
- •Структура и свойства ферментов.
- •Для ферментов и неорганических катализаторов характерны общие свойства:
- •Ферменты классифицируют по химической структуре:
- •Функции белковой и небелковой части фермента.
- •Теории, объясняющие механизм взаимодействия фермента и субстрата.
- •Зависимость скорости реакции от рН
- •Влияние рН.
- •Классификация ферментов.
- •Номенклатура ферментов.
- •Необратимое ингибирование
- •Vmax – одинакова
- •Неконкурентное, обратимое ингибирование.
- •Уровни организации ферментов в клетке.
- •Биологическое окисление.
- •Пути использования энергии переноса электронов.
- •Причины нарушения биологического окисления.
- •Обмен углеводов.
- •Гликолиз.
- •Стадии гликолиза.
- •1. Фосфорилирование глюкозы: реакция протекает необратимо, катализируется гексокиназой и требует затраты атф:
- •Значение анаэробного гликолиза:
- •Пентозофосфатный (апотамический) путь окисления глюкозы.
- •Фосфоенолпируват ббразуется из пирувата через оксалоацетат.
- •Алкоголь тормозит глюконеогенез.
- •Патология обмена углеводов.
- •Особенности обмена глюкозы в клетках опухали.
- •Гликогенозы.
- •Мышечные гликогенозы
- •Гемолитические анемии.
- •Особенности обмена углеводов в различных органах и тканях.
- •1. Обмен углеводов в печени.
- •Регуляция гликолиза.
- •Регуляция пируватдегидрогеназного комплекса.
- •Регуляция цтк.
- •Гормональная регуляция обмена углеводов
- •Механизм действия инсулина
- •Функции жирных кислот
- •Переваривание и всасывание липидов
- •Ресинтез жиров в стенке кишечника
- •Окисление жирных кислот.
- •Этапы -окисления
- •Расчет выхода энергии при окислении жирной кислоты
- •Окисление ненасыщенных жирных кислот
- •Окисление жирных кислот с нечетным числом углеродных атомов
- •Биосинтез жирных кислот
- •Биосинтез холестерина
- •Судьба холестерина в клетке
- •Превращение холестерина в организме
- •Эстерификация холестерина
- •Окисление холестерина.
Неконкурентное, обратимое ингибирование.
Действие неконкурентного ингибитора не может быть устранено увеличением концентрации субстрата.
Неконкурентный
ингибитор не
связывается с активным центром, он
может связываться со свободным ферментом
,
либо с комплексом FS
,
либо с тем и другим, но обе формы JF
и JFS
– не активны.
Km- не изменяется, т.к. нет связывания с активным центром.
Vmax – уменьшается.
Наиболее общий тип неконкурентного ингибирования имеет место при действии реагентов, обратимо связывающих SH-группы цис, входящего в каталитический центр или близко от него. Это ионы Cu2+, Hg2+, Ag+ и их производные с образованием меркаптидов:
Ферменты, для активации которых необходимы ионы Ме ингибируются по такому способу агентами связывающими эти ионы:
ферро
или ферроцианид.
Регуляция активности ферментов.
Использование ферментов в фармации, медицине.
Виды регуляции активности ферментов:
Аллостерическая модификация.
Активация зимогенов.
Регуляция путем химической модификации.
Аллостерическая модификация.
Этот
вид активации характерен для ключевых
обменных процессов:
Ключевой фермент начинает (открывает) процесс.
Ферменты, от активности которых зависит скорость процесса, называются регуляторными или аллостерическими.
Особенности аллостерических ферментов.
Регуляторные ферменты – это олиго или мультиферменты.
Регуляторные ферменты имеют аллостерический центр или центры, которые формируются за счет 2 или нескольких протомеров.
Для регуляторных ферментов характерен сигмоидный характер зависимости скорости реакции от концентрации субстрата.
S-образная форма кривой объясняется по-видимому тем, что регуляторный фермент состоит не из одной полипептидной цепи, а из нескольких. Каждый протомер обладает свойством связывать субстрат (есть субстратные и каталитические центры на каждом протомере) с образованием F-S-комплекса. Активные центры конкурируют между собой за субстрат до тех пор пока не произойдет полного насыщения всех активных центров, после этого скорость реакции быстро достгает максимума.
I
.-
простой фермент
II – регуляторный фермент.
Вещества, связывающиеся с активны центром и изменяющие структуру белковой молекулы фермента, а следовательно и пространственную ориентацию функциональных групп аминокислот, составляющих субстратный и каталитический центры называют модификаторами.
Модификаторы бывают двух видов:
Положительные модификаторы (+) – после присоединения активность ферментов повышается.
Отрицательные модификаторы(-) после взаимодействия с ферментом снижают его активность.
Модификаторы обычно низкомолекулярные вещества. Это субстраты конечные продукты реакции.
Различают три вида регуляторных ферментов:
Гомотропные – для этого класса ферментов субстрат является положительным модулятором или регуляция по принципу прямой положительной связи.
Гетеротропные – активируются другими модификаторами, ингибируются конечным продуктом или регуляция по принципу обратной отрицательной связи.
Гомогетеротропные – для этих ферментов характерно смешанное регулирование и субстратом и другими соединениями.
Активация зимогенов.
Многие пищеварительные ферменты синтезируются в неактивной форме – в виде зимогенов (пепсиноген, трипсиноген и др.).
Эти неактивные зимогены активируются после попадания в ЖКТ, благодаря этому не происходит переваривания клеток, где происходит синтез ферментов. Зимогены не активны, так как содержат дополнительные участки или группы, которые препятствуют доступу субстрата к активному центру. Удаление этой блокирующей группы протеолитическими ферментами приводит к необратимой активации зимогена.
Трипсиноген
Эндопептидаза расщепляет пептидную связь между лиз в положении 6 и лей в положении 7, в результате отщепляется пептид и образуется активный трипсин.
Схема активации зимогена:
По такой схеме происходит активация целого ряда зимогенов:
Пищеварительные ферменты
Ферменты свертывания крови
Белковые гормоны
Кининовая система, компонент
Фибриллярный белок проколлоген коллоген.
Основная черта активации зимогенов заключается в каскадном (последовательном) включении зимогенов с образованием активных ферментов например 12-перстной кишки.
Регуляция путем химической модификации.
По существу это изменение химической структуры активного центра. В некоторых случаях фермент может существовать в клетке в неактивной форме или слабоактивном состоянии, но присоединение фосфатной группы при участии фосфорилирующего фермента, называемого киназой, к аминокислоте вблизи от активного центра, активирует фермент. Такая система может быть возвращена в исходное состояние под действием фермента, отщепляющего фосфатную группу.
Киназа Ф
F
(актив)
F
(неакт) Ф
Фосфотаза – Ф
Такой механизм очень важен, т.к. активность киназы и фосфатазы могут изменяться под действием гормонов.