дезоксисахара. У дезоксисахаров одна из гидроксильных групп, присоединенных к кольцевой структуре, замещена на атом водорода. Они образуются при гидролизе ряда соединений, играющих важную роль в биологических процессах. Примером может служить дезоксирибоза, входящая в состав нуклеиновых кислот (ДНК):
Аминосахара. Это производные моносахаридов, гидроксильная группа которых —ОН замещена аминогруппой —NH2. В зависимости от положения аминогруппы (при атомах углерода) в молекуле аминосахара различают 2-амино-, 3-амино- и 4-аминосахара и т.д. По числу аминогрупп выделяют моноаминосахара и диаминосахара.
Аминосахара обладают всеми свойствами аминов, обычных моносахаров, а также специфическими свойствами, обусловленными пространственной близостью гидроксильных и аминных групп.
В организме человека и животных наиболее важными аминосахарами являются D-глюкозамин и D-галактозамин:
Аминосахара входят в состав мукополисахаридов животного, растительного и бактериального происхождения, являются углеводными компонентами различных гликопротеинов и гликолипидов.