 
        
        - •Оглавление
- •ВВЕДЕНИЕ
- •МОДУЛЬ I. СТАТИЧЕСКАЯ БИОХИМИЯ
- •Моносахариды
- •Олигосахариды
- •Классификация
- •Воски
- •Стероиды
- •Липопротеины
- •Гликопротеины
- •Протеогликаны
- •Фосфопротеины
- •Металлопротеины
- •Нуклеопротеины
- •Хромопротеины
- •Гемоглобин
- •Миоглобин
- •Хлорофиллы
- •Флавопротеины
- •Гликопротеины
- •Фосфопротеины
- •Липопротеины
- •Металлопротеины
- •Температура
- •МОДУЛЬ II. ДИНАМИЧЕСКАЯ БИОХИМИЯ
- •Трегалаза
- •Глюконеогенез
- •МОДУЛЬ III. МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ
- •Аминоацил-тРНК-синтетазы
- •БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК
 
| Электронный | учебно-методический комплекс | 
БИОХИМИЯ
И МОЛЕКУЛЯРНАЯ
БИОЛОГИЯ
Учебная программа дисциплины
Конспект лекций
Лабораторный практикум
Методические указания по самостоятельной работе
Банк тестовых заданий в системе UniTest
Красноярск ИПК СФУ
2008
УДК 577.1 ББК 28.072
Б63
Авторы:
Н. М. Титова, А. А. Савченко, Т. Н. Замай, Г. И. Боровкова, Т. Н. Субботина, Е. В. Инжеваткин
Электронный учебно-методический комплекс по дисциплине «Биохимия и молекулярная биология» подготовлен в рамках инновационной образовательной программы «Создание и развитие Департамента физико-химической биологии и фундаментальной экологии», реализованной в ФГОУ ВПО СФУ в 2007 г.
Рецензенты:
Красноярский краевой фонд науки; Экспертная комиссия СФУ по подготовке учебно-методических комплексов дисциплин
| Б63 | Биохимия и молекулярная биология. Версия 1.0 | [Электронный ресурс] : | ||
| 
 | конспект лекций / Н. М. Титова, А. А. Савченко, Т. Н. Замай и др. – Электрон. | |||
| 
 | дан. (10 Мб). – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – (Биохимия и молекулярная | |||
| 
 | биология : УМКД | № 175-2007 / рук. | творч. коллектива Н. М. Титова). – | |
| 
 | 1 электрон. опт. диск (DVD). – Систем. требования : Intel Pentium (или анало- | |||
| 
 | гичный процессор других производителей) 1 ГГц ; 512 Мб оперативной памя- | |||
| 
 | ти ; 10 Мб свободного дискового пространства ; привод DVD ; операционная | |||
| 
 | система Microsoft | Windows 2000 SP 4 / | XP SP 2 / | Vista (32 бит) ; Adobe | 
Reader 7.0 (или аналогичный продукт для чтения файлов формата pdf). ISBN 978-5-7638-0882-7 (комплекса)
ISBN 978-5-7638-1433-0 (конспекта лекций)
Номер гос. регистрации в ФГУП НТЦ «Информрегистр» 0320802400 от 21.11.2008 г. (комплекса)
Настоящее издание является частью электронного учебно-методического комплекса по дисциплине «Биохимия и молекулярная биология», включающего учебную программу, лабораторный практикум, методические указания к самостоятельной работе, контрольно-измерительные материалы «Биохимия и молекулярная биология. Банк тестовых заданий», наглядное пособие «Биохимия и молекулярная биология. Презентационные материалы».
Изложены современные представления о структуре и функциях белков, нуклеиновых кислот, углеводов и липидов, путях биосинтеза и распада этих биополимеров, механизме ферментативного катализа, его регуляции. Даны сведения о важнейших группах ферментов и коферментов, их структуре, участии окислительных ферментов в осуществлении процессов тканевого дыхания, его энергетической эффективности. Особое внимание уделено структуре и механизму действия на обмен веществ витаминов.
Предназначен для студентов направления подготовки бакалавров 020200.62 «Биология» укрупненной группы 020000 «Естественные науки».
© Сибирский федеральный университет, 2008
Рекомендовано к изданию Инновационно-методическим управлением СФУ
Редактор В. Р. Наумова
Разработка и оформление электронного образовательного ресурса: Центр технологий электронного обучения информационно-аналитического департамента СФУ; лаборатория по разработке мультимедийных электронных образовательных ресурсов при КрЦНИТ
Содержимое ресурса охраняется законом об авторском праве. Несанкционированное копирование и использование данного продукта запрещается. Встречающиеся названия программного обеспечения, изделий, устройств или систем могут являться зарегистрированными товарными знаками тех или иных фирм.
Подп. к использованию 22.09.2008 Объем 10 Мб
Красноярск: СФУ, 660041, Красноярск, пр. Свободный, 79
 
| Оглавление | 
 | 
| Введение.................................................................... | 9 | 
| Модуль I. Статическая биохимия .......................... | 11 | 
| Лекция 1 Строение, свойства, биологическая роль моно – и олигосахаридов11 | |
| Классификация углеводов.......................................................................................... | 11 | 
| Моносахариды............................................................................................................. | 12 | 
| Стереоизомерия моносахаридов............................................................................... | 15 | 
| Представители моносахаридов................................................................................. | 16 | 
| Олигосахариды............................................................................................................ | 18 | 
| Отдельные представители дисахаридов.................................................................. | 20 | 
| Лекция 2 Строение, свойства, биологическая роль гомо – | 
 | 
| и гетерополисахаридов............................................................................................... | 21 | 
| Отдельные представители полисахаридов.............................................................. | 24 | 
| Лекция 3 Строение, свойства, биологическая роль простых липидов............ | 26 | 
| Классификация............................................................................................................ | 26 | 
| Воски............................................................................................................................ | 28 | 
| Нейтральные жиры (триацилглицеролы, триглицериды)........................................ | 29 | 
| Стероиды..................................................................................................................... | 30 | 
| Желчные кислоты....................................................................................................... | 32 | 
| Лекция 4 Строение, свойства, биологическая роль сложных липидов............ | 33 | 
| Лекция 5 Аминокислотный состав белков.............................................................. | 40 | 
| Белки и их функции..................................................................................................... | 40 | 
| Элементарный состав белков.................................................................................... | 42 | 
| Методы выделения и очистки белков....................................................................... | 42 | 
| Аминокислотный состав белков................................................................................. | 44 | 
| Химические свойства аминокислот........................................................................... | 45 | 
| Классификация аминокислот, заменимые и незаменимые аминокислоты........... | 47 | 
| Лекция 6 Уровни структурной организации белков............................................... | 50 | 
| Структурная организация белков.............................................................................. | 50 | 
| Первичная структура белка: методы исследования. Структурные особенности | 
 | 
| пептидной связи.......................................................................................................... | 51 | 
| Номенклатура пептидов и полипептидов. Природные пептиды: глутатион, | 
 | 
| карнозин, ансерин, грамицидин S, окситоцин, энкефалины................................... | 52 | 
| Вторичная структура белков: α-спираль, ее основные характеристики, β- | 
 | 
| структура, β-изгиб. Роль водородных связей в формировании вторичной | 
 | 
| структуры. Сверхвторичные (надвторичные) структуры белка.............................. | 55 | 
| Третичная структура белков. Типы нековалентных связей, стабилизирующих | 
 | 
| третичную структуру. Роль S-S-мостиков в формировании третичной структуры | |
| некоторых белков........................................................................................................ | 58 | 
| Четвертичная структура белков. Количество и типы субъединиц. заимодействия | |
| между субъединицами, стабилизирующие четвертичную структуру. | 
 | 
| Функциональное значение четвертичной структуры белков................................... | 60 | 
| Биохимия и молекулярная биология. Конспект лекций | -3- | 
 
| ОГЛАВЛЕНИЕ | 
 | 
| Лекция 7 Физико-химические свойства белков...................................................... | 62 | 
| Ионизация, гидратация, растворимость, осмотические и онкотические свойства, | |
| оптические свойства................................................................................................... | 62 | 
| Молекулярная масса и размеры белков. Методы определения молекулярной | 
 | 
| массы белков. Необходимость применения комплекса методов для точной оценки | |
| молекулярной массы белков...................................................................................... | 64 | 
| Денатурация белков.................................................................................................... | 67 | 
| Лекция 8 Классификация белков. простые и сложные белки............................. | 68 | 
| Принципы классификации белков............................................................................. | 68 | 
| Фибриллярные белки.................................................................................................. | 68 | 
| Глобулярные белки..................................................................................................... | 70 | 
| Сложные белки............................................................................................................ | 70 | 
| Лекция 9 Сложные белки ............................................................................................ | 79 | 
| Гликопротеины............................................................................................................ | 79 | 
| Фосфопротеины.......................................................................................................... | 83 | 
| Липопротеины.............................................................................................................. | 83 | 
| Металлопротеины....................................................................................................... | 85 | 
| Лекция 10 Строение, свойства, биологическая роль нуклеотидов.................... | 87 | 
| Циклические нуклеотиды............................................................................................ | 92 | 
| Лекция 11 Строение, свойства, биологическая роль нуклеиновых кислот...... | 93 | 
| Транспортные РНК.................................................................................................... | 101 | 
| Матричные РНК......................................................................................................... | 102 | 
| Рибосомальные РНК................................................................................................. | 103 | 
| Лекция 12 Витамины – биологическая роль, классификация. | 
 | 
| Водорастворимые витамины.................................................................................. | 105 | 
| Витамин В1 (тиамин) ................................................................................................. | 107 | 
| Витамин В2 (рибофлавин) ........................................................................................ | 108 | 
| Витамин В3 (РР, никотиновая кислота, никотинамид) ........................................... | 109 | 
| Витамин В5 (пантотеновая кислота) ........................................................................ | 110 | 
| Витамин В6 (пиридоксин, пиридоксаль, пиридоксамин)......................................... | 111 | 
| Витамин В9 (фолиевая кислота) .............................................................................. | 112 | 
| Витамин В12 (кобалами) ............................................................................................ | 113 | 
| Витамин Н (биотин)................................................................................................... | 114 | 
| Витамин С (аскорбиновая кислота) ......................................................................... | 115 | 
| Витамин Р (рутин) ..................................................................................................... | 116 | 
| Лекция 13 Жирорастворимые витамины............................................................... | 117 | 
| Витамин А (ретинол) ................................................................................................. | 117 | 
| Витамин D (кальциферол)........................................................................................ | 119 | 
| Витамин Е (токоферол) ............................................................................................ | 121 | 
| Витамин К (нафтохинон)........................................................................................... | 122 | 
| Лекция 14 Ферменты – строение: свойства, механизм действия..................... | 123 | 
| Понятие о ферментах. Сущность явлений ферментативного катализа.............. | 123 | 
| Структурная организация ферментов..................................................................... | 125 | 
| Изоферменты: биологическая роль........................................................................ | 135 | 
| Механизм действия ферментов............................................................................... | 138 | 
| Биохимия и молекулярная биология. Конспект лекций | -4- | 
 
| ОГЛАВЛЕНИЕ | 
 | 
| Специфичность действия ферментов..................................................................... | 141 | 
| Стационарная кинетика ферментативных реакций............................................... | 144 | 
| Единицы ферментов................................................................................................. | 152 | 
| Лекция 15 Регуляция ферментативной активности. Классификация | 
 | 
| ферментов.................................................................................................................... | 154 | 
| Активирование и ингибирование ферментов......................................................... | 154 | 
| Активаторы ферментов............................................................................................ | 154 | 
| Ингибиторы ферментов............................................................................................ | 154 | 
| Регуляция каталитичекой активности ферментов................................................. | 160 | 
| Классификация и номенклатура ферментов.......................................................... | 166 | 
| Ферменты в клинической диагностике. Энзимопатии............................................ | 169 | 
| Модуль II. Динамическая биохимия ................... | 170 | 
| Лекция 16 Обмен веществ и энергии в живых системах. Расщепление | 
 | 
| углеводов в пищеварительном тракте................................................................... | 170 | 
| Понятие метаболизма. Центральные и специальные метаболические пути..... | 170 | 
| Катаболические, анаболические, амфиболические пути...................................... | 172 | 
| Метаболизм углеводов............................................................................................. | 175 | 
| Расщепление углеводов в пищеварительном тракте............................................ | 176 | 
| Всасывание моносахаридов в тонком кишечнике и их дальнейший транспорт. | |
| Глюкозные транспортеры......................................................................................... | 181 | 
| Лекция 17 Анаэробный катаболизм углеводов.................................................... | 185 | 
| Анаэробное окисление глюкозы. Гликолиз. Внутриклеточная локализация | 
 | 
| процесса..................................................................................................................... | 185 | 
| Отдельные реакции гликолиза, их термодинамические характеристики. | 
 | 
| Образование 2,3-дифосфоглицерата в шунте Рапопорта-Люберинга................ | 187 | 
| Расщепление гликогена (гликогенолиз). Строение, механизм действия и | 
 | 
| регуляция гликогенфосфорилазы........................................................................... | 194 | 
| Спиртовое и молочнокислое брожение .................................................................. | 199 | 
| Лекция 18 Аэробный катаболизм углеводов (часть 1).................................... | 200 | 
| Аэробный метаболизм пирувата. Митохондрии: структура и энергетические | 
 | 
| функции...................................................................................................................... | 200 | 
| Окислительное декарбоксилирование пирувата. Строение мультиферментного | |
| пируватдегидрогеназного комплекса. Суммарное уравнение и энергетический | |
| баланс окислительного декарбоксилирования пирувата. Регуляция активности | |
| пируватдегидрогеназного комплекса: ковалентная модификация, | 
 | 
| аллостерический механизм...................................................................................... | 201 | 
| Цикл лимонной кислоты. Отдельные реакции цикла, их термодинамическая | 
 | 
| характеристики. Суммарное уравнение окисления ацетил-CоА в цикле Кребса202 | |
| Лекция 19 Аэробный катаболизм углеводов (часть 2).................................... | 207 | 
| Регуляция цикла Кребса на уровне цитратсинтазы, изоцитратдегидрогеназы и α- | |
| кетоглутаратдегидрогеназного комплекса.............................................................. | 207 | 
| Амфиболическое значение цикла Кребса. Необходимость анаплеротических | |
| путей, пополняющих запас компонентов, участвующих в цикле......................... | 209 | 
| Биохимия и молекулярная биология. Конспект лекций | -5- | 
 
| ОГЛАВЛЕНИЕ | 
 | 
| Зависимое от АТP и биотина карбоксилирование пирувата: анаплеротический | 
 | 
| путь синтеза оксалоацетата..................................................................................... | 212 | 
| Пентозофосфатный путь (гексозомонофосфатный шунт) .................................... | 214 | 
| Отдельные реакции ПФП, их термодинамические характеристики. Суммарное | |
| уравнение пентозофосфатного пути. Регуляция пентозофосфатного пути на | 
 | 
| уровне глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы............................................................... | 215 | 
| Участки перекреста ПФП с гликолизом................................................................... | 218 | 
| Циклический характер ПФП ..................................................................................... | 219 | 
| Лекция 20 Биосинтез углеводов.............................................................................. | 220 | 
| Глюконеогенез........................................................................................................... | 222 | 
| Лекция 21 Расщепление пищевых и тканевых липидов..................................... | 226 | 
| Катаболизм липидов................................................................................................. | 228 | 
| Всасывание продуктов расщепления липидов....................................................... | 231 | 
| Транспорт липидов ................................................................................................... | 233 | 
| Метаболизм глицерола............................................................................................. | 234 | 
| Лекция 22 Катаболизм жирных кислот................................................................... | 234 | 
| Активация жирной кислоты...................................................................................... | 235 | 
| Транспорт ацил-СоА в митохондрии....................................................................... | 236 | 
| β-окисление жирных кислот..................................................................................... | 237 | 
| Катаболизм ненасыщенных жирных кислот........................................................... | 240 | 
| Катаболизм жирных кислот с нечетным числом атомов углерода....................... | 241 | 
| Образование кетоновых тел (кетогенез)................................................................. | 242 | 
| Кетоновые тела как источники энергии................................................................... | 244 | 
| Глиоксилатный цикл.................................................................................................. | 245 | 
| Лекция 23 Биосинтез жирных кислот и триацилглицеролов............................. | 247 | 
| Строение синтазы жирных кислот........................................................................... | 247 | 
| Механизм синтеза жирных кислот........................................................................... | 250 | 
| Транспорт ацетил-СоА из митохондрий в цитозоль.............................................. | 250 | 
| Образование малонил-СоА...................................................................................... | 251 | 
| Наращивание (элонгация) углеродной цепи жирной кислоты.............................. | 253 | 
| Синтез других предельных и непредельных ЖК.................................................... | 255 | 
| Биосинтез триацилглицеролов................................................................................ | 258 | 
| Лекция 24 Биосинтез холестерола и желчных кислот........................................ | 260 | 
| Биосинтез холестерола............................................................................................ | 260 | 
| Регуляция биосинтеза ХС........................................................................................ | 265 | 
| Биосинтез желчных кислот....................................................................................... | 266 | 
| Лекция 25 Биологическое окисление...................................................................... | 268 | 
| Роль высокоэнергетических фосфатов в биоэнергетике. Биологическая роль | 
 | 
| АТР. Свободная энергия гидролиза АТФ и других органических фосфатов...... | 268 | 
| Биологическое окисление. Ферменты, участвующие в биологическом | 
 | 
| окислении................................................................................................................... | 269 | 
| Свободное окисление и его биологическая роль. Цитохром Р-450 .................... | 272 | 
| Лекция 26 Субстратное и окислительное фосфорилировние. Дыхательная | 
 | 
| цепь............................................................................................................................... | 273 | 
| Биохимия и молекулярная биология. Конспект лекций | -6- | 
 
| ОГЛАВЛЕНИЕ | 
 | 
| Окисление, сопряжённое с фосфорилированием АDР. Окислительно- | 
 | 
| восстановительные потенциалы дыхательных переносчиков. Субстратное | 
 | 
| фосфорилирование на примере реакций, катализируемых глицеральдегид-3- | |
| фосфатдегидрогеназой и енолазой. Понятие энергетического заряда клетки | . .. 273 | 
| Цепь переноса электронов и протонов внутренней мембраны митохондрий | 
 | 
| (дыхательная цепь, редокс-цепь). Компоненты дыхательной цепи: | 
 | 
| флавопротеины, железосерные белки, коэнзим Q, цитохромы в, с1, с, аа3. | 
 | 
| Топография дыхательных переносчиков в редокс-цепи....................................... | 277 | 
| Энергетическое значение ступенчатого транспорта электронов от окисляемых | |
| субстратов к молекулярному кислороду. Окислительное фосфорилирование в | |
| дыхательной цепи..................................................................................................... | 283 | 
| Организация компонентов дыхательной цепи в виде четырех комплексов: NADH- | |
| дегидрогеназы, сукцинатдегидрогеназы, цитохромов вс1, цитохромоксидазы. | |
| Роль коэнзима Q и цитохрома с в интеграции комплексов. Коллекторная функция | |
| NAD+ и коэнзима Q в дыхательной цепи. Коэффициент окислительного | 
 | 
| фосфорилирования Р/О, Р/2е.................................................................................. | 285 | 
| Локализация пунктов сопряжения окисления и фосфорилирования в дыхательной | |
| цепи на основании редокс-потенциалов, действия специфических ингибиторов | |
| (ротенон, амитал, антимицин А, цианид, СО, NaN3) .............................................. | 289 | 
| Полные и редуцированные дыхательные цепи..................................................... | 290 | 
| Лекция 27 Механизмы образования и использования АТР в живых | 
 | 
| системах....................................................................................................................... | 291 | 
| Представления о механизмах сопряжения окисления и фосфорилирования в | |
| дыхательной цепи. Хемиосмотическая теория Митчелла. Электрохимический | |
| протонный градиент как форма запасания энергии............................................... | 291 | 
| Строение АТP-синтазного комплекса. Механизм образования АТP. Обратимость | |
| реакции, катализируемой АТP-синтазой. Разобщение транспорта электронов и | |
| синтеза АТP; действие 2,4-динитрофенола........................................................... | 292 | 
| Механизм образования АТP..................................................................................... | 295 | 
| Окисление цитоплазматического NADH в дыхательной цепи. | 
 | 
| Глицеролфосфатный и малат-аспартатный челночные механизм...................... | 296 | 
| Лекция 28 Интеграция клеточного метаболизма.................................................. | 298 | 
| Основные аспекты регуляции метаболизма .......................................................... | 300 | 
| Регуляция на уровне транскрипции......................................................................... | 301 | 
| Аллостерическая регуляция активности ферментов............................................. | 301 | 
| Ковалентная модификация ферментов.................................................................. | 302 | 
| Гормональная регуляция.......................................................................................... | 303 | 
| Посттранскрипционная и посттрансляционная модификация макромолекул..... | 304 | 
| Изменение концентрации метаболитов.................................................................. | 304 | 
| Мембранная регуляция ............................................................................................ | 305 | 
| Модуль III. Молекулярная биология.................... | 307 | 
| Лекция 29 Репликация ДНК....................................................................................... | 307 | 
| Точность репликации................................................................................................ | 314 | 
| Репликация ДНК у эукариот..................................................................................... | 315 | 
| Биохимия и молекулярная биология. Конспект лекций | -7- | 
 
| ОГЛАВЛЕНИЕ | 
 | 
| Репаративный синтез ДНК....................................................................................... | 316 | 
| Лекция 30 Транскрипция (биосинтез РНК) ............................................................. | 317 | 
| Транскрипция у прокариот........................................................................................ | 319 | 
| Инициация транскрипции......................................................................................... | 320 | 
| Элонгация транскрипции.......................................................................................... | 322 | 
| Терминация транскрипции....................................................................................... | 323 | 
| Транскрипция у эукариот.......................................................................................... | 324 | 
| Процессинг первичных транскриптов РНК.............................................................. | 325 | 
| Регуляция генной экспрессии на уровне транскрипции......................................... | 327 | 
| Механизм индукции на примере Lac-оперона........................................................ | 329 | 
| Катаболитная репрессия.......................................................................................... | 330 | 
| Лекция 31 Трансляция (биосинтез белка) .............................................................. | 331 | 
| Система активации и транспорта аминокислот в рибосомы................................. | 332 | 
| Роль тРНК в трансляции ......................................................................................... | 333 | 
| Аминоацил-тРНК-синтетазы .................................................................................... | 333 | 
| Белоксинтезирующая система клетки..................................................................... | 334 | 
| Инициация трансляции............................................................................................. | 335 | 
| Элонгация трансляции ............................................................................................. | 338 | 
| Терминация трансляции........................................................................................... | 341 | 
| Эффективность трансляции..................................................................................... | 342 | 
| Точность белкового синтеза..................................................................................... | 342 | 
| Энергетические затраты на трансляцию................................................................ | 342 | 
| Посттрансляционные модификации полипептидной цепи.................................... | 342 | 
| Библиографический список................................ | 345 | 
| Основная литература................................................................................................. | 345 | 
| Дополнительная литература.................................................................................... | 346 | 
| Биохимия и молекулярная биология. Конспект лекций | -8- | 
