
бышевский-биохимия для врача
.pdf


3.2. Биоэнергетика
Напомним, что источник энергии, используемый организмом для выполнения всех видов работ (химической, механической, электрической и осмотической),
— это энергия химической связи. Высвобождение энергии углеводов, белков, липидов и других органических соединений происходит при их окислительно восстановительном распаде. Высвободившаяся энергия затрачивается на син тез универсального аккумулятора энергии — аденозинтрифосфорной кислоты (АТФ) или ее аналогов. Системы или клетки организма, обеспечивающие выполнение химической, механической, электрической и осмотической работы, используют в качестве источника энергии только эти универсальные для живого соединения (см. рис. 2).
Сейчас нам предстоит рассмотреть механизмы высвобождения и запасания энергии, т.е. окислительно-восстановительные процессы и синтез АТФ. Эти процессы протекают в митохондриях.
Митохондрии— органеллы овальной формы. Их длинник около 2, поперечный размер — около 0,5 мкм. Электронно-микроскопические исследования показали, что митохондрии имеют две мембранные системы: наружную мембрану и внутреннюю с большой поверхностью. Внутренняя мембрана образует множество складок, которые называют кристами. Пространство между наружной и внутренней мембраной называют межмембранным пространством. Замкнутое пространство, ограниченное внутренней мембраной, — матрикс. Н аруж ная мембрана проницаема для большинства мелких молекул и ионов, внутренняя
— почти для всех ионов (исключение составляют протоны Н+) и для большинства незаряженных молекул. Окисление тех или иных субстратов может происходить как на внешней стороне внутренней мембраны, так и в матриксе. Доставка ряда соединений в матрикс обеспечивается специальными транспортными системами. В толщ е внутренней мембраны вмонтированы дыхательны е ферменты — собственно структурные элементы мембраны (рис.36 и 37).
3.2.1. Продуцирование энергии
Основной источник энергии в клетке — окисление субстратов кислородом воздуха. Реализоваться окисление может тремя различными, но эквивалентны ми способами: присоединением кислорода к атому углерода в субстрате, отщеплением водорода или потерей электрона. В клетке окисление протекает в форме последовательного переноса водорода и электронов от субстрата к ■кислороду. Кислород играет в этом случае роль восстанавливающегося соеди нения (окислителя). Соединения, последовательно принимающие и отдающие протоны и электроны, играют роль промежуточных переносчиков (рис. 38).
Окислительные реакции протекают с высвобождением энергии, т.е. они экзэргоничные.
Для биологических реакций характерны сравнительно небольшие изменения энергии. Этот эффект достигается представленным на схеме (рис. 38) дробле нием реакции окисления на ряд промежуточных стадий. Если бы реакция протекала непосредственно между субстратом и кислородом, то вся энергия окисления высвобождалась бы одновременно. Это затрудняло бы ее использо вание и сопровождалось бы большими потерями (рассеивание тепла).
Итак, биологическое окисление представляет процесс, в ходе которого
окисляющиеся субстраты теряют протоны и электроны, т.е. являются донаторами водорода, промежуточные переносчики — акцепторами-дона торами, а кислород — конечным акцептором водорода.
Восстановление атома кислорода при взаимодействии с парой протонов и электронов приводит к образованию молекулы воды. Следовательно, кислород потребляется в процессе биологического окисления. Клетка, ткань или орган, в которых протекает окисление субстратов, потребляют кислород. Потребление кислорода тканями обозначают термином тканевое дыхание. Понятие биоло гическое окисление и тканевое дыхание однозначны, если речь идет о биоло гическом окислении при участии кислорода. Такой тип окисления можно называть еще аэробным окислением. Это основной путь окисления, поставщик значительной части энергии, в которой нуждается клетка (организм).
Наряду с кислородом роль конечного акцептора в цепи переноса водорода, отнятого у субстрата, могут играть и другие соединения, восстанавливающиеся при этом в дигидропродукты. Например, пировиноградная кислота может выступать как акцептор водорода при дегидрировании 3-фосфоглицеринового альдегида.
|
+ 2 Н+ |
СН - С - СООН |
--------- ►сн3 - СН - СООН |
I |
I |
о |
он |
Биологическое окисление с участием в качестве конечного акцептора водорода любого соединения, кроме кислорода, принято обозначать как анаэробное окисление.
Итак, биологическое окисление — дегидрирование субстрата с помощью промежуточных переносчиков водорода и его конечного акцептора. Если в роли конечного акцептора выступает кислород, процесс называют аэробным окислением, или тканевым дыханием, если конечный акцептор представлен не кислородом — анаэробным окислением. Анаэробное окисление имеет ограни ченное значение у высших организмов.
Как следует из схемы, данной на рис. 38, для биологического окисления необходимы система переноса протонов и электронов и система доставки в ткани кислорода.
Ферменты тканевого дыхания (дыхательная цепь) — это переносчики протонов и электронов от окисляемого субстрата на кислород. Способность принимать электроны и определяет соединение как окислитель. Т акая способ ность соединения может быть охарактеризована количественно как его окис лит ельно-восст ановит ельны й пот енциал по отношению к стандартному водородному электроду, pH которого равен нулю. В биологии предпочитают использовать систему, соответствующую pH 7,0. Чем меньше потенциал от дельного звена системы, тем сильнее его восстанавливающие свойства, и наоборот, чем больше потенциал, тем выше окислительные свойства. Таким образом, любое соединение может отдать элект роны т олько соединению с более высоким окислительно-восстановительным потенциалом.
Дыхательная цепь включает последовательно звенья с нарастающим значе нием окислительно-восстановительного потенциала. Эта последовательность такова (табл. 4).
Дегидрогеназы катализируют дегидрирование многочисленных субстратов,
|
|
|
Таблица 4 |
|
Последовательность расположения элементов |
||
|
дыхательной цепи |
|
|
№ |
Название |
Окислительно-восстановитель |
|
л /п |
|
ный потенциал, В |
|
0 |
Окисляемый субстрат |
Меньше - 0,32 |
|
1 |
Дегидрогеназа НАДили НАДФ-зависимая |
- 0,32 |
|
2 |
Дегидрогеназа Ф АД - или ФМН-зависимая |
- 06 |
|
3 |
Убихинон |
+ |
0,1 |
4 |
Цитохром Ь |
+ |
0,26 |
5 |
Цитохром с |
+ |
0,29 |
6 |
Цитохром а+а3 |
+ |
0,81 |
7 |
Кислород |
+ |
0,81 |
N H 2
I
С N\ / ^
N С СН
I II
НС с
/ \ /
N N
О
Аденин
Рибозо-5-фосфат
CONH„ Никотинамид
Рибозо-5-фосфат
Никотинамидадениндинуклеотид (НАД)
отличаются специфичностью и содержат один из следующих коферментов: НАД или НАДФ, ФМН или ФАД.
Кофермент НАД представляет собой два нуклеотида, соединенные через остатки фосфорной кислоты (смотрите схему).
НАДФ — никотинамидадениндинуклеотидфосфат содержит дополнительно третий остаток фосфорной кислоты в положении 2 остатка рибозы в адениловом нуклеотиде.
Кофермент НАД или НАДФ, а именно та его часть, которая представлена пиридиновым кольцом никотинамида, способна присоединясь электроны и протоны, является непосредственным переносчиком водорода.
ФАДили ФМН-зависимые дегидрогеназы катализирую т ограниченное число субстратов, в первую очередь НАД восстановленный, янтарную кислоту, некоторые аминокислоты, жирные кислоты, ксантин. Наиболее важ ная из этих дегидрогеназ ФМ Н-зависимая дегидрирует НАД • Н2остальные дегидрогеназы ФАД-зависимые.
Существуют флавиновые дегидрогеназы, содержащ ие металлы — металлофлавопротеиды. Чащ е всего это ж елезо и молибден.
Структура флавинадениндинуклеотида (ФАД) представлена ниже на стр. 57.
|
|
|
|
|
|
|
|
NH, |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
I |
|
N |
|
|
|
|
|
|
|
|
С |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
// \ |
/ |
^ |
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
С |
СН |
|
|
|
|
|
|
|
|
I |
I |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
НС |
с |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
/ |
\ |
X |
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
|
N |
|
ОН ОН о н |
0 |
О |
|
|
|||||
|
I |
|
I |
I |
|
|
П |
I |
|
|
сн - с - с - с - с н 2 - о Р - О - Р - |
|
|
||||||||
|
|
|
|
|
|
|
1 |
I |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ОН |
ОН |
|
Н |
|
|
н |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N N |
|
|
|
|
|
|||
|
|
C |
|
\ |
|
|
|
|||
н ,с - |
//S S |
\У |
|
/ |
Аденозин |
|
||||
С |
8 |
с |
с |
1 |
с = о |
|
||||
|
1 |
|
|
1 |
|
|
|
|||
Н,С - |
С |
|
С |
С |
\ |
NH |
|
|
|
|
|
\ ч |
/ \ |
/ S |
|
/ |
|
|
|
||
|
|
С |
|
N |
|
|
С |
|
|
|
|
|
Н |
|
|
|
|
I |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
О |
|
|
|
Рибофлавин (витамин В2) |
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
Флавинадениндинуклеотид (ФАД) |
|
|
ФМН (флавомононуклеотид) представляет собой фосфорный эфир витамина
в,-
Убихинон (кофермент Q) дегидрирует флавопротеиды. По структуре это хиноновое кольцо с длинной изопреноидной цепью
ОН
I |
|
С |
СН, |
/ / |
\ / |
Н,СО - с |
с |
I |
I |
н ,с о - с |
с |
Чч |
/ \ |
С |
R |
I |
|
ОН В осстан овлен н ы й убихи нон
Присоединяя два атома водорода, убихинон переходит в гидрохинон. Цитохромы — белки-хромопротеиды, способные переносить электроны
благодаря наличию в их составе ионов металла. Простетическая группа напоминает по структуре гем.
Простетическая группа цитохромов связана с двумя остатками цистеина в белковой части фермента через винильные группировки, а через ж елезо — с остатками основных аминокислот. В отличие от гема атом ж елеза в цитохроме может обратимо переходить из дву- в трехвалентное состояние. Это и обеспе чивает участие цитохрома в транспорте электронов.
Из большого числа цитохромов, имеющихся в тканях, изучены цитохромы Ь, с, а и а3. Два последних «работают» в ассоциации как один фермент (цитохромоксидаза а+ а3). Этот фермент акцептирует электроны от цитохрома

Типы дегидрирования. Действию дегидрогеназ доступна пара атомов водо рода, занимающая определенное положение в органическом соединении. В связи с этим можно различать следующие случаи дегидрирования:
1. Дегидрирование насыщенных соединений осуществляется путем отнятия двух атомов водорода, связанных с соседствующими атомами углерода —
R |
|
|
|
|
|
|
I |
|
|
£ |
(продукт |
реакции — нена- |
|
С |
Н |
- 2Н+ |
||||
ц |
сыщенное |
соединение) |
||||
I |
|
|
||||
С |
Н |
|
С |
|
|
|
I |
|
|
I |
|
|
|
R |
|
|
|
|
|
2. Дегидрирование первичных спиртов — отнятие атома водорода спиртовой группы и атома водорода, связанного с углеродом —
|
R |
|
|
|
R |
|
|
|
|
|
I |
^ |
2Н+ |
|
I |
(продукт реакции |
|
|
|
Н |
- С |
О н |
|
|
С = О |
альдегид) |
|
|
|
|
I |
|
|
|
I |
|
|
|
|
|
Н |
|
|
|
н |
|
|
|
|
|
3. Дегидрирование вторичных спиртов по аналогии с первичными |
|
|||||||
|
R |
|
|
|
R |
(продукт — кетон) |
|
|
|
Н |
- С |
- О [Н |
- 2Н+ |
|
I |
|
|
||
|
|
-*С = О |
|
|
|
|
|||
|
I |
|
|
|
I |
|
|
|
|
|
R |
|
|
|
R |
|
|
|
|
|
4. Дегидрирование ненасыщенных соединений протекает в два этапа: гидра |
||||||||
тация с образованием спирта, затем по аналогии со спиртом |
|
|
|||||||
R |
|
|
|
R |
|
R |
(продукт |
— |
|
|
1 |
+НОН |
Н — |
1 |
- 2Н+ |
1 |
кетон) |
|
|
- С - Н |
С — ОН |
С = О |
|
|
|||||
|
I |
------------------ ► |
|
I |
• |
I |
|
|
|
- С - Н |
|
|
Н — С — Н |
|
С - Н |
|
|
||
|
I |
(1-й этап) |
|
I |
(2-й этап) |
I |
|
|
|
R |
|
R |
R |
|
|
||||
|
5. Дегидрирование альдегидов происходит в два этапа: образование гидрати |
||||||||
рованного соединения с последующим отнятием двух атомов водорода |
|
||||||||
^ О |
|
|
|
^ О Н |
|
|
(продукт |
— |
|
С - Н |
+НОН |
Н — |
С — ОН |
- 2Н+ |
СООН |
кислота) |
|
||
I |
|
|
► |
|
I |
► |
I |
|
|
R |
|
(1-й |
этап) |
|
R |
(2-й этап) |
R |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
6. Дегидрирование аминокислот протекает по аналогии с дегидрированием |
||||||||
вторичных спиртов |
|
|
|
|
|
|
|||
|
СООН |
- 2Н+ |
СООН |
|
|
|
|
||
Н |
С |
- N Н |
I |
|
|
|
|
||
|
• |
С = NH |
|
|
|
|
|||
|
I |
|
|
|
I |
|
|
|
|
|
R |
|
|
|
R |
|
|
|
|
Анализ типов дегидрирования показывает, что дегидрогеназы отнимают пару атомов водорода только в том случае, если они соединены с двумя соседствующими атомами углерода или с одним при условии, что один из них связан с атомом углерода через кислород, т.е. дегидрированию подлеж ат только
насыщенные соединения или спирты. Многие химические превращ ения можно рассматривать как подготовку субстрата к действию дегидрогеназы — к окислению. Примеры этому — реакции дегидрирования ненасыщенных соеди нений и альдегидов.
Как протекает дегидрирование соединения, которое может быть донатором только одного атома водорода, и как в процессе окисления соединения высвобождают С 02, мы рассмотрим при изучении превращ ения конкретных метаболитов.
Транспорт протонов и электронов по дыхательной цепи, как уж е сказано, обеспечивается разностью потенциалов между отдельными дыхательными ферментами. На рис. 39 показано, как количественно изменяется потенциал от дегидрогеназ-НАД до кислорода. Каждое увеличение потенциала примерно на 0,16 В освобождает энергию в количестве, достаточном для синтеза одной молекулы АТФ из АДФ и Н3Р 0 4.
Прямыми экспериментами показано, что потребление одной молекулы кислорода, т.е. перенос пары протонов и электронов и образование одной молекулы воды, сопровождается синтезом 3 молекул АТФ. На это расходуется около 40% всей высвобождающейся при увеличении потенциала энергии.
3.3. Запасание энергии
Макроэргические связи. Прежде чем изучить механизм синтеза АТФ, необходимо усвоить понятия «макроэргическая связь» и «макроэргическое соединение».
Энергия химической связи равна разнице свободных энергий соединения, содержащего эту связь, и соединения, которое возникает при ее разрыве. Так, если соединение Z распадается на продукты X и Y, то энергия связи между X и Y в Z равна свободной энергии Z минус свободная энергия Y. М акроэргическая связь — связь, богатая энергией — это такая химическая связь, при разрыве которой высвобождается более 4 ккал/моль. Соединение, содержащее макроэргическую связь, называют макроэргическим или макроэргом.
Выше мы неоднократно говорили о том, что энергия химических связей, разрушающихся при окислительном распаде, запасается (аккумулируется) в связях АТФ или ее аналогов. АТФ содержит макроэргическую связь между вторьм и третьим остатками фосфорной кислоты. Ее обозначают извилистой линией ( ~ ): реакция распада АТФ на АДФ и неорганический фосфат связана с уменьшением свободной энергии на 7,3 ккал/моль, значит, энергия этой связи равна 7,3 ккал/моль. Для синтеза этой связи, т.е. для реакции АДФ + Н3Р 0 4 = АТФ + Н20, требуется затратить столько же ккал/моль. Таким образом, в процессе переноса пары атомов водорода по дыхательной цепи запасается 7,1 х 3 ккал/моль (21,3 ккал/моль). Это составляет около 40% всей высвободившейся при переносе пары атомов водорода энергии. АТФ — не единственный, но важнейший макроэрг, использующийся в организме.
3.3.1. Окислительное фосфорилирование
Основной путь запасания энергии в организме — синтез АТФ из АДФ и Н3Р 0 4. На этот синтез затрачивается энергия, высвобождающаяся в процессе тканевого дыхания, т.е. транспорта водорода по дыхательной цепи. Такой синтез АТФ называют окислительным фосфорилированием, или сопряжен ным фосфорилированием, имея в виду его сопряженность с процессом окисления.
На вопрос о том, каков механизм сопряжения, наиболее полно отвечает хемиоосмотическая теория (Митчелл, 1961). Эта теория опирается на следую щие основные факты:
1. Не удалось найти белок-переносчик активированной Н3Р 0 4.
2.Синтез АТФ сопряжен с транспортом водорода только при ненарушенной структуре митохондриальных мембран.
3.Митохондриальная мембрана непроницаема для протонов.
4.Протонный градиент (разница между концентрацией протонов по обе стороны внутренней митохондриальной мембраны) создается за счет переноса электронов в матрикс.