- •Введение
- •1.1 Методические указания по выполнению лабораторных работ
- •(Общие положения).
- •Спектральные методы иссдедования
- •Динамика белковой структуры.
- •2.2. Абсорбционная и дифференциальная спектрофотометрия белков.
- •2.3.Температурно-пертурбационная дифференциальная спектрофотометрия.
- •А. Б. Рубина. М: Наука. 1988
- •3 . Вопросы и задания к лабораторной работе
- •4. Библиографический список
2.2. Абсорбционная и дифференциальная спектрофотометрия белков.
Спектр поглощения белка в УФ-области (230—310 нм) определяется поглощением ароматических аминокислот: триптофана, тирозина и фенилаланина. УФ-свет поглощают хромофорные группы этих аминокислот: индольное кольцо триптофана, фенольное кольцо тирозина и бензольное кольцо фенилаланина.
Основным законом абсорбционной спектрофотометрии является закон Ламберта-Бэра:
I=I0e-lc, (1)
где I интенсивность света, прошедшего через раствор концентрацией с (моль л-1); I0 — интенсивность света, падающего на кювету; l – толщина кюветы; – молярный коэффициент экстинкции (моль-1 х м-1).
Закон Ламберта—Бэра в логарифмической форме запишется следующим образом:
D=lc, (2)
где D—оптическая плотность раствора.
Зависимость D или от длины волны поглощенного света называется спектром поглощения: D=(). Спектральные приборы, которые измеряют спектры поглощения или пропускания вещества, называются спектрофотометрами. На рис.2 изображена блок-схема двухлучевого спектрофотометра.
Спектр поглощения триптофана (рис.1а) имеет максимум поглощения max= 280 нм и небольшой пик 288 нм. Молярный коэффициент экстинкции 280=5,6105 моль-1м-1. Максимум спектра поглощения тирозина max= 275 нм и 275= 1,25105 моль-1м-1. Наиболее слабое поглощение имеет фенилаланин: max = 257.5 нм и 257.5=0,19105 моль-1м-1. Таким образом, характерная полоса поглощения белка с max = 280 им представляет в основном сложение спектров поглощения триптофановых и тирозиновых остатков.
При конформационных перестройках белковых молекул происходит небольшое смещение спектра (меньше 1,0 нм), которое трудно регистрировать на спектрофотометрах. Для повышения чувствительности метода используется дифференциальная спектро-фотометрия. Под дифференциальным спектром понимают разностный спектр, получаемый при автоматическом вычитании из спектра поглощения вещества в измеряемой кювете спектра поглощения вещества в кювете сравнения.Если спектр поглощения в кювете сравнения D(), а при действии определенного фактора в измеряемой кювете наблюдается смещенный на спектр D(+), тогда дифференциальный cпектр будет:
Рис.1. Спектр поглощения (а) и темиературно-пертурбационный дифференциальный спектр (б) триптофана в воде ;(рН == 7,0):
градиент температуры =10; D – дифференциальная оптическая плотность.
D() = D(+) – D() (3)
Если разложить (4.11) в степенной ряд по малому параметру и пренебречь членами второго порядка малости, тогда
(4)
В первом приближении
дифференциальный спектр соответствует
первой производной
от спектра поглощения. Таким образом,
вместо регистрации небольших спектральных
сдвигов
точно измеряют интенсивность
дифференциального поглощения D
на чувствительных дифференциальных
спектрофотометрах.Методы абсорбционной
и дифференциальной спектрофотометрии
широко используются для определения
различных констант равновесия диссоциации
низкомолекулярных лигандов, констант
скорости ассоциации субъединиц в белках,
конформационных изменений в белках,
включая процессы денатурации и ренатурации
белков (см. рис. 4). Конформациониое
состояние белковой глобулы оценивается
определением доступности хромофорных
групп (триптофанилов и тирозинов) для
внешних пертурбантов.
