12.Транскрипция днк у прокариот. Кодирующая и антикодирующая цепи.

Транскрипция- перенос информации с двуцепочечной мол-лы ДНК на одноцепочечные мол-лы РНК.В трансрипции различают- инициацию, элонгацию, терминацию. Молекула ДНК двухцепочечная, но лишь одна цепь служит для синтеза РНК. Ее называют антикодирующей цепью. Противоположная ей цепь, последовательности нуклеотидов в которой совпадает с последовательностями иРНК, называется кодирующей. Для синтеза РНК используется фермент наз ДНК- зависимая РНК- полимераза или РНК- аза. Подобно синтезу ДНК синтез иРНК идет в направлении 5^{ -} 3. Поэтому он всегда начинается с 3^ конца антикодирующей цепи. Часто у 2х рядом расположенных генов ДНК кодирующая и антикодирующая цепи бывают разные т е 1й ген синтезируеться на 1 нити ДНК, а 2ой на другой цепи ДНК.Существование иРНК было теоретически доказано Уотсоном и Криком при рассмотрении вопроса о том, каким образом заложенная в двуспиральной ДНК генетическая информация реализуется при синтезе белка.

13.РНК- полимеразы. Строение, виды, функции.

РНК полимеразы это сложные белки с молек весом 480 тыс Да, состоят из 5 полипептидных цепей.4 цепи постоянные и образуют кор-фермент, сюда входит 2 , , , 5ый полипептид кот входит в состав РНК полимеразы  (сигма– фактор), 4 компонента постоянны, а  (сигма– фактор) различен, это зависит от того гена экспрессию которого нужно о вызывать в данный момент, этот фактор узнает свой ген и начинает процесс транскрипции.

В отличие от прокариот у эукариот известно 3 типа РНК- полимераз ответственных за синтез различных классов РНК. РНК-полимераза I, она наиболее активна, обнаружена в ядрышках. С помощью нее синтезируется, что составляет 50-70 % от общего синтеза РНК. РНК-полимераза II локализована в нуклеоплазме ядра и синтезирует иРНК, но сначало это незрелая РНК и ее наз гетерогенной ядерной РНК, в ней по мере созревания производиться сплайсинг п процессинг, заключающийся в вырезании незрелых частей так называемых интронов и сшивание значимых экзонов. РНК-полимераза III также находится в нуклеоплазме и ответственна за синтез большей части мелких ядерных РНК и тРНК.

14.Инициация транскрипции. Промотор, стартовая точка сигма-фактор.

Инициация начинается просмотром на 5-конце и заканчивается терминатором на 3-конце. Эта единица транскрипции наз транскриптон. В начале РНК полимераза распознает промотор, фрагмент дл 41-44 пар нктд. Транскрипция ДНК происходит в направлении 5-3, или слева направо. Иметься нулевая или стартовая точка последовательности нктд. Последовательности, лежащие вправо от стартового нуклеотида, с которого начинается синтез иРНК, обозначаются номерами со знаком “+” (+1, +2 и т.д.), а находящееся левее - со знаком “-” (-1,-2 и т.д.). РНК- полимераза садиться на ДНК в области -20 до +20. Минимальный участок, связанный с РНК-полимеразой, состоит из 12 п.н. Во всех промоторах присутствуют одни и те же нуклеотидные последовательности, называемые консервативными. Они служат сигналами, распознаваемыми РНК-полимеразами. Стартовая точка обычно, представлена пурином (чаще аденином, чем гуанином). Сразу же влево от нее располагаются 6-9 п.н., известные как последовательность (или ящик) Прибнова: ТАТААТ.Он имеет особое значение здесь все последовательности АТ, а между ними 2 связи и эти связи легко рвутся, поэтому ящик Прибнова становиться одноцепочечным это создает условия для функционирования РНК-полимеразы. Центр “ящика Прибнова” приходится на нктд в положении -10. Близкая по составу последовательность расположена в другом участке с центром в положении -35, т.е. на расстоянии 35 п.н. от стартовой точки. Этот участок, состоящий из 9 п.н., обозначают как последовательность 35, или район распознавания. Сюда присоединяется -фактор. Есть промоторы, с которых РНК-полимераза не может начать транскрипцию без помощи специальных белков. Одним из них служит фактор САР, или CRP.В РНК полимеразе сигма фактор может заменяться и это ведет к тому, что РНК полимераза начинает транскрибирвать иные гены. При этом кор- фермент неизменен, сколько генов столько -факторов.

У эукариот более подробно изучены промоторы, взаимодействующие с РНК-полимеразой II. Они содержат три участка распознавания в стартовой точке в положении -25, -27. Стартовым основанием служит А фланкированный с обеих сторон пиримидинами Т и Ц. На расстоянии 19-27 п.н. влево от этого участка расположены 7 п.н., наз. “ящик Хогнесса”. Он окружен ГЦ-парами. Последовательность ТАТА напоминает “ящик Прибнова” у прокариот, но расположена в среднем на 15 п.н. левее стартовой точки. Еще левее в положении от -70 до -80 находится последовательность ЦААТ, наз “ящик ЦААТ”. Предполагается что“ящик Хогнесса контролирует выбор стартового нуклеотида, а ЦААТ - первичное связывание РНК-полимеразы с ДНК-матрицей.