Поліаденилування мРнк і термінація транскрипції

Рис. 7.8. Впізнання polyA-сигналу та поліаденилування мРНК.

Сигнал термінації транскрипції та поліаденилування (так званий polyA-сигнал) складається з двох елементів послідовності: консенсус AAUAAA і розташована в ~20 нуклеотидах нижче від нього U- або G/U-збагачена послідовність (рис. 7.8). Перший елемент впізнається гетеротетрамерним білком CPSF (Cleavage-Polyadenylation Specificity Factor). Три з чотирьох субодиниць фактора є компонентами базального фактора транскрипції TFIID – вони переносяться на CTD після ініціації, і далі полімераза несе їх на собі, доки вони не зустрінуть сигнал. Другий елемент polyA-сигналу впізнається фактором розрізання РНК СstF (Cleavage stimulation Factor). Взаємодія обох факторів з РНК є кооперативною – вони підсилюють зв'язування одне одного.

Після первинного впізнання polyA-сигналу, поки РНК-полімераза продовжує синтез РНК за сигналом (до 1000 нуклеотидів), до мультибілкового комплексу, що збирається на polyA-сигналі, долучаються polyA-полімераза (РАР), ще два фактори розрізання (Сleavage Factors) CF 1 та 2 та, можливо, інші білки. Збірка комплексу стимулюється зв'язаним з кепом СВС, а також сплайсосомою на останньому інтроні – сплайсинг останнього інтрона та розрізання/поліаденилування РНК здійснюються одночасно і стимулюють одне одного. Зокрема, білок U2AF, що знаходиться на останньому інтроні, взаємодіє з РАР.

Рис. 7.9. Синхронізація поліаденилування і термінації транскрипції.

У межах другого елемента послідовності polyA-сигналу знаходиться консервативний динуклеотид СА, в якому й відбувається розрізання (сleavage) РНК. Від якої конкретно активності залежить це розрізання, залишається невідомим. До 3'-кінця, що з'явився внаслідок розрізу, РАР (при стимулюючій дії CPSF) приєднує один за одним 100-200 аденінових нуклеотидів. З polyA-хвостом, що зростає, відразу зв'язується специфічний білок РАВР (PolyA Binding Protein), який підвищує процесивність РАР (рис. 7.8).

Розрізання/поліаденилування РНК є тригером термінації транскрипції (рис. 7.9). Напевно, впізнання polyA-сигналу та розрізання/поліаденилування факторами, що зв'язані з РНК-полімеразою, індукує конформаційні зміни в полімеразному комплексі, які призводять до зниження спорідненості полімерази до ДНК та/або транскрипту. Крім того, процес розрізання та поліаденилування синхронізовані з так званою котранскрипційною деградацією РНК нуклеазами нижче від polyA-сигналу. Механізми активації такої деградації не з'ясовані, але швидке руйнування транскрипту має стимулювати дисоціацію полімеразного комплексу. Термінація транскрипції іноді потребує також інших регуляторних елементів послідовності. Одні з них можуть знаходитись у межах останнього інтрона та стимулювати/блокувати впізнання polyA-сигналу, інші – нижче від polyA-сигналу та зумовлювати паузи в роботі полімерази, які сприяють термінації.

Рис. 7.10. Схема будови мРНК.

Узагальнену схему будови зрілої еукаріотичної мРНК, яка звільняється з полімеразного комплексу, транспортується у цитоплазму і використовується як матриця для білкового синтезу, представлено на рис. 7.10. Між кепом та початком кодуючої ділянки (стартовим кодоном – найчастіше AUG) розташована 5'-кінцева зона, що не транслюється (5' UTR – UnTranslated Region). За кодуючою ділянкою, що закінчується одним із стоп-кодонів, і перед polyA-послідовністю знаходиться 3'-кінцева зона, що не піддається трансляції. Обидві зони, що не транслюються, містять важливі елементи послідовності, які використовуються для регуляції білкового синтезу (розділ 8).

Майже єдиним виключенням серед інших еукаріотичних мРНК є гістонові мРНК, які не піддаються сплайсингу (гістонові гени не містять інтронів) та поліаденилуванню 3'-кінця. Термінація транскрипції гістонових генів залежить від двох сигнальних елементів послідовності РНК: один утворює шпильку (як у прокаріотів, див. розділ 5), інший спарюється з маленькою ядерною РНК U7; між цими елементами індукується розріз. Аналогічно відбувається термінація транскрипції маленьких ядерних РНК, які також не піддаються поліаденилуванню.