- •Міністерство освіти і науки України
- •Програма
- •Професор кафедри біоінформатики, д.Ф-м.Н., проф. Горобець о.Ю. _______________
- •Мета та завдання навчальної дисципліни
- •Рекомендований розподіл навчального часу
- •Тема 1. Основні алгоритми біоінформатики.
- •Тема 2. Методи динамічного програмування
- •4. Рекомендована тематика лабораторних робіт (комп’ютерних практикумів)
- •5. Рекомендовані індивідуальні завдання
- •6. Рекомендована література
- •8. Методичні рекомендації
Мета та завдання навчальної дисципліни
1.1. Метою навчальної дисципліни є формування у студентів здатностей:
до вивчення принципів роботи та визначення можливостей використання біоінформаційних методів аналізу порівняння складу, структури та властивостей і взаємодії різних біологічних молекул;
до використання сучасних інформаційних та обчислювальних технологій для підтримки і оновлення баз даних молекулярної біології.
логічно мислити, вирішувати складні проблеми з молекулярної біології з використанням сучасного програмного забезпечення та оволодіння навичками користувача світових баз даних для вирішення задач генетики, мікробіології, медицини та ін.
Згідно з вимогами програми навчальної дисципліни студенти після засвоєння кредитного модуля мають продемонструвати такі результати навчання:
знання :
набуття знань та навичок з оцінки можливостей та практичного використання біоінформаційних баз даних в дослідженнях з молекулярної біології;
уміння:
набуття умінь у написання комп’ютерних програм для побудови різноманітних вирівнювань.
отримання умінь і навичок роботи з основними наявними нуклеотидними ресурсами біоінформаційних баз даних і, як наслідок, вмінь проведення аналізу геномів, виділення з їх складу окремих генів, екзон-інтронної структури окремих нуклеотидних послідовностей, сигнальних послідовностей і т. ін.;
набуття умінь і навичок роботи з основними наявними білковими ресурсами біоінформаційних баз даних і, як наслідок, вмінь проведення аналізу амінокислотних послідовностей, оцінювання ролі окремих складових амінокислотної послідовності у функціонуванні білка, передбачення вторинної та третинної структури білка за її лінійною будовою і т. ін.
набуття умінь і навичок роботи з використання програмних продуктів основних БІБД: GenBank, EMBL, SwissProt, PDB, методу розпізнавання фолда і т. ін.
досвід:
в процесі вивчення дисципліни студенти отримують досвід у написанні програм на мові програмування Ruby та роботи з різними базами даних, а також в майбутньому зможуть аналізувати та працювати в різних базах даних, вивчивши основи їх ієрархії та організації.
2. На вивчення навчальної дисципліни відводиться 108 годин/ 3 кредита ECTS.
Навчальна дисципліна містить 1 кредитний модуль.
Рекомендований розподіл навчального часу
Зміст навчальної дисципліниФорма
навчання
Кредитні модулі
Всього
кредитів
Години
Розподіл навчального часу за видами занять
Семестрова
атестація
Лекції
Практичні
(семінарські) заняття
Комп’ютерні практикуми
СРС
Денна
Всього
3
108
26
-
26
56
1
3
108
26
-
26
56
залік
Заочна
1
3
108
4
-
4
100
залік
Семестровий (кредитний) модуль 1. (з розподілом на розділи)
Розділ 1. Основи курсу.
