МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ РЕСПУБЛИКИ БЕЛАРУСЬ

БЕЛОРУССКИЙ ГОСУДАРСТВАЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ

БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

Отчет по прикладной геномике

Выполнила студентка

4 курса, 5 группы

Баранова Вера

МИНСК 2012

Задание.

1. Сделайте предположение на основании сравнений с нуклеотидными базами данных, какому организму принадлежит данный фрагмент ДНК.

2. Найдите все открытые рамки считывания (ОРС) данного фрагмента ДНК, которые содержат более 100 кодонов.

3. Проанализируйте три самых длинных ОРС:

- постройте рестрикционные карты (составьте список сайтов рестрикции с указанием координат и рестиктаз);

– установите аминокислотную последовательность возможных белковых продуктов ОРС;

- определите молекулярный вес и pI возможных белковых продуктов;

- укажите гомологию возможных белковых продуктов с уже известными белками, а также наличие консервативных доменов;

- сделайте предположение о времени полужизни возможных белковых продуктов, их локализации и функции.

- определите элементы вторичной структуры в выбранных белках.

- если возможно, смоделируйте третичную структуру выбранных белков;

- на основании аминокислотной последовательности одного из трех выбранных белков постройте филогенетическое дерево, отражающее систематическое положение организма, из которого он выделен.

4. Сконструируйте по паре праймеров для трёх самых длинных ОРС. Ампликон должен содержать всю последовательность ОРС.

- напишите параметры ПЦР для каждой из трёх реакций (Температуру отжига праймеров, время для элонгации).

5. Сконструируйте пару праймеров, с помощью которых можно амплифицировать самую длинную ОРС и экспрессировать в векторе pET-24(+) с полигистидиновым хвостом. Постройте карту рекомбинантной плазмиды.

01.

TTTGTtTATtGTAaATCTGCGTGGGCAGAAGGTAgAGGTGAGATATTATACCATAAGGATTcTAGTCCGCAGtAaGCGCTATTGATTAAACCGGATATccATATTAGTACAgAAGAGTTTTTTACcAGTGtGGATTTAATTAAGgCATCGGTaaaAATATCTAAtGATTTAGGCTTTGAtAAGAGCATTATGCATAACGAtTTTGAGAATGTTtTTTATGCAAAATATCCaGAGTTTAGTCAATATCTAAtAGAGTTAGATAGTGATaTTAGAATGACAGGTACAGttTCTTaTTTTTATgaACTCTCAGgAgATAAAAATAAACTTGAGCAACTTGCAAGAAAAATTAATAaACCTCTTGACAAATGGCTAGTCAAgACATgAAACTATGTCTAtTAACTTAAGtTTAGcCTCTtTTGGGCTATCGCCAAGCGGTAAGGCAACGGGTTTTGATCCCGTCATgCCCAcGTTCGAATCCTGGtAGCCCAGCCATCAAAACTCAAAgACTTtATTTCGcATATAAGtTTTAAATCTTGATTATTTTAGTGTAAacTAAATTTATTGTTTcTTAATTTtATaTTAAATTAATGTTCCTGAAaATATaATCTTATTTatAATCACTgTTcCTTTTGACTTTCGTATACTTTTTGaTAAGACAAAAAAGGGTtGCATGGTTATTTGTCaCCTTGcCATACGCTTATCCATTTTTGAGTGAGATTATCAAACTTAGTCAAGCAGTGACcGTACCTGTAGATTATTAgCTGTATGCTATCCCAAATGcTTTATTGTACCTgGCGGTAGCTATATGaGGACTATTGACATCAAAATCTcAACACaTAGTAGCTATTAGACAAAGGAcTAATTAtATAGaTAAaCCGAAAGATATTgGTAGcaAAAGATATTtGTgGAAATGTTaTAATGTCTAATAAAAATGCCATCATaTAGCCAAGATTTTAgAGACgTCGTAATTAATAaACATGAAGAAGGTAcGACGGAGTTgGAGCTGAGTAccTTTTTTAACATAGgTAAGCGTACAGTTGaTTCATGGAaAGAGgTTTATAAAAGAAgCGGAGATTATAtcTCaAAGCAAGGAGTTGGcTtTGaCAGAGTCcCTAGCTTTACCGATAAAACATTGATTGAACAGTATTTgATAGATCATCCAGATGCAAGTGCATTAGAaATAAAAGAaGCATTAGCCCCTGATATTCCAAGAAGTACATTTTATGATTGTCTTAATAGACTTGGTtTgAGTcTTAAAAAAAGACTCCAAAATagAAGCAAAGAAAAGAgCATGAAAGGTTGGAGTATATAGAAAAACTAAAgcAAATAGCTCAAAACTTaTTATTTTATATAGATGAGATGGGGTGTGACAATAAGCTTTCTATCCTAAGAGGATGGTCACTAcTTGGTGAGCCTAGTctTGcTGAGcTTTTAGCcTATtAgACACAcAgAAGAgGTATTGTTGCTGGATATAATTATGCAGATAAgAAGATTATAGCTCTATTAtAGTACAGCGGATATACCAATACTGAAAcTTTTtATCaATGGTTTGAGgAACACTTATGCCCATCATTAAAACCTcAAACTACTATAtTAATgGATAATgCTAGTTTCCATAAATCCTCTAAcCTcATTcAaATAGCCAgTAAATTTGATGTAgaAATATTATATCTACCTtCGTACTCgCCAGATTTAAATCCcATTcAAgAGGTTTAGgCTAaCTTcAAAAAAATcTTTAGAaAAGTaAATAATAGTTTTGAAAAATTTTGTGATGCTATCTCTTATGTGTTtAAcgAAATACTCtCGGATTAACTATACTTTCAAGCTTAATGTATGAGAATATTATTAATCCTACACCTGTAtAAAACATCTTAATAtCACTTTGTgCCtCgCTAGCTATGCCTTTATCTTTTgtGAtTCCTTGcATACAgATTGAcAaTATTAATGGCGCGATAtTACCACATAGtAAAGCTGTACCAATGCCAAATATAAcTATGGgAAAAcTATTTGTATATAACTTAAACaATAATATAAATGCTATAAgATGAAACAAAAATgATCCAGGTAGCAAAGCAAGAATCTTTTCGGAAGCATATCTATATAAGAAACGTTGTAATGaAAgAGCTCCAGcGGCCAAACTTaATAcCGTAGAAGCTGTTTATAgAACCaTTGGTAATTACTGgTATGCCTAcGTGATtTAgCACAAtAaGcAACATATTATAAAAACCTtTGGAATAAACATAAAaTAAgGCCGAAAGAAGACTCATTATAAAAAAGTAACGATTTTTGAAATAATACcAATACTTATCTAtAGTGGTTTTATAGTTtaTTgTATATTgAAGTCtaCTTGAAGTTcCAGGCATTATTAACAAGATTAACAAAAAAACAAtgATATTTATTtgTAGCAGAGTTgTTAGgGAAAATCTtCATGAGCTAACaGaTTGTATAAAAGCACCTAGTACTGGTGCAATACgTcGCGATATCTGACTAGcTAAGGCATATAAAGAAAATGATTgCCTTAATCTCtTAGGtTTGTGTaAAACATCAGCAATTATTGATCTACaTATTACAGGACAACCAGCACTcCCAATCGtAGTTACAATTCTACCGtTGTcGAAAGGAACGATTCaTTGAGCAAAAGCTGATtTTAAAATACcTAGAATTGTTATTGAtAGTGAAATTtACACAAGTTTCTTACGTCCATcTCTATCACTTAAAAATCCAtATGGTAGTTGAAATATTCCTAGGAaAAGCATGTAGGTTgATACACTATTTTTAAGTAATGTTTGAGATGTTaCAAAAtCAGATTTAAcGTAGGTTAGGGATGGGCTAATAAAATCGATCGACATTAATCCTcTAAGTACtATTAAGCCACTAAgAATTAAGGTAATACGATACGCTTTAAGCATgCAGAGTTTACTCAAGAtAGATTATAAAGgTATTTTCTTATGATAAATGATAATTACAAAGCTTTATTTAaGATTTTGTATATTtTTTAAGGATAGTcGGGTTATTATTAAGCCAGTTGTCAAACcCtTGaGCAATTTTCTTACtTTGTGATGTATTATTAAACATAAAGGCTTTGTAGTATTGATTATtATCAACTTTTACAGGTACTTGGCATATCtTATaGTTCTTAGAATGTTGATaAGCTATTTCTAAAgTATaTGTAgACATAATATCAGGgTGAATATTATCTATACCTTTTAcGATAGAgTTTAtTGCTTGGTTcTTAgCGaTTAtTATTAGCACTTTAGCATTTgTTAATTTCTGTAATGggAATAgTTcATTTgTAaCAgCcCTATcTTCcATAAcTAATGTTTTTGGATTATCAATtgCgTTAaAcGTTTTatACTgATTTAACTTTTTACAAGCAGatATAGaTGCCTTaaTAAtTGATATTAtTGGGTTTGAAAAGACAtATTCTTTTTGACaTTCAGGAGTTgTTgTCATTcCTCCcACAAAAACAcCAAATTTcTTGCTTcTTAAATCATTCTCaGCAGgTGCCCAAGAAGTTgTGACAAACTtTAcTTGTTTTTTTGcTTgTTGCAgAAGCTTCTATGAGCTTTATATCCTTACTAGAGTATTTATTgTCTTTGGGATTATAAACTGAAAATGGCGCATAATCGCCTGTTGTTCCTACGGTAATATCAGtATATGCGcTAGAAATCAcAACTGCAaTAGcAGTTATAAATGTtAATACGGTTtaTTTCATTTTTTTAAAGATcATGcTTTTTACTGATAAGATTTTACgCCAAAGAACAAAAAATAGAATAGCTTAGATAATGATgTTTATTTTGATTGATCTTCTTTtTTTTCTAATCTAGTAGCTACcAAACAAaCTACTGTAACTGCTAGACCAGCtGATATAgTtCATGCTAAATAATACATACACTTgCTCCTTATTTAGTACATTTtgTGTGAATTAGCTTTAATCTCTTCAGCTGATgTcCTTCGTCCaTTAaCCCACATTTTCTTATAGACAAcGAATGTATAGCaAatTATGATCGGAAcAATAATAaCAGCtGCGCATAATATACCTAgcAGTGATGTTTGagTACTACTTGAGaTGTAaACaGTTAGACTATaCATATAGTCACCAtTATatGaTACCATAATAAATGGGAAgAAAGTAAAGtCAACGGTTAAAACAGCACCAAGaAAAGATGCCATACTAGCTAAGAAAGCAGCGCCATCggTGTCTTGATTGTTAAAtCTAATAcCAAATATAGCGCCAACAAAAGcgAGaACTGGTGCAAACCACAtCCAAATATGTGCATGGTTGAAcTTATAGTACcATGAagAGTCgGTAGgTACTTTACCTGATGTGAAAGCATGATTTAAAGCATCTGATAGATGAGCTAAGCTAGCATCTgGAGTAAACTGATATCCAGgTATAAAAGTTATCCAAATTtCAGCGATTAaaAATtAAACgAgATATACACTTGCTGTTGCaTTAGtAATCtTTCTcAACCTATCACGTAAAATAgaACaAGTTCTcAGcTTAGCATAAGCtGATCCATGCATTAcTaCCATcTTTAATGCtAAcATACCAAATAATAGTGCAAATGccGTTAGTAcATGTcGTAATGTGATCCACATCGACTGATATTGACCATTTGTTACTGTACCATAAATCAGTCTGGCAGTATCAtCcTAAGAGATTGGAaAcCCTAAAAAAAGATTACCAACAGCTACACCCATCACAACTATAGGGATTcTACTTCCAAGTAtAAGCATtaAATCCCAGAAATaACGCCACTtAGGATTGTCTATTTTCTTTCTATACTCAAtAGCAGGAGGTCTgAGGAAcAGTgCtCATAGTACTACTAAAATTGCAAgATAcAATCgTGAGAAGCTAGTgcCATATACTTGAGGCCAGATTGCAAATATAGCACCACCAGCagTGAtAAACCAAAgtTGcCTgCCATCCCATGTAGGTCCTgCGGTATTTATGATgGCTCTTtTCTCGTAATCcTcTTTACCAAcGAATTTatCAAGGATTCCTACCCCAAAtTCAAAACgAACTGTAGCgGCTACCAAAAATATTAGCACTCCTACAACTAGCCAAGAGATAATTTGTAACACGTCTAATAACATTTATCTCTCCTTATTTACTTTTTTTGTTgTGTTCAAAATAATATTTGCCcGTACCTAGAGAGCTAGGACCAAGTgTTGCATAaTTGAACcTTAAAAAcACCATTACAGtAAATAGCGCAGTtTCgATTAAGAAGagTATCGCCATTggTGcTCCAACGTCAGCAGCAGTTAgTGCTtAAGAACTAATACTTGTAgGTAGTTcGTCATAAACAGTCaAAGGTTGACGACCATGTTCAGtTACAtACCcGCCAGCAATACATGCGATATAAGGTAATGGTcTTGACCAAaTCAtAACCCTTAGGATAAATCTAtTtAATGCATTGCTAGgAAGgGCcgTTCTcGCaAGTgGAcTTAGatCAACaACTATTAAGGtAAACAgAAAGAATtCTATGAATaCCATTtTCCTAAAGcTCCAGAAAACACTAGCAACATCAGGAACCATAaTAGTAGCAACAGcTCTTACTAATTCTGgATCATTTGtAGCTTTGtCAATTGTTGCTGgATCAGCCACACCATATTTTTCTTGAGCAGCaaGTcCTAGCATTTTaCCAAAGCCaATGTACTTCTGATAAaTAgaGTTGTTGTAGTcAGTGTAGCtACTATCAGGAcTATCACCACTATGTaCTGTCTCACGCCATTTTAGAAGGTCAGCATATGCAAGACCACCTTCTTTGATCAgAACTAAAGCAGAAGGTACTTTTTCATATTTGCTTGGATCAGCAGaAGCATCTTgAGGTGAAACATCAGCAGTTTGACgTGTTTTcATATCTtTGTAGTATGCAAGGTTgGGAgCTCTTGTACgATCAGCTGTCTTTTTACCAcAGAGTATAGCTTTGaTTCCTGGAATTTCTGTATCTGTTGAGTGAGTTGCAATTAAACCTAATACGaCAGGGATAGGAACATCAAAgTTATTTTTTTGTTCTTTTTGACTCGcTAGCGCAACTGCATTGAATGCTGCTGGAGCTTTAGAAGTATCCCATTCTGCTTCGATAGCAGCCATaTTTAGTGGTTGTACTCTAAAAGCATCTaCAtCATgTGCgTCGCgAAAGATgATCGCCACTATgCATGTAATTAAACCAAtaCCTAAGCCAATCGCGAcAtATCTCTaAGCaAAtGCTATATCACGACCTCTAATCgGATAAAATaCACTTATCCCGaTTACAAcGATTGCAGCaGTAGTATATCCTGCAGTCaTCAgATGGCCAAAATTTGTTTGGcCTGTcTGGaTAAcGAATaGAtCTAATAAGCTAACAGcCTCCATTCTaATAGTTGAAGCAACAAATTgAGAGgCGtcaGGcTGCTGCATGcAGCCGTtTGCAACTAAaATAAGTAAAGCTGgGAAACTTGAGCCAATTGCTAAACAAAAAGTgGAAAGTAGGTGTTGTcTTTTTGTAAGTTTAgCCCAACCgAAGAAAAATAAAcCAGCAAATGTtGAtTCAtGCATAAATGCTGCTAAACCTTCAATtGCTAGTGGTaTtCCgAAAATAtCACaTACgGgcTGAGAGTAGTATGACCAcTTAGgACCAgAcTCAAAgTCaATGGTCAAACCAGTAATAATgtCgAGTGcAAAGTTTATTCCGAGTAATTTACCCCAAAACTTCACCaTATCTTTAcAAAtTTCTTTACaTGtTCTTATGTACATTAGCTCCAtaGTGAATAAGATCCACGTaAGACCTcAAGtTAGAGGAAaAcATAAAAAGTGAAATGATGCTGTTAAACCAAACTGTAATcTcGCTAAGTCAACAGAtATGAcCGTcGGTgACATATTTATTTTCTgCTaATAGCTCAAGTtACTGTGTAcTATTAAATTTgTCTAAcAAGAAAATCGGAAGAAAAAATAGGCTGAtCTGAGCAGTAGTCACTgTTTCTCCCCTTTAATTaTGCAGTTGAAATTGTtcCACATTAATgATTTAAATCAATAAATTATGCTGAAAGCATTGAAAATAAAGgcTcTGAGTATACCAAAATGGaATAGATTTgATATACaGcaATGGTATaGTTTTGCAgTTTGATTAAAATTTAATCACTtATGGCTATtTaAAATATTATCTttGGTGGGTTTTAACATAAAGGTTTTTGgTTAAATAAGTATGTGATTAAGTTgAGTATTGTTTTAAATTTTAcTTTATTTATTATTgTATATTATCTAtTGGTTTATGTATTAAATTACTGAaATGATTAGCCTTGATAAGATTAGATTTAGTAAGTGTTcTAgTTTTATGCTTGATTAGCAGTgATAAAATTAATTTTTtCAAGAAGAtTcTTaTCATCgAATTCTTTTTTATgAACCTTGATATAAATAGCATTTTCCcCTAAACAAATTATTGaTcCtTATATCCCTTTTTGTTTGTGGAGTAGTTGATCTAATTTTACTTTTAGGTTTGGTGtTAGTTTATCTAGTCTGTgcACTTTTGAATTaAAATAAGTAGGCTCTGCCATTATcAAACTAATTATAtACCAAGATACTGATAAGGCTGTACACAAgATAAGCACACCAGCGATACCAAAGTGATcATAAGTAATACCACCAATCATACCTtCGATAAAAATAcCcAAAAATTGACAACTAGAAAATACTCCCAacGCGGTACCTTTACaACCAATgtGAGCTATTTTTGATAgCCATGAAGGTAcACAtGACTCCAGAAATGTAAACGCAGCAAAGAAAAAgGgCcGGATAATTGATAGTAAaAAAGTATGTTTATAGCTAATTACTAAgAGCGCAAGgCATATACCTAGTAGaGCTACTgCGATTACAAgATACTTTgTCtTTTTGCGTTGTACTTCAGCAATgATTACAAAAGGAAACATGATGCTGAATGAGATAATCgAAACtGGTAAGTATACtAACCATTGATAGTCAGCATgTATATTAtGGtTATTTGTCAgAtTTGGTGGAAgTACTATAAACAGTGCTGTTAGTGTGtCATGAAGAGTAAATATGCCATAATTAAGTTTAAcgAGTTCTTTGTGAGAGATCACATCTcTGATTAGTTTAAAAACTGGaTTTGCTtCAgGATGAAAGCTTGGAGCcTTGGGTGTTGGTAaCTTTGTAAaCATGAAAATACcTAGCCaAtCAAAAACTGCAGTCAGCCAgAAAgTTCCTGATAAGCCTATAATaCTATTTAGGATGGAGCTAAtCATCATTtCTcCTaAGAATGAGAAACCtAgCGACATACCTATTAAAtACATCGCTcTGAgGCGaTTTTCTTCTTTAGTtGAtTCaGCCACAAGAGCTGTTAAAGTACTACCTATTGCACCTGCTCCTTGGATTGaTCtCCCGATGATTATGCCATATATAGcGCTTGAGCAGGCAGCGACTATACTGCCAATAATGAAAcgTATTAATCCTgCAAATgTTATTGGTTTGtGCCCAAATTTGTCAGATAGAATGCTTAATACAATTTGAAcCATcGCCTGACTTAAGCCATATACTCCAAGAGCTAAGCCTATCAaAAcTGGTGTGGCATACTCTAgATGATTGATATACgAACTAaAGATTGGGAaGATTgTAAATaACCCcATCATcCTAAAaCTATAaATTAGTGATAcATTTATaGcTGTTTTAACTTCGTTGTtGTACATcTGTTAAgTTGATTTTAATAAGATAGTaATGAGTATAATTAATTGATTTTTATAATTAAACATTAAcATgTgGTAAAtGAcGATTTTTcCGCTAAATTAcGTTGCTTatTATAAGTATCAAAttTTGTAgATAATTTTGATGTTAGGTGATTAACtaATTTTTTATAACCCGAAATcACTAATgtATAAAGTCTTTAGTTAGATATTTTAATTTTTTTGTCATGTATATAGATTAATATGTTAAATTACAGTGATTTTGgaTTTTTAGACATGTTATATATAATcTACTAGCaTGGTGAAATGTGTGcTTGCGTATAAACATaATAaTTTAAtCGTCAATgcAAAGGtAATGTATTTAAAATGAACTGGAAtAAATACTTGcTAATCTTGaCTAGTGTaGTCGGcGTTCTGcCTTTATCTGGTcGTAgGGcTGGTActgGGAATCCGAgcGGTGggATTACAGCACAAGAAAAAtAACTGCTTATCTTTGCAATAGTTCTTATGCTTTTTGTAGTAGTACaAGTTATAATCTTGAaTCTTTcGTTgGCTTGGAAGTAtCGTGATGGTGCTAATGCTGAGTATCGcCCAACTTGGAGTCcgAGTAATAAaCTAGAGATggTATGTTGGGGtGTGcCaTTTATAATAATTtTGATATTAGtTAcaGTTACTTaGAAAACAACACACTCATTGAGTCCTTATAAACCATTAGAATCgGtCAAAAAGCCTGTTGAGATAGAaGTGGTAGCTCTAAATaGGAAATGGATGTTTATTtATCcAGAGTATaATATaGCTACTGTTAACTcTATTGAcATTCCTAAGGATCGCCCAaTTAACTaTAaGATAAtTTCAGCAGCGCgGATGAACTCATTCTTTAgACCAGAGTTAGCAGGACAGATTTATGCAATGACTGGTAtGACCACACAATTGCAcTTGAcAGCgACTCATGAAGGTAAATATAGAGGATTCTCAGCAAcgTATaCTGGTATAGGCTTTGgAGAAATGGAGTcTTTTcCAAAAGcTACAcATCAGGCAGAcTTtGAcAAAcctGTTAAAGATGTTAAGAATGGAAAACAcCAATCATTAACATGGGATTACTTCTaGAGCGATCTAtTTAAAaACTCTATAGtTAATCCAGTAGCTTACTATTCTaATGTCGATAAGAACTTATTTAgCGATATTGTCATGTCTTATATGATGCCAAACTATAAGCCAGGAGACATGGCTTGTAATATGTCTGGTAcGtAtATGCgTCATGATcTGTAGTGTTATTAATAAtaAGTAgTTTTaAATAGtAGACAAATATGCTAGAAGCATTAATTGtAAAATTAAAtAATCCGCAgTTAGTGTTTCCATACCTATATGAACCtGTAAGTCAACAGTTAATTATATTAACtA

1. Анализ последовательности данного фрагмента ДНК проводился с помощью сервера www.ncbi.nlm.nih.gov., при помощи программы Protein blast. На основании сравнений исследуемой последовательности с нуклеотидными базами данных Национального центра по биотехнологической информации (NCBI) (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi), можно сделать предположение, что данный фрагмент ДНК принадлежит организму рода Francisella (обнаружено 94% сходства в последовательности нуклеотидов) Семейства Francisellaceae, Порядка Thiotrichales. Мы не можем точно говорить о видовой принадлежности, т.к. разница между видами в последовательности нукледотидов составляет от 1 до 6 процентов, а до абсолютного сходства нам не хватает 6 процента.

Таблица 1. Предполагаемый вид и процент сходства в последовательности ДНК

Вид	Процент сходства
Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00	94%
Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18	94%
Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200	94%
Francisella tularensis subsp. holarctica LVS	94%

2. Поиск открытых рамок считывания (ОРС) данного фрагмента ДНК, которые содержат более 100 кодонов, производился с помощью программы ORF Finder - Open Reading Frame Finder (http://bioinformatics.org/sms/orf_find.html).

Найдено 8 ОРС

ОРС 1

С 9448 по 9786.(338) нуклеотида

Atgtttatttatccagagtataatatagctactgttaactctattgacattcctaaggatcgcccaattaactataagataatttcagcagcgcggatgaactcattctttagaccagagttagcaggacagatttatgcaatgactggtatgaccacacaattgcacttgacagcgactcatgaaggtaaatatagaggattctcagcaacgtatactggtataggctttggagaaatggagtcttttccaaaagctacacatcaggcagactttgacaaacctgttaaagatgttaagaatggaaaacaccaatcattaacatgggattacttctag

ОРС 2

С 932 по 1312(380) нуклеотида

Atgccatcatatagccaagattttagagacgtcgtaattaataaacatgaagaaggtacgacggagttggagctgagtaccttttttaacataggtaagcgtacagttgattcatggaaagaggtttataaaagaagcggagattatatctcaaagcaaggagttggctttgacagagtccctagctttaccgataaaacattgattgaacagtatttgatagatcatccagatgcaagtgcattagaaataaaagaagcattagcccctgatattccaagaagtacattttatgattgtcttaatagacttggtttgagtcttaaaaaaagactccaaaatagaagcaaagaaaagagcatgaaaggttggagtatatag

ОРС 3

С 8159 по 8509.(350) нуклеотида

Atgaaaatacctagccaatcaaaaactgcagtcagccagaaagttcctgataagcctataatactatttaggatggagctaatcatcatttctcctaagaatgagaaacctagcgacatacctattaaatacatcgctctgaggcgattttcttctttagttgattcagccacaagagctgttaaagtactacctattgcacctgctccttggattgatctcccgatgattatgccatatatagcgcttgagcaggcagcgactatactgccaataatgaaacgtattaatcctgcaaatgttattggtttgtgcccaaatttgtcagatagaatgcttaatacaatttga

ОБРАТНЫЕ ЦЕПИ

ОРС 4

С 1396 по 2649.(1254) нуклеотида

atgtacaacaacgaagttaaaacagctataaatgtatcactaatttatagttttaggatgatggggttatttacaatcttcccaatctttagttcgtatatcaatcatctagagtatgccacaccagttttgataggcttagctcttggagtatatggcttaagtcaggcgatggttcaaattgtattaagcattctatctgacaaatttgggcacaaaccaataacatttgcaggattaatacgtttcattattggcagtatagtcgctgcctgctcaagcgctatatatggcataatcatcgggagatcaatccaaggagcaggtgcaataggtagtactttaacagctcttgtggctgaatcaactaaagaagaaaatcgcctcagagcgatgtatttaataggtatgtcgctaggtttctcattcttaggagaaatgatgattagctccatcctaaatagtattataggcttatcaggaactttctggctgactgcagtttttgattggctaggtattttcatgtttacaaagttaccaacacccaaggctccaagctttcatcctgaagcaaatccagtttttaaactaatcagagatgtgatctctcacaaagaactcgttaaacttaattatggcatatttactcttcatgacacactaacagcactgtttatagtacttccaccaaatctgacaaataaccataatatacatgctgactatcaatggttagtatacttaccagtttcgattatctcattcagcatcatgtttccttttgtaatcattgctgaagtacaacgcaaaaagacaaagtatcttgtaatcgcagtagctctactaggtatatgccttgcgctcttagtaattagctataaacatacttttttactatcaattatccggccctttttctttgctgcgtttacatttctggagtcatgtgtaccttcatggctatcaaaaatagctcacattggttgtaaaggtaccgcgttgggagtattttctagttgtcaatttttgggtatttttatcgaaggtatgattggtggtattacttatgatcactttggtatcgctggtgtgcttatcttgtgtacagccttatcagtatcttggtatataattagtttgataatggcagagcctacttattttaattcaaaagtgcacagactagataaactaacaccaaacctaaaagtaaaattagatcaactactccacaaacaaaaagggatataa

ОРС 5

С 5815 по 6174.(332) нуклеотида

Atgtggtttgcaccagttctcgcttttgttggcgctatatttggtattagatttaacaatcaagacaccgatggcgctgctttcttagctagtatggcatcttttcttggtgctgttttaaccgttgactttactttcttcccatttattatggtatcatataatggtgactatatgtatagtctaactgtttacatctcaagtagtactcaaacatcactgctaggtatattatgcgcagctgttattattgttccgatcataatttgctatacattcgttgtctataagaaaatgtgggttaatggacgaaggacatcagctgaagagattaaagctaattcacacaaaatgtactaa

ОРС 6

С 6628 по 7104.(476) нуклеотида

Atgacaacaactcctgaatgtcaaaaagaatatgtcttttcaaacccaataatatcaattattaaggcatctatatctgcttgtaaaaagttaaatcagtataaaacgtttaacgcaattgataatccaaaaacattagttatggaagatagggctgttacaaatgaactattcccattacagaaattaacaaatgctaaagtgctaataataatcgctaagaaccaagcaataaactctatcgtaaaaggtatagataatattcaccctgatattatgtctacatatactttagaaatagcttatcaacattctaagaactataagatatgccaagtacctgtaaaagttgataataatcaatactacaaagcctttatgtttaataatacatcacaaagtaagaaaattgctcaagggtttgacaactggcttaataataacccgactatccttaaaaaatatacaaaatcttaa

ОРС 7

С 3330 по 3875.(546) нуклеотида

Atggagctaatgtacataagaacatgtaaagaaatttgtaaagatatggtgaagttttggggtaaattactcggaataaactttgcactcgacattattactggtttgaccattgactttgagtctggtcctaagtggtcatactactctcagcccgtatgtgatattttcggaataccactagcaattgaaggtttagcagcatttatgcatgaatcaacatttgctggtttatttttcttcggttgggctaaacttacaaaaagacaacacctactttccactttttgtttagcaattggctcaagtttcccagctttacttattttagttgcaaacggctgcatgcagcagcctgacgcctctcaatttgttgcttcaactattagaatggaggctgttagcttattagatctattcgttatccagacaggccaaacaaattttggccatctgatgactgcaggatatactactgctgcaatcgttgtaatcgggataagtgtattttatccgattagaggtcgtgatatagcatttgcttag

ОРС 8

С 3981 по 4805.(825) нуклеотида

Atggctgctatcgaagcagaatgggatacttctaaagctccagcagcattcaatgcagttgcgctagcgagtcaaaaagaacaaaaaaataactttgatgttcctatccctgtcgtattaggtttaattgcaactcactcaacagatacagaaattccaggaatcaaagctatactctgtggtaaaaagacagctgatcgtacaagagctcccaaccttgcatactacaaagatatgaaaacacgtcaaactgctgatgtttcacctcaagatgcttctgctgatccaagcaaatatgaaaaagtaccttctgctttagttctgatcaaagaaggtggtcttgcatatgctgaccttctaaaatggcgtgagacagtacatagtggtgatagtcctgatagtagctacactgactacaacaactctatttatcagaagtacattggctttggtaaaatgctaggacttgctgctcaagaaaaatatggtgtggctgatccagcaacaattgacaaagctacaaatgatccagaattagtaagagctgttgctactattatggttcctgatgttgctagtgttttctggagctttaggaaaatggtattcatagaattctttctgtttaccttaatagttgttgatctaagtccacttgcgagaacggcccttcctagcaatgcattaaatagatttatcctaagggttatgatttggtcaagaccattaccttatatcgcatgtattgctggcgggtatgtaactgaacatggtcgtcaacctttgactgtttatgacgaactacctacaagtattagttcttaa