- •Часть 11................................................................................26
- •Часть 12
- •Часть 2
- •Часть 3...................244
- •Часть 12
- •Часть 2
- •Часть 3
- •1. Философия и логика континуума и диофан-товости в биологии и генетике.
- •5. Краткий перечень фактов, на основе кото-рых строится обоснование необходимых мо-тивационных целей для трактовки сличения выводов из теории с наблюдаемыми опыт-
- •Часть 11
- •1. Нематода с.Elegans как объект
- •2. Нобелевские премии
- •3. Перечень прилагаемых ,
- •8. По поводу обнаруженного микроритма митозов приведены гипотезы, направленные на уточнение
- •5. Конфигурация дробления
- •6. Подробное описание
- •6.1. Таблица(№1) клеток
- •7. Таблица № 2 шифров событий
- •8. Эмбриональное развитие c.Elegans.
- •8.1.Актуальность поиска «кванта вре-
- •8.2. Две промежуточных стадии развития
- •9.1 Структурнодинамическое
- •9.2. 55 Пар сестринских нейронов
- •9.3. 55 Клеток, еще делящихся
- •10.Клеточные деревья и их фрагменты,
- •10.1. Глотка нематоды с. Elegans–и дта-57
- •10.2. Стадия 57 клеток
- •10.3. Стадия развития эмбриона, на
- •10.4. Клеточное дерево нервной(*с.110)
- •11. Моделирование динамики развития
- •12. Разбиение всего дерева развития
- •13. Комментарии к разбиению
- •14(16-Ть)клонов всех поклеточных делений
- •14. Динамика внутриклональной
- •15. Вариант протоколов решений для
- •16. Уравнения дифференцировки и
- •3. Посмотрим теперь, какие из них могут разлагаться на обратные квадраты. Для этого, используя разложе-ние на простые множители их корней, определим ком-бинаторикой
- •12. Перейдем к рассмотрению возможного использования квадрата «225».
- •18. Аналогично исключены квадраты «100», «121»- они оставляют меньше объектов из 277 и имеют еще большие возможные s, чем квадрат «25».
- •21. Число «9» не может использоваться больше одного раза и только вместе с одним квадратом «81».
- •2. Число квадратов «9» не более одного;
- •3. Остаток равен «0».
- •Часть 12
- •17. Волны митозов,
- •18. Периодизация событий митозов,
- •19. Одномерная периодичность -фаза - и
- •20. Уточнения значений времени
- •784 : , Которая
- •23. Исторический экскурс
- •Часть 2
- •31.Архитектура каскадной реализации
- •31.1 Вступление
- •31.2 Информация на 1-м уровне-вида и гена:
- •31.3 Гомеодомены
- •31.5. Повторы
- •1. Notch-повторы. В [41-37] приведены весьма ценные данные о с-богатых 36 повторах с 55-58-ю позициями нейрогенных локусов дрозофилы, отвечающих за синтез egf -подобных белков.
- •31.6. Обработка и анализ данных
- •31.7. Циклины и кинезины
- •31.8.Повторы
- •Часть 1: группы b7 и 94 , 93 из b6 (на 57 позициях:1-34)
- •Часть 2: группы b1,4 и 92 , 91 из b6 (на 57 позициях: 35-57)
- •2.Далее обобщаемые данные и модельные сопостав-ления мы приведем в кратком изложении.
- •31.9. Заключение
- •32. Примеры на общую динамику
- •32.1. Протекание беременности
- •32.2. Геоселитебные системы
- •32.3. Универсальный архетип
- •32.4 Геоселитебные системы
- •Часть 3
- •33. Применение решений уравнений
- •33.1. Пары нуклеозидов
- •33.1.1. Общая характеристика
- •1. Пиримидиновые основания
- •2. Пуриновые основания.
- •33.1.2. Разбиения атомов на группы
- •33.2.1. Общая характеристика фермента
- •33.2.2 Разбиение рнк-фермента
- •33.3. Церамид гликосфинголипидов
- •33.3.1. Общая характеристика
- •33.3.2. Разбиение радикала церамида
- •33.3.3. Обсуждение результатов,
- •34. Антибиотик валиномицин
- •34.1. Общая характеристика
- •34.2. Круговая диаграмма 20 аминокислот,
- •34.3. Молекулы цитохрома с
- •34.4. Общая характеристика молекул
- •34.5. Разбиение консервативной части
- •34.6. Обсуждение результатов
- •34.7. Разбиение 112 аминокислот
- •34.9...........Последовательность
- •34.9.1. Общая характеристика гемоглобина
- •34.9.3. Задача
- •34.9.4. Разбиение аминокислотных
- •34.9.5. Общая характеристика ферредоксинов
- •35. Применение решений уравнений
- •35.1. Витамин в12, его кофермент и дта-57
- •35.2. Молекула монактина
- •35.3. Молекула хлорофила
- •35.4. Гем гемоглобина
- •36. Классы молекул избирательно приб-лижающихся к распределению дта-57
- •36.1. Тройки аминокилотных остатков
- •36.2. Разбиение атомов на группы
- •36.2.0. Предварительное обсуждение
- •36.2.1. Примеры разбиений
- •36.2.2. Обсуждение
- •1. W1 (1атом n) - в тройках wrg (1), wkg(2), wyg (3),
- •36.3. Структура тРнк и дта-57
- •36.4. Еще примеры: порфирины,
- •36.4.1 Порфины
- •36.4.2. Стероиды
- •36.4.3. Фосфолипиды
- •36.4.3.1 Общая характеристика фосфолипидов.
- •37. Редукция биологических структур
- •37.1. Преонкосфера
- •37.3. Молекула коллагена
- •37.4. Разбиение аминокислотных
- •3. Среди чисел 6-го столбца последовательных событий (-деления или апоптоза-смерти клеток) нет одинаковых значений чисел.
- •7.6.1. Динамика внутриклональной органи-
- •75.Конюхов б.В. Клональный анализ онтогенеза млекопитающихся. Успехи совр.Биол.1989.Т.107, №. 2, с. 274-288.
- •77. Макеев а. В. Основы биологии. Ч.1 :Уч. Пособ./мфти.М.,1996. 244 с.Ил.
- •79. Санников-Проскуряков с.С. Космология и живая клетка. Физика, №5, 2004, с. 27-37.
- •1. Поиск решений диофантовых уравнений
- •1.1. Простейшие решения
- •1.2. Способы «размножения» числа решений с
- •1.3. Способ перебора всех возможных
- •1.4. Избранные совокупности решений
- •1.4.1. Сумма bs в области существования
- •1.4.2. Надстройка «56» над решениями
- •1.4.3.Набор решений
3. Перечень прилагаемых ,
ВЫБОРОЧНЫХ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ СВЕДЕНИЙ
ПО
ЭМБРИОНАЛЬНОМУ РАЗВИТИЮ
НЕМАТОДЫ С.Elegans
В этой книге приведены только востребованные нами при теоретическом анализе сведения по развитию почвенной нематоды С.Elegans. Клон С.Elegans изучался в двух вариантах, отличающихся по полу животного – были изучены самец и гермафродит - очень близкие друг к другу на стадии эмбрионального развития. Необходимые отличия отконтрастированны в приводимом здесь по [2] материале. Здесь последовательно даны:
1. схематичное дерево развития со всеми делениями, с указанием делящихся после вылупления из яйца (кутикулы) клеток и всех смертей; времена делений и смертей клеток на этой схеме не даны, но даны в нижеследующей таблице; специализация клеток представлена упрощенно на приведенном схематично дереве с помощью специальных номеров, объединяющих клетки по типу в большие группы;
2. более подробные спецификации клеток по функции с указаниями их пространственных перемещений приводятся нами в таблице групп клеток; ориентации осей клеточных дроблений понадобятся нам один раз при анализе результатов и их индексы даны вместе с нумерацией групп клеток;
3. времена делений не были приведены в табличной форме в статье [2], но были восстановлены по приведенном там масштабным по времени рисункам с помощью многократных измерений штангенциркулем и усреднением (ЦаревО. Б., Лянгасов Ю.А., Калмыков Д.В. ). Таблица времен делений и смертей клеток приводится с указанием оригинальной шифровки событий [Царев О.Б.] и привязок каждого события к предыдущему и последующим событиям на клеточном дереве эмбрионального развития С.Elegans.
Для удобства пользования экспериментальным материалом такого объема и сложной внутренней структуры, как клеточное дерево нематоды нами даны многочисленные перекрестные ссылки и дублирование информации между таблицей групп клеток (таблица 1) и таблицей времен событий (таблица 2) и внутри таблицы времен событий. Так, информация, заданная шифрами таблицы времен и шифрами пространственных дроблений, позволяет каждая в отдельности реконструировать вид ветвлений дерева. Ссылки внутри таблицы времен на предшествующие и последующие по времени события в сочетании с удобными шифрами событий дает возможность легко находить и исключать возможные опечатки.
Если необходимая для анализа данных информация опущена в основном перечне экспериментального материала, то она будет дана в последующем. Так, например, при анализе данных отдельно приведено пространственное расположение клеток глотки эмб-риона С.Elegans, взятое из [44]. Информация о переме-щениях и положениях клеток внутри животного в [2,44] дана, но нами не воспроизводиться, т.к. не испо-льзуется при анализе данных(-кроме морфогенеза).
4. ПРЕДВАРИТЕЛЬНЫЕ ЗАМЕЧАНИЯ
К ОБРАБОТКЕ ПРИВОДИМЫХ
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ
РЕЗУЛЬТАТОВ
Последовательно в книге обобщаются следующие полученные нами в разное время теоретические результаты:
1.
общая динамика появления клеток в
эмбрионе нематоды укладывается в
модельный интервал [12-13,20-21]х
с
шагом
равным
учетверенному обнаруженному микроциклу
митозов
;
подобная кратность циклов хорошо с
внешней стороны соотносится с удвоением
периодов в аттракторах Фейгенбаума;
микроцикл митозов в делениях клеток
нематоды имеет период около 5.723 минут;
приводится подробный рисунок с временной
разверткой этого микроцикла [ 9, 11].
2. динамика появления клеток в периоде [12-13,20-21] имеет характерные особенности – три макроволны митозов - совпавшие с особенностями развития на аналогичном модельном интервале, примененном к развитию человеческого плода [13] и гелиоселитебных систем [14] ;
3. структура клеточных ветвей клеток, образующих глотку, описывается решениями уравнений диффе-ренцировки, при этом группы bs выделены по форме ветвей, а группы bs,I по специализации и пространст-венному расположению [9-11]; аналогичный результат [9,12] был затем получен нами на дереве развития актинии Ascidian C. Intestinalis [21];
4. все окончания клеточного дерева эмбриона C.elegans описаны с помощью решений уравнений дифференцировки, при этом глотка описывается решениями при s равных от 1 до семи, а остальная часть – избранными решениями при s от 8 до 16 [7];
5. обнаружено большое количество групп клеток, имеющих численность в своей группе, кратную инте-ресующему нас диапазону от 52 до 57 (110 парных ней-ронов, (55х2); 113 умирающих за время эмбриональ-ного развития клеток, (56+57); 57 делящихся после вылупления эмбриона С.Elegans нейробластов; 85 кле-ток гиподермиса, образующихся за счет 55 последних в клеточных линиях делений; 91 клетка мускулатуры, образующихся также в результате 55 последних в кле-точных линиях делений ; 80 клеток глотки у эмбриона нематоды также образуются в результате 55 делений, а с учетом умирающих на ветвях глотки клеток – за 57 событий [3,9]);
6. временная развертка части из перечисленных групп клеток имеет структуру, предсказываемую уравнениями дифференцировки (ДТА-57) – это деления 55 парных нейронов и клетки, делящиеся после вылупления [3,9];
7. как альтернативный вариант описания клеточных клонов нематоды имеется попытка разбить все дерево эмбриона C.Elegans на 14 частей численностью от 54 до 57 клеток, описываемых многократным применением решений уравнений дифференцировки в области их единственного решения – при s меньших 8 [9,10] ; при его описании удобны шифры ориентации пространственных дроблений (поляризации) клеток;
