Часть 2: группы b1,4 и 92 , 91 из b6 (на 57 позициях: 35-57)
|
b6=36, 92 |
b6=36, 91 |
b1 + b4=0-5 |
№\ № |
35 36 37 38 39 40 41 42 43 |
44 45 46 47 48 49 50 51 52 |
53 54 55 56 57 |
1 |
T Y C A C D S H Y |
V G D Y C E H R N |
P - - - - |
2 |
I S C K C P L G F |
D E S L C E I A V |
P N A - - |
3 41 |
Y T C A C A N G Y |
T G E R C E T K N |
L - - - - |
4 |
F T C S C P P G F |
T G D T C S Y D I |
E E - - - |
5 |
Y Q C M C P T G T |
T G K D C D T K Y |
N P - - - |
6 |
Y E C K C P K G F |
E G K N C E Q N Y |
D D - - - |
7 42 |
Y T C R C P P N F |
T G R F C Q D D V |
D E - - - |
8 |
Y S C I C V N GW |
A G L D C S N N T |
D D - - - |
9 191 |
F Y C Q C T K G K |
T G L L C H L D D |
A - - - - |
10 |
Y A C S C A T G T |
K G V D C S E D I |
D E - - - |
11 |
Y R C N C S Q G F |
T G P R C E T N I |
N E - - - |
12 41 |
F R C V C M P G F |
T G T Q C E I D I |
D E - - - |
13 |
F K C S C A L G F |
T G A R C Q I N I |
D D - - - |
14 |
Y S C E C P P G Y |
T G T S C E I N I |
N D - - - |
15 |
F K C L C D P G Y |
T G Y I C Q K Q I |
N E - - - |
16 42 |
Y Y C Q C Q A G T |
S G K N C E V N V |
N E - - - |
17 |
Y K C Q C V P G F |
T G Q H C E K N V |
D E - - - |
18192 |
Y K C E C P R G F |
Y D A H C L S D V |
D E - - - |
19 |
F I C H C P P G - |
T G K R C E L D I |
D E - - - |
20 |
F S C Q M P G Y - |
T G Q K C E T N I |
D D - - - |
21 41 |
Y K C V C K V P F |
T G R D C E S KM |
D P - - - |
22 |
F S C T C K L GY |
T G R Y C D E D I |
D E - - - |
23 |
Y R C L C T K GY |
E G R D C A I N T |
D D - - - |
24 |
Y S C L C V D GF |
D G K H C E T D I |
N E - - - |
25 42 |
Y T C T C P L GF |
S G I N C Q T N D |
E D - - - |
26 |
Y N C S C L A G Y |
S G A N C Q Y K L |
N K - - - |
27193 |
Y T C H C P S GF |
T G K Q C S E Y V |
DW - - - |
28 |
F S C K C S A GW |
T G K L C D V Q T |
I S - - - |
29 |
HV C Y C S Q GY |
A G S Y C Q K E I |
D E - - - |
30 41 |
YE C Q Q R G FQ |
Q GQ N C E L N I |
D D - - - |
31 |
F S C S C P P GT |
M G I I C E I N K |
D D - - - |
32 |
F E C V C Q P GF |
V G A R C E G D I |
N E - - - |
33 |
YH C N C R P GH |
M G R H C E H KV |
D F - - - |
34 42 |
HH C I C N N GY |
Y G K N C E L SG |
Q D - - - |
35 |
YR C E C P R T L |
L G E H C E I DT |
L D E - - |
36194 |
YE C L C P S KW |
K G K R C D I YD |
A N - - - |
∑*) |
F X C X C X X GF Y Y |
X G X X C X X XX |
D X - - - |
*) консенсусная последовательность по всем 36 повторам.
Ген сdс-10 - ген чайного гриба, ген SW-16 дрозофи-лы. Второе. А.к. последовательность из 788 позиций
циркадного (!) гена frg нейроспоры (561 с. [40-23]) и аналогичный белок нематоды определяют-по наше-му мнению - с точностью до "-4" минут - время пос-леднего деления 784 0,5 мин, а так же число кле-ток и событий к этому моменту времени - 784 собы-тия, включая акт оплодотворения, перед вылупле-нием гермафродита. (См. также наше замечание о числе белков слизневика: в нем обна-ружено всего 778 белков, а разрешение двумерных методов гель-электрофореза вполне допускает ошибку-недоста-ток-в 6 белков, например, в 6 парах почти идентич-ных по «физике разгона» белков).См. с.98 вып.I. (3-е измерение и -третья временная ось(см.с.217), но уже с расширенной до 58-ми позиций рамкой и с учетом имеющейся многовариантности функциональной информации при сдвиге рамки считывания), (см. также с.217).
Отметим, что 55 позиций в 36-и повторах имеют обращенную последовательность и интересующее нас разбиение 55-ки на 3,36 и 16 позиций начинает-ся с конца, с 16-ки. 55-ю позициями полностью об-ладает только 29-й повтор. 8-й повтор имеет так-же 41 и 42 , а все остальные повторы целиком содер-жат только 41 , а 42 -лишь частично одну, реже две пози-ции, тогда как 43, 4 отсутствуют нацело, за исключе-нием концовки 14 в 44=11+12+13+14, которой оканчи-ваются при соответствующих делециях все 36 пов-торов. Девять позиций по горизонтали в 91,2,3,4 из 36-ки в 55-ти а.к. выделены так:
а. В 91-й выделены 42: 1-я позиция, а в ней - С-остат-ки во всех 36-ти повторах. Первая позиция в 42 в 92-ке также занята С-остатками во всех 36 повторах. 93 выделена тем, что во всех 36 повторах имеется в ней делеция в первой позиции в 41, кроме 2-го повтора с
V-а.к.-й, а 94-я также имеет делецию везде, кроме 33-го повтора с S-а.к. -й. В 94 -х конец 42 содержат в 36 повторах по С-а.к.
б. По вертикали 9-е позиции в 9-х в 36-ти повторах (9,18,27,36, строки, см. 576 с. [41-37]) выделены весь-ма специфично по равным численностям одинако-вых а.к. в последовательных позициях по вертика-ли: 9(-91), 9(-92), 9(-93), 9(-94) (для ясности в двух слу-чаях добавляем индексы строк по суммам а.к.-т во всех 9-ах строки): К-а.к-та: 39-118-127-336(и т.д.); L-а.к.-та : 3-1-1-3; М-а.к.: 0-0-0-0; Q-а.к-та: 2-1-2-1 ; R-а. к-та : 0-1-0-1; Е-а.к-ма: 3-0-3-0; Y-а.к-та: 2-2-2-2. В позициях 1 (строки 1,10,19, 28) в четверках 41,2 по-добного явления нет-велика вариабильность этих позиций. Во 2-ых позициях (строки 2,11,-20,29): М-а.к-та: 1-0-1-0: W-а.к-та: 1-0-0-01; В 3-х позициях (3,12,21,30-е строки) С-а.к-та: 10-9-9-10; М-а.к-та:0-1-1-0; W-а.к-та: 1-1-1-1; 0-делеций: 17-17-17-17. Пов-торы в 4,13,22,31 строках : (конец 41 -ок) H-а.к-та: 0-1-0-1; I-а.к-та:1-3-1-3; W-а.к-та: 1-1-1-1; О-делеций: 15-17-15-17. Повторы 6,15,24,33-строки в 42-ах: W-а.к-та: 1-0-1-0; и только. В 7,16,25,34-строках: К-а.к-та: 0-1-0-1; М-а.к-та: 0-0-0-0; Р-а.к-та: 2-1-2-1; Y-а.к-та: 1-2-2-1; О-делеция::17-17-17-17. Наконец, послед-ние позиции в 4-ах: (8,17,26,35-строки):F-а.к-та: 08-117-026-135; I-а.к-та: 1-2-2-1, К-а.к-та:0-2-2-0;М-а.к-та:0-0-0-0.
в. Проиллюстрированные этими данными законо-мерности настолько уникальны, что с абсолютной достоверностью оправдывают разбиение по верти-кали 36-ти повторов на 9-ки и 41,2-ки, поскольку лю-бая трансляция по строкам их нарушает. «0» везде означает или отсутствие данной а.к., или делецию, что оговаривается каждый раз. К этой работе при-
мыкает и статьи [69-36] по нейрогенному Delta-гену Дрозофилы, кодирующего 9 полных EGF-подобных повторов трансмембранного белка.