31.7. Циклины и кинезины
В КИНЕТОПЛАСТАХ
1. Сравнительно давно были обнаружены небольшие пептиды, отвечающие, в частности, за длительность синхронного дробления (циклины или РСNА-домены [45-14,56-33,55-34,76-38]), и кинезины, запускающие ме-ханизм расхождения хромосом в ходе митоза и мейоза. Самым важным для нас оказалось отмеченное в [76-
38] численное совпадение количества а.к. (13 а.к.) в А-циклине у пяти генов в двух разных областях -в 10 гомеодоменах-, и их функционирование в течении 13 синхронных циклов в первые два часа развития Дрозофилы. Подчеркнем, что перераспределение циклина по объему эмбриона завершаются на 12-13 циклах. При этом домены соответственно (для Clам А) находились в позициях196-208 и 249-261, а степень сходства составила 102 идентичных позиции из 130 (78,8%). Совпадение чисел 13 а.к. и 13 циклов может, как мы отметили выше, быть причинно обусловленным и независимым. Но в каждом из вариантов отдельно эти числа имеют прямое отноше-ние к ДМЯ хотя бы каждое на своем иерархическом уровне и, очевидно, требуют прозрачной причинно-следственной связи либо во временном, либо в структурном аспекте со всеми другими числами или особенностями на 5,8,20-21 шагах или стадиях во времени, или на структурном уровне -см. разбиения выше на эклоны.
2. В работе [42-19] приведены а.к. последовательности по 5-ти доменам кинезинов из кинетопластов, влияю-щих на протекание перехода между фазами клеточного цикла G2 и М, который происходит с помощью продукта гена Cut7+ у делящихся дрожжей на 129,5 (+/- 3%) минуте ( =10 мин.?), ср.[1,9]. Причем в 4-х из 5-и (без гена claret) гомеодоменах есть в точности 13 позиций с полностью совпадающими а.к., начиная с позиции 361 в Cut7+-гене.
3. Отметим наличие уже нуклеотидной последователь-ности из 13 пар оснований (ORI-последовательность) в минициклах ДНК кинетопласта (кДНК), которая отве-чает функционально важным белковым факторам ки-нетопласта, Эта последовательность оказалась иденти-
чна
во всех 13 штаммах Трипанососомы из самых
разных географических районов [43-32,
с.175], а число копий этих минициклов в
одной особи равно 5*103-4.
Число максициклов в кДНК значительно
меньше - 20-50 копий и среди них наблюдается
большое ко-личество длинных консервативных
фрагментов, в час-тности, из 130 пар
оснований (
=10
- столько пар нук-леотидов содержится
в одном витке двойной спирали ДНК).
31.8.Повторы
Первое. Белки генов SW16 и cdc-10 (и со-ответствующие им белки C.elegans), имеют 849 общих а.к. позиции:это означает, что длительность первой личиночной стадии С. .elegans должна быть равна 849 Таблица 26:-36 Notch повторов Дрозофилы;
Часть 1: группы b7 и 94 , 93 из b6 (на 57 позициях:1-34)
|
b7=16 |
b6=36, 94 |
b6=36, 93 |
№\ № |
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 |
17 18 19 20 21 22 23 24 25 |
26 27 28 29 30 31 32 33 34 |
1 |
C - - - - - - - - - - T S V G C |
- - Q M G G T C - |
- - V T Q L N G K |
2 |
C - - - - - - - - - - N S M R C |
- - Q M G G T C Q |
V T F R N G R P G |
3 41 |
C - - - - - - - - - - D H V T C |
- - L M G G T C - |
- - Q L K T L E E |
4 |
C - - - - - - - - - - A S S P C |
- - R M G A T C - |
- T A L A G S S S |
5 |
C - - - - - - - - - - Q S N P C |
- - K Y G G I C - |
- - - V N T H G S |
6 |
C - - - - - - - - - - S P S P C |
- - Q M A G I C - |
- - - R S N G L S |
7 42 |
C - - - - - - - - - - L G H L C |
- - Q M G G T C - |
- - - I D G I S D |
8 |
C - - - - - - - A Q R D H P V C |
- - Q M G A T C - |
- - - T N T H G S |
9 191 |
C - - - - - - - - - - K Q A A C |
- - F Y G A T C - |
- - - I D G V G S |
10 |
C - - - - - - - - - - T S N P C |
- - H A D A I C - |
- D T S P I N G S |
11 |
C - - - - - - - - - D Q G S P C |
- - E H N G I C - |
- - - V N T P G S |
12 41 |
C - - - - - - - - - - E S H P C |
- - Q M E G S C - |
- - - L D D P G T |
13 |
C - - - - - - - - - - Q S N P C |
- - L M D G T C - |
- - - H D K I N G |
14 |
C - - - - - - - - - - Q S Q P C |
- - R M R G I C - |
- - - H D S I A G |
15 |
C - - - - - - - - - - D S N P C |
- - - H R G K C - |
- - - I D D V N S |
16 42 |
C - - - - - - - - - - E S N P C |
- - Q F D G H C - |
- - - Q D R V G S |
17 |
C - - - - - - - - - - H S N P C |
- - N M G A T C - |
- - I D G G I N S |
18192 |
C - - - - - - - - - - I S S P C |
- - A M N G V C - |
- - - I D Q V N G |
19 |
C - - - - - - - - - - A S N P C |
- - V M E G R C - |
- - - E D G I N E |
20 |
C - - - - - - - - - - S S N P C |
- - Q H G G T C - |
- - - Y D K L N A |
21 41 |
C - - - - - - - - - - V T N P C |
- - G M G G T C - |
- - - I D K V N G |
22 |
C - - - - - - - - - - A R N R C |
- - K M E A K C - |
- T P S S N F L D |
23 |
C - - - - - - - - - S L S S P C |
- - R M G A S C - |
- - - L N V P G S |
24 |
C - - - - - - - - - - A S F P C |
- - Q M G R T C - |
- - - L D G I G D |
25 42 |
C - - - - - - - - - .- L S Q P C |
- - Q M G A T C - |
- - - S Q Y V N S |
26 |
C - - - - - - - - - - T E S S C |
- - L M G G S C - |
- - - I D G I N G |
27193 |
C - - - - - - - - - - D S N P C |
- - L M G A T C - |
- - - H E Q N N E |
28 |
C - - - - - - - - - - G Q S P C |
- - E M G A T C - |
- - - S Q M K H Q |
29 |
C QDAA D R KG L S L R Q L C |
- - - M N G T C - |
- - - K D Y G N S |
30 41 |
C - - - - - - - - - - Q S Q P C |
- - Q M G G T C - |
- - - R D L I G A |
31 |
C - - - - - - - - - - A P N P C |
- - Q M G G T C - |
- - - H D R V M H |
32 |
C - - - - - - - - - - K P G A C |
- - H M N G T C - |
- - - I D R V G G |
33 |
C - - - - - - - - - - L S N P C |
S N A G T L D C - |
- - - V Q L V N N |
34 42 |
C - - - - - - - - - - A Q S P C |
- - Q M G G N C - |
- - N I R Q S G H |
35 |
C - - - - - - - - - - D S N P C |
- - - R V G N C - |
- V V A D E G F G |
36194 |
C - - - - - - - - - - S P N P C |
- - A Q G A A C - |
- - E D L L L G D |
∑*) |
C - - - - - - - - - - X S X P C |
- - X M G G T C - |
- - - X D X X X X |
*)консенсусная последовательность по всем 36 повторам.
минутам (опыт дает величину в 850 мин. ).
Таблица 26:-36 Notch-повторов Дрозофилы;