7.6.1. Динамика внутриклональной органи-
зации нематоды С.еlegans [8,Л-1] -
"атома водорода" по Дж. Уотсону для
теоретической биологии.
Здесь мы фиксируем : нам удалось так разбить все 784 события (это число на опыте определено абсолютно точно) и все клетки у гермафродита С.elegans на клоны (события - на группы ), что уже внутриклональная динамика и её структура (структура согласуется с моделью лучше) весьма неплохо уложилась в следствия ДМЯ структурного характера: все 14 (четырнадцать) клонов с численностями клеток и событий (к ним относятся 113* событий смерти клеток и 113 событий рождения их сестринских клеток) 2 57 + 2 54 + 2 55 + 1 56 + 1 57 + 1 56 + 1 57 + 2 57 + 2 56 = 784 - указаны кратности клонов- разбились на группы из (2 5) + 36 + 16 = 54 57, которые, в свою очередь, динамически
и структурно разбились на элементарные клоны, или ЭКЛОНЫ: 36=91+92+93+41+42+1,-6 слагаемых,
16=41+42+43+11+12+13+14,-7 слагаемых,
как это предсказано ДМЯ в [1,2, Л-3]. Собственно ДМЯ предполагает разбиение только последней 4-й девятки и последней в 16-ке четвёрке на единицы. Но наши данные (см. Таблицу 1) свидетельствуют об обратном: все девятки разбиваются на аналогичные эклоны. В принципе, все клетки перед вылуплением индивидуализированы, но их предыстория имеет явный структурированный, групповой характер. Таким образом, ДМЯ можно пополнить принципом револьверной симметрии.
Последнее деление происходит на 784 0.5 минуте, при этом наступает именно 784 событие (у самца пос-леднее 782 событие происходит на 782 0.5 минуте также !). Отметим, что полное описание уже опубли-кованных (депонированных [12, Л-1]) таблиц - там они занимают 66 стр.- потребует еще несколько сотен стра-ниц. Здесь на одном из самых важных примеров, на нейронах специального вида (они делятся только на нейроны, нейробласты, в последнем делении получа-ются сразу по два нейрона), сошлёмся на саму про-цедуру разбиения на эклоны (см.стр.124-129) и приве-дём протокол решений развития одного клона "55n-2", (с разбивкой 5-го шага на два промежуточных «под-шага», s0 = 1), 110 одних нейробластов, [8]): Таблица 3
s s-1
-bs + b 2as-1 2as-1+ s bs as s |
0 --
-- -- -- -- 1/2 1/2 |
1 0
0 +0 1 1 1 1 |
2 1
-1 +0 2 2 1 2 |
3 2
-0 +0 2 2 2 3 |
4 3
-0 +0 4 4 4 5 |
5 4
-2 -2 +0 +0 8 12 8 12 6 10 9 15 |
6 5
-0 +2 20 22 22 25 |
7 6
-36 +0 44 44 8 47 |
8 7
-16 +0 16 16 0 55 |
ЛИТЕРАТУРА
11. Царев О.Б. Модель динамики роста и дифференци-ровки клеточной популяции // Онтогенез. 1980. 11.№4.387.
12. Tsarev O.B. Dynamic model of the growth and Differentiation of the cell Population. I. Basic concepts and possibilities for comparing theory with experience. The Soviet J. Dev. Biol. N.Y.1981,May,p.227-236.
2. Sulston J.E. et.al. The Embryonic cell lineage of the Nematode C. elegans. Dev. Biol. 1983. V.100, p.64-119.
3. Стоянов А.В., ЛянгасовЮ.А., Калмыков Д.В., Царев О.Б. Варианты диофантовой модели развития живой системы. Сб. тр. 11. конф. молодых. уч.Ч.1. МФТИ. Депонир. ВИНИТИ. 1986. №5696-В86, с. 183-203.
4. Стоянов А.В. Исследования вариантов диофанто-вой модели развития живой системы. Диплом. МФТИ. 1986. 50 с.
5. Лянгасов Ю.А. Исследование диофантовой модели роста структурно-динамической гетерогенности сложной живой системы. Диплом. МФТИ. 1982. 95 с.
6. Царёв Р.О. Сквозные закономерности и диофантовые аттракторы.1. Аттракторы 13-21 и 52-57 в динамике и структуре адронов, атомов, биомолекул и поклеточных деревьев развития.М.: МГАПИ // ПМТФ.-2002.-Т.2. -№1.-С.17-42.
7. Царёв Р.О. Уравнение дифференцировки и клеточное развитие эмбриона нематоды С. еlеgаns - М.: МФТИ. Сб. Моделирование процессов управления и обработки информации -1992. с.55-64.
8. Царёв Р.О. Прямые и обратные задачи биоструктуродинамики.//Прикладная математика и техническая физика: теоретический и научно-практический журнал./ МГАПИ.; 2000. №3 -с.41-70.
9. Царев Р.О. Сравнительное изучение на основе диофантовой модели развития структурных и динамических особенностей биологических систем различной сложности // Деп.ВИНИТИ, №3681 -В91, 13 сент. 1991.243 с.
10. Царев Р.О. Динамика развития клеточных клонов нематоды С.еlegans // В сб. Физические взаимодействие в химически реагирующих системах. М.: МФТИ. 1990. 100.
11. Царев Р.О. Периодизация динамики развития нематоды Ценорабдиды элегантной // Труды XV конф. мол. уч. Моск. физ.-тех ин-та. М.1990. Ч.1.56. Деп. ВИНИТИ, №6174-В90, 12 дек.1990.
12.Царев Р.О. Архитектура каскадной реализации линейной программы ДНК. Физические взаимо-действия в химически реагирующих системах. Сб. МФТИ. М.: 1991. -с.96-111.
13. Царев Р.О. , Лянгасов Ю.А. Динамика иммунного конфликта мать-плод.// Сб.XIV конф. мол. уч. Моск. физ.-техн. ин-та. Ч.1. с.101. Деп. ВИНИТИ. №-В89. 11 сент.1989.
14. Царёв Р.О. Формирование селитебных геосистем в сопоставлении с одной моделью и объектами биологии: единый архетип развития? // Физические взаимодействия в химически реагирующих системах. Сб. МФТИ, М., 1993. -с. 126-130
15. Геринг В.И. Молекулярные основы развития// В мире науки. М.: Мир.- 1985. -№12 -с.111.
16. Де Робертис Э.М. и др. Гомеозисные гены и план строения тела у позвоночных животных // В мире науки. М.: 1990- №9. -с.16
17. Заварзин А.А. Труды по теории параллелизма и эволюционная динамика тканей. - Л., Наука. 1986.-194 с.
18. Корочкин Л. И. Генетическая регуляция процессов нейрогенеза. Онтогенез. 1989. Т.20, №6, с.593-606.
19. Куница М.Н. Закономерности формирования селитебных геосистем Подолии // Взаимодействие общества и природы в процессе общественной эволюции: Сб./ Московский филиал географического общества СССР. М. , 1981 с.97-108.
20. Albertson D.G. end Tompson J.N. The pharynx of C. Elegans //Phil;l/ Trans. Roy. Soc. London. Ser. B.1976.T.275.p.299-325.
21. Nicol D. and Meinrtzagen I.A. Development of the central nervous system of the larva of the Actidian, Ciona intestinalis L. // Dev. Biology. 1988. V.130. p. 737-766.
22. Buss L.W. The evolution of individiualiti. Princton. New Jersey. Princton Univ. Press. 1988. 203 p.
23. Белоусов Л. В. Рецензия. Журнал общ. биол. 1989. Т. 50, №6, с. 842.
24. Царев Р.О. Стратегия разума. Сб. МФТИ. Русский космизм и ноосфера. 1989. т.2. С.79-81
25. Томас Р.Чек. РНК-фермент.// В мире науки. №1 1987 г. -с.26-36
26. Сен-Итиро Хакомори. Гликосфинголипиды. В мире науки.№7 1986 -с.15
27. Молекулярная биология клетки. В 3-х томах т.1 М., Мир. 1994 -с. 355-358.
28. Я. Мусил и др. Биохимия в схемах. Мир, М., 1984 г. 216 с. -с.76 . (сфингозины - амино-спирты).
29. А.Уайт. Основы биохимии. т.1. Мир. М. 1981с.425-426.
30. А. Уайт и др. Основы биохимии. т.2. Мир. М. 1981.
31. Основы биохимии. А.Уайт и др. т.3 М.: Мир, 1981. 726 с.
32. В. Л. Кретович. Биохимия растений. М. Выш. школа. 1986 г. 503. стр. 124 (- цитохром С -пшеничные зародыши).
33. А.Фрей-Висслинг Сравнительная органеллогра-фия цитоплазмы.М., Мир.1976. 144 с.
34.Иванова-Казас О.М. Сравнительная эмбриология
беспозвоночных животных.// Наука, Сиб.отд. 1975. 375 с.
35. В.Н.Измайлова П.А.Ребиндер Структурообра-зование в белковых системах. М.: Изд. ”Наука”, 1974. 268 с.
36. Георгиев Г.П. Гены высших организмов и их экспрессия. -М.: Наука. 1989. -255 с.
37. Шеллер Р.X.,Аксель Р.Как гены контролируют врожденное поведение. В мире науки. М., Мир.1984.N.5, с.28-37
38. Дулиттл Р.Ф. Белки // В мире науки. М.: Мир. -1985. №12. -c. 40 - 52
39. Scott M.P. et. al. The structure and function of the homeodomain // BBA. 1989. v.989. p.25-48.
40. Mc. Clung C.R. et. al. The Neurospora clock gene Freguency shares a seguence element with the Drosohila clock gene period // Nature. 1989. v. 339. p. 558-562
41. Wharton K.A., Johansen K.M. Nucleotide sequence from the neurogenic locus Notch implies a gene product that shares homology with proteins containing EGF-like repeats // Cell. 1985 (Part 2) v. 43. p. 567-581
42. Hagan I, and Yanagida M. Novel potential mitotic motor protein encoded by the fission yeast cut 7+ gene // Nature. 1990. v.347.p. 563-566
43. Songa E.B. et. al. Evidence for kinetoplast and nuclear DNA homogeneity in Trypanosoma evansiisolates // Mol. Bioch. Parasitology. 1990. v. 43.-p.167-180
44. Albertson D.G. and Thomson J. N. The pharynx of C. elegans. - Phyl. Trans. Roy. Soc. London. Ser. B. 1976. T. 275.-p.299-325
45. Breeden L. and Nasmyth K. Similarity between cell-cycle genes of budding yeast and fissin yeast and the Notch gene of Drosohila // Nature. 1987, v.329, p.651-654
46. Whitfield W.G.F.et al.Transcripts of one of two Drosophila cyclin genes become localized in pole cells during
embryogenesis//Nature.1989/V.338/p/337-340.
47. Deppe V.E.,et al.Pros.Natl. Acad. Sci.,U.S.A.75:1978. p.379. s.Dev.Biol.376-380.
48. Scyierenberg, E. et al. Cell lineages of mutants of C.Eleg.
Dev.Biol.V.76.1980.p.144.
49. Margoliasher, et. al., Fed. Proc., 35, 2125, 1976
50. Т.Джункс. Роль кодирующих триплетов в эволюции генов гемоглобинов и цитохромов С.// Сб. Происхождение предбиологических систем. Изд. «Мир», М.1966 г. с.462 ; стр.406-436.
51. Грин Брайан. Элегантная Вселенная. Суперструны, скрытые размерности и поиски окончательной теории: -М.: Ед. УРСС,2004.-288 с.
52. Неорганическая биохимия. 1978 т.2 .736 с. ред. Г.Эйхгорн. гл.22 -с.116-153.
53.Царев Р.О. Диофантовая структуродинамика. ВыпускI.-М.:Янус-К, 2004-208с.
54-26. Page D.C. et. al. The sex-determining region of the human Y chromosome encodes a finger protein //- Cell. 1987. v. 51. p. 1091-1104
55-34. Suzuka I. et . аl. Gene for proliferating-cell nuclear antigen DNA polymerase
auxiliary protein is pressent in both mammalian and higher plant genomes // PNAS. 1989. v. 86 p. 3189-3193.
56-33. Standart N. et.al. Cyclin senthesis, modification and destruction during meiotic maturation of the starfish oocyte // Dev. Biology, 1987. v.124. p.248-258
57-40. Yanofsky M.F. et. al. The protein encoded the Arabidopsie homeotic gene agamous resembles Transcripthion factore // Nature. 1990. v. 346, p.35-39
58-12. Bender W. Hometic gete products as growth factors // Cell. 1985.V.43.pp.559-560.
59-13. Birnbaum M.J. Identification of a novel gene encoding an insulin-responsive glucose transporter protein // Cell. 1989. V.57.pp.305-315.
60-15. Burglin T.R. et al. C. elegans has scores of homeobox-containing genes // Nature. 1989.V.341. pp.239-243.
61-18. Greenwald I.lin-12, nematode homeotic gene, is homologous to a set of mammalian proteins that includes epidermal growth factor // Cell. 1985. V.43.p.583-590.
62-21. Hopwood N.D. and Gurdon J.B. Activation of muscle genes without myogenesis by ectopic expression of Myod in frod embryo cells // Nature/ 1990/ V.347. p.197-201.
63-24. Messer W. and Noyer-Weidner M. Timing and Targeting: the biological functions of Dam methylation min E.coli // Cell. 19887.V.54.p.735-737.
64-27. Peter C.W.B. et al. Drosophila and vertebrate myb proteins shape two conserved regions, one of which
functions as a DNA-binding domain // EMBO J. 1987. V.6<#10. p.3085-3090.
65-28. Rosales R. et al. In vitro binding of cell-specific and ubiquitous nuclear proteins to the octomer motif of the SV40 enhancer and related motifs present in other promoters and enhancers // ENBO J. 1980. V.6, №10. p.3015-3025.
66-29. Ruvkun G.and Giusto J. The C. elegans heterochronic gene lin-14 encodes a nuclear protein that forms a temporal developmental swish // Nature. 1989. V.338.pp. 313-319.
67-31. Solomon M. et al. Ciclin in fission yeast // Cell. 1988. V.54. p.738-740.
68-35. Thomas S.M., Lamb R.A. Two mRNA that differ by two nontemplated nucleotides encodes the amino coterminal proteins P and V of the paramyxovirus SV5 // Cell. 1988. V.54. p.891-902.
69-36. Vassion H. et al. The neurogenic gene Delta of Dr. melanogaster is expressed in neurogenetic territories and encodes a putative transmembrane protein with EGF-like repeats // EMBO J. 198. v.6, №11.P. 3431-3440.
70-39. Xiao J.H. et al. One cell- specific and three ubiquitous nuclear proteins bind in vitro to overlapping motifs in the domain B1 of the SV40 ehancer // EMBO j. 1987. v.6, №10. P. 3005-3013.
71-41. Yasukawa K. et al. Structure and expression of human B cell stumulatory factor-2 (BSF-2/IL-6) gene Ц// EMBO J.1987.V.6.№10,p. 2939-2945.
72-42. Yochem J. and Greenwald I. glp-1 and lin-12, genes implicated in distinct cell-cell interactions in C. elegans, encode similar transmembrane proteins // Cell. 1989. V.58. p.553-563.
73-43. Yochem J., Westor K., Greenwald I. The C. elegans lin-12 gene encodes a trans membrane protein with overall similarity to Drosophila Notch // Nature. 1988. V.335. p. 547-550.
74-20. He X. et al. Expression of a large family of POU-domain regulatory genes in mammalian brain development // Nature.1989. V.340. p.35-42.